Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06637
- Subject:
- NM_008689.2
- Aligned Length:
- 2955
- Identities:
- 2466
- Gaps:
- 90
Alignment
Query 1 ATGGCAGAAGATGATCCATATTTGGGAAGGCCTGAACAAATGTTTCATTTGGATCCTTCTTTGACTCATACAAT 74
||||||||.||||||||.|| .|||| |||..|||||||||||||||.|..||.||||||||||..||||
Sbjct 1 ATGGCAGACGATGATCCCTA---CGGAA---CTGGGCAAATGTTTCATTTGAACACTGCTTTGACTCACTCAAT 68
Query 75 ATTTAATCCAGAAGTAT-TTCAACCACAGATGGCACTGCCAACAGCAGATGGCCCATACCTTCAAATATTAGAG 147
|||||||.|||||.||| ||| ||||.|.||..|||||.||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 69 ATTTAATGCAGAATTATATTC-ACCAGAAATACCACTGTCAA---CAGATGGCCCATACCTTCAAATATTAGAG 138
Query 148 CAACCTAAACAGAGAGGATTTCGTTTCCGTTATGTATGTGAAGGCCCATCCCATGGTGGACTACCTGGTGCCTC 221
|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||.||.|||||
Sbjct 139 CAACCAAAACAGAGGGGATTTCGATTCCGCTATGTGTGTGAAGGCCCATCACACGGAGGGCTTCCGGGAGCCTC 212
Query 222 TAGTGAAAAGAACAAGAAGTCTTACCCTCAGGTCAAAATCTGCAACTATGTGGGACCAGCAAAGGTTATTGTTC 295
||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 213 TAGTGAGAAGAACAAGAAATCCTACCCACAGGTCAAAATTTGCAACTATGTGGGGCCTGCAAAGGTTATCGTTC 286
Query 296 AGTTGGTCACAAATGGAAAAAATATCCACCTGCATGCCCACAGCCTGGTGGGAAAACACTGTGAGGATGGGATC 369
||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||.|.
Sbjct 287 AGTTGGTCACAAATGGAAAAAACATCCACCTGCACGCCCACAGCCTGGTGGGCAAGCACTGTGAGGACGGGGTA 360
Query 370 TGCACTGTAACTGCTGGACCCAAGGACATGGTGGTCGGCTTCGCAAACCTGGGTATACTTCATGTGACAAAGAA 443
|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 361 TGCACCGTAACAGCAGGACCCAAGGACATGGTGGTTGGCTTTGCAAACCTGGGAATACTTCATGTGACTAAGAA 434
Query 444 AAAAGTATTTGAAACACTGGAAGCACGAATGACAGAGGCGTGTATAAGGGGCTATAATCCTGGACTCTTGGTGC 517
|||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..||||||
Sbjct 435 AAAGGTATTTGAAACACTGGAAGCACGGATGACAGAGGCGTGTATTAGGGGCTATAATCCTGGACTTCTGGTGC 508
Query 518 ACCCTGACCTTGCCTATTTGCAAGCAGAAGGTGGAGGGGACCGGCAGCTGGGAGATCGGGAAAAAGAGCTAATC 591
|..||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||.||||||||.||...|||..|.||.||.|||.|.|||
Sbjct 509 ATTCTGACCTTGCCTATCTACAAGCAGAAGGCGGAGGAGACCGGCAACTCACAGACAGAGAGAAGGAGATCATC 582
Query 592 CGCCAAGCAGCTCTGCAGCAGACCAAGGAGATGGACCTCAGCGTGGTGCGGCTCATGTTTACAGCTTTTCTTCC 665
|||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 583 CGCCAGGCAGCCGTGCAGCAGACCAAGGAGATGGACCTGAGCGTGGTGCGCCTCATGTTCACAGCCTTCCTCCC 656
Query 666 GGATAGCACTGGCAGCTTCACAAGGCGCCTGGAACCCGTGGTATCAGACGCCATCTATGACAGTAAAGCCCCCA 739
.||.|||||||||||||||||..||.|.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 657 TGACAGCACTGGCAGCTTCACTCGGAGACTGGAGCCTGTGGTGTCAGACGCCATCTATGATAGCAAAGCCCCGA 730
Query 740 ATGCATCCAACTTGAAAATTGTAAGAATGGACAGGACAGCTGGATGTGTGACTGGAGGGGAGGAAATTTATCTT 813
|||||||||||.|||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 731 ATGCATCCAACCTGAAAATCGTGAGAATGGACAGAACAGCAGGATGTGTGACGGGAGGGGAGGAGATTTACCTT 804
Query 814 CTTTGTGACAAAGTTCAGAAAGATGACATCCAGATTCGATTTTATGAAGAGGAAGAAAATGGTGGAGTCTGGGA 887
||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 805 CTCTGTGACAAGGTTCAGAAAGATGACATCCAGATTCGGTTTTATGAAGAGGAAGAAAATGGCGGAGTTTGGGA 878
Query 888 AGGATTTGGAGATTTTTCCCCCACAGATGTTCATAGACAATTTGCCATTGTCTTCAAAACTCCAAAGTATAAAG 961
|||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 879 AGGATTTGGGGACTTTTCCCCCACAGATGTTCATAGACAGTTTGCCATTGTCTTCAAAACGCCAAAGTATAAGG 952
Query 962 ATATTAATATTACAAAACCAGCCTCTGTGTTTGTCCAGCTTCGGAGGAAATCTGACTTGGAAACTAGTGAACCA 1035
||.|.||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.
Sbjct 953 ATGTCAACATTACAAAGCCAGCTTCCGTGTTTGTTCAGCTTCGGAGGAAATCAGACCTGGAAACTAGTGAACCG 1026
Query 1036 AAACCTTTCCTCTACTATCCTGAAATCAAAGATAAAGAAGAAGTGCAGAGGAAACGTCAGAAGCTCATGCCCAA 1109
|||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1027 AAACCCTTTCTCTACTACCCTGAAATCAAAGACAAAGAGGAAGTGCAAAGGAAACGCCAGAAGCTTATGCCGAA 1100
Query 1110 TTTTTCGGATAGTTTCGGCGGTGGTAGTGGTGCCGGAGCTGGAGGCGGAGGCATGTTTGGTAGTGGCGGTGGAG 1183
.||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1101 CTTCTCGGACAGCTTCGGTGGCGGCAGTGGAGCGGGAGCCGGTGGTGGAGGCATGTTCGGTAGTGGCGGTGGCG 1174
Query 1184 GAGGGGGCACTGGAAGTACAGGTCCAGGGTATAGCTTCCCACACTATGGATTTCCTACTTATGGTGGGATTACT 1257
|||||.|.||.|||||..|.||.|||||||||.|||.|.|..||||.|||||||||.|.||.|||||||||||.
Sbjct 1175 GAGGGAGTACCGGAAGCCCTGGCCCAGGGTATGGCTACTCGAACTACGGATTTCCTCCCTACGGTGGGATTACA 1248
Query 1258 TTCCATCCTGGAACTACTAAATCTAATGCTGGGATGAAGCATGGAACCATGGACACTGAATCTAAAAAGGACCC 1331
||||||||.|||...||.|||||.||.||.|||.|.|..|||||.|||||..||||..|||.||||||.|.|||
Sbjct 1249 TTCCATCCCGGAGTCACGAAATCCAACGCAGGGGTCACCCATGGCACCATAAACACCAAATTTAAAAATGGCCC 1322
Query 1332 TGAAGGTTGTGACAAAAGTGATGACAAAAACACTGTAAACCTCTTTGGGAAAGTTATTGAAACCACAGAGCAAG 1405
|.|||.|||||.|||.|||||||||.|..|.|.|.|.|..|||..||.|||.|..|.|| |||
Sbjct 1323 TAAAGATTGTGCCAAGAGTGATGACGAGGAGAGTCTGACTCTCCCTGAGAAGGAAACTG------------AAG 1384
Query 1406 ATCAGGAGCCCAGCGAGGCCACCGTTGG-------GAATGGTGAGGTCACTCTAAC------GTATGCAACA-G 1465
.|.|.|.|||||||..|.||| ||| .|| ||.|..|| |.|.| |.||.||.|| |
Sbjct 1385 GTGAAGGGCCCAGCCTGCCCA----TGGCCTGCACCAA----GACGGAAC-CCATCGCCTTGGCATCCACCATG 1449
Query 1466 GAACAAAAGAAGAG-AG----TGCTGGAGTTCAGGATAACCTCTTTCTAGAGAAGGCTATGCAGCTTGCAAAGA 1534
|||.|.||| ||| || || |||.|||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||.|.|.
Sbjct 1450 GAAGACAAG--GAGCAGGACATG--GGATTTCAGGATAACCTCTTTCTTGAGAAGGCTCTGCAGCTCGCCAGGC 1519
Query 1535 GGCATGCCAATGCCCTTTTCGACTACGCGGTGACAGGAGACGTGAAGATGCTGCTGGCCGTCCAGCGCCATCTC 1608
|.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||.||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1520 GACACGCCAACGCCCTTTTCGACTACGCAGTGACGGGGGATGTGAAGATGTTGCTGGCCGTGCAACGCCATCTC 1593
Query 1609 ACTGCTGTGCAGGATGAGAATGGGGACAGTGTCTTACACTTAGCAATCATCCACCTTCATTCTCAACTTGTGAG 1682
||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||..||||.||||||||
Sbjct 1594 ACCGCCGTGCAGGATGAGAATGGGGACAGTGTCTTACACTTAGCCATCATCCACCTCCACGCTCAGCTTGTGAG 1667
Query 1683 GGATCTACTAGAAGTCACATCTGGTTTGATTTCTGATGACATTATCAACATGAGAAATGATCTGTACCAGACGC 1756
||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1668 GGATCTGCTGGAAGTCACATCTGGTTTGATCTCTGATGACATCATCAACATGAGAAATGACCTGTATCAGACAC 1741
Query 1757 CCTTGCACTTGGCAGTGATCACTAAGCAGGAAGATGTGGTGGAGGATTTGCTGAGGGCTGGGGCCGACCTGAGC 1830
|..||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||.||||||.|||||||||
Sbjct 1742 CTCTGCACTTGGCCGTGATCACCAAGCAGGAAGATGTAGTAGAGGATTTGCTGAGGGTTGGGGCTGACCTGAGC 1815
Query 1831 CTTCTGGACCGCTTGGGTAACTCTGTTTTGCACCTAGCTGCCAAAGAAGGACATGATAAAGTTCTCAGTATCTT 1904
|||||||||||||.|||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||.|.|.|.|||||.|||.|
Sbjct 1816 CTTCTGGACCGCTGGGGCAACTCTGTCCTGCACCTAGCTGCCAAAGAAGGACACGACAGAATCCTCAGCATCCT 1889
Query 1905 ACTCAAGCACAAAAAGGCAGCACTACTTCTTGACCACCCCAACGGGGACGGTCTGAATGCCATTCATCTAGCCA 1978
.||||||..||.|||.|||||.|..|||.|.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||..||||..
Sbjct 1890 GCTCAAGAGCAGAAAAGCAGCGCCCCTTATCGACCACCCCAATGGGGAAGGTCTAAATGCCATCCACATAGCTG 1963
Query 1979 TGATGAGCAATAGCCTGCCATGTTTGCTGCTGCTGGTGGCCGCTGGGGCTGACGTCAATGCTCAGGAGCAGAAG 2052
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1964 TGATGAGCAATAGCCTGCCATGTCTGCTGCTGCTGGTGGCTGCCGGGGCAGAAGTCAATGCTCAGGAGCAGAAG 2037
Query 2053 TCCGGGCGCACAGCACTGCACCTGGCTGTGGAGCACGACAACATCTCATTGGCAGGCTGCCTGCTCCTGGAAGG 2126
||.|||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 2038 TCTGGGCGCACAGCGCTGCACCTGGCCGTGGAGTACGACAACATCTCCTTGGCTGGCTGCCTGCTTCTGGAGGG 2111
Query 2127 TGATGCCCATGTGGACAGTACTACCTACGATGGAACCACACCCCTGCATATAGCAGCTGGGAGAGGGTCCACCA 2200
|||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 2112 TGATGCCCACGTGGACAGTACCACCTATGATGGGACTACACCTCTGCATATAGCGGCCGGAAGAGGGTCCACCA 2185
Query 2201 GGCTGGCAGCTCTTCTCAAAGCAGCAGGAGCAGATCCCCTGGTGGAGAACTTTGAGCCTCTCTATGACCTGGAT 2274
|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2186 GACTGGCAGCTCTTCTCAAAGCAGCAGGAGCAGACCCCCTGGTGGAGAACTTTGAGCCTCTCTATGACCTGGAC 2259
Query 2275 GACTCTTGGGAAAATGCAGGAGAGGATGAAGGAGTTGTGCCTGGAACCACGCCTCTAGATATGGCCACCAGCTG 2348
|||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||..|||.|||
Sbjct 2260 GACTCTTGGGAGAAGGCTGGAGAAGATGAGGGAGTGGTGCCAGGTACCACACCCCTGGACATGGCTGCCAACTG 2333
Query 2349 GCAGGTATTTGACATATTAAATGGGAAACCATATGAGCCAGAGTTTACATCTGATGATTTACTAGCACAAGGAG 2422
||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.|.|||.||||||||||||.|||||.|||||||.|
Sbjct 2334 GCAGGTATTTGACATACTAAATGGGAAACCGTATGAGCCTGTGTTCACATCTGATGATATACTACCACAAGGGG 2407
Query 2423 ACATGAAACAGCTGGCTGAAGATGTGAAGCTGCAGCTGTATAAGTTACTAGAAATTCCTGATCCAGACAAAAAC 2496
|||||||.||||||.|.|||||...||.|||.||.||.|..||..|.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2408 ACATGAAGCAGCTGACAGAAGACACGAGGCTACAACTCTGCAAACTGCTGGAAATTCCTGATCCAGACAAAAAC 2481
Query 2497 TGGGCTACTCTGGCGCAGAAATTAGGTCTGGGGATACTTAATAATGCCTTCCGGCTGAGTCCTGCTCCTTCCAA 2570
|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2482 TGGGCCACTCTGGCACAGAAGTTGGGTCTGGGGATACTGAACAATGCCTTCCGGCTGAGTCCTGCTCCTTCTAA 2555
Query 2571 AACACTTATGGACAACTATGAGGTCTCTGGGGGTACAGTCAGAGAGCTGGTGGAGGCCCTGAGACAAATGGGCT 2644
|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||..|||.|||||||.|||||||||||..|||.|||||||
Sbjct 2556 AACTCTCATGGACAACTATGAGGTCTCTGGGGGTACCATCAAAGAGCTGATGGAGGCCCTGCAACAGATGGGCT 2629
Query 2645 ACACCGAAGCAATTGAAGTGATCCAGG------------------------CAGCCTCCAGCCCAGTGAAGACC 2694
||||.||.||.|||||||||||||||| |||||||||||||.|| ||||
Sbjct 2630 ACACAGAGGCCATTGAAGTGATCCAGGCAGCCTTCCGCACCCCGGCAACCACAGCCTCCAGCCCCGT---GACC 2700
Query 2695 ACCTCTCAGGCCCACTCGCTGCCTCTCTCGCCTGCCTCCACAAGGCAGCAAATAGACGAGCTCCGAGACAGTGA 2768
||..||||||.|||||..||||||||||||.||.|||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 2701 ACTGCTCAGGTCCACTGTCTGCCTCTCTCGTCTTCCTCCACGAGGCAGCACATAGATGAACTCCGGGATAGTGA 2774
Query 2769 CAGTGTCTGCGACAGCGGCGTGGAGACATCCTTCCGCAAACTCAGCTTTACCGAGTCTCTGACCAGTGG----T 2838
|||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|| ||| .
Sbjct 2775 CAGCGTCTGTGACAGTGGTGTGGAGACATCCTTCCGCAAACTCAGCTTTACAGAGTCTCTTAC---TGGAGACA 2845
Query 2839 GCCTCACTGCTAACTCTCAACAAAATGCCCCATGATTATGGGCAGGAAGGACCTCTAGAAGGCAAAATT 2907
||| ||||||||.||||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||.|.||||||||||||
Sbjct 2846 GCC-CACTGCTATCTCTGAACAAAATGCCCCACGGTTATGGGCAGGAAGGACCTATTGAAGGCAAAATT 2913