Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06784
• Subject: NR_001296.3
• Aligned Length: 863
• Identities: 680
• Gaps: 122

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  CTCACCTCACAGACACTCCTCTCTGGATCCTCCAGAGCTATAAAGACGGGCCTTCCACCACCAGACAGGCGCAC  74

Query   1  ---------ATGAATCCATTCCTGATCCTTACCTTTGTGGCAGCTGCTCTTGCTGCCCCCTTTGATGATGATGA  65
                    |||||||||.|||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  75  TCTACCACCATGAATCCACTCCTGATCCTTGCCTTTGTGGGAGCTGCTGTTGCTGTCCCCTTTGATGATGATGA  148

Query  66  CAAGATCGTTGGGGGCTACAACTGTGAGGAGAATTCTGTCCCCTACCAGGTGTCCCTGAATTCTGGCTACCACT  139
           ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||
Sbjct 149  CAAGATCGTTGGGGGCTACACCTGTGAGGAGAATTCTGTCCCCTACCAGGTGTCCTTGAATTCTGGCTCCCACT  222

Query 140  TCTGTGGTGGCTCCCTCATCAACGAACAGTGGGTGGTATCAGCAGGCCACTGCTACAAGTCCCGCATCCAGGTG  213
           ||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||.||||||||||
Sbjct 223  TCTGCGGTGGCTCCCTCATCAGCGAACAGTGGGTGGTGTCAGCAGGTCACTGCTACAAGCCCCACATCCAGGTG  296

Query 214  AGACTGGGAGAGCACAACATCGAAGTCCTGGAGGGGAATGAGCAGTTCATCAATGCAGCCAAGATCATCCGCCA  287
           |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AGACTGGGAGAGCACAATATCGAAGTCCTGGAGGGGAATGAGCAGTTCATCAATGCAGCCAAGATCATCCGCCA  370

Query 288  CCCCCAATACGACAGGAAGACTCTGAACAATGACATCATGTTAATCAAGCTCTCCTCACGTGCAGTAATCAACG  361
           ||||.|||||.||||||..|.|||||||||||||||||||.|.||||||||||||.|||.|||.||.|||||.|
Sbjct 371  CCCCAAATACAACAGGATTATTCTGAACAATGACATCATGCTGATCAAGCTCTCCACACCTGCCGTCATCAATG  444

Query 362  CCCGCGTGTCCACCATCTCTCTGCCCACCGCCCCTCCAGCCACTGGCACGAAGTGCCTCATCTCTGGCTGGGGC  435
           |||..|||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||..|||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 445  CCCATGTGTCCACCATCTCTCTGCCCACTGCCCCTCCAGCTGCTGGCACCGAGTGCCTTATCTCCGGCTGGGGC  518

Query 436  AACACTGCGAGCTCTGGCGCCGACTACCCAGACGAGCTGCAGTGCCTGGATGCTCCTGTGCTGAGCCAGGCTAA  509
           ||.||...|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||
Sbjct 519  AATACCCTGAGCTCTGGGGCCGACTACCCAGATGAGCTGCAGTGCCTGGACGCTCCTGTGCTGACCCAGGCTAA  592

Query 510  GTGTGAAGCCTCCTACCCTGGAAAGATTACCAGCAACATGTTCTGTGTGGGCTTCCTTGAGGGAGGCAAGGATT  583
           ||||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  GTGTAAAGCCTCCTACCCTTTAAAGATTACCAGCAACATGTTCTGTGTGGGCTTCCTTGAGGGAGGCAAGGATT  666

Query 584  CATGTCAGGGTGATTCTGGTGGCCCTGTGGTCTGCAATGGACAGCTCCAAGGAGTTGTCTCCTGGGGTGATGGC  657
           |.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||..|||||
Sbjct 667  CCTGCCAGGGTGACTCTGGTGGCCCTGTGGTCTGCAATGGACAGCTTCAAGGAATTGTCTCCTGGGGCTATGGC  740

Query 658  TGTGCCCAGAAGAACAAGCCTGGAGTCTACACCAAGGTCTACAACTATGTGAAATGGATTAAGAACACCATAGC  731
           |||||||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.||||||||||
Sbjct 741  TGTGCCCAGAAGAGAAGGCCTGGAGTCTACACCAAGGTCTACAACTATGTGGACTGGATTAAGGACACCATAGC  814

Query 732  TGCCAATAGC---------------------------------------  741
           ||||||.|||                                       
Sbjct 815  TGCCAACAGCTAAAGCCCCTGGTCACTCTGCAGTCTCTATACCAATAAA  863