Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06636
- Subject:
- XM_006722759.2
- Aligned Length:
- 1701
- Identities:
- 1247
- Gaps:
- 450
Alignment
Query 1 ATGTATTCGTCCCCGCTCTGCCTCACCCA-GGATGAGTTCCACCCGTTCATCGAGGCCCTGCTGCCTCACGTCC 73
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Sbjct 1 ----------------------------ATGGATGAGTTCCACCCGTTCATCGAGGCCCTGCTGCCTCACGTCC 46
Query 74 GCGCCTTCGCCTACACCTGGTTCAACCTGCAGGCGCGGAAGCGCAAGTACTTCAAGAAGCACGAGAAGCGGATG 147
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Sbjct 47 GCGCCTTCGCCTACACCTGGTTCAACCTGCAGGCGCGGAAGCGCAAGTACTTCAAGAAGCACGAGAAGCGGATG 120
Query 148 TCGAAGGACGAGGAGCGTGCGGTCAAGGACGAGCTGCTGGGCGAGAAGCCCGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCGTC 221
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Sbjct 121 TCGAAGGACGAGGAGCGTGCGGTCAAGGACGAGCTGCTGGGCGAGAAGCCCGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCGTC 194
Query 222 GCGGCTGCTGGCCAAGCTGCGCAAGGACATCCGGCCCGAGTGCCGCGAGGACTTCGTGCTGAGCATCACCGGCA 295
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Sbjct 195 GCGGCTGCTGGCCAAGCTGCGCAAGGACATCCGGCCCGAGTGCCGCGAGGACTTCGTGCTGAGCATCACCGGCA 268
Query 296 AGAAGGCGCCGGGCTGCGTGCTCTCCAACCCCGACCAGAAGGGCAAGATGCGGCGCATCGACTGTCTCCGGCAG 369
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Sbjct 269 AGAAGGCGCCGGGCTGCGTGCTCTCCAACCCCGACCAGAAGGGCAAGATGCGGCGCATCGACTGTCTCCGGCAG 342
Query 370 GCGGACAAGGTGTGGCGGCTGGACCTGGTCATGGTCATCCTGTTCAAGGGCATCCCGCTGGAGAGCACCGACGG 443
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Sbjct 343 GCGGACAAGGTGTGGCGGCTGGACCTGGTCATGGTCATCCTGTTCAAGGGCATCCCGCTGGAGAGCACCGACGG 416
Query 444 CGAGCGCCTGGTCAAGGCTGCGCAGTGCGGTCACCCGGTCCTGTGCGTGCAGCCGCACCACATTGGCGTGGCCG 517
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Sbjct 417 CGAGCGCCTGGTCAAGGCTGCGCAGTGCGGTCACCCGGTCCTGTGCGTGCAGCCGCACCACATTGGCGTGGCCG 490
Query 518 TCAAGGAGCTGGACCTCTACCTGGCCTACTTCGTGCGTGAGCGAGATGCAGAGCAAAGCGGCAGTCCCCGGACA 591
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Sbjct 491 TCAAGGAGCTGGACCTCTACCTGGCCTACTTCGTGCGTGAGCGAGATGCAGAGCAAAGCGGCAGTCCCCGGACA 564
Query 592 GGGATGGGCTCTGACCAGGAGGACAGCAAGCCCATCACGCTGGACACGACCGACTTCCAGGAGAGCTTTGTCAC 665
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Sbjct 565 GGGATGGGCTCTGACCAGGAGGACAGCAAGCCCATCACGCTGGACACGACCGACTTCCAGGAGAGCTTTGTCAC 638
Query 666 CTCCGGCGTGTTCAGCGTCACTGAGCTCATCCAAGTGTCCCGGACACCCGTGGTGACTGGAACAGGACCCAACT 739
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Sbjct 639 CTCCGGCGTGTTCAGCGTCACTGAGCTCATCCAAGTGTCCCGGACACCCGTGGTGACTGGAACAGGACCCAACT 712
Query 740 TCTCCCTGGGGGAGCTGCAGGGGCACCTGGCATACGACCTGAACCCAGCCAGCACTGGCCTCAGAAGAACGCTG 813
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Sbjct 713 TCTCCCTGGGGGAGCTGCAGGGGCACCTGGCATACGACCTGAACCCAGCCAGCACTGGCCTCAGAAGAACGCTG 786
Query 814 CCCAGCACCTCCTCCAGTGGGAGCAAGCGGCACAAATCGGGCTCGATGGAGGAAGACGTGGACACGAGCCCTGG 887
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Sbjct 787 CCCAGCACCTCCTCCAGTGGGAGCAAGCGGCACAAATCGGGCTCGATGGAGGAAGACGTGGACACGAGCCCTGG 860
Query 888 CGGCGATTACTACACTTCGCCCAGCTCGCCCACGAGTAGCAGCCGCAACTGGACGGAGGACATGGAAGGAGGCA 961
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Sbjct 861 CGGCGATTACTACACTTCGCCCAGCTCGCCCACGAGTAGCAGCCGCAACTGGACGGAGGACATGGAAGGAGGCA 934
Query 962 TCTCGTCCCCGGTGAAGAAGACAGAGATGGACAAGTCACCATTCAACAGCCCGTCCCCCCAGGACTCTCCCCGC 1035
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Sbjct 935 TCTCGTCCCCGGTGAAGAAGACAGAGATGGACAAGTCACCATTCAACAGCCCGTCCCCCCAGGACTCTCCCCGC 1008
Query 1036 CTCTCCAGCTTCACCCAGCACCACCGGCCCGTCATCGCCGTGCACAGCGGGATCGCCCGGAGCCCACACCCGTC 1109
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Sbjct 1009 CTCTCCAGCTTCACCCAGCACCACCGGCCCGTCATCGCCGTGCACAGCGGGATCGCCCGGAGCCCACACCCGTC 1082
Query 1110 CTCCGCTCTGCATTTCCCTACGACGTCCATCCTACCCCAGACGGCCTCCACCTACTTCCCCCACACGGCCATCC 1183
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Sbjct 1083 CTCCGCTCTGCATTTCCCTACGACGTCCATCCTACCCCAGACGGCCTCCACCTACTTCCCCCACACGGCCATCC 1156
Query 1184 GCTACCCACCTCATCTCAACCCCCAGGACCCGCTCAAAGATCTTGTCTCGCTGGCCTGCGACCCAGCCAGCCAG 1257
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Sbjct 1157 GCTACCCACCTCATCTCAACCCCCAGGACCCGCTCAAAGATCTTGTCTCGCTGGCCTGCGACCCAGCCAGCCAG 1230
Query 1258 CAACCTGGACCGTCCTGGGATCTGGGA----------------------------------------------- 1284
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Sbjct 1231 CAACCTGGACCGT-----TAAATGGAAGTGGTCAGCTCAAAATGCCCAGCCACTGCCTTTCTGCTCAGATGCTG 1299
Query 1285 -------------------------------------------------------------------------- 1284
Sbjct 1300 GCACCTCCGCCCCCGGGGCTGCCACGGCTGGCGCTCCCCCCTGCCACCAAACCCGCCACCACCTCCGAGGGAGG 1373
Query 1285 -------------------------------------------------------------------------- 1284
Sbjct 1374 AGCCACGTCGCCGACCTCGCCTTCCTACTCTCCGCCCGACACGTCCCCTGCAAACCGTTCCTTTGTGGGATTAG 1447
Query 1285 -------------------------------------------------------------------------- 1284
Sbjct 1448 GACCAAGGGATCCTGCGGGCATTTATCAGGCACAGGCTCCGCAAAACCAGCCGGAGGAGGAAGCAGGGATGGAG 1521
Query 1285 -------------------------------------------------------------------------- 1284
Sbjct 1522 GCTGCTTCTCCTGAGTTCAGAGGAGATCCATGTGCTATGGGTGGAGGGAATCCTGGGTCAGGGGCCAGGGCTCC 1595
Query 1285 ------------------------------------------------------------------------- 1284
Sbjct 1596 AGCCCAGTGCTGGCTCACCCACTCTGAACCTCTGTCTCTTCCTCTGGCCTTGGGCACCCGCACCAAGAGCCTT 1668
