Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06826
• Subject: NM_011223.3
• Aligned Length: 1672
• Identities: 1491
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  ATGGACGACCTCGACGCCCTGCTGGCGGACTTGGAGTCTACCACCTCCCACATCTCCAAACGGCCTGTGTTCTT  74
            ||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGACGACCTCGATGCCCTGCTGGCAGACTTGGAATCTACCACCTCCCACATCTCCAAACGGCCAGTGTTCTT  74

Query   75  GTCGGAGGAGACCCCCTACTCATACCCAACTGGAAACCACACATACCAGGAGATTGCCGTGCCACCCCCCGTCC  148
            |||.||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct   75  GTCAGAGGAGCCCCCCTACTCCTACCCAACTGGAAACCACACATACCAGGAGATTGCGGTGCCACCTCCGGTCC  148

Query  149  CCCCACCCCCGTCCAGCGAGGCCCTCAATGGCACAATCCTTGACCCCTTAGACCAGTGGCAGCCCAGCGGCTCC  222
            |.|||||.||||||||||||||||||||||||||..||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||
Sbjct  149  CACCACCACCGTCCAGCGAGGCCCTCAATGGCACGGTCCTGGACCCTTTAGATCAGTGGCAGCCTAGTGGTTCC  222

Query  223  CGATTCATCCACCAGCAGCCTCAGTCCTCATCACCTGTGTACGGCTCCAGTGCCAAAACTTCCAGTGTCTCCAA  296
            .|||.|...|||||||||||||.||||.||...||.||||||.||||||||||.||||.||||||||.||||||
Sbjct  223  AGATACGCTCACCAGCAGCCTCCGTCCCCACTGCCCGTGTACAGCTCCAGTGCTAAAAATTCCAGTGCCTCCAA  296

Query  297  CCCTCAGGACAGTGTTGGCTCTCCGTGCTCCCGAGTGGGTGAGGAGGAGCACGTCTACAGCTTCCCCAACAAGC  370
            |.|.||||||.|.||.|||||.|..||.|||||||..||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACCCAGGACGGCGTGGGCTCCCTTTGTTCCCGAGCAGGCGAGGAAGAGCACGTCTACAGCTTCCCCAACAAGC  370

Query  371  AGAAATCAGCTGAGCCTTCACCCACCGTAATGAGCACGTCCCTGGGCAGCAACCTTTCTGAACTCGACCGCCTG  444
            ||||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct  371  AGAAGTCGGCAGAGCCCTCACCTACCGTCATGAGCTCCTCCCTGGGCAGCAACCTCTCTGAACTTGACCGGCTG  444

Query  445  CTGCTGGAACTGAACGCTGTACAGCATAACCCGCCAGGCTTCCCTGCAGATGAGGCCAACTCAAGCCCCCCGCT  518
            .|.|||||.||||||||.||.|||||.|.||||||.|||||||||||||||||.|||.|.||.|||||||| ||
Sbjct  445  TTACTGGAGCTGAACGCAGTGCAGCACAGCCCGCCTGGCTTCCCTGCAGATGAAGCCGAATCGAGCCCCCC-CT  517

Query  519  T-CCTGGGGCCCTGAGCCCCCTCTATGGTGTCCCAGAGACTAACAGCCCCTTGGGAGGCAAAGCTGGGCCCCTG  591
            | |||||.||||||||||||||.|||||..|||||||.|.|||||..||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  518  TGCCTGGAGCCCTGAGCCCCCTTTATGGCATCCCAGAAAATAACACTCCCTTGGGGGGCAAAGCGGGGCCCCTG  591

Query  592  ACGAAAGAGAAGCCTAAGCGGAATGGGGGCCGGGGCCTGGAGGACGTGCGGCCCAGTGTGGAGAGTCTCTTGGA  665
            ..||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  592  GTGAAAGAGAAGCCAAAGCGAAATGGAGGCCGGGGGCTGGAGGATGTGCGGCCCAGCGTGGAGAGCCTCTTGGA  665

Query  666  TGAACTGGAGAGCTCCGTGCCCAGCCCCGTCCCTGCCATCACTGTGAACCAGGGCGAGATGAGCAGCCCGCAGC  739
            ||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  666  TGAACTGGAGAGTTCCGTGCCCAGCCCTGTCCCGGCCATCACTGTGAACCAGGGAGAGATGAGCAGTCCGCAGC  739

Query  740  GCGTCACCTCCACCCAACAGCAGACACGCATCTCGGCCTCCTCTGCCACCAGGGAGCTGGACGAGCTGATGGCT  813
            |.||||||||||.|||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  740  GAGTCACCTCCAGCCAGCAGCAGACCCGGATCTCGGCCTCCTCTGCCACCAGGGAGCTGGACGAGCTCATGGCG  813

Query  814  TCGCTGTCGGATTTCAAGTTCATGGCCCAGGGGAAGACAGGGAGCAGCTCACCCCCTGGGGGGCCCCCGAAGCC  887
            ||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|.|.|.|||||
Sbjct  814  TCACTGTCAGATTTCAAGTTCATGGCCCAGGGGAAAACTGGGAGCAGCTCACCCCCTGGGGGACTCTCCAAGCC  887

Query  888  CGGGAGCCAGCTGGACAGCATGCTGGGGAGCCTGCAGTCTGACCTGAACAAGCTGGGGGTCGCCACAGTCGCCA  961
            ||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  888  CGGGAGCCAGCTGGACAGCATGTTGGGGAGTCTGCAGTCCGACCTGAACAAGCTAGGGGTCGCCACCGTTGCCA  961

Query  962  AAGGAGTCTGCGGGGCCTGCAAGAAGCCCATCGCCGGGCAGGTTGTGACCGCCATGGGGAAGACGTGGCACCCC  1035
            ||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  962  AAGGGGTCTGTGGAGCCTGCAAGAAGCCCATCGCCGGGCAGGTCGTGACCGCCATGGGGAAGACATGGCACCCC  1035

Query 1036  GAGCACTTCGTCTGCACCCACTGCCAGGAGGAGATCGGATCCCGGAACTTCTTCGAGCGGGATGGACAGCCCTA  1109
            ||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1036  GAGCACTTTGTGTGCACCCACTGCCAGGAGGAGATTGGATCCCGAAACTTTTTTGAGCGGGACGGACAGCCCTA  1109

Query 1110  CTGTGAAAAGGACTACCACAACCTCTTCTCCCCGCGCTGCTACTACTGCAACGGCCCCATCCTGGATAAAGTGG  1183
            ||||||.|||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1110  CTGTGAGAAGGACTACCACAGCCTCTTCTCCCCACGCTGCTACTACTGCAACGGACCCATCCTGGATAAAGTGG  1183

Query 1184  TGACAGCCCTTGACCGGACGTGGCACCCTGAACACTTCTTCTGTGCACAGTGTGGAGCCTTCTTTGGTCCCGAA  1257
            |||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1184  TGACAGCGCTGGACCGCACATGGCACCCGGAACACTTCTTCTGTGCCCAGTGTGGAGCCTTCTTTGGTCCAGAA  1257

Query 1258  GGGTTCCACGAGAAGGACGGCAAGGCCTACTGTCGCAAGGACTACTTCGACATGTTCGCACCCAAGTGTGGCGG  1331
            ||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 1258  GGCTTCCACGAGAAGGACGGCAAAGCGTACTGTCGTAAAGATTACTTCGACATGTTTGCTCCCAAGTGCGGCGG  1331

Query 1332  CTGCGCCCGGGCCATCCTGGAGAACTATATCTCAGCCCTCAACACGCTGTGGCATCCTGAGTGCTTTGTGTGCC  1405
            |||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||.
Sbjct 1332  CTGCGCCCGTGCCATCCTGGAGAACTACATTTCAGCCCTCAACACCCTCTGGCACCCCGAATGCTTTGTGTGCA  1405

Query 1406  GGGAATGCTTCACGCCATTCGTGAACGGCAGCTTCTTCGAGCACGACGGGCAGCCCTACTGTGAGGTGCACTAC  1479
            ||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1406  GGGAGTGCTTCACACCCTTCGTCAACGGCAGCTTCTTTGAGCACGACGGGCAGCCGTACTGTGAGGTCCACTAC  1479

Query 1480  CACGAGCGGCGCGGCTCGCTGTGTTCTGGCTGCCAGAAGCCCATCACCGGCCGCTGCATCACCGCCATGGCCAA  1553
            |||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480  CACGAGCGGCGCGGCTCGCTGTGCTCCGGCTGCCAGAAGCCCATCACGGGCCGCTGCATCACCGCCATGGCCAA  1553

Query 1554  GAAGTTCCACCCCGAGCACTTCGTCTGTGCCTTCTGCCTCAAGCAGCTCAACAAGGGCACCTTCAAGGAGCAGA  1627
            ||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554  GAAGTTCCACCCCGAGCATTTCGTGTGCGCCTTTTGCCTGAAGCAGCTCAACAAGGGCACCTTCAAGGAGCAGA  1627

Query 1628  ACGACAAGCCTTACTGTCAGAACTGCTTCCTCAGGCTCTTCTGC  1671
            |||||||.||.|||||.||||.|||||||.|.|.||||||||||
Sbjct 1628  ACGACAAACCCTACTGCCAGAGCTGCTTCGTGAAGCTCTTCTGC  1671