Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06668
- Subject:
- NM_177215.3
- Aligned Length:
- 2704
- Identities:
- 2374
- Gaps:
- 29
Alignment
Query 1 ATGGAGCCGCCGCTCCCGGTCGGAGCCCAGCCGCTTGCCACTGTCGAGGGTATGGAGATGAAGGGTCCTCTCCG 74
||||||||||.|||||||.|.|||||.|||||.||.||.|..||.|.||||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGGAGCCGCGGCTCCCGATTGGAGCTCAGCCCCTGGCAATGGTGGCGGGTTTGGAGATGAAGGGTCCCCTCCG 74
Query 75 GGAGCCCTGCGCCCTGACCCTAGCCCAGAGGAACGGGCAATATGAGTTAATAATCCAGTTGCATGAGAAGGAAC 148
|||.|||||||.||||||||||||||.||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||..|||||||
Sbjct 75 GGAACCCTGCGTCCTGACCCTAGCCCGGAGGAATGGGCAGTATGAGTTAATAATCCAGTTGCATGGAAAGGAAC 148
Query 149 AGCATGTTCAAGATATCATTCCTATAAATAGCCACTTCAGATGTGTTCAAGAAGCAGAAGAAACTCTTTTGATT 222
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AACATGTTCAAGATATCATTCCTATAAATAGCCACTTCAGATGTGTTCAAGAAGCAGAAGAAACTCTTTTGATT 222
Query 223 GACATAGCTTCTAACAGTGGCTGCAAAATTCGGGTTCAGGGGGACTGGATCAGAGAGCGCCGCTTTGAAATCCC 296
||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||.|||||||||||.|||||||||.||
Sbjct 223 GATATTGCTTCAAACAGTGGCTGCAAAATTCGGGTACAGGGAGACTGGACCAGAGAGCGCCACTTTGAAATTCC 296
Query 297 TGATGAGGAACACTGTTTGAAGTTCCTCTCAGCTGTCCTTGCTGCTCAGAAAGCTCAGTCACAGCTTCTTGTTC 370
||||||.||||.||||||||||||||||||||..|||||.|..||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGATGAAGAACGCTGTTTGAAGTTCCTCTCAGAGGTCCTCGAAGCTCAGGAAGCTCAGTCACAGCTTCTTGTTC 370
Query 371 CAGAGCAAAAGGACTCATCTAGCTGGTACCAGAAATTAGACACTAAGGACAAACCTTCTGTTTTTTCAGGGCTT 444
||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||| |||.||.|||||||||.
Sbjct 371 CAGAACAAAAAGACTCATCTAGCTGGTACCAGAAATTAGACACTATGGATAAAC---CTGCTTATTCAGGGCTG 441
Query 445 CTTGGATTTGAAGACAATTTTTCTTCTATGAATTTGGACAAGAAAATAAATTCACAAAATCAGCCTA-CTGGGA 517
|||||||||||.||.||||||||.|||.||.||||.||.||||||||.|||.||||||||| .||.| |.||||
Sbjct 442 CTTGGATTTGAGGATAATTTTTCATCTCTGGATTTAGATAAGAAAATGAATACACAAAATC-CCCGATCAGGGA 514
Query 518 TTCATCGGGAACCCCCACCTCCACCCTTTTCAGTGAATAAAATGCTTCCACGTGAAAAAGAAGCTTCTAACAAG 591
.||||||||||||.||.||||||||.|.||||..||.||.|||||||.|.||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 515 GTCATCGGGAACCACCCCCTCCACCTTCTTCATCGACTAGAATGCTTTCGCGTGAAAAGGAAGCTTCAAACAAA 588
Query 592 GAGCAGCCCAAAGTGACCAACACCATGCGGAAGCTCTTTGTACCAAATACCCAATCTGGGCAGCGGGAGGGTCT 665
||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||.|.||||||||.||||||||
Sbjct 589 GAACAGCCCAAAGTGACCAATACCATGCGGAAGCTATTTGTCCCGAACACCCAAACCGGGCAGCGAGAGGGTCT 662
Query 666 CATCAAACATATCCTGGCAAAGCGAGAGAAAGAATATGTCAACATTCAGACTTTCAGATTTTTTGTTGGAACTT 739
|||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||||||||||||||||
Sbjct 663 CATTAAACATATCCTCACAAAGCGAGAGAAAGAATATGTCAACATCCAGTCTTTCAGGTTTTTTGTTGGAACTT 736
Query 740 GGAATGTGAATGGCCAGTCTCCAGATAGCGGGTTAGAACCTTGGCTGAACTGTGATCCCAATCCTCCTGATATC 813
||||||||||.||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 737 GGAATGTGAACGGCCAGTCTCCAGACAGCAGCTTAGAACCTTGGCTCGACTGTGATCCAAATCCTCCTGATATT 810
Query 814 TACTGCATTGGATTCCAAGAACTGGACTTGAGCACAGAAGCCTTCTTCTACTTTGAATCTGTGAAGGAACAAGA 887
||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct 811 TACTGCATTGGATTCCAAGAGCTGGACTTGAGCACCGAAGCCTTTTTCTACTTCGAGTCTGTGAAAGAGCAAGA 884
Query 888 ATGGTCCATGGCTGTAGAGAGAGGTTTGCATTCCAAAGCCAAGTATAAGAAAGTTCAACTGGTGCGCCTTGTTG 961
.||||||.|||||||.||.||.||..|||.|||.||.||||||||||..||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 885 GTGGTCCTTGGCTGTGGAAAGGGGGCTGCCTTCGAAGGCCAAGTATAGAAAAGTTCAACTGGTCCGCCTTGTGG 958
Query 962 GGATGATGCTTCTTATATTTGCCAGAAAGGATCAGTGTCGATACATTCGTGATATTGCTACAGAAACAGTTGGA 1035
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||.||.|||.||||||||||||||..||||
Sbjct 959 GGATGATGCTTCTTATATTTGCCAGAAAAGATCAGTGTCAATACATCCGAGATGTTGCTACAGAAACAACTGGA 1032
Query 1036 ACTGGAATCATGGGGAAAATGGGAAACAAAGGTGGGGTAGCTGTGAGATTTGTATTTCACAACACCACCTTTTG 1109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 1033 ACTGGAATCATGGGGAAAATGGGAAACAAAGGTGGGGTAGCTGTAAGATTTGTATTCCACAACACCACTTTCTG 1106
Query 1110 CATTGTCAATTCCCATCTGGCTGCACACGTGGAGGACTTTGAGAGAAGGAATCAAGATTATAAGGACATTTGTG 1183
||||||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.||.||..||||||||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 1107 CATTGTCAATTCGCACCTGGCCGCCCACGTGGAAGAGTTCGAACGAAGGAATCAGGATTATAAAGACATCTGTG 1180
Query 1184 CGAGAATGAGTTTTGTGGTCCCAAATCAGACCCTCCCGCAGTTGAACATCATGAAACATGAGGTTGTCATTTGG 1257
|.|||||||.||||...|||||.||||||||..|||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1181 CAAGAATGACTTTTTCAGTCCCCAATCAGACTGTCCCGCAAGTGAACATCATGAAGCATGATGTTGTCATTTGG 1254
Query 1258 TTGGGAGATTTGAATTATAGACTTGGCATGCCTGATGCCAATGAGGTGAAAAGTCTTATTAATAAGAAAGACCT 1331
.|||||||.|||||.||.||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1255 CTGGGAGACTTGAACTACAGACTTTGCATGCCTGATGCCAGTGAGGTGAAAAGTCTTATTAATAAAAATGAGCT 1328
Query 1332 TCAGAGACTCTTGAAATTCGACCAGCTAAATATTCAGCGCACACAGAAAAAAGCTTTTGTTGACTTCAATGAAG 1405
|||.|..||.||||||||.||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||..||.||||||||||
Sbjct 1329 TCATAAGCTGTTGAAATTTGACCAGTTAAACATTCAGCGCACACAGAAAAAAGCTTTTGCGGATTTCAATGAAG 1402
Query 1406 GGGAAATCAAGTTCATCCCCACTTATAAGTATGACTCTAAAACAGACCGGTGGGATTCCAGTGGGAAATGCCGG 1479
|||||||.||.|||.|.|||||.||.||.|||||.||.|||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1403 GGGAAATTAATTTCGTTCCCACGTACAAATATGATTCGAAAACTGACAGATGGGATTCCAGTGGGAAATGCCGA 1476
Query 1480 GTTCCAGCCTGGTGTGACCGAATTCTTTGGAGAGGAACAAATGTTAATCAGCTTAATTATCGGAGTCACATGGA 1553
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||
Sbjct 1477 GTTCCCGCCTGGTGTGACCGAATTCTTTGGAGAGGAATAAATGTTAATCAACTTCATTACCGGAGTCACATGGA 1550
Query 1554 ACTGAAAACCAGCGACCACAAGCCTGTTAGCGCCCTCTTCCATATTGGGGTGAAGGTTGTGGATGAACGAAGGT 1627
|||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1551 ACTCAAAACTAGTGACCACAAACCTGTTAGCGCCCTGTTCCATATTGGGGTGAAGGTTGTGGATGAGCGGAGGT 1624
Query 1628 ACCGGAAAGTCTTTGAAGATAGTGTACGCATCATGGACAGAATGGAAAATGACTTCCTTCCTTCCTTAGAACTC 1701
|.|||||.|||||||||||||..||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1625 ATCGGAAGGTCTTTGAAGATATCGTCCGCATTATGGACAGAATGGAAAACGACTTCCTTCCTTCATTAGAACTT 1698
Query 1702 AGCAGGAGGGAGTTTGTGTTTGAAAATGTGAAGTTTCGGCAACTACAAAAGGAGAAGTTCCAGATCAGCAACAA 1775
||||||||.||||||.|.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699 AGCAGGAGAGAGTTTTTTTTTGAGAATGTGAAGTTTCGGCAGCTGCAAAAGGAGAAGTTCCAGATCAGCAACAA 1772
Query 1776 TGGACAGGTTCCCTGCCATTTTTCTTTCATCCCTAAACTTAATGACAGCCAGTACTGCAAGCCATGGCTTCGGG 1849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1773 TGGACAGGTTCCCTGCCATTTTTCTTTCATCCCTAAGCTTAATGACAGCCAATACTGCAAGCCATGGCTTCGAG 1846
Query 1850 CTGAACCTTTTGAGGGCTACTTGGAGCCAAATGAGACAGTGGACATTTCTCTTGATGTGTATGTCAGCAAAGAC 1923
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1847 CTGAACCTTTTGAGGGCTACTTGGAGCCAAACGAGACCTTAGACATCTCCCTTGATGTATACGTCAGCAAAGAC 1920
Query 1924 TCTGTAACCATCCTGAACTCGGGAGAAGATAAGATTGAAGATATTCTCGTCCTTCACCTGGATCGAGGCAAAGA 1997
||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||..||||||||||||||||
Sbjct 1921 TCTGTAACCATCCTGAACTCCGGTGAAGATAAGATTGAAGATATTCTTGTCCTCCATTTGGATCGAGGCAAAGA 1994
Query 1998 TTACTTCTTGACTATCAGTGGAAATTACCTCCCAAGTTGTTTTGGCACATCCTTAGAGGCTCTGTGCCGTATGA 2071
||||||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||.|||||||.||||
Sbjct 1995 TTACTTCTTGACCATCGGTGGGAATTACCTCCCAAGTTGCTTTGGAACCTCATTGGAGGCTTTGTGCCGAATGA 2068
Query 2072 AAAGACCAATCCGAGAAGTTCCTGTTACCAAACTCATAGACTT------------------------GGAGAAA 2121
||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.| |||||||
Sbjct 2069 AAAGACCAATTCGAGAAGTTCCTGTCACCAAACTCATAGACCTGGAAGAAGACAGCTACCTAGAAAAGGAGAAA 2142
Query 2122 TCCCTTCTGCAAATGGTTCCTTTGGATGAAGGTGCCAGTGAGAGGCCCCTTCAGGTTCCCAAGGAGATCTGGCT 2195
|||||||||||.|||||.||.||||||||||||.||||||||.|.||||||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 2143 TCCCTTCTGCAGATGGTACCCTTGGATGAAGGTACCAGTGAGCGACCCCTTCAAGTCCCCAAAGAGATCTGGCT 2216
Query 2196 TCTAGTAGATCACCTATTCAAATACGCCTGTCACCAGGAGGACCTGTTCCAGACCCCTGGAATGCAGGAAGAGC 2269
|||||||||||||.|.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||.|||.
Sbjct 2217 TCTAGTAGATCACTTGTTCAAATATGCATGTCACCAGGAGGACTTGTTCCAAACCCCTGGAATGCAGGAGGAGT 2290
Query 2270 TCCAGCAGATCATTGATTGTCTGGATACCAGCATTCCTGAGACAATCCCTGGCAGCAACCACTCTGTGGCTGAA 2343
|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||..|||||.||||||||||||
Sbjct 2291 TACAGCAGATCATTGATTGCCTGGATACCAGCATTCCTGAGACAATTCCTGGCAATAACCATTCTGTGGCTGAA 2364
Query 2344 GCACTGCTCATTTTCTTGGAAGCCCTGCCAGAGCCAGTCATCTGTTACGAGCTGTATCAGCGATGTCTTGACTC 2417
|||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2365 GCACTGCTCATTTTCCTGGAAGCTCTGCCAGAGCCAGTCATCTGTTATGAGCTGTATCAGCGATGTCTTGACTC 2438
Query 2418 TGCTTATGATCCCCGGATCTGCCGACAGGTGATCTCCCAGCTTCCGAGATGCCATAGAAATGTTTTCCGTTACT 2491
||||.|||||||.|||||||||..||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2439 TGCTCATGATCCTCGGATCTGCAAACAGGTCATTTCCCAGCTTCCAAGGTGCCATAGAAATGTTTTCCGCTACT 2512
Query 2492 TGATGGCATTCCTTCGAGAACTCTTAAAATTCTCTGAATACAATAGCGTCAATGCCAACATGATCGCTACTCTC 2565
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|...||||..||||||||||.|||||.||.
Sbjct 2513 TGATGGCATTCCTTCGTGAACTCTTAAAATTCTCTGACTACAACAATATCAACACCAACATGATTGCTACCCTG 2586
Query 2566 TTCACTAGTCTTCTCCTGAGGCCTCCACCCAACCTTATGGCAAGACAGACTCCAAGTGACCGCCAGCGTGCTAT 2639
||||.|||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||.|||||||||||.|||.||
Sbjct 2587 TTCAGTAGCCTTCTCCTAAGACCTCCACCAAACCTCATGACAAGACAGACTCCAAATGACCGCCAGCATGCCAT 2660
Query 2640 TCAGTTCCTTCTGGGCTTTCTGCTTGGGAGCGAAGAAGAC 2679
.||||||||..|||.|||.||||||||||.|||.||||||
Sbjct 2661 CCAGTTCCTCTTGGTCTTCCTGCTTGGGAACGAGGAAGAC 2700