Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06790
- Subject:
- NM_001276495.1
- Aligned Length:
- 1284
- Identities:
- 918
- Gaps:
- 306
Alignment
Query 1 ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATTACTTTT 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct 1 ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT 74
Query 75 AAACTTCTGGAACTTGCCTACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCAAGGGGAAGG 148
||||||||||||...|||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||..|||||||||
Sbjct 75 AAACTTCTGGAATCCGCCCACAACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG 148
Query 149 ACGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAAGGAC 222
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||...||
Sbjct 149 ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATTTGGTACAAAGGGCAAATGACATAC 222
Query 223 CTCTACCATTACATTACATCATACGTAGTAGATGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGACGAGA 296
|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 223 CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAAGAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA 296
Query 297 AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA 370
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAGAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACGCAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA 370
Query 371 TCGTAAAGCGAGGTGATGGGACTAGAGGAGAAACTGGACATTTCACCTTCACCTTATACCTGGAGACTCCCAAG 444
||.||||||||.|.|||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCATAAAGCGACGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTTA------------------ 426
Query 445 CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTATACCCCAGGGAGGACATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGATCCTGAGAC 518
Sbjct 427 -------------------------------------------------------------------------- 426
Query 519 TCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGCAGTTGTCCAAAA 592
Sbjct 427 -------------------------------------------------------------------------- 426
Query 593 ACAAAAGGACCCTCTTTCTATTTGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA 666
Sbjct 427 -------------------------------------------------------------------------- 426
Query 667 GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA 740
|.|||.||||||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct 427 ---------------------------------------CACCCAAAGCTGTCCAAGCCCTACATCACAATCAA 461
Query 741 CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA 814
|||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 462 CAACTTAAACCCCAGAGAGAATAAGGATGTCTTAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTAAGAACTACACCTACA 535
Query 815 TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT 888
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCTGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT 609
Query 889 CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACAGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG 962
|||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 610 CTACCCAATGTCACGAGAAATGAAACAGGACCTTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG 683
Query 963 TTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCATT 1036
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 684 TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT 757
Query 1037 CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCGGACTCTAACCCACCAGCAGAATATTCTTGGACAATTAATGGG 1110
|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||..|||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 758 CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCCGAGTCTAACCCACGGGCACAATATTCTTGGACAATTAATGGG 831
Query 1111 AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAGATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC 1184
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 832 AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATAACTACAAAGCATAGTGGGCTCTATGCTTGCTC 905
Query 1185 TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCATGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTGCTCCTTCAGGAACAG 1258
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||.||||||||| ||.|
Sbjct 906 TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATCACAGTCAAAGTCTCTG-----------ACTG 968
Query 1259 GACATCTTCCTGGCCTTAATCCATTA 1284
||.||...||
Sbjct 969 GATATTACCC---------------- 978