Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06698
• Subject: NM_011049.5
• Aligned Length: 1488
• Identities: 1366
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGATCGGATGAAGAAGATCAAACGGCAGCTGTCAATGACACTCCGAGGTGGCCGAGGCATAGACAAGACCAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGATCGGATGAAGAAGATCAAACGGCAGCTGTCAATGACACTCCGAGGGGGCCGAGGCATAGATAAGACCAA  74

Query   75  TGGTGCCCCTGAGCAGATAGGCCTGGATGAGAGTGGTGGTGGTGGCGGCAGTGACCCTGGAGAGGCCCCCACAC  148
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||.||||||.||.|||||.|
Sbjct   75  TGGTGTCCCTGAGCAGATAGGCCTGGATGAGAGTGGTGGCGGTGGTGGCAGTGACCTTGGAGAAGCTCCCACCC  148

Query  149  GTGCTGCTCCTGGGGAACTTCGTTCTGCACGGGGCCCACTCAGCTCTGCACCAGAGATTGTGCACGAGGACTTG  222
            ||..|||.||||||||.|||||.||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  149  GTATTGCCCCTGGGGAGCTTCGCTCTGTTCGGGGCCCACTCAGCTCTGCACCAGAGATTGTGCACGAGGACATG  222

Query  223  AAGATGGGGTCTGATGGGGAGAGTGACCAGGCTTCAGCCACGTCCTCGGATGAGGTGCAGTCTCCAGTGAGAGT  296
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGATGGGATCTGATGGGGAGAGTGACCAGGCTTCAGCCACATCCTCAGATGAGGTGCAGTCTCCAGTGAGAGT  296

Query  297  GCGTATGCGCAACCATCCCCCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAGCGCCTATCACTACCAGCTGACA  370
            |||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  GCGCATGCGCAACCACCCCCCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAACGCCTGTCACTACCAGCTGACA  370

Query  371  TCCGGCTGCCTGAGGGCTACCTGGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGACAAGCCCCTCAGCCGCCGC  444
            |.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct  371  TACGGCTGCCTGAGGGCTACCTTGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGATAAGCCTCTTAGCCGGCGC  444

Query  445  CTCCGTCGTGTCAGCCTATCTGAGATTGGCTTTGGGAAACTGGAGACCTACATTAAGCTGGACAAACTGGGCGA  518
            |||||.||.|||||..|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct  445  CTCCGCCGAGTCAGTTTGTCTGAGATTGGCTTTGGAAAACTGGAGACCTACATCAAGCTAGACAAGCTGGGTGA  518

Query  519  GGGTACCTATGCCACCGTCTACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTGGCACTCAAGGAGATCAGAC  592
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  519  GGGTACCTATGCCACTGTCTACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTAGCACTTAAGGAGATCAGAC  592

Query  593  TGGAACATGAAGAGGGGGCACCCTGCACCGCCATCCGGGAAGTGTCCCTACTCAAGGACCTCAAACACGCCAAC  666
            |||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct  593  TGGAACACGAAGAAGGGGCACCCTGTACTGCTATCCGGGAAGTATCCCTGCTTAAGGACCTCAAGCATGCCAAC  666

Query  667  ATCGTTACGCTACATGACATTATCCACACGGAGAAGTCCCTCACCCTTGTCTTTGAGTACCTGGACAAGGACCT  740
            |||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct  667  ATCGTCACACTACATGACATTATCCACACAGAGAAGTCCCTCACACTTGTCTTTGAATACTTGGACAAGGACCT  740

Query  741  GAAGCAGTACCTGGATGACTGTGGGAACATCATCAACATGCACAACGTGAAACTGTTCCTGTTCCAGCTGCTCC  814
            ||||||||||||||||||||||||.||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  741  GAAGCAGTACCTGGATGACTGTGGAAATGTCATCAACATGCACAATGTGAAACTGTTCCTGTTCCAGTTGCTCC  814

Query  815  GTGGCCTGGCCTACTGCCACCGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAGAACCTGCTCATCAACGAG  888
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  815  GTGGCCTGGCCTACTGCCACAGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAGAACCTACTCATCAACGAG  888

Query  889  AGGGGAGAGCTCAAGCTGGCTGACTTTGGCCTGGCCCGAGCCAAGTCAATCCCAACAAAGACATACTCCAATGA  962
            ||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||
Sbjct  889  AGGGGAGAGCTCAAACTGGCAGATTTTGGCCTGGCTCGTGCCAAGTCAATTCCTACTAAAACATACTCCAACGA  962

Query  963  GGTGGTGACACTGTGGTACCGGCCCCCTGACATCCTGCTTGGGTCCACGGACTACTCCACTCAGATTGACATGT  1036
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct  963  AGTGGTGACACTGTGGTACCGGCCCCCTGACATCCTACTTGGGTCCACAGACTACTCTACCCAAATTGACATGT  1036

Query 1037  GGGGTGTGGGCTGCATCTTCTATGAGATGGCCACAGGCCGTCCCCTCTTTCCGGGCTCCACGGTGGAGGAACAG  1110
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1037  GGGGTGTAGGCTGCATCTTCTATGAGATGGCCACCGGCCGGCCCCTCTTCCCAGGCTCCACAGTGGAAGAACAG  1110

Query 1111  CTACACTTCATCTTCCGTATCTTAGGAACCCCAACTGAGGAGACGTGGCCAGGCATCCTGTCCAACGAGGAGTT  1184
            ||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1111  CTGCACTTCATCTTCCGCATTTTGGGAACCCCAACTGAGGAGACATGGCCAGGTATCCTGTCCAATGAGGAGTT  1184

Query 1185  CAAGACATACAACTACCCCAAGTACCGAGCCGAGGCCCTTTTGAGCCACGCACCCCGACTTGATAGCGACGGGG  1258
            .|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1185  TAGAACATACAACTACCCCAAGTACCGAGCCGAGGCCCTTCTGAGCCATGCACCCCGACTTGATAGCGATGGAG  1258

Query 1259  CCGACCTCCTCACCAAGCTGTTGCAGTTTGAGGGTCGAAATCGGATCTCCGCAGAGGATGCCATGAAACATCCA  1332
            |.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 1259  CTGACCTCCTCACCAAGCTGCTGCAGTTTGAGGGTCGCAATCGGATCTCTGCTGAGGATGCCAGGAAACATCCA  1332

Query 1333  TTCTTCCTCAGTCTGGGGGAGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATTTGCACTAAAGGAGATTCA  1406
            |||||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 1333  TTCTTTCTCAGCTTGGGGGAGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATTTGCACTAAAGGAGGTACA  1406

Query 1407  GCTACAAAAGGAGGCCAGCCTTCGGTCTTCGTCGATGCCTGACTCAGGCAGGCCAGCTTTCCGCGTGGTGGACA  1480
            |||||||||||||||||.|.|||||||..|.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1407  GCTACAAAAGGAGGCCAACATTCGGTCCACTTCTATGCCTGACTCAGGCAGGCCAGCTTTCCGTGTGGTGGATA  1480

Query 1481  CCGAGTTC  1488
            ||||||||
Sbjct 1481  CCGAGTTC  1488