Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06668
• Subject: NM_000276.4
• Aligned Length: 2703
• Identities: 2677
• Gaps: 24

Alignment

Query    1  ATGGAGCCGCCGCTCCCGGTCGGAGCCCAGCCGCTTGCCACTGTCGAGGGTATGGAGATGAAGGGTCCTCTCCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCCGCCGCTCCCGGTCGGAGCCCAGCCGCTTGCCACTGTCGAGGGTATGGAGATGAAGGGTCCTCTCCG  74

Query   75  GGAGCCCTGCGCCCTGACCCTAGCCCAGAGGAACGGGCAATATGAGTTAATAATCCAGTTGCATGAGAAGGAAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGCCCTGCGCCCTGACCCTAGCCCAGAGGAACGGGCAATATGAGTTAATAATCCAGTTGCATGAGAAGGAAC  148

Query  149  AGCATGTTCAAGATATCATTCCTATAAATAGCCACTTCAGATGTGTTCAAGAAGCAGAAGAAACTCTTTTGATT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCATGTTCAAGATATCATTCCTATAAATAGCCACTTCAGATGTGTTCAAGAAGCAGAAGAAACTCTTTTGATT  222

Query  223  GACATAGCTTCTAACAGTGGCTGCAAAATTCGGGTTCAGGGGGACTGGATCAGAGAGCGCCGCTTTGAAATCCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACATAGCTTCTAACAGTGGCTGCAAAATTCGGGTTCAGGGGGACTGGATCAGAGAGCGCCGCTTTGAAATCCC  296

Query  297  TGATGAGGAACACTGTTTGAAGTTCCTCTCAGCTGTCCTTGCTGCTCAGAAAGCTCAGTCACAGCTTCTTGTTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGATGAGGAACACTGTTTGAAGTTCCTCTCAGCTGTCCTTGCTGCTCAGAAAGCTCAGTCACAGCTTCTTGTTC  370

Query  371  CAGAGCAAAAGGACTCATCTAGCTGGTACCAGAAATTAGACACTAAGGACAAACCTTCTGTTTTTTCAGGGCTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGAGCAAAAGGACTCATCTAGCTGGTACCAGAAATTAGACACTAAGGACAAACCTTCTGTTTTTTCAGGGCTT  444

Query  445  CTTGGATTTGAAGACAATTTTTCTTCTATGAATTTGGACAAGAAAATAAATTCACAAAATCAGCCTACTGGGAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTGGATTTGAAGACAATTTTTCTTCTATGAATTTGGACAAGAAAATAAATTCACAAAATCAGCCTACTGGGAT  518

Query  519  TCATCGGGAACCCCCACCTCCACCCTTTTCAGTGAATAAAATGCTTCCACGTGAAAAAGAAGCTTCTAACAAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCATCGGGAACCCCCACCTCCACCCTTTTCAGTGAATAAAATGCTTCCACGTGAAAAAGAAGCTTCTAACAAGG  592

Query  593  AGCAGCCCAAAGTGACCAACACCATGCGGAAGCTCTTTGTACCAAATACCCAATCTGGGCAGCGGGAGGGTCTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCAGCCCAAAGTGACCAACACCATGCGGAAGCTCTTTGTACCAAATACCCAATCTGGGCAGCGGGAGGGTCTC  666

Query  667  ATCAAACATATCCTGGCAAAGCGAGAGAAAGAATATGTCAACATTCAGACTTTCAGATTTTTTGTTGGAACTTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCAAACATATCCTGGCAAAGCGAGAGAAAGAATATGTCAACATTCAGACTTTCAGATTTTTTGTTGGAACTTG  740

Query  741  GAATGTGAATGGCCAGTCTCCAGATAGCGGGTTAGAACCTTGGCTGAACTGTGATCCCAATCCTCCTGATATCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAATGTGAATGGCCAGTCTCCAGATAGCGGGTTAGAACCTTGGCTGAACTGTGATCCCAATCCTCCTGATATCT  814

Query  815  ACTGCATTGGATTCCAAGAACTGGACTTGAGCACAGAAGCCTTCTTCTACTTTGAATCTGTGAAGGAACAAGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACTGCATTGGATTCCAAGAACTGGACTTGAGCACAGAAGCCTTCTTCTACTTTGAATCTGTGAAGGAACAAGAA  888

Query  889  TGGTCCATGGCTGTAGAGAGAGGTTTGCATTCCAAAGCCAAGTATAAGAAAGTTCAACTGGTGCGCCTTGTTGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGGTCCATGGCTGTAGAGAGAGGTTTGCATTCCAAAGCCAAGTATAAGAAAGTTCAACTGGTGCGCCTTGTTGG  962

Query  963  GATGATGCTTCTTATATTTGCCAGAAAGGATCAGTGTCGATACATTCGTGATATTGCTACAGAAACAGTTGGAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GATGATGCTTCTTATATTTGCCAGAAAGGATCAGTGTCGATACATTCGTGATATTGCTACAGAAACAGTTGGAA  1036

Query 1037  CTGGAATCATGGGGAAAATGGGAAACAAAGGTGGGGTAGCTGTGAGATTTGTATTTCACAACACCACCTTTTGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGGAATCATGGGGAAAATGGGAAACAAAGGTGGGGTAGCTGTGAGATTTGTATTTCACAACACCACCTTTTGC  1110

Query 1111  ATTGTCAATTCCCATCTGGCTGCACACGTGGAGGACTTTGAGAGAAGGAATCAAGATTATAAGGACATTTGTGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATTGTCAATTCCCATCTGGCTGCACACGTGGAGGACTTTGAGAGAAGGAATCAAGATTATAAGGACATTTGTGC  1184

Query 1185  GAGAATGAGTTTTGTGGTCCCAAATCAGACCCTCCCGCAGTTGAACATCATGAAACATGAGGTTGTCATTTGGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAGAATGAGTTTTGTGGTCCCAAATCAGACCCTCCCGCAGTTGAACATCATGAAACATGAGGTTGTCATTTGGT  1258

Query 1259  TGGGAGATTTGAATTATAGACTTGGCATGCCTGATGCCAATGAGGTGAAAAGTCTTATTAATAAGAAAGACCTT  1332
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGGAGATTTGAATTATAGACTTTGCATGCCTGATGCCAATGAGGTGAAAAGTCTTATTAATAAGAAAGACCTT  1332

Query 1333  CAGAGACTCTTGAAATTCGACCAGCTAAATATTCAGCGCACACAGAAAAAAGCTTTTGTTGACTTCAATGAAGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGAGACTCTTGAAATTCGACCAGCTAAATATTCAGCGCACACAGAAAAAAGCTTTTGTTGACTTCAATGAAGG  1406

Query 1407  GGAAATCAAGTTCATCCCCACTTATAAGTATGACTCTAAAACAGACCGGTGGGATTCCAGTGGGAAATGCCGGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGAAATCAAGTTCATCCCCACTTATAAGTATGACTCTAAAACAGACCGGTGGGATTCCAGTGGGAAATGCCGGG  1480

Query 1481  TTCCAGCCTGGTGTGACCGAATTCTTTGGAGAGGAACAAATGTTAATCAGCTTAATTATCGGAGTCACATGGAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTCCAGCCTGGTGTGACCGAATTCTTTGGAGAGGAACAAATGTTAATCAGCTTAATTATCGGAGTCACATGGAA  1554

Query 1555  CTGAAAACCAGCGACCACAAGCCTGTTAGCGCCCTCTTCCATATTGGGGTGAAGGTTGTGGATGAACGAAGGTA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGAAAACCAGCGACCACAAGCCTGTTAGCGCCCTCTTCCATATTGGGGTGAAGGTTGTGGATGAACGAAGGTA  1628

Query 1629  CCGGAAAGTCTTTGAAGATAGTGTACGCATCATGGACAGAATGGAAAATGACTTCCTTCCTTCCTTAGAACTCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCGGAAAGTCTTTGAAGATAGTGTACGCATCATGGACAGAATGGAAAATGACTTCCTTCCTTCCTTAGAACTCA  1702

Query 1703  GCAGGAGGGAGTTTGTGTTTGAAAATGTGAAGTTTCGGCAACTACAAAAGGAGAAGTTCCAGATCAGCAACAAT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCAGGAGGGAGTTTGTGTTTGAAAATGTGAAGTTTCGGCAACTACAAAAGGAGAAGTTCCAGATCAGCAACAAT  1776

Query 1777  GGACAGGTTCCCTGCCATTTTTCTTTCATCCCTAAACTTAATGACAGCCAGTACTGCAAGCCATGGCTTCGGGC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GGACAGGTTCCCTGCCATTTTTCTTTCATCCCTAAACTTAATGACAGCCAGTACTGCAAGCCATGGCTTCGGGC  1850

Query 1851  TGAACCTTTTGAGGGCTACTTGGAGCCAAATGAGACAGTGGACATTTCTCTTGATGTGTATGTCAGCAAAGACT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGAACCTTTTGAGGGCTACTTGGAGCCAAATGAGACAGTGGACATTTCTCTTGATGTGTATGTCAGCAAAGACT  1924

Query 1925  CTGTAACCATCCTGAACTCGGGAGAAGATAAGATTGAAGATATTCTCGTCCTTCACCTGGATCGAGGCAAAGAT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTGTAACCATCCTGAACTCGGGAGAAGATAAGATTGAAGATATTCTCGTCCTTCACCTGGATCGAGGCAAAGAT  1998

Query 1999  TACTTCTTGACTATCAGTGGAAATTACCTCCCAAGTTGTTTTGGCACATCCTTAGAGGCTCTGTGCCGTATGAA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TACTTCTTGACTATCAGTGGAAATTACCTCCCAAGTTGTTTTGGCACATCCTTAGAGGCTCTGTGCCGTATGAA  2072

Query 2073  AAGACCAATCCGAGAAGTTCCTGTTACCAAACTCATAGACTT------------------------GGAGAAAT  2122
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                        ||||||||
Sbjct 2073  AAGACCAATCCGAGAAGTTCCTGTTACCAAACTCATAGACTTGGAAGAAGACAGCTTCCTAGAAAAGGAGAAAT  2146

Query 2123  CCCTTCTGCAAATGGTTCCTTTGGATGAAGGTGCCAGTGAGAGGCCCCTTCAGGTTCCCAAGGAGATCTGGCTT  2196
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CCCTTCTGCAAATGGTTCCTTTGGATGAAGGTGCCAGTGAGAGACCCCTTCAGGTTCCCAAGGAGATCTGGCTT  2220

Query 2197  CTAGTAGATCACCTATTCAAATACGCCTGTCACCAGGAGGACCTGTTCCAGACCCCTGGAATGCAGGAAGAGCT  2270
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTAGTAGATCACCTATTCAAATACGCCTGTCACCAGGAGGACCTGTTCCAGACCCCTGGAATGCAGGAAGAGCT  2294

Query 2271  CCAGCAGATCATTGATTGTCTGGATACCAGCATTCCTGAGACAATCCCTGGCAGCAACCACTCTGTGGCTGAAG  2344
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCAGCAGATCATTGATTGTCTGGATACCAGCATTCCTGAGACAATCCCTGGCAGCAACCACTCTGTGGCTGAAG  2368

Query 2345  CACTGCTCATTTTCTTGGAAGCCCTGCCAGAGCCAGTCATCTGTTACGAGCTGTATCAGCGATGTCTTGACTCT  2418
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CACTGCTCATTTTCTTGGAAGCCCTGCCAGAGCCAGTCATCTGTTACGAGCTGTATCAGCGATGTCTTGACTCT  2442

Query 2419  GCTTATGATCCCCGGATCTGCCGACAGGTGATCTCCCAGCTTCCGAGATGCCATAGAAATGTTTTCCGTTACTT  2492
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GCTTATGATCCCCGGATCTGCCGACAGGTGATCTCCCAGCTTCCGAGATGCCATAGAAATGTTTTCCGTTACTT  2516

Query 2493  GATGGCATTCCTTCGAGAACTCTTAAAATTCTCTGAATACAATAGCGTCAATGCCAACATGATCGCTACTCTCT  2566
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GATGGCATTCCTTCGAGAACTCTTAAAATTCTCTGAATACAATAGCGTCAATGCCAACATGATCGCTACTCTCT  2590

Query 2567  TCACTAGTCTTCTCCTGAGGCCTCCACCCAACCTTATGGCAAGACAGACTCCAAGTGACCGCCAGCGTGCTATT  2640
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TCACTAGTCTTCTCCTGAGGCCTCCACCCAACCTTATGGCAAGACAGACTCCAAGTGACCGCCAGCGTGCTATT  2664

Query 2641  CAGTTCCTTCTGGGCTTTCTGCTTGGGAGCGAAGAAGAC  2679
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CAGTTCCTTCTGGGCTTTCTGCTTGGGAGCGAAGAAGAC  2703