Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06790
• Subject: NM_002785.3
• Aligned Length: 1286
• Identities: 931
• Gaps: 283

Alignment

Query    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATTACTTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACAGAGCACATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATTACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACTTGCCTACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCAAGGGGAAGG  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||||.|||.|||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACTTGCCTACCACTGCCCAAGTCATGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTGTCCGAGGGGAAGG  148

Query  149  ACGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAAGGAC  222
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATCAGGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATACGTAGTAGATGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGACGAGA  296
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAATTATATATGGACCGGCATACAGTGGACGAGA  296

Query  297  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCGTAAAGCGAGGTGATGGGACTAGAGGAGAAACTGGACATTTCACCTTCACCTTATACCTGGAGACTCCCAAG  444
            ||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCATAAAGCGAGGTGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGATATTTCACCTTCACCTTATACCTGGAGACTCCCAAG  444

Query  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTATACCCCAGGGAGGACATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGATCCTGAGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGACTGTGATCTTAACCTGTAATCCTGAGAC  518

Query  519  TCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGCAGTTGTCCAAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||.||||..|||
Sbjct  519  TCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCATAGGATGCAGCTGTCTGAAA  592

Query  593  ACAAAAGGACCCTCTTTCTATTTGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666
            .|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTTGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATATGGAACTCA  666

Query  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  740
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct  667  GGGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCC-------------------------------  709

Query  741  CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACAGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  962
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  963  TTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCATT  1036
                                      ||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||.||||.|||
Sbjct  710  --------------------------ATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTTCCCTTCAGTCACCTCTTACTATT  757

Query 1037  CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCGGACTCTAACCCACCAGCAGAATATTCTTGGACAATTAATGGG  1110
            |||||||.||||||.||||||||||||||||..|||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||
Sbjct  758  CAGGAGAGAACCTCGACTTGTCCTGCTTCGCAAACTCTAACCCACCAGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGGG  831

Query 1111  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAGATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||..|||||||||||||||||
Sbjct  832  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCTCAGATTACTCCAAAGCATAATGGGCTCTATGCTTGCTC  905

Query 1185  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCATGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTGCTCCTTCAGGAACAG  1258
            ||.|||||||||||||||||||..|||||||||||.||||.|||||.||..||||..|||||||.|||||..||
Sbjct  906  TGCTCGTAACTCAGCCACTGGCGAGGAAAGCTCCACATCCTTGACAATCAGAGTCATTGCTCCTCCAGGATTAG  979

Query 1259  GACATCTTCCTGGCCTTAATCCATTA--  1284
            ||..|.||.||..|..|||||||  |  
Sbjct  980  GAACTTTTGCTTTCAATAATCCA--ACG  1005