Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06809
- Subject:
- NM_031990.4
- Aligned Length:
- 1671
- Identities:
- 1649
- Gaps:
- 21
Alignment
Query 1 ATGGACGGCATTGTCCCAGATATAGCCGTTGGTACAAAGCGGGGATCTGACGAGCTTTTCTCTACTTGTGTCAC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGACGGCATTGTCCCAGATATAGCCGTTGGTACAAAGCGGGGATCTGACGAGCTTTTCTCTACTTGTGTCAC 74
Query 75 TAACGGACCGTTTATCATGAGCAGCAACTCGGCTTCTGCAGCAAACGGAAATGACAGCAAGAAGTTCAAAGGTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TAACGGACCGTTTATCATGAGCAGCAACTCGGCTTCTGCAGCAAACGGAAATGACAGCAAGAAGTTCAAAGGTG 148
Query 149 ACAGCCGAAGTGCAGGCGTCCCCTCTAGAGTGATCCACATCCGGAAGCTCCCCATCGACGTCACGGAGGGGGAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACAGCCGAAGTGCAGGCGTCCCCTCTAGAGTGATCCACATCCGGAAGCTCCCCATCGACGTCACGGAGGGGGAA 222
Query 223 GTCATCTCCCTGGGGCTGCCCTTTGGGAAGGTCACCAACCTCCTGATGCTGAAGGGGAAAAACCAGGCCTTCAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTCATCTCCCTGGGGCTGCCCTTTGGGAAGGTCACCAACCTCCTGATGCTGAAGGGGAAAAACCAGGCCTTCAT 296
Query 297 CGAGATGAACACGGAGGAGGCTGCCAACACCATGGTGAACTACTACACCTCGGTGACCCCTGTGCTGCGCGGCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CGAGATGAACACGGAGGAGGCTGCCAACACCATGGTGAACTACTACACCTCGGTGACCCCTGTGCTGCGCGGCC 370
Query 371 AGCCCATCTACATCCAGTTCTCCAACCACAAGGAGCTGAAGACCGACAGCTCTCCCAACCAGGCGCGGGCCCAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGCCCATCTACATCCAGTTCTCCAACCACAAGGAGCTGAAGACCGACAGCTCTCCCAACCAGGCGCGGGCCCAG 444
Query 445 GCGGCCCTGCAGGCGGTGAACTCGGTCCAGTCGGGGAACCTGGCCTTGGCTGCCTCGGCGGCGGCCGTGGACGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCGGCCCTGCAGGCGGTGAACTCGGTCCAGTCGGGGAACCTGGCCTTGGCTGCCTCGGCGGCGGCCGTGGACGC 518
Query 519 AGGGATGGCGATGGCCGGGCAGAGCCCCGTGCTCAGGATCATCGTGGAGAACCTCTTCTACCCTGTGACCCTGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGGGATGGCGATGGCCGGGCAGAGCCCCGTGCTCAGGATCATCGTGGAGAACCTCTTCTACCCTGTGACCCTGG 592
Query 593 ATGTGCTGCACCAGATTTTCTCCAAGTTCGGCACAGTGTTGAAGATCATCACCTTCACCAAGAACAACCAGTTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGTGCTGCACCAGATTTTCTCCAAGTTCGGCACAGTGTTGAAGATCATCACCTTCACCAAGAACAACCAGTTC 666
Query 667 CAGGCCCTGCTGCAGTATGCGGACCCCGTGAGCGCCCAGCACGCCAAGCTGTCGCTGGACGGGCAGAACATCTA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAGGCCCTGCTGCAGTATGCGGACCCCGTGAGCGCCCAGCACGCCAAGCTGTCGCTGGACGGGCAGAACATCTA 740
Query 741 CAACGCCTGCTGCACGCTGCGCATCGACTTTTCCAAGCTCACCAGCCTCAACGTCAAGTACAACAATGACAAGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAACGCCTGCTGCACGCTGCGCATCGACTTTTCCAAGCTCACCAGCCTCAACGTCAAGTACAACAATGACAAGA 814
Query 815 GCCGTGACTACACACGCCCAGACCTGCCTTCCGGGGACAGCCAGCCCTCGCTGGACCAGACCATGGCCGCGGCC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCCGTGACTACACACGCCCAGACCTGCCTTCCGGGGACAGCCAGCCCTCGCTGGACCAGACCATGGCCGCGGCC 888
Query 889 TTCGGTGCACCTGGTATAATCTCAGCCTCTCCGTATGCAGGAGCTGGTTTCCCTCCCACCTTTGCCATTCCTCA 962
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTC---------------------GCCTCTCCGTATGCAGGAGCTGGTTTCCCTCCCACCTTTGCCATTCCTCA 941
Query 963 AGCTGCAGGCCTTTCCGTTCCGAACGTCCACGGCGCCCTGGCCCCCCTGGCCATCCCCTCGGCGGCGGCGGCAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 942 AGCTGCAGGCCTTTCCGTTCCGAACGTCCACGGCGCCCTGGCCCCCCTGGCCATCCCCTCGGCGGCGGCGGCAG 1015
Query 1037 CTGCGGCGGCAGGTCGGATCGCCATCCCGGGCCTGGCGGGGGCAGGAAATTCTGTATTGCTGGTCAGCAACCTC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1016 CTGCGGCGGCAGGTCGGATCGCCATCCCGGGCCTGGCGGGGGCAGGAAATTCTGTATTGCTGGTCAGCAACCTC 1089
Query 1111 AACCCAGAGAGAGTCACACCCCAAAGCCTCTTTATTCTTTTCGGCGTCTACGGTGACGTGCAGCGCGTGAAGAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090 AACCCAGAGAGAGTCACACCCCAAAGCCTCTTTATTCTTTTCGGCGTCTACGGTGACGTGCAGCGCGTGAAGAT 1163
Query 1185 CCTGTTCAATAAGAAGGAGAACGCCCTAGTGCAGATGGCGGACGGCAACCAGGCCCAGCTGGCCATGAGCCACC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164 CCTGTTCAATAAGAAGGAGAACGCCCTAGTGCAGATGGCGGACGGCAACCAGGCCCAGCTGGCCATGAGCCACC 1237
Query 1259 TGAACGGGCACAAGCTGCACGGGAAGCCCATCCGCATCACGCTCTCGAAGCACCAGAACGTGCAGCTGCCCCGC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1238 TGAACGGGCACAAGCTGCACGGGAAGCCCATCCGCATCACGCTCTCGAAGCACCAGAACGTGCAGCTGCCCCGC 1311
Query 1333 GAGGGCCAGGAGGACCAGGGCCTGACCAAGGACTACGGCAACTCACCCCTGCACCGCTTCAAGAAGCCGGGCTC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312 GAGGGCCAGGAGGACCAGGGCCTGACCAAGGACTACGGCAACTCACCCCTGCACCGCTTCAAGAAGCCGGGCTC 1385
Query 1407 CAAGAACTTCCAGAACATATTCCCGCCCTCGGCCACGCTGCACCTCTCCAACATCCCGCCCTCAGTCTCCGAGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386 CAAGAACTTCCAGAACATATTCCCGCCCTCGGCCACGCTGCACCTCTCCAACATCCCGCCCTCAGTCTCCGAGG 1459
Query 1481 AGGATCTCAAGGTCCTGTTTTCCAGCAATGGGGGCGTCGTCAAAGGATTCAAGTTCTTCCAGAAGGACCGCAAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1460 AGGATCTCAAGGTCCTGTTTTCCAGCAATGGGGGCGTCGTCAAAGGATTCAAGTTCTTCCAGAAGGACCGCAAG 1533
Query 1555 ATGGCACTGATCCAGATGGGCTCCGTGGAGGAGGCGGTCCAGGCCCTCATTGACCTGCACAACCACGACCTCGG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1534 ATGGCACTGATCCAGATGGGCTCCGTGGAGGAGGCGGTCCAGGCCCTCATTGACCTGCACAACCACGACCTCGG 1607
Query 1629 GGAGAACCACCACCTGCGGGTCTCCTTCTCCAAGTACACCATC 1671
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1608 GGAGAACCACCACCTGCGGGTCTCCTTCTCCAAGTCCACCATC 1650