Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06622
• Subject: XM_011511228.3
• Aligned Length: 1097
• Identities: 1036
• Gaps: 43

Alignment

Query    1  ATGGCCTTGCGGCTCCTGAAGCTGGCAGCGACGTCCGCGTCCGCCCGGGTCGTGGCGGCGGGCGCCCAGCGCGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCTTGCGGCTCCTGAAGCTGGCAGCGACGTCCGCGTCCGCCCGGGTCGTGGCGGCGGGCGCCCAGCGCGT  74

Query   75  GAGAGGAATTCATAGCAGTGTGCAGTGCAAGCTGCGCTATGGAATGTGGCATTTCCTACTTGGGGATAAAGCAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAGAGGAATTCATAGCAGTGTGCAGTGCAAACTGCGCTATGGAATGTGGCATTTCCTACTTGGGGATAAAGCAA  148

Query  149  GCAAAAGACTGACAGAACGCAGCAGAGTGATAACTGTAGATGGCAATATATGTACTGGAAAAGGCAAACTTGCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAAAAGACTGACAGAACGCAGCAGAGTGATAACTGTAGATGGCAATATATGTACTGGAAAAGGCAAACTTGCA  222

Query  223  AAAGAAATAGCAGAGAAACTAGGCTTCAAGCACTTTCCTGAAGCGGGGATTCATTATCCAGACAGTACCACAGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAGAAATAGCAGAGAAACTAGGCTTCAAGCACTTTCCTGAAGCGGGGATTCATTATCCAGACAGTACCACAGG  296

Query  297  AGATGGGAAGCCCCTCGCCACCGACTATAATGGCAACTGTAGTTTGGAGAAATTTTACGATGATCCGAGAAGCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGATGGGAAGCCCCTCGCCACCGACTATAATGGCAACTGTAGTTTGGAGAAATTTTACGATGATCCGAGAAGCA  370

Query  371  ATGATGGCAACAGTTACCGCCTGCAGTCCTGGTTGTACAGCAGTCGCCTGCTGCAGTACTCAGATGCCTTGGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGATGGCAACAGTTACCGCCTGCAGTCCTGGTTGTACAGCAGTCGCCTGCTGCAGTACTCAGATGCCTTGGAG  444

Query  445  CACTTGCTGACCACAGGACAAGGTGTTGTGTTGGAGCGCTCCATCTTCAGTGACTTTGTGTTCCTGGAGGCGAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACTTGCTGACCACAGGACAAGGTGTTGTGTTGGAGCGCTCCATCTTCAGTGACTTTGTGTTCCTGGAGGCGAT  518

Query  519  GTACAACCAGGGATTCATCCGAAAGCAGTGTGTGGACCACTACAACGAGGTGAAGAGCGTCACCATCTGCGATT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTACAACCAGGGATTCATCCGAAAGCAGTGTGTGGACCACTACAACGAGGTGAAGAGCGTCACCATCTGCGATT  592

Query  593  ACCTGCCCCCCCACCTGGTGATTTACATCGATGTGCCCGTTCCAGAGGTCCAGAGGCGGATTCAGAAGAAAGGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCTGCCCCCCCACCTGGTGATTTACATCGATGTGCCCGTTCCAGAGGTCCAGAGGCGGATTCAGAAGAAAGGA  666

Query  667  GATCCACATGAAATGAAGATCACCTCTGCCTATCTACAGGACATTGAGAATGCCTATAAGAAAACCTTTCTCCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATCCACATGAAATGAAGATCACCTCTGCCTATCTACAGGACATTGAGAATGCCTATAAGAAAACCTTTCTCCC  740

Query  741  TGAGATGAGTGAAAAATGTGAGGTTTTACAGTATTCTGCAAGGGAAGCTCAAGATTCAAAAAAGGTGGTAGAGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGAGATGAGTGAAAAATGTGAGGTTTTACAATATTCTGCAAGGGAAGCTCAAGATTCAAAAAAGGTGGTAGAGG  814

Query  815  ACATTGAATACCTGAAGTTCGATAAAGGGCCGTGGCTCAAGCAGGACAATCGCACTTTATACCACCTGCGATTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACATTGAATACCTGAAGTTCGATAAAGGGCCGTGGCTCAAGCAGGACAATCGCACTTTATACCACCTGCGATTA  888

Query  889  CTGGTTCAGGATAAGTTTGAGGTGCTGAATTACACAAGCATTCCTATCTTTCTCCCGGAAGTCACCATTGGAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGGTTCAGGATAAGTTTGAGGTGCTGAATTACACAAGCATTCCTATCTTTCTCCCGGAAGTCACCATTGGAGC  962

Query  963  TCATCAGACTGACCGTGTCTTACATCAGTTCAGAGAG--CTGCCGGGCCGCAAGTA----CAGCCCTG------  1024
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||.|       ||||.|    .||||..|      
Sbjct  963  TCATCAGACTGACCGTGTCTTACATCAGTTCAGAGAGGTCTTC-------CAAGAATCAGAAGCCAAGAGATTA  1029

Query 1025  --GGTACAACACCGAGG-----TGGGAGACAA--------GTGGATCTGGCTGAAG-----  1065
              .||..||    ||||     |||.|||.||        ..|||||.||..||.|     
Sbjct 1030  GATGTCGAA----GAGGTCTGTTGGAAGAAAACACCTTTGAAGGATCGGGGAGAGGAAGTC  1086