Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06637
• Subject: XM_006501107.1
• Aligned Length: 2954
• Identities: 2128
• Gaps: 475

Alignment

Query    1  ATGGCAGAAGATGATCCATATTTGGGAAGGCCTGAACAAATGTTTCATTTGGATCCTTCTTTGACTCATACAAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ATTTAATCCAGAAGTATTTCAACCACAGATGGCACTGCCAACAGCAGATGGCCCATACCTTCAAATATTAGAGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AACCTAAACAGAGAGGATTTCGTTTCCGTTATGTATGTGAAGGCCCATCCCATGGTGGACTACCTGGTGCCTCT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AGTGAAAAGAACAAGAAGTCTTACCCTCAGGTCAAAATCTGCAACTATGTGGGACCAGCAAAGGTTATTGTTCA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GTTGGTCACAAATGGAAAAAATATCCACCTGCATGCCCACAGCCTGGTGGGAAAACACTGTGAGGATGGGATCT  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  GCACTGTAACTGCTGGACCCAAGGACATGGTGGTCGGCTTCGCAAACCTGGGTATACTTCATGTGACAAAGAAA  444
                                      ||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct    1  --------------------------ATGGTGGTTGGCTTTGCAAACCTGGGAATACTTCATGTGACTAAGAAA  48

Query  445  AAAGTATTTGAAACACTGGAAGCACGAATGACAGAGGCGTGTATAAGGGGCTATAATCCTGGACTCTTGGTGCA  518
            ||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||
Sbjct   49  AAGGTATTTGAAACACTGGAAGCACGGATGACAGAGGCGTGTATTAGGGGCTATAATCCTGGACTTCTGGTGCA  122

Query  519  CCCTGACCTTGCCTATTTGCAAGCAGAAGGTGGAGGGGACCGGCAGCTGGGAGATCGGGAAAAAGAGCTAATCC  592
            ..||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||.||||||||.||...|||..|.||.||.|||.|.||||
Sbjct  123  TTCTGACCTTGCCTATCTACAAGCAGAAGGCGGAGGAGACCGGCAACTCACAGACAGAGAGAAGGAGATCATCC  196

Query  593  GCCAAGCAGCTCTGCAGCAGACCAAGGAGATGGACCTCAGCGTGGTGCGGCTCATGTTTACAGCTTTTCTTCCG  666
            ||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.
Sbjct  197  GCCAGGCAGCCGTGCAGCAGACCAAGGAGATGGACCTGAGCGTGGTGCGCCTCATGTTCACAGCCTTCCTCCCT  270

Query  667  GATAGCACTGGCAGCTTCACAAGGCGCCTGGAACCCGTGGTATCAGACGCCATCTATGACAGTAAAGCCCCCAA  740
            ||.|||||||||||||||||..||.|.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct  271  GACAGCACTGGCAGCTTCACTCGGAGACTGGAGCCTGTGGTGTCAGACGCCATCTATGATAGCAAAGCCCCGAA  344

Query  741  TGCATCCAACTTGAAAATTGTAAGAATGGACAGGACAGCTGGATGTGTGACTGGAGGGGAGGAAATTTATCTTC  814
            ||||||||||.|||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  345  TGCATCCAACCTGAAAATCGTGAGAATGGACAGAACAGCAGGATGTGTGACGGGAGGGGAGGAGATTTACCTTC  418

Query  815  TTTGTGACAAAGTTCAGAAAGATGACATCCAGATTCGATTTTATGAAGAGGAAGAAAATGGTGGAGTCTGGGAA  888
            |.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  419  TCTGTGACAAGGTTCAGAAAGATGACATCCAGATTCGGTTTTATGAAGAGGAAGAAAATGGCGGAGTTTGGGAA  492

Query  889  GGATTTGGAGATTTTTCCCCCACAGATGTTCATAGACAATTTGCCATTGTCTTCAAAACTCCAAAGTATAAAGA  962
            ||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  493  GGATTTGGGGACTTTTCCCCCACAGATGTTCATAGACAGTTTGCCATTGTCTTCAAAACGCCAAAGTATAAGGA  566

Query  963  TATTAATATTACAAAACCAGCCTCTGTGTTTGTCCAGCTTCGGAGGAAATCTGACTTGGAAACTAGTGAACCAA  1036
            |.|.||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.|
Sbjct  567  TGTCAACATTACAAAGCCAGCTTCCGTGTTTGTTCAGCTTCGGAGGAAATCAGACCTGGAAACTAGTGAACCGA  640

Query 1037  AACCTTTCCTCTACTATCCTGAAATCAAAGATAAAGAAGAAGTGCAGAGGAAACGTCAGAAGCTCATGCCCAAT  1110
            ||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.
Sbjct  641  AACCCTTTCTCTACTACCCTGAAATCAAAGACAAAGAGGAAGTGCAAAGGAAACGCCAGAAGCTTATGCCGAAC  714

Query 1111  TTTTCGGATAGTTTCGGCGGTGGTAGTGGTGCCGGAGCTGGAGGCGGAGGCATGTTTGGTAGTGGCGGTGGAGG  1184
            ||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  715  TTCTCGGACAGCTTCGGTGGCGGCAGTGGAGCGGGAGCCGGTGGTGGAGGCATGTTCGGTAGTGGCGGTGGCGG  788

Query 1185  AGGGGGCACTGGAAGTACAGGTCCAGGGTATAGCTTCCCACACTATGGATTTCCTACTTATGGTGGGATTACTT  1258
            ||||.|.||.|||||..|.||.|||||||||.|||.|.|..||||.|||||||||.|.||.|||||||||||.|
Sbjct  789  AGGGAGTACCGGAAGCCCTGGCCCAGGGTATGGCTACTCGAACTACGGATTTCCTCCCTACGGTGGGATTACAT  862

Query 1259  TCCATCCTGGAACTACTAAATCTAATGCTGGGATGAAGCATGGAACCATGGACACTGAATCTAAAAAGGACCCT  1332
            |||||||.|||...||.|||||.||.||.|||.|.|..|||||.|||||..||||..|||.||||||.|.||||
Sbjct  863  TCCATCCCGGAGTCACGAAATCCAACGCAGGGGTCACCCATGGCACCATAAACACCAAATTTAAAAATGGCCCT  936

Query 1333  GAAGGTTGTGACAAAAGTGATGACAAAAACACTGTAAACCTCTTTGGGAAAGTTATTGAAACCACAGAGCAAGA  1406
            .|||.|||||.|||.|||||||||.|..|.|.|.|.|..|||..||.|||.|..|.||            |||.
Sbjct  937  AAAGATTGTGCCAAGAGTGATGACGAGGAGAGTCTGACTCTCCCTGAGAAGGAAACTG------------AAGG  998

Query 1407  TCAGGAGCCCAGCGAGGCCACCGTTGG-------GAATGGTGAGGTCACTCTAAC------GTATGCAACA-GG  1466
            |.|.|.|||||||..|.|||    |||       .||    ||.|..|| |.|.|      |.||.||.|| ||
Sbjct  999  TGAAGGGCCCAGCCTGCCCA----TGGCCTGCACCAA----GACGGAAC-CCATCGCCTTGGCATCCACCATGG  1063

Query 1467  AACAAAAGAAGAG-AG----TGCTGGAGTTCAGGATAACCTCTTTCTAGAGAAGGCTATGCAGCTTGCAAAGAG  1535
            ||.|.|||  ||| ||    ||  |||.|||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||.|.|.|
Sbjct 1064  AAGACAAG--GAGCAGGACATG--GGATTTCAGGATAACCTCTTTCTTGAGAAGGCTCTGCAGCTCGCCAGGCG  1133

Query 1536  GCATGCCAATGCCCTTTTCGACTACGCGGTGACAGGAGACGTGAAGATGCTGCTGGCCGTCCAGCGCCATCTCA  1609
            .||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||.||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1134  ACACGCCAACGCCCTTTTCGACTACGCAGTGACGGGGGATGTGAAGATGTTGCTGGCCGTGCAACGCCATCTCA  1207

Query 1610  CTGCTGTGCAGGATGAGAATGGGGACAGTGTCTTACACTTAGCAATCATCCACCTTCATTCTCAACTTGTGAGG  1683
            |.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||..||||.|||||||||
Sbjct 1208  CCGCCGTGCAGGATGAGAATGGGGACAGTGTCTTACACTTAGCCATCATCCACCTCCACGCTCAGCTTGTGAGG  1281

Query 1684  GATCTACTAGAAGTCACATCTGGTTTGATTTCTGATGACATTATCAACATGAGAAATGATCTGTACCAGACGCC  1757
            |||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 1282  GATCTGCTGGAAGTCACATCTGGTTTGATCTCTGATGACATCATCAACATGAGAAATGACCTGTATCAGACACC  1355

Query 1758  CTTGCACTTGGCAGTGATCACTAAGCAGGAAGATGTGGTGGAGGATTTGCTGAGGGCTGGGGCCGACCTGAGCC  1831
            ..||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||.||||||.||||||||||
Sbjct 1356  TCTGCACTTGGCCGTGATCACCAAGCAGGAAGATGTAGTAGAGGATTTGCTGAGGGTTGGGGCTGACCTGAGCC  1429

Query 1832  TTCTGGACCGCTTGGGTAACTCTGTTTTGCACCTAGCTGCCAAAGAAGGACATGATAAAGTTCTCAGTATCTTA  1905
            ||||||||||||.|||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||.|.|.|.|||||.|||.|.
Sbjct 1430  TTCTGGACCGCTGGGGCAACTCTGTCCTGCACCTAGCTGCCAAAGAAGGACACGACAGAATCCTCAGCATCCTG  1503

Query 1906  CTCAAGCACAAAAAGGCAGCACTACTTCTTGACCACCCCAACGGGGACGGTCTGAATGCCATTCATCTAGCCAT  1979
            ||||||..||.|||.|||||.|..|||.|.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||..||||..|
Sbjct 1504  CTCAAGAGCAGAAAAGCAGCGCCCCTTATCGACCACCCCAATGGGGAAGGTCTAAATGCCATCCACATAGCTGT  1577

Query 1980  GATGAGCAATAGCCTGCCATGTTTGCTGCTGCTGGTGGCCGCTGGGGCTGACGTCAATGCTCAGGAGCAGAAGT  2053
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1578  GATGAGCAATAGCCTGCCATGTCTGCTGCTGCTGGTGGCTGCCGGGGCAGAAGTCAATGCTCAGGAGCAGAAGT  1651

Query 2054  CCGGGCGCACAGCACTGCACCTGGCTGTGGAGCACGACAACATCTCATTGGCAGGCTGCCTGCTCCTGGAAGGT  2127
            |.|||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1652  CTGGGCGCACAGCGCTGCACCTGGCCGTGGAGTACGACAACATCTCCTTGGCTGGCTGCCTGCTTCTGGAGGGT  1725

Query 2128  GATGCCCATGTGGACAGTACTACCTACGATGGAACCACACCCCTGCATATAGCAGCTGGGAGAGGGTCCACCAG  2201
            ||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1726  GATGCCCACGTGGACAGTACCACCTATGATGGGACTACACCTCTGCATATAGCGGCCGGAAGAGGGTCCACCAG  1799

Query 2202  GCTGGCAGCTCTTCTCAAAGCAGCAGGAGCAGATCCCCTGGTGGAGAACTTTGAGCCTCTCTATGACCTGGATG  2275
            .||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1800  ACTGGCAGCTCTTCTCAAAGCAGCAGGAGCAGACCCCCTGGTGGAGAACTTTGAGCCTCTCTATGACCTGGACG  1873

Query 2276  ACTCTTGGGAAAATGCAGGAGAGGATGAAGGAGTTGTGCCTGGAACCACGCCTCTAGATATGGCCACCAGCTGG  2349
            ||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||..|||.||||
Sbjct 1874  ACTCTTGGGAGAAGGCTGGAGAAGATGAGGGAGTGGTGCCAGGTACCACACCCCTGGACATGGCTGCCAACTGG  1947

Query 2350  CAGGTATTTGACATATTAAATGGGAAACCATATGAGCCAGAGTTTACATCTGATGATTTACTAGCACAAGGAGA  2423
            |||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.|.|||.||||||||||||.|||||.|||||||.||
Sbjct 1948  CAGGTATTTGACATACTAAATGGGAAACCGTATGAGCCTGTGTTCACATCTGATGATATACTACCACAAGGGGA  2021

Query 2424  CATGAAACAGCTGGCTGAAGATGTGAAGCTGCAGCTGTATAAGTTACTAGAAATTCCTGATCCAGACAAAAACT  2497
            ||||||.||||||.|.|||||...||.|||.||.||.|..||..|.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2022  CATGAAGCAGCTGACAGAAGACACGAGGCTACAACTCTGCAAACTGCTGGAAATTCCTGATCCAGACAAAAACT  2095

Query 2498  GGGCTACTCTGGCGCAGAAATTAGGTCTGGGGATACTTAATAATGCCTTCCGGCTGAGTCCTGCTCCTTCCAAA  2571
            ||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2096  GGGCCACTCTGGCACAGAAGTTGGGTCTGGGGATACTGAACAATGCCTTCCGGCTGAGTCCTGCTCCTTCTAAA  2169

Query 2572  ACACTTATGGACAACTATGAGGTCTCTGGGGGTACAGTCAGAGAGCTGGTGGAGGCCCTGAGACAAATGGGCTA  2645
            ||.||.|||||||||||||||||||||||||||||..|||.|||||||.|||||||||||..|||.||||||||
Sbjct 2170  ACTCTCATGGACAACTATGAGGTCTCTGGGGGTACCATCAAAGAGCTGATGGAGGCCCTGCAACAGATGGGCTA  2243

Query 2646  CACCGAAGCAATTGAAGTGATCCAGG------------------------CAGCCTCCAGCCCAGTGAAGACCA  2695
            |||.||.||.||||||||||||||||                        |||||||||||||.||   |||||
Sbjct 2244  CACAGAGGCCATTGAAGTGATCCAGGCAGCCTTCCGCACCCCGGCAACCACAGCCTCCAGCCCCGT---GACCA  2314

Query 2696  CCTCTCAGGCCCACTCGCTGCCTCTCTCGCCTGCCTCCACAAGGCAGCAAATAGACGAGCTCCGAGACAGTGAC  2769
            |..||||||.|||||..||||||||||||.||.|||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||
Sbjct 2315  CTGCTCAGGTCCACTGTCTGCCTCTCTCGTCTTCCTCCACGAGGCAGCACATAGATGAACTCCGGGATAGTGAC  2388

Query 2770  AGTGTCTGCGACAGCGGCGTGGAGACATCCTTCCGCAAACTCAGCTTTACCGAGTCTCTGACCAGTGG----TG  2839
            ||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||   |||    .|
Sbjct 2389  AGCGTCTGTGACAGTGGTGTGGAGACATCCTTCCGCAAACTCAGCTTTACAGAGTCTCTTAC---TGGAGACAG  2459

Query 2840  CCTCACTGCTAACTCTCAACAAAATGCCCCATGATTATGGGCAGGAAGGACCTCTAGAAGGCAAAATT  2907
            || ||||||||.||||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||.|.||||||||||||
Sbjct 2460  CC-CACTGCTATCTCTGAACAAAATGCCCCACGGTTATGGGCAGGAAGGACCTATTGAAGGCAAAATT  2526