Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_06785
Subject:
NM_001303414.1
Aligned Length:
783
Identities:
738
Gaps:
42

Alignment

Query   1  ATGAATCCACTCCTGATCCTTACCTTTGTTGCAGCTGCTGTTGCTGCCCCCTTTGATGATGATGACAAGATCGT  74
           |||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGAATCTACTTCTGATCCTTACCTTTGTTGCAGCTGCTGTTGCTGCCCCCTTTGATGATGATGACAAGATCGT  74

Query  75  TGGGGGCTACATCTGTGAGGAGAATTCTGTCCCCTACCAGGTGTCCTTGAATTCTGGCTACCACTTCTGCGGTG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TGGGGGCTACATCTGTGAGGAGAATTCTGTCCCCTACCAGGTGTCCTTGAATTCTGGCTACCACTTCTGCGGTG  148

Query 149  GCTCCCTCATCAGCGAACAGTGGGTGGTGTCAGCAGGTCACTGCTACAAGTC----------------------  200
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      
Sbjct 149  GCTCCCTCATCAGCGAACAGTGGGTGGTGTCAGCAGGTCACTGCTACAAGTCGGCAATTAACTCAAAATTATCA  222

Query 201  --------------------CCGCATCCAGGTGAGACTGGGAGAGCACAACATCGAAGTCCTGGAGGGGAATGA  254
                               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GGAAGAGGGTGTGAATATCACCGCATCCAGGTGAGACTGGGAGAGCACAACATCGAAGTCCTGGAGGGGAATGA  296

Query 255  ACAGTTCATCAATGCAGCCAAGATCATCCGCCACCCCAAATACAACAGCCGGACTCTGGACAATGACATCCTGC  328
           |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  ACAGTTCATCAATGCGGCCAAGATCATCCGCCACCCCAAATACAACAGCCGGACTCTGGACAATGACATCCTGC  370

Query 329  TGATCAAGCTCTCCTCACCTGCCGTCATCAATTCCCGCGTGTCCGCCATCTCTCTGCCCACTGCCCCTCCAGCT  402
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TGATCAAGCTCTCCTCACCTGCCGTCATCAATTCCCGCGTGTCCGCCATCTCTCTGCCCACTGCCCCTCCAGCT  444

Query 403  GCTGGCACCGAGTCCCTCATCTCCGGCTGGGGCAACACTCTGAGTTCTGGTGCCGACTACCCAGACGAGCTGCA  476
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GCTGGCACCGAGTCCCTCATCTCCGGCTGGGGCAACACTCTGAGTTCTGGTGCCGACTACCCAGACGAGCTGCA  518

Query 477  GTGCCTGGATGCTCCTGTGCTGAGCCAGGCTGAGTGTGAAGCCTCCTACCCTGGAAAGATTACCAACAACATGT  550
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  GTGCCTGGATGCTCCTGTGCTGAGCCAGGCTGAGTGTGAAGCCTCCTACCCTGGAAAGATTACCAACAACATGT  592

Query 551  TCTGTGTGGGCTTCCTCGAGGGAGGCAAGGATTCCTGCCAGGGTGATTCTGGTGGCCCTGTGGTCTCCAATGGA  624
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  TCTGTGTGGGCTTCCTCGAGGGAGGCAAGGATTCCTGCCAGGGTGATTCTGGTGGCCCTGTGGTCTCCAATGGA  666

Query 625  GAGCTCCAAGGAATTGTCTCCTGGGGCTATGGCTGTGCCCAGAAGAACAGGCCTGGAGTCTACACCAAGGTCTA  698
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  GAGCTCCAAGGAATTGTCTCCTGGGGCTATGGCTGTGCCCAGAAGAACAGGCCTGGAGTCTACACCAAGGTCTA  740

Query 699  CAACTATGTGGACTGGATTAAGGACACCATAGCTGCCAACAGC  741
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  CAACTATGTGGACTGGATTAAGGACACCATAGCTGCCAACAGC  783