Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_06785
Subject:
NM_001197097.2
Aligned Length:
795
Identities:
683
Gaps:
66

Alignment

Query   1  ------------------------------------------ATGAATCCAC---------TCCTGATCCTTAC  23
                                                     |.||.|.|.|         |||  |||||  |
Sbjct   1  ATGCACATGAGAGAGACAAGTGGCTTCACATTGAAGAAGGGGAGGAGTGCGCCATTGGTTTTCC--ATCCT--C  70

Query  24  CTTTGTTGCAGCTGCTG-TTGCTGCCCCCTTTGATGATGATGACAAGATCGTTGGGGGCTACATCTGTGAGGAG  96
           |  .|.||||    ||| ||||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||
Sbjct  71  C--AGATGCA----CTGATTGCTGTCCCCTTTGACGATGATGACAAGATTGTTGGGGGCTACACCTGTGAGGAG  138

Query  97  AATTCTGTCCCCTACCAGGTGTCCTTGAATTCTGGCTACCACTTCTGCGGTGGCTCCCTCATCAGCGAACAGTG  170
           ||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 139  AATTCTCTCCCCTACCAGGTGTCCCTGAATTCTGGCTCCCACTTCTGCGGTGGCTCCCTCATCAGCGAACAGTG  212

Query 171  GGTGGTGTCAGCAGGTCACTGCTACAAGTCCCGCATCCAGGTGAGACTGGGAGAGCACAACATCGAAGTCCTGG  244
           ||||||.|||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 213  GGTGGTATCAGCAGCTCACTGCTACAAGACCCGCATCCAGGTGAGACTGGGAGAGCACAACATCAAAGTCCTGG  286

Query 245  AGGGGAATGAACAGTTCATCAATGCAGCCAAGATCATCCGCCACCCCAAATACAACAGCCGG--ACTCTGGACA  316
           ||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||  ||  ||||||||||
Sbjct 287  AGGGGAATGAGCAGTTCATCAATGCGGCCAAGATCATCCGCCACCCTAAATACAACAG--GGACACTCTGGACA  358

Query 317  ATGACATCCTGCTGATCAAGCTCTCCTCACCTGCCGTCATCAATTCCCGCGTGTCCGCCATCTCTCTGCCCACT  390
           ||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||.
Sbjct 359  ATGACATCATGCTGATCAAACTCTCCTCACCTGCCGTCATCAATGCCCGCGTGTCCACCATCTCTCTGCCCACC  432

Query 391  GCCCCTCCAGCTGCTGGCACCGAGTCCCTCATCTCCGGCTGGGGCAACACTCTGAGTTCTGGTGCCGACTACCC  464
           ||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||||||
Sbjct 433  GCCCCTCCAGCTGCTGGCACTGAGTGCCTCATCTCCGGCTGGGGCAACACTCTGAGCTTTGGTGCTGACTACCC  506

Query 465  AGACGAGCTGCAGTGCCTGGATGCTCCTGTGCTGAGCCAGGCTGAGTGTGAAGCCTCCTACCCTGGAAAGATTA  538
           ||||||||||.||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 507  AGACGAGCTGAAGTGCCTGGATGCTCCGGTGCTGACCCAGGCTGAGTGTAAAGCCTCCTACCCTGGAAAGATTA  580

Query 539  CCAACAACATGTTCTGTGTGGGCTTCCTCGAGGGAGGCAAGGATTCCTGCCAGGGTGATTCTGGTGGCCCTGTG  612
           ||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct 581  CCAACAGCATGTTCTGTGTGGGCTTCCTTGAGGGAGGCAAGGATTCCTGCCAGCGTGACTCTGGTGGCCCTGTG  654

Query 613  GTCTCCAATGGAGAGCTCCAAGGAATTGTCTCCTGGGGCTATGGCTGTGCCCAGAAGAACAGGCCTGGAGTCTA  686
           ||||.|||.|||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct 655  GTCTGCAACGGACAGCTCCAAGGAGTTGTCTCCTGGGGCCATGGCTGTGCCTGGAAGAACAGGCCTGGAGTCTA  728

Query 687  CACCAAGGTCTACAACTATGTGGACTGGATTAAGGACACCATAGCTGCCAACAGC  741
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 729  CACCAAGGTCTACAACTATGTGGACTGGATTAAGGACACCATCGCTGCCAACAGC  783