Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06698
- Subject:
- XM_011543923.2
- Aligned Length:
- 1525
- Identities:
- 1469
- Gaps:
- 53
Alignment
Query 1 ------------------ATGGATCGGATGAAGAAGATCAAACGGCAGCTGTCAATGACACTCCGAGGTGGCCG 56
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCAGTCCGAGATCGCCATGGATCGGATGAAGAAGATCAAACGGCAGCTGTCAATGACACTCCGAGGTGGCCG 74
Query 57 AGGCATAGACAAGACCAATGGTGCCCCTGAGCAGATAGGCCTGGATGAGAGTGGTGGTGGTGGCGGCAGTGACC 130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGGCATAGACAAGACCAATGGTGCCCCTGAGCAGATAGGCCTGGATGAGAGTGGTGGTGGTGGCGGCAGTGACC 148
Query 131 CTGGAGAGGCCCCCACACGTGCTGCTCCTGGGGAACTTCGTTCTGCACGGGGCCCACTCAGCTCTGCACCAGAG 204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTGGAGAGGCCCCCACACGTGCTGCTCCTGGGGAACTTCGTTCTGCACGGGGCCCACTCAGCTCTGCACCAGAG 222
Query 205 ATTGTGCACGAGGACTTGAAGATGGGGTCTGATGGGGAGAGTGACCAGGCTTCAGCCACGTCCTCGGATGAGGT 278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATTGTGCACGAGGACTTGAAGATGGGGTCTGATGGGGAGAGTGACCAGGCTTCAGCCACGTCCTCGGATGAGGT 296
Query 279 GCAGTCTCCAGTGAGAGTGCGTATGCGCAACCATCCCCCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAGCGCC 352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCAGTCTCCAGTGAGAGTGCGTATGCGCAACCATCCCCCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAGCGCC 370
Query 353 TATCACTACCAGCTGACATCCGGCTGCCTGAGGGCTACCTGGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGAC 426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TATCACTACCAGCTGACATCCGGCTGCCTGAGGGCTACCTGGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGAC 444
Query 427 AAGCCCCTCAGCCGCCGCCTCCGTCGTGTCAGCCTATCTGAGATTGGCTTTGGGAAACTGGAGACCTACATTAA 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAGCCCCTCAGCCGCCGCCTCCGTCGTGTCAGCCTATCTGAGATTGGCTTTGGGAAACTGGAGACCTACATTAA 518
Query 501 GCTGGACAAACTGGGCGAGGGTACCTATGCCACCGTCTACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTGG 574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTGGACAAACTGGGCGAGGGTACCTATGCCACCGTCTACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTGG 592
Query 575 CACTCAAGGAGATCAGACTGGAACATGAAGAGGGGGCACCCTGCACCGCCATCCGGGAAGTGTCCCTACTCAAG 648
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 593 CACTCAAGGAGATCAGACTGGAACATGAAGAGGGGGCACCCTGCACCGCCATCCGGGAAGTGTCCCTGCTCAAG 666
Query 649 GACCTCAAACACGCCAACATCGTTACGCTACATGACATTATCCACACGGAGAAGTCCCTCACCCTTGTCTTTGA 722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GACCTCAAACACGCCAACATCGTTACGCTACATGACATTATCCACACGGAGAAGTCCCTCACCCTTGTCTTTGA 740
Query 723 GTACCTGGACAAGGACCTGAAGCAGTACCTGGATGACTGTGGGAACATCATCAACATGCACAACGTGAAACTGT 796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GTACCTGGACAAGGACCTGAAGCAGTACCTGGATGACTGTGGGAACATCATCAACATGCACAACGTGAAACTGT 814
Query 797 TCCTGTTCCAGCTGCTCCGTGGCCTGGCCTACTGCCACCGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAG 870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCCTGTTCCAGCTGCTCCGTGGCCTGGCCTACTGCCACCGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAG 888
Query 871 AACCTGCTCATCAACGAGAGGGGAGAGCTCAAGCTGGCTGACTTTGGCCTGGCCCGAGCCAAGTCAATCCCAAC 944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AACCTGCTCATCAACGAGAGGGGAGAGCTCAAGCTGGCTGACTTTGGCCTGGCCCGAGCCAAGTCAATCCCAAC 962
Query 945 AAAGACATACTCCAATGAGGTGGTGACACTGTGGTACCGGCCCCCTGACATCCTGCTTGGGTCCACGGACTACT 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AAAGACATACTCCAATGAGGTGGTGACACTGTGGTACCGGCCCCCTGACATCCTGCTTGGGTCCACGGACTACT 1036
Query 1019 CCACTCAGATTGACATGTGGGGTGTGGGCTGCATCTTCTATGAGATGGCCACAGGCCGTCCCCTCTTTCCGGGC 1092
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCACTCAGATTGACATGTGGGGTGTGGGCTGCATCTTCTATGAGATGGCCACAGGCCGTCCCCTCTTTCCGGGC 1110
Query 1093 TCCACGGTGGAGGAACAGCTACACTTCATCTTCCGTATCTTAGGAACCCCAACTGAGGAGACGTGGCCAGGCAT 1166
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCCACGGTGGAGGAACAGCTACACTTCATCTTCCGTATCTTAGGAACCCCAACTGAGGAGACGTGGCCAGGCAT 1184
Query 1167 CCTGTCCAACGAGGAGTTCAAGACATACAACTACCCCAAGTACCGAGCCGAGGCCCTTTTGAGCCACGCACCCC 1240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCTGTCCAACGAGGAGTTCAAGACATACAACTACCCCAAGTACCGAGCCGAGGCCCTTTTGAGCCACGCACCCC 1258
Query 1241 GACTTGATAGCGACGGGGCCGACCTCCTCACCAAGCTGTTGCAGTTTGAGGGTCGAAATCGGATCTCCGCAGAG 1314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GACTTGATAGCGACGGGGCCGACCTCCTCACCAAGCTGTTGCAGTTTGAGGGTCGAAATCGGATCTCCGCAGAG 1332
Query 1315 GATGCCATGAAACATCCATTCTTCCTCAGTCTGGGGGAGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATT 1388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GATGCCATGAAACATCCATTCTTCCTCAGTCTGGGGGAGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATT 1406
Query 1389 TGCACTAAAGGAGATTCAGCTACAAAAGGAGGCCAGCCTTCGGTCTTCGTCGATGCCTGACTCAGGCAGGCCAG 1462
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGCACTAAAGGAGATTCAGCTACAAAAGGAGGCCAGCCTTCGGTCTTCGTCGATGCCTGACTCAG--------- 1471
Query 1463 CTTTCCGCGTGGTGGACA------CCGAGTTC------------- 1488
||.|| |||||||| || ||.|
Sbjct 1472 -TTGCC----GGTGGACAGCATGGCC--GTGCCAGCCTCCCACAC 1509