Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06790
• Subject: NM_001297773.2
• Aligned Length: 1296
• Identities: 1213
• Gaps: 24

Alignment

Query    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATTACTTTT  74
            |||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct    1  ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACTTGCCTACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCAAGGGGAAGG  148
            |||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148

Query  149  ACGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAAGGAC  222
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATACGTAGTAGATGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGACGAGA  296
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATAGTGGACGAGA  296

Query  297  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCGTAAAGCGAGGTGATGGGACTAGAGGAGAAACTGGACATTTCACCTTCACCTTATACCTGGAGACTCCCAAG  444
            ||.|||||.|||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||.|||
Sbjct  371  TCATAAAGGGAGATGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGACGTTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCTAAG  444

Query  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTATACCCCAGGGAGGACATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGATCCTGAGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||..|||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGACCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGACCCTGAGAC  518

Query  519  TCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGCAGTTGTCCAAAA  592
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct  519  TCCAGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGAAGCTGTCCGAAA  592

Query  593  ACAAAAGGACCCTCTTTCTATTTGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666
            .|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666

Query  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  740

Query  741  CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814

Query  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888

Query  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACAGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  962

Query  963  TTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCATT  1036
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  963  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036

Query 1037  CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTC-GCGGACTCTAACCCACCAGCAGAATATTCTTGGACAATTAATGG  1109
            ||||||||..||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||||.
Sbjct 1037  CAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTG-TTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGA  1109

Query 1110  GAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAGATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCT  1183
            .||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1110  AAAGTTTCAGCTACCAGGACAAAAGCTCTTTATCCGCCATATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGTTTGCT  1183

Query 1184  CTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCATGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTGCT------CCTTCA  1251
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ..||||
Sbjct 1184  CTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTGCTTATAGCAGTTCA  1257

Query 1252  GGAACAGGAC-AT-CTTCCTGG---CCTTAATCCATTA  1284
            ..||    || || ||| ||||   ||.||||      
Sbjct 1258  ATAA----ACTATACTT-CTGGGAACCGTAAT------  1284