Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06636
• Subject: NM_001245005.2
• Aligned Length: 1324
• Identities: 1250
• Gaps: 74

Alignment

Query    1  ATGTATTCGTCCCCGCTCTGCCTCACCCA-GGATGAGTTCCACCCGTTCATCGAGGCCCTGCTGCCTCACGTCC  73
                                        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------ATGGATGAGTTCCACCCGTTCATCGAGGCCCTGCTGCCTCACGTCC  46

Query   74  GCGCCTTCGCCTACACCTGGTTCAACCTGCAGGCGCGGAAGCGCAAGTACTTCAAGAAGCACGAGAAGCGGATG  147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   47  GCGCCTTCGCCTACACCTGGTTCAACCTGCAGGCGCGGAAGCGCAAGTACTTCAAGAAGCACGAGAAGCGGATG  120

Query  148  TCGAAGGACGAGGAGCGTGCGGTCAAGGACGAGCTGCTGGGCGAGAAGCCCGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCGTC  221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  TCGAAGGACGAGGAGCGTGCGGTCAAGGACGAGCTGCTGGGCGAGAAGCCCGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCGTC  194

Query  222  GCGGCTGCTGGCCAAGCTGCGCAAGGACATCCGGCCCGAGTGCCGCGAGGACTTCGTGCTGAGCATCACCGGCA  295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  195  GCGGCTGCTGGCCAAGCTGCGCAAGGACATCCGGCCCGAGTGCCGCGAGGACTTCGTGCTGAGCATCACCGGCA  268

Query  296  AGAAGGCGCCGGGCTGCGTGCTCTCCAACCCCGACCAGAAGGGCAAGATGCGGCGCATCGACTGTCTCCGGCAG  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  269  AGAAGGCGCCGGGCTGCGTGCTCTCCAACCCCGACCAGAAGGGCAAGATGCGGCGCATCGACTGTCTCCGGCAG  342

Query  370  GCGGACAAGGTGTGGCGGCTGGACCTGGTCATGGTCATCCTGTTCAAGGGCATCCCGCTGGAGAGCACCGACGG  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  343  GCGGACAAGGTGTGGCGGCTGGACCTGGTCATGGTCATCCTGTTCAAGGGCATCCCGCTGGAGAGCACCGACGG  416

Query  444  CGAGCGCCTGGTCAAGGCTGCGCAGTGCGGTCACCCGGTCCTGTGCGTGCAGCCGCACCACATTGGCGTGGCCG  517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  417  CGAGCGCCTGGTCAAGGCTGCGCAGTGCGGTCACCCGGTCCTGTGCGTGCAGCCGCACCACATTGGCGTGGCCG  490

Query  518  TCAAGGAGCTGGACCTCTACCTGGCCTACTTCGTGCGTGAGCGAGATGCAGAGCAAAGCGGCAGTCCCCGGACA  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  491  TCAAGGAGCTGGACCTCTACCTGGCCTACTTCGTGCGTGAGCGAGATGCAGAGCAAAGCGGCAGTCCCCGGACA  564

Query  592  GGGATGGGCTCTGACCAGGAGGACAGCAAGCCCATCACGCTGGACACGACCGACTTCCAGGAGAGCTTTGTCAC  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  565  GGGATGGGCTCTGACCAGGAGGACAGCAAGCCCATCACGCTGGACACGACCGACTTCCAGGAGAGCTTTGTCAC  638

Query  666  CTCCGGCGTGTTCAGCGTCACTGAGCTCATCCAAGTGTCCCGGACACCCGTGGTGACTGGAACAGGACCCAACT  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  639  CTCCGGCGTGTTCAGCGTCACTGAGCTCATCCAAGTGTCCCGGACACCCGTGGTGACTGGAACAGGACCCAACT  712

Query  740  TCTCCCTGGGGGAGCTGCAGGGGCACCTGGCATACGACCTGAACCCAGCCAGCACTGGCCTCAGAAGAACGCTG  813
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Sbjct  713  TCTCCCTGGGGGAGCTGCAGGGGCACCTGGCATACGACCTGAACCCAGCCAGCACTGGCCTCAGAAGAACGCTG  786

Query  814  CCCAGCACCTCCTCCAGTGGGAGCAAGCGGCACAAATCGGGCTCGATGGAGGAAGACGTGGACACGAGCCCTGG  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  787  CCCAGCACCTCCTCCAGTGGGAGCAAGCGGCACAAATCGGGCTCGATGGAGGAAGACGTGGACACGAGCCCTGG  860

Query  888  CGGCGATTACTACACTTCGCCCAGCTCGCCCACGAGTAGCAGCCGCAACTGGACGGAGGACATGGAAGGAGGCA  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  861  CGGCGATTACTACACTTCGCCCAGCTCGCCCACGAGTAGCAGCCGCAACTGGACGGAGGACATGGAAGGAGGCA  934

Query  962  TCTCGTCCCCGGTGAAGAAGACAGAGATGGACAAGTCACCATTCAACAGCCCGTCCCCCCAGGACTCTCCCCGC  1035
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Sbjct  935  TCTCGTCCCCGGTGAAGAAGACAGAGATGGACAAGTCACCATTCAACAGCCCGTCCCCCCAGGACTCTCCCCGC  1008

Query 1036  CTCTCCAGCTTCACCCAGCACCACCGGCCCGTCATCGCCGTGCACAGCGGGATCGCCCGGAGCCCACACCCGTC  1109
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Sbjct 1009  CTCTCCAGCTTCACCCAGCACCACCGGCCCGTCATCGCCGTGCACAGCGGGATCGCCCGGAGCCCACACCCGTC  1082

Query 1110  CTCCGCTCTGCATTTCCCTACGACGTCCATCCTACCCCAGACGGCCTCCACCTACTTCCCCCACACGGCCATCC  1183
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Sbjct 1083  CTCCGCTCTGCATTTCCCTACGACGTCCATCCTACCCCAGACGGCCTCCACCTACTTCCCCCACACGGCCATCC  1156

Query 1184  GCTACCCACCTCATCTCAACCCCCAGGACCCGCTCAAAGATCTTGTCTCGCTGGCCTGCGACCCAGCCAGCCAG  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157  GCTACCCACCTCATCTCAACCCCCAGGACCCGCTCAAAGATCTTGTCTCGCTGGCCTGCGACCCAGCCAGCCAG  1230

Query 1258  CAACCTGGACCG-------TCC--------------------------------TGGGATCTGGGA  1284
            ||||||||||||       |||                                ||||||      
Sbjct 1231  CAACCTGGACCGCCTACTCTCCGCCCGACACGTCCCCTGCAAACCGTTCCTTTGTGGGAT------  1290