Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_06638
Subject:
NM_002505.5
Aligned Length:
1041
Identities:
952
Gaps:
87

Alignment

Query    1  ATGGAGCAGTATACAGCAAACAGCAATAGTTCGACAGAGCAGATTGTTGTCCAGGCAGGACAGATTCAGCAGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCAGTATACAGCAAACAGCAATAGTTCGACAGAGCAGATTGTTGTCCAGGCAGGACAGATTCAGCAGCA  74

Query   75  G-------------------------------------------------------------------------  75
            |                                                                         
Sbjct   75  GCAGCAGGGTGGTGTCACTGCTGTGCAGTTGCAGACTGAGGCCCAGGTGGCATCCGCCTCAGGCCAGCAAGTCC  148

Query   76  --------------GTCCAAGGGCAGCCATTAATGGTGCAGGTCAGTGGAGGCCAGCTAATCACATCAACTGGC  135
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGACCCTCCAGGTAGTCCAAGGGCAGCCATTAATGGTGCAGGTCAGTGGAGGCCAGCTAATCACATCAACTGGC  222

Query  136  CAACCCATCATGGTCCAGGCTGTCCCTGGTGGGCAAGGTCAAACCATCATGCAAGTACCTGTTTCTGGAACACA  209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAACCCATCATGGTCCAGGCTGTCCCTGGTGGACAAGGTCAAACCATCATGCAAGTACCTGTTTCTGGAACACA  296

Query  210  GGGTTTGCAGCAAATACAGTTGGTCCCACCTGGACAGATCCAGATCCAGGGTGGACAGGCTGTGCAGGTGCAGG  283
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGTTTGCAGCAAATACAGTTGGTCCCACCTGGACAGATCCAGATCCAGGGTGGACAGGCTGTGCAGGTGCAGG  370

Query  284  GCCAGCAGGGCCAGACCCAGCAGATCATCATCCAGCAGCCCCAGACGGCTGTCACTGCTGGCCAGACTCAGACA  357
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCAGCAGGGCCAGACCCAGCAGATCATCATCCAGCAGCCCCAGACGGCTGTCACTGCTGGCCAGACTCAGACA  444

Query  358  CAGCAGCAGATTGCTGTCCAGGGACAGCAAGTGGCACAGACTGCTGAAGGGCAGACCATCGTCTATCAACCAGT  431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGCAGCAGATTGCTGTCCAGGGACAGCAAGTGGCACAGACTGCTGAAGGGCAGACCATCGTCTATCAACCAGT  518

Query  432  TAATGCAGATGGCACCATTCTCCAGCAAGTTACAGTCCCTGTTTCAGGCATGATCACTATCCCAGCAGCCAGTT  505
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TAATGCAGATGGCACCATTCTCCAGCAAGTTACAGTCCCTGTTTCAGGCATGATCACTATCCCAGCAGCCAGTT  592

Query  506  TGGCAGGAGCACAGATTGTTCAAACAGGAGCCAATACCAACACAACCAGCAGTGGGCAAGGGACTGTCACTGTG  579
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGCAGGAGCACAGATTGTTCAAACAGGAGCCAATACCAACACAACCAGCAGTGGGCAAGGGACTGTCACTGTG  666

Query  580  ACACTACCAGTGGCAGGCAATGTGGTCAATTCAGGAGGGATGGTCATGATGGTTCCTGGGGCTGGCTCTGTGCC  653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACACTACCAGTGGCAGGCAATGTGGTCAATTCAGGAGGGATGGTCATGATGGTTCCTGGGGCTGGCTCTGTGCC  740

Query  654  TGCTATCCAAAGAATCCCTCTACCTGGAGCAGAGATGCTTGAAGAAGAGCCTCTCTACGTGAATGCCAAACAAT  727
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCTATCCAAAGAATCCCTCTACCTGGAGCAGAGATGCTTGAAGAAGAGCCTCTCTACGTGAATGCCAAACAAT  814

Query  728  ACAACCGTATTCTTAAGAGGAGGCAAGCCCGAGCTAAACTAGAGGCAGAAGGGAAAATTCCAAAGGAGAGAAGG  801
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCACCGTATTCTTAAGAGGAGGCAAGCCCGAGCTAAACTAGAGGCAGAAGGGAAAATTCCAAAGGAGAGAAGG  888

Query  802  AAATACCTGCATGAGTCTCGGCACCGTCATGCCATGGCACGGAAGCGTGGTGAAGGTGGACGATTTTTCTCTCC  875
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAATACCTGCATGAGTCTCGGCACCGTCATGCCATGGCACGGAAGCGTGGTGAAGGTGGACGATTTTTCTCTCC  962

Query  876  AAAGGAAAAGGATAGTCCCCATATGCAGGATCCAAACCAAGCCGATGAAGAAGCAATGACACAGATCATCCGAG  949
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAAGGAAAAGGATAGTCCCCATATGCAGGATCCAAACCAAGCCGATGAAGAAGCAATGACACAGATCATCCGAG  1036

Query  950  TGTCC  954
            |||||
Sbjct 1037  TGTCC  1041