Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06769
• Subject: NM_008922.2
• Aligned Length: 1531
• Identities: 1282
• Gaps: 20

Alignment

Query    1  ATGGAGTTTTCTGGAAGAAAGTGGAGGAAGCTGAGGTTGGCAGGTGACCAGAGGAATGCTTCCTACCCTCATTG  74
            |||.||||.||.|||||.|...|||.|||||||.|.|||||.|||||||||||.||||||...||||||||..|
Sbjct    1  ATGCAGTTCTCAGGAAGGATCCGGAAGAAGCTGCGATTGGCGGGTGACCAGAGAAATGCTAGTTACCCTCACAG  74

Query   75  CCTTCAGTTTTACTTGCAGCCACCTTCTGAAAACATATCTTTAATAGAATTTGAAAACTTGGCTATTGATAGAG  148
            |||||||||||||.|||||||.|||.|||||||||||||.||.|..||.|||||||||||||||.||||.||||
Sbjct   75  CCTTCAGTTTTACCTGCAGCCGCCTACTGAAAACATATCGTTGACGGAGTTTGAAAACTTGGCTTTTGACAGAG  148

Query  149  TTAAATTGTTAAAATCAGTTGAAAATCTTGGAGTGAGCTATGTGAAAGGAACTGAACAATACCAGAGTAAGTTG  222
            ||||||||.|.|||.||.||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  TTAAATTGCTTAAAGCAATTGAGAACCTCGGTGTGAGCTATGTGAAAGGAACCGAACAATACCAGAGTAAATTG  222

Query  223  GAGAGTGAGCTTCGGAAGCTCAAGTTTTCCTACAGAGAAAACTTAGAAGATGAATATGAACCACGAAGAAGAGA  296
            |||...|||.||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|.||.|||||.|||||.|||||..||||.||
Sbjct  223  GAGGCCGAGATTCGAAAGCTCAAGTTTTCCTACAGAGAGAACCTGGAGGATGAGTATGAGCCACGGCGAAGGGA  296

Query  297  TCATATTTCTCATTTTATTTTGCGGCTTGCTTATTGCCAGTCTGAAGAACTTAGACGCTGGTTCATTCAACAAG  370
            .||.||.||.||.|||||..|.||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  297  CCACATCTCCCACTTTATCCTACGCCTCGCGTACTGCCAGTCGGAAGATCTTAGACGATGGTTTATTCAACAAG  370

Query  371  AAATGGATCTCCTTCGATTTAGATTTAGTATTTTACCCAAGGATAAAATTCAGGATTTCTTAAAGGATAGCCAA  444
            ||||||||||.|||||.|||.||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||..||||||.||||||||.||.
Sbjct  371  AAATGGATCTGCTTCGGTTTCGATTCAGTATTTTACCAAAGGATAAAGTCCAGAGTTTCTTGAAGGATAGTCAT  444

Query  445  TTGCAGTTTGAGGCTATAAGTGATGAAGAGAAGACTCTTCGAGAACAGGAGATTGTTGCCTCATCACCAAGTTT  518
            |||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||..|.||.||.||.|||||..|
Sbjct  445  TTGCATTTTGAGGCTATCAGTGACGAGGAGAAGACCCTTCGGGAACAGGATATCATGGCGTCCTCTCCAAGCCT  518

Query  519  AAGTGGACTTAAGTTGGGGTTCGAGTCCATTTATAAGATCCCTTTTGCTGATGCTCTGGATTTGTTTCGAGGAA  592
            ||||||..|.|||||||.||..|||||..||||||||.||||.|||||||||||||||||..||||..||||||
Sbjct  519  AAGTGGGATCAAGTTGGAGTCAGAGTCAGTTTATAAGGTCCCCTTTGCTGATGCTCTGGACCTGTTCAGAGGAA  592

Query  593  GGAAAGTCTATTTGGAAGATGGCTTTGCTTACGTACCACTTAAGGACATTGTGGCAATCATCCTGAATGAATTT  666
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.||.|||
Sbjct  593  GGAAAGTCTACTTGGAAGATGGCTTTGCTTATGTGCCACTTAAGGACATCGTGGCCATTATCTTGAACGAGTTT  666

Query  667  AGAGCCAAACTGTCCAAGGCTTTGGCATTAACAGCCAGGTCCTTGCCTGCTGTGCAGTCTGATGAAAGACTTCA  740
            |||||||..|||||.||||||||||||.||||.||||||||..||||||||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct  667  AGAGCCACGCTGTCTAAGGCTTTGGCACTAACGGCCAGGTCGCTGCCTGCTGTGCAGTCCGATGAACGACTTCA  740

Query  741  GCCTCTGCTCAATCACCTCAGTCATTCCTACACTGGCCAAGATTACAGTACCCAGGGAAATGTTGGGAAGATTT  814
            ||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||...||....||.|||||||
Sbjct  741  GCCTCTGCTCAACCACCTCAGTCATTCTTACACTGGTCAAGATTATAGTACCCAGAAGAACACCGGCAAGATTT  814

Query  815  CTTTAGATCAGATTGATTTGCTTTCTACCAAATCCTTCCCACCTTGCATGCGTCATTTACATAAAGCCTTGCGG  888
            |.||||||||||||||||.|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||..|.||.||.||..||.||
Sbjct  815  CCTTAGATCAGATTGATTCGCTGTCTACAAAATCCTTCCCACCTTGCATGCGTCAGCTGCACAAGGCGCTGAGG  888

Query  889  GAAAATCACCATCTTCGTCATGGAGGCCGAATGCAGTATGGCCTATTTCTGAAGGGCATTGGTTTAACTTTGGA  962
            ||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||..||||..||||
Sbjct  889  GAGAACCACCATCTCCGTCACGGAGGCCGGATGCAGTACGGCCTGTTCCTCAAGGGCATTGGGCTAACGCTGGA  962

Query  963  ACAGGCATTGCAGTTCTGGAAGCAAGAATTTATCAAAGGAAAGATGGATCCAGACAAGTTTGATAAAGGTTACT  1036
            .|||||||||||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCAGGCATTGCAGTTCTGGAAGCAGGAGTTTATCAGAGGAAAGATGGACCCAGACAAGTTTGATAAAGGTTACT  1036

Query 1037  CTTACAACATCCGTCACAGCTTTGGAAAGGAAGGCAAGAGGACAGACTATACACCTTTCAGTTGCCTGAAGATT  1110
            |||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
Sbjct 1037  CTTACAATATCCGGCATAGCTTCGGAAAGGAAGGCAAGAGGACAGACTATACGCCTTTCAGTTGCATGAAGATT  1110

Query 1111  ATTCTGTCCAATCCACCAAGCCAAGGGGATTATCATGGGTGCCCATTCCGTCACAGTGATCCAGAGCTGCTGAA  1184
            ||.|||.||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1111  ATCCTGACCAACCCACCAGGCCAAGGGGATTATCATGGGTGCCCCTTCCGTCACAGTGATGCAGAGCTGCTGAA  1184

Query 1185  GCAAAAGTTGCAGTCATACAAGATCTCT-CCTGGAGGGATAAGCCAGATTTTGGATTTAGTAAAGGGGACACAT  1257
            |||.|||.|||||||.|||||||||.|| |||.| |||||.|||||||||||||||||.||||||||||..|||
Sbjct 1185  GCAGAAGATGCAGTCCTACAAGATCCCTGCCTCG-GGGATCAGCCAGATTTTGGATTTGGTAAAGGGGAATCAT  1257

Query 1258  TACCAGGTAGCCTGTCAAAAATACTTTGAGATGATACACAATGTGGATGATTGTGGCTTTTCTTTGAATCATCC  1331
            |||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||.|||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  TACCAAGTAGCCTGTCAGAAGTACTTCGAGATGACACATAATGTGGACGATTGTGGCTTTTCTTTGAATCATCC  1331

Query 1332  TAATCAGTTCTTTTGTGAGAGCCAACGTATTCTAAATGGTGGTAAAGACATAAAGAAGGAACCTATC---CAAC  1402
            .|||||||||||||.|||||||||.||.||.||||.||||||.|||||.||.|||||||||   |||   ||.|
Sbjct 1332  AAATCAGTTCTTTTTTGAGAGCCAGCGCATCCTAACTGGTGGCAAAGATATCAAGAAGGAA---ATCAGTCAGC  1402

Query 1403  CAGAAACTCCTCAACCCAAACCAAGTGTCCAGAAAACCAAGGATGCATCATCTGCTCTGGCCTCTTTAAATTCC  1476
            |||||||.|||||.|.||||||.||...||||||.||||.||||||..|||||||.||||||||..||.|.|||
Sbjct 1403  CAGAAACACCTCAGCACAAACCTAGCACCCAGAAGACCAGGGATGCTGCATCTGCGCTGGCCTCCCTAGACTCC  1476

Query 1477  TCTCTGGAAATGGATATGGAAGGACTAGAAGATTACTTTAGTGAAGATTCT  1527
            ||.|||||||||||..||||.||.||.|||||.||||||            
Sbjct 1477  TCCCTGGAAATGGACCTGGAGGGGCTGGAAGAGTACTTT------------  1515