Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06696
• Subject: NM_000439.5
• Aligned Length: 2259
• Identities: 2257
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGCGAAGAGCCTGGAGTCTGCAGTGCACTGCTTTCGTCCTCTTTTGCGCTTGGTGTGCACTGAACAGTGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCGAAGAGCCTGGAGTCTGCAGTGCACTGCTTTCGTCCTCTTTTGCGCTTGGTGTGCACTGAACAGTGC  74

Query   75  AAAAGCGAAAAGGCAATTTGTCAATGAATGGGCAGCGGAGATCCCCGGGGGCCCGGAAGCAGCCTCGGCCATCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAAAGCGAAAAGGCAATTTGTCAATGAATGGGCAGCGGAGATCCCCGGGGGCCCGGAAGCAGCCTCGGCCATCG  148

Query  149  CCGAGGAGCTGGGCTATGACCTTTTGGGTCAGATTGGTTCACTTGAAAATCACTACTTATTCAAACATAAAAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCGAGGAGCTGGGCTATGACCTTTTGGGTCAGATTGGTTCACTTGAAAATCACTACTTATTCAAACATAAAAAC  222

Query  223  CACCCCAGAAGGTCTCGAAGGAGTGCCTTTCATATCACTAAGAGATTATCTGATGATGATCGTGTGATATGGGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CACCCCAGAAGGTCTCGAAGGAGTGCCTTTCATATCACTAAGAGATTATCTGATGATGATCGTGTGATATGGGC  296

Query  297  TGAACAACAGTATGAAAAAGAAAGAAGTAAACGTTCAGCTCTAAGGGACTCAGCACTAAATCTCTTCAATGATC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAACAACAGTATGAAAAAGAAAGAAGTAAACGTTCAGCTCTAAGGGACTCAGCACTAAATCTCTTCAATGATC  370

Query  371  CCATGTGGAATCAGCAATGGTACTTGCAAGATACCAGGATGACGGCAGCCCTGCCCAAGCTGGACCTTCATGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCATGTGGAATCAGCAATGGTACTTGCAAGATACCAGGATGACGGCAGCCCTGCCCAAGCTGGACCTTCATGTG  444

Query  445  ATACCTGTTTGGCAAAAAGGCATTACGGGCAAAGGAGTTGTTATCACCGTACTGGATGATGGTTTGGAGTGGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATACCTGTTTGGCAAAAAGGCATTACGGGCAAAGGAGTTGTTATCACCGTACTGGATGATGGTTTGGAGTGGAA  518

Query  519  TCACACGGACATTTATGCCAACTATGATCCAGAGGCTAGCTATGATTTTAATGATAATGACCATGATCCATTTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCACACGGACATTTATGCCAACTATGATCCAGAGGCTAGCTATGATTTTAATGATAATGACCATGATCCATTTC  592

Query  593  CCCGATATGATCCCACAAACGAGAACAAACACGGGACCAGATGTGCAGGAGAAATTGCCATGCAAGCAAATAAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCGATATGATCCCACAAACGAGAACAAACACGGGACCAGATGTGCAGGAGAAATTGCCATGCAAGCAAATAAT  666

Query  667  CACAAATGCGGGGTTGGAGTTGCATACAATTCCAAAGTTGGAGGCATAAGAATGCTGGATGGCATTGTGACGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CACAAATGCGGGGTTGGAGTTGCATACAATTCCAAAGTTGGAGGCATAAGAATGCTGGATGGCATTGTGACGGA  740

Query  741  TGCTATTGAGGCCAGTTCAATTGGATTCAATCCTGGACACGTGGATATTTACAGTGCAAGCTGGGGCCCTAATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCTATTGAGGCCAGTTCAATTGGATTCAATCCTGGACACGTGGATATTTACAGTGCAAGCTGGGGCCCTAATG  814

Query  815  ATGATGGGAAAACTGTGGAGGGGCCTGGCCGGCTAGCCCAGAAGGCTTTTGAATATGGTGTCAAACAGGGGAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGATGGGAAAACTGTGGAGGGGCCTGGCCGGCTAGCCCAGAAGGCTTTTGAATATGGTGTCAAACAGGGGAGA  888

Query  889  CAGGGGAAGGGGTCCATCTTCGTCTGGGCTTCGGGAAACGGGGGGCGTCAGGGAGATAATTGTGACTGTGATGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGGGGAAGGGGTCCATCTTCGTCTGGGCTTCGGGAAACGGGGGGCGTCAGGGAGATAATTGTGACTGTGATGG  962

Query  963  CTACACAGACAGCATCTACACCATCTCCATCAGCAGTGCCTCCCAGCAAGGCCTATCCCCCTGGTACGCTGAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTACACAGACAGCATCTACACCATCTCCATCAGCAGTGCCTCCCAGCAAGGCCTATCCCCCTGGTACGCTGAGA  1036

Query 1037  AGTGCTCCTCCACACTGGCCACCTCTTACAGCAGCGGAGATTACACCGACCAGAGAATCACGAGCGCTGACCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGTGCTCCTCCACACTGGCCACCTCTTACAGCAGCGGAGATTACACCGACCAGAGAATCACGAGCGCTGACCTG  1110

Query 1111  CACAATGACTGCACGGAGACGCACACAGGCACCTCGGCCTCTGCACCTCTGGCTGCTGGCATCTTCGCTCTGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CACAATGACTGCACGGAGACGCACACAGGCACCTCGGCCTCTGCACCTCTGGCTGCTGGCATCTTCGCTCTGGC  1184

Query 1185  CCTGGAAGCAAACCCAAATCTCACCTGGCGAGATATGCAGCACCTGGTTGTCTGGACCTCTGAGTATGACCCGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTGGAAGCAAACCCAAATCTCACCTGGCGAGATATGCAGCACCTGGTTGTCTGGACCTCTGAGTATGACCCGC  1258

Query 1259  TGGCCAATAACCCTGGATGGAAAAAGAATGGAGCAGGCTTGATGGTGAATAGTCGATTTGGATTTGGCTTGCTA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGCCAATAACCCTGGATGGAAAAAGAATGGAGCAGGCTTGATGGTGAATAGTCGATTTGGATTTGGCTTGCTA  1332

Query 1333  AATGCCAAAGCTCTGGTGGATTTAGCTGACCCCAGGACCTGGAGGAGCGTGCCTGAGAAGAAAGAGTGTGTTGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AATGCCAAAGCTCTGGTGGATTTAGCTGACCCCAGGACCTGGAGGAGCGTGCCTGAGAAGAAAGAGTGTGTTGT  1406

Query 1407  AAAGGACAATGACTTTGAGCCCAGAGCCCTGAAAGCTAATGGAGAAGTTATCATTGAAATTCCAACAAGAGCTT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AAAGGACAATGACTTTGAGCCCAGAGCCCTGAAAGCTAATGGAGAAGTTATCATTGAAATTCCAACAAGAGCTT  1480

Query 1481  GTGAAGGACAAGAAAATGCTATCAAGTCCCTGGAGCATGTACAATTTGAAGCAACAATTGAATATTCCCGAAGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTGAAGGACAAGAAAATGCTATCAAGTCCCTGGAGCATGTACAATTTGAAGCAACAATTGAATATTCCCGAAGA  1554

Query 1555  GGAGACCTTCATGTCACACTTACTTCTGCTGCTGGAACTAGCACTGTGCTCTTGGCTGAAAGAGAACGGGATAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGAGACCTTCATGTCACACTTACTTCTGCTGCTGGAACTAGCACTGTGCTCTTGGCTGAAAGAGAACGGGATAC  1628

Query 1629  ATCTCCTAATGGCTTTAAGAATTGGGACTTCATGTCTGTTCACACATGGGGAGAGAACCCTATAGGTACTTGGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ATCTCCTAATGGCTTTAAGAATTGGGACTTCATGTCTGTTCACACATGGGGAGAGAACCCTATAGGTACTTGGA  1702

Query 1703  CTTTGAGAATTACAGACATGTCTGGAAGAATTCAAAATGAAGGAAGAATTGTGAACTGGAAGCTGATTTTGCAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTTTGAGAATTACAGACATGTCTGGAAGAATTCAAAATGAAGGAAGAATTGTGAACTGGAAGCTGATTTTGCAC  1776

Query 1777  GGGACCTCTTCTCAGCCAGAGCATATGAAGCAGCCTCGTGTGTACACGTCCTACAACACTGTTCAGAATGACAG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GGGACCTCTTCTCAGCCAGAGCATATGAAGCAGCCTCGTGTGTACACGTCCTACAACACTGTTCAGAATGACAG  1850

Query 1851  AAGAGGGGTGGAGAAGATGGTGGATCCAGGGGAGGAGCAGCCCACACAAGAGAACCCTAAGGAGAACACCCTGG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AAGAGGGGTGGAGAAGATGGTGGATCCAGGGGAGGAGCAGCCCACACAAGAGAACCCTAAGGAGAACACCCTGG  1924

Query 1925  TGTCCAAAAGCCCCAGCAGCAGCAGCGTAGGGGGCCGGAGGGATGAGTTGGAGGAGGGAGCCCCTTCCGAGGCC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1925  TGTCCAAAAGCCCCAGCAGCAGCAGCGTAGGGGGCCGGAGGGATGAGTTGGAGGAGGGAGCCCCTTCCCAGGCC  1998

Query 1999  ATGCTGCGACTCCTGCAAAGTGCTTTCAGTAAAAACTCACCGCCAAAGCAATCACCAAAGAAGTCCCCAACTGC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1999  ATGCTGCGACTCCTGCAAAGTGCTTTCAGTAAAAACTCACCGCCAAAGCAATCACCAAAGAAGTCCCCAAGTGC  2072

Query 2073  AAAGCTCAACATCCCTTATGAAAACTTCTACGAAGCCCTGGAAAAGCTGAACAAACCTTCCCAGCTTAAAGACT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AAAGCTCAACATCCCTTATGAAAACTTCTACGAAGCCCTGGAAAAGCTGAACAAACCTTCCCAGCTTAAAGACT  2146

Query 2147  CTGAAGACAGTCTGTATAATGACTATGTTGATGTTTTTTATAACACTAAACCTTACAAGCACAGAGACGACCGG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CTGAAGACAGTCTGTATAATGACTATGTTGATGTTTTTTATAACACTAAACCTTACAAGCACAGAGACGACCGG  2220

Query 2221  CTGCTTCAAGCTCTGGTGGACATTCTGAATGAGGAAAAT  2259
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTGCTTCAAGCTCTGGTGGACATTCTGAATGAGGAAAAT  2259