Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_06809
Subject:
NM_031990.4
Aligned Length:
1671
Identities:
1649
Gaps:
21

Alignment

Query    1  ATGGACGGCATTGTCCCAGATATAGCCGTTGGTACAAAGCGGGGATCTGACGAGCTTTTCTCTACTTGTGTCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGGCATTGTCCCAGATATAGCCGTTGGTACAAAGCGGGGATCTGACGAGCTTTTCTCTACTTGTGTCAC  74

Query   75  TAACGGACCGTTTATCATGAGCAGCAACTCGGCTTCTGCAGCAAACGGAAATGACAGCAAGAAGTTCAAAGGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TAACGGACCGTTTATCATGAGCAGCAACTCGGCTTCTGCAGCAAACGGAAATGACAGCAAGAAGTTCAAAGGTG  148

Query  149  ACAGCCGAAGTGCAGGCGTCCCCTCTAGAGTGATCCACATCCGGAAGCTCCCCATCGACGTCACGGAGGGGGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACAGCCGAAGTGCAGGCGTCCCCTCTAGAGTGATCCACATCCGGAAGCTCCCCATCGACGTCACGGAGGGGGAA  222

Query  223  GTCATCTCCCTGGGGCTGCCCTTTGGGAAGGTCACCAACCTCCTGATGCTGAAGGGGAAAAACCAGGCCTTCAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCATCTCCCTGGGGCTGCCCTTTGGGAAGGTCACCAACCTCCTGATGCTGAAGGGGAAAAACCAGGCCTTCAT  296

Query  297  CGAGATGAACACGGAGGAGGCTGCCAACACCATGGTGAACTACTACACCTCGGTGACCCCTGTGCTGCGCGGCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGAGATGAACACGGAGGAGGCTGCCAACACCATGGTGAACTACTACACCTCGGTGACCCCTGTGCTGCGCGGCC  370

Query  371  AGCCCATCTACATCCAGTTCTCCAACCACAAGGAGCTGAAGACCGACAGCTCTCCCAACCAGGCGCGGGCCCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCCCATCTACATCCAGTTCTCCAACCACAAGGAGCTGAAGACCGACAGCTCTCCCAACCAGGCGCGGGCCCAG  444

Query  445  GCGGCCCTGCAGGCGGTGAACTCGGTCCAGTCGGGGAACCTGGCCTTGGCTGCCTCGGCGGCGGCCGTGGACGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCGGCCCTGCAGGCGGTGAACTCGGTCCAGTCGGGGAACCTGGCCTTGGCTGCCTCGGCGGCGGCCGTGGACGC  518

Query  519  AGGGATGGCGATGGCCGGGCAGAGCCCCGTGCTCAGGATCATCGTGGAGAACCTCTTCTACCCTGTGACCCTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGGATGGCGATGGCCGGGCAGAGCCCCGTGCTCAGGATCATCGTGGAGAACCTCTTCTACCCTGTGACCCTGG  592

Query  593  ATGTGCTGCACCAGATTTTCTCCAAGTTCGGCACAGTGTTGAAGATCATCACCTTCACCAAGAACAACCAGTTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGTGCTGCACCAGATTTTCTCCAAGTTCGGCACAGTGTTGAAGATCATCACCTTCACCAAGAACAACCAGTTC  666

Query  667  CAGGCCCTGCTGCAGTATGCGGACCCCGTGAGCGCCCAGCACGCCAAGCTGTCGCTGGACGGGCAGAACATCTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGGCCCTGCTGCAGTATGCGGACCCCGTGAGCGCCCAGCACGCCAAGCTGTCGCTGGACGGGCAGAACATCTA  740

Query  741  CAACGCCTGCTGCACGCTGCGCATCGACTTTTCCAAGCTCACCAGCCTCAACGTCAAGTACAACAATGACAAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAACGCCTGCTGCACGCTGCGCATCGACTTTTCCAAGCTCACCAGCCTCAACGTCAAGTACAACAATGACAAGA  814

Query  815  GCCGTGACTACACACGCCCAGACCTGCCTTCCGGGGACAGCCAGCCCTCGCTGGACCAGACCATGGCCGCGGCC  888
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Sbjct  815  GCCGTGACTACACACGCCCAGACCTGCCTTCCGGGGACAGCCAGCCCTCGCTGGACCAGACCATGGCCGCGGCC  888

Query  889  TTCGGTGCACCTGGTATAATCTCAGCCTCTCCGTATGCAGGAGCTGGTTTCCCTCCCACCTTTGCCATTCCTCA  962
            |||                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTC---------------------GCCTCTCCGTATGCAGGAGCTGGTTTCCCTCCCACCTTTGCCATTCCTCA  941

Query  963  AGCTGCAGGCCTTTCCGTTCCGAACGTCCACGGCGCCCTGGCCCCCCTGGCCATCCCCTCGGCGGCGGCGGCAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  942  AGCTGCAGGCCTTTCCGTTCCGAACGTCCACGGCGCCCTGGCCCCCCTGGCCATCCCCTCGGCGGCGGCGGCAG  1015

Query 1037  CTGCGGCGGCAGGTCGGATCGCCATCCCGGGCCTGGCGGGGGCAGGAAATTCTGTATTGCTGGTCAGCAACCTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1016  CTGCGGCGGCAGGTCGGATCGCCATCCCGGGCCTGGCGGGGGCAGGAAATTCTGTATTGCTGGTCAGCAACCTC  1089

Query 1111  AACCCAGAGAGAGTCACACCCCAAAGCCTCTTTATTCTTTTCGGCGTCTACGGTGACGTGCAGCGCGTGAAGAT  1184
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Sbjct 1090  AACCCAGAGAGAGTCACACCCCAAAGCCTCTTTATTCTTTTCGGCGTCTACGGTGACGTGCAGCGCGTGAAGAT  1163

Query 1185  CCTGTTCAATAAGAAGGAGAACGCCCTAGTGCAGATGGCGGACGGCAACCAGGCCCAGCTGGCCATGAGCCACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164  CCTGTTCAATAAGAAGGAGAACGCCCTAGTGCAGATGGCGGACGGCAACCAGGCCCAGCTGGCCATGAGCCACC  1237

Query 1259  TGAACGGGCACAAGCTGCACGGGAAGCCCATCCGCATCACGCTCTCGAAGCACCAGAACGTGCAGCTGCCCCGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1238  TGAACGGGCACAAGCTGCACGGGAAGCCCATCCGCATCACGCTCTCGAAGCACCAGAACGTGCAGCTGCCCCGC  1311

Query 1333  GAGGGCCAGGAGGACCAGGGCCTGACCAAGGACTACGGCAACTCACCCCTGCACCGCTTCAAGAAGCCGGGCTC  1406
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Sbjct 1312  GAGGGCCAGGAGGACCAGGGCCTGACCAAGGACTACGGCAACTCACCCCTGCACCGCTTCAAGAAGCCGGGCTC  1385

Query 1407  CAAGAACTTCCAGAACATATTCCCGCCCTCGGCCACGCTGCACCTCTCCAACATCCCGCCCTCAGTCTCCGAGG  1480
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Sbjct 1386  CAAGAACTTCCAGAACATATTCCCGCCCTCGGCCACGCTGCACCTCTCCAACATCCCGCCCTCAGTCTCCGAGG  1459

Query 1481  AGGATCTCAAGGTCCTGTTTTCCAGCAATGGGGGCGTCGTCAAAGGATTCAAGTTCTTCCAGAAGGACCGCAAG  1554
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Sbjct 1460  AGGATCTCAAGGTCCTGTTTTCCAGCAATGGGGGCGTCGTCAAAGGATTCAAGTTCTTCCAGAAGGACCGCAAG  1533

Query 1555  ATGGCACTGATCCAGATGGGCTCCGTGGAGGAGGCGGTCCAGGCCCTCATTGACCTGCACAACCACGACCTCGG  1628
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Sbjct 1534  ATGGCACTGATCCAGATGGGCTCCGTGGAGGAGGCGGTCCAGGCCCTCATTGACCTGCACAACCACGACCTCGG  1607

Query 1629  GGAGAACCACCACCTGCGGGTCTCCTTCTCCAAGTACACCATC  1671
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Sbjct 1608  GGAGAACCACCACCTGCGGGTCTCCTTCTCCAAGTCCACCATC  1650