Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06790
• Subject: NM_001330524.2
• Aligned Length: 1285
• Identities: 933
• Gaps: 308

Alignment

Query    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATTACTTTT  74
            |||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct    1  ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACTTGCCTACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCAAGGGGAAGG  148
            |||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148

Query  149  ACGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAAGGAC  222
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATACGTAGTAGATGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGACGAGA  296
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATAGTGGACGAGA  296

Query  297  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCGTAAAGCGAGGTGATGGGACTAGAGGAGAAACTGGACATTTCACCTTCACCTTATACCTGGAGACTCCCAAG  444
            ||.|||||.|||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||                  
Sbjct  371  TCATAAAGGGAGATGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGACGTTTCACCTTCACCTTA------------------  426

Query  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTATACCCCAGGGAGGACATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGATCCTGAGAC  518
                                                                                      
Sbjct  427  --------------------------------------------------------------------------  426

Query  519  TCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGCAGTTGTCCAAAA  592
                                                                                      
Sbjct  427  --------------------------------------------------------------------------  426

Query  593  ACAAAAGGACCCTCTTTCTATTTGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666
                                                                                      
Sbjct  427  --------------------------------------------------------------------------  426

Query  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  740
                                                   |.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  427  ---------------------------------------CACCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  461

Query  741  CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  462  CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  535

Query  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  536  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  609

Query  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACAGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  610  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  683

Query  963  TTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCATT  1036
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  684  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  757

Query 1037  CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTC-GCGGACTCTAACCCACCAGCAGAATATTCTTGGACAATTAATGG  1109
            ||||||||..||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||||.
Sbjct  758  CAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTG-TTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGA  830

Query 1110  GAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAGATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCT  1183
            .||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  831  AAAGTTTCAGCTACCAGGACAAAAGCTCTTTATCCGCCATATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGTTTGCT  904

Query 1184  CTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCATGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTGCTCCTTCAGGAACA  1257
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||.
Sbjct  905  CTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTG-----------ACT  967

Query 1258  GGACATCTTCCTGGCCTTAATCCATTA  1284
            |||||..|.||                
Sbjct  968  GGACAGTTCCC----------------  978