Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06790
- Subject:
- NM_001184826.2
- Aligned Length:
- 1285
- Identities:
- 1195
- Gaps:
- 35
Alignment
Query 1 ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATTACTTTT 74
|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1 ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT 74
Query 75 AAACTTCTGGAACTTGCCTACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCAAGGGGAAGG 148
|||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 75 AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG 148
Query 149 ACGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAAGGAC 222
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 149 ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGAC 222
Query 223 CTCTACCATTACATTACATCATACGTAGTAGATGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGACGAGA 296
|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATAGTGGACGAGA 296
Query 297 AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA 370
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA 370
Query 371 TCGTAAAGCGAGGTGATGGGACTAGAGGAGAAACTGGACATTTCACCTTCACCTTATACCTGGAGACTCCCAAG 444
||.|||||.|||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||.|||
Sbjct 371 TCATAAAGGGAGATGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGACGTTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCTAAG 444
Query 445 CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTATACCCCAGGGAGGACATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGATCCTGAGAC 518
||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||..|||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 445 CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGACCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGACCCTGAGAC 518
Query 519 TCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGCAGTTGTCCAAAA 592
|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 519 TCCAGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGAAGCTGTCCGAAA 592
Query 593 ACAAAAGGACCCTCTTTCTATTTGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA 666
.|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA 666
Query 667 GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA 740
Query 741 CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA 814
Query 815 TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT 888
Query 889 CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACAGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG 962
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG 962
Query 963 TTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCATT 1036
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 963 TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT 1036
Query 1037 CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTC-GCGGACTCTAACCCACCAGCAGAATATTCTTGGACAATTAATGG 1109
||||||||..||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||||.
Sbjct 1037 CAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTG-TTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGA 1109
Query 1110 GAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAGATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCT 1183
.||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1110 AAAGTTTCAGCTACCAGGACAAAAGCTCTTTATCCGCCATATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGTTTGCT 1183
Query 1184 CTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCATGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTGCTCCTTCAGGAACA 1257
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1184 CTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCT----------GAA-- 1245
Query 1258 GGACATCTTCCTGGCCTTAATCCATTA 1284
|||.||
Sbjct 1246 -------------GCCCTA-------- 1251