Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06826
• Subject: NM_001243756.1
• Aligned Length: 1815
• Identities: 1669
• Gaps: 144

Alignment

Query    1  ATGGACGACCTCGACGCCCTGCTGGCGGACTTGGAGTCTACCACCTCCCACATCTCCAAACGGCCTGTGTTCTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGACCTCGACGCCCTGCTGGCGGACTTGGAGTCTACCACCTCCCACATCTCCAAACGGCCTGTGTTCTT  74

Query   75  GTCGGAGGAGACCCCCTACTCATACCCAACTGGAAACCACACATACCAGGAGATTGCCGTGCCACCCCCCGTCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTCGGAGGAGACCCCCTACTCATACCCAACTGGAAACCACACATACCAGGAGATTGCCGTGCCACCCCCCGTCC  148

Query  149  CCCCACCCCCGTCCAGCGAGGCCCTCAATGGCACAATCCTTGACCCCTTAGACCAGTGGCAGCCCAGCGGCTCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  149  CCCCACCCCCGTCCAGCGAGGCCCTCAATGGCACAATCCTTGACCCCTTAGACCAGTGGCAGCCCAGCAGCTCC  222

Query  223  CGATTCATCCACCAGCAGCCTCAGTCCTCATCACCTGTGTACGGCTCCAGTGCCAAAACTTCCAGTGTCTCCAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGATTCATCCACCAGCAGCCTCAGTCCTCATCACCTGTGTACGGCTCCAGTGCCAAAACTTCCAGTGTCTCCAA  296

Query  297  CCCTCAGGACAGTGTTGGCTCTCCGTGCTCCCGAGTGGGTGAGGAGGAGCACGTCTACAGCTTCCCCAACAAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCTCAGGACAGTGTTGGCTCTCCGTGCTCCCGAGTGGGTGAGGAGGAGCACGTCTACAGCTTCCCCAACAAGC  370

Query  371  AGAAATCAGCTGAGCCTTCACCCACCGTAATGAGCACGTCCCTGGGCAGCAACCTTTCTGAACTCGACCGCCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAAATCAGCTGAGCCTTCACCCACCGTAATGAGCACGTCCCTGGGCAGCAACCTTTCTGAACTCGACCGCCTG  444

Query  445  CTGCTGGAACTGAACGCTGTACAGCATAACCCGCCAGGCTTCCCTGCAGATGAGGCCAACTCAAGCCCCCCGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGCTGGAACTGAACGCTGTACAGCATAACCCGCCAGGCTTCCCTGCAGATGAGGCCAACTCAAGCCCCCCGCT  518

Query  519  TCCTGGGGCCCTGAGCCCCCTCTATGGTGTCCCAGAGACTAACAGCCCCTTGGGAGGCAAAGCTGGGCCCCTGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCTGGGGCCCTGAGCCCCCTCTATGGTGTCCCAGAGACTAACAGCCCCTTGGGAGGCAAAGCTGGGCCCCTGA  592

Query  593  CGAAAGAGAAGCCTAAGCGGAATGGGGGCCGGGGCCTGGAGGACGTGCGGCCCAGTGTGGAGAGTCTCTTGGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CGAAAGAGAAGCCTAAGCGGAATGGGGGCCGGGGCCTGGAGGACGTGCGGCCCAGTGTGGAGAGTCTCTTGGAT  666

Query  667  GAACTGGAGAGCTCCGTGCCCAGCCCCGTCCCTGCCATCACTGTGAACCAGGGCGAGATGAGCAGCCCGCAGCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAACTGGAGAGCTCCGTGCCCAGCCCCGTCCCTGCCATCACTGTGAACCAGGGCGAGATGAGCAGCCCGCAGCG  740

Query  741  CGTCACCTCCACCCAACAGCAGACACGCATCTCGGCCTCCTCTGCCACCAGGGAGCTGGACGAGCTGATGGCTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGTCACCTCCACCCAACAGCAGACACGCATCTCGGCCTCCTCTGCCACCAGGGAGCTGGACGAGCTGATGGCTT  814

Query  815  CGCTGTCGGATTTCA-----------------------------------------------------------  829
            |||||||||||||||                                                           
Sbjct  815  CGCTGTCGGATTTCAAGGGCTCCTGGCCCCTGGAGGAGGTTGTACTTCTTGTCTCCATCAGCTCATCTGTCCAG  888

Query  830  --------------------------------------------------------------------------  829
                                                                                      
Sbjct  889  GAGGGAGAAAAGTACCCCCATCCCTGTGCTGCCAGACACCGTACCCCGAGCCTCAGGAGTCCTGACCAGCCCCC  962

Query  830  -----------AGTTCATGGCCCAGGGGAAGACAGGGAGCAGCTCACCCCCTGGGGGGCCCCCGAAGCCCGGGA  892
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCCGTGTCCACAGTTCATGGCCCAGGGGAAGACAGGGAGCAGCTCACCCCCTGGGGGGCCCCCGAAGCCCGGGA  1036

Query  893  GCCAGCTGGACAGCATGCTGGGGAGCCTGCAGTCTGACCTGAACAAGCTGGGGGTCGCCACAGTCGCCAAAGGA  966
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCCAGCTGGACAGCATGCTGGGGAGCCTGCAGTCTGACCTGAACAAGCTGGGGGTCGCCACAGTCGCCAAAGGA  1110

Query  967  GTCTGCGGGGCCTGCAAGAAGCCCATCGCCGGGCAGGTTGTGACCGCCATGGGGAAGACGTGGCACCCCGAGCA  1040
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTCTGCGGGGCCTGCAAGAAGCCCATCGCCGGGCAGGTTGTGACCGCCATGGGGAAGACGTGGCACCCCGAGCA  1184

Query 1041  CTTCGTCTGCACCCACTGCCAGGAGGAGATCGGATCCCGGAACTTCTTCGAGCGGGATGGACAGCCCTACTGTG  1114
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTTCGTCTGCACCCACTGCCAGGAGGAGATCGGATCCCGGAACTTCTTCGAGCGGGATGGACAGCCCTACTGTG  1258

Query 1115  AAAAGGACTACCACAACCTCTTCTCCCCGCGCTGCTACTACTGCAACGGCCCCATCCTGGATAAAGTGGTGACA  1188
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAAAGGACTACCACAACCTCTTCTCCCCGCGCTGCTACTACTGCAACGGCCCCATCCTGGATAAAGTGGTGACA  1332

Query 1189  GCCCTTGACCGGACGTGGCACCCTGAACACTTCTTCTGTGCACAGTGTGGAGCCTTCTTTGGTCCCGAAGGGTT  1262
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCCCTTGACCGGACGTGGCACCCTGAACACTTCTTCTGTGCACAGTGTGGAGCCTTCTTTGGTCCCGAAGGGTT  1406

Query 1263  CCACGAGAAGGACGGCAAGGCCTACTGTCGCAAGGACTACTTCGACATGTTCGCACCCAAGTGTGGCGGCTGCG  1336
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCACGAGAAGGACGGCAAGGCCTACTGTCGCAAGGACTACTTCGACATGTTCGCACCCAAGTGTGGCGGCTGCG  1480

Query 1337  CCCGGGCCATCCTGGAGAACTATATCTCAGCCCTCAACACGCTGTGGCATCCTGAGTGCTTTGTGTGCCGGGAA  1410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCCGGGCCATCCTGGAGAACTATATCTCAGCCCTCAACACGCTGTGGCATCCTGAGTGCTTTGTGTGCCGGGAA  1554

Query 1411  TGCTTCACGCCATTCGTGAACGGCAGCTTCTTCGAGCACGACGGGCAGCCCTACTGTGAGGTGCACTACCACGA  1484
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGCTTCACGCCATTCGTGAACGGCAGCTTCTTCGAGCACGACGGGCAGCCCTACTGTGAGGTGCACTACCACGA  1628

Query 1485  GCGGCGCGGCTCGCTGTGTTCTGGCTGCCAGAAGCCCATCACCGGCCGCTGCATCACCGCCATGGCCAAGAAGT  1558
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCGGCGCGGCTCGCTGTGTTCTGGCTGCCAGAAGCCCATCACCGGCCGCTGCATCACCGCCATGGCCAAGAAGT  1702

Query 1559  TCCACCCCGAGCACTTCGTCTGTGCCTTCTGCCTCAAGCAGCTCAACAAGGGCACCTTCAAGGAGCAGAACGAC  1632
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TCCACCCCGAGCACTTCGTCTGTGCCTTCTGCCTCAAGCAGCTCAACAAGGGCACCTTCAAGGAGCAGAACGAC  1776

Query 1633  AAGCCTTACTGTCAGAACTGCTTCCTCAGGCTCTTCTGC  1671
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1777  AAGCCTTACTGTCAGAACTGCTTCCTCAAGCTCTTCTGC  1815