Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06790
• Subject: XM_017027001.2
• Aligned Length: 1290
• Identities: 931
• Gaps: 297

Alignment

Query    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATTACTTTT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACTTGCCTACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCAAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||...|||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||..|||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAATCCGCCCACAACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148

Query  149  ACGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAAGGAC  222
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||...||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATTTGGTACAAAGGGCAAATGACATAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATACGTAGTAGATGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGACGAGA  296
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAAGAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA  296

Query  297  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACGCAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCGTAAAGCGAGGTGATGGGACTAGAGGAGAAACTGGACATTTCACCTTCACCTTATACCTGGAGACTCCCAAG  444
            ||.||||||||.|.|||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct  371  TCATAAAGCGACGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTTA------------------  426

Query  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTATACCCCAGGGAGGACATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGATCCTGAGAC  518
                                                                                      
Sbjct  427  --------------------------------------------------------------------------  426

Query  519  TCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGCAGTTGTCCAAAA  592
                                                                                      
Sbjct  427  --------------------------------------------------------------------------  426

Query  593  ACAAAAGGACCCTCTTTCTATTTGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666
                                                                                      
Sbjct  427  --------------------------------------------------------------------------  426

Query  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  740
                                                   |.|||.||||||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct  427  ---------------------------------------CACCCAAAGCTGTCCAAGCCCTACATCACAATCAA  461

Query  741  CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  462  CAACTTAAACCCCAGAGAGAATAAGGATGTCTTAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTAAGAACTACACCTACA  535

Query  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  536  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCTGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  609

Query  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACAGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  962
            |||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  610  CTACCCAATGTCACGAGAAATGAAACAGGACCTTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  683

Query  963  TTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCATT  1036
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  684  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  757

Query 1037  CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCGGACTCTAACCCACCAGCAGAATATTCTTGGACAATTAATGGG  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||..|||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  758  CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCCGAGTCTAACCCACGGGCACAATATTCTTGGACAATTAATGGG  831

Query 1111  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAGATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  832  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATAACTACAAAGCATAGTGGGCTCTATGCTTGCTC  905

Query 1185  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCATGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTGCTCCTTCAGGAACAG  1258
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||.|||||||||        |.||..|
Sbjct  906  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATCACAGTCAAAGTCTCTG--------GTAAGTG  971

Query 1259  GA---CATCTTCC-TGGCCTTAAT--CCATTA  1284
            ||   ||.|.||| ||||   |||  ..||| 
Sbjct  972  GATCCCAGCATCCTTGGC---AATAGGGATT-  999