Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06826
• Subject: NM_133915.3
• Aligned Length: 1774
• Identities: 1491
• Gaps: 104

Alignment

Query    1  ATGGACGACCTCGACGCCCTGCTGGCGGACTTGGAGTCTACCACCTCCCACATCTCCAAACGGCCTGTGTTCTT  74
            ||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGACGACCTCGATGCCCTGCTGGCAGACTTGGAATCTACCACCTCCCACATCTCCAAACGGCCAGTGTTCTT  74

Query   75  GTCGGAGGAGACCCCCTACTCATACCCAACTGGAAACCACACATACCAGGAGATTGCCGTGCCACCCCCCGTCC  148
            |||.||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct   75  GTCAGAGGAGCCCCCCTACTCCTACCCAACTGGAAACCACACATACCAGGAGATTGCGGTGCCACCTCCGGTCC  148

Query  149  CCCCACCCCCGTCCAGCGAGGCCCTCAATGGCACAATCCTTGACCCCTTAGACCAGTGGCAGCCCAGCGGCTCC  222
            |.|||||.||||||||||||||||||||||||||..||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||
Sbjct  149  CACCACCACCGTCCAGCGAGGCCCTCAATGGCACGGTCCTGGACCCTTTAGATCAGTGGCAGCCTAGTGGTTCC  222

Query  223  CGATTCATCCACCAGCAGCCTCAGTCCTCATCACCTGTGTACGGCTCCAGTGCCAAAACTTCCAGTGTCTCCAA  296
            .|||.|...|||||||||||||.||||.||...||.||||||.||||||||||.||||.||||||||.||||||
Sbjct  223  AGATACGCTCACCAGCAGCCTCCGTCCCCACTGCCCGTGTACAGCTCCAGTGCTAAAAATTCCAGTGCCTCCAA  296

Query  297  CCCTCAGGACAGTGTTGGCTCTCCGTGCTCCCGAGTGGGTGAGGAGGAGCACGTCTACAGCTTCCCCAACAAGC  370
            |.|.||||||.|.||.|||||.|..||.|||||||..||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACCCAGGACGGCGTGGGCTCCCTTTGTTCCCGAGCAGGCGAGGAAGAGCACGTCTACAGCTTCCCCAACAAGC  370

Query  371  AGAAATCAGCTGAGCCTTCACCCACCGTAATGAGCACGTCCCTGGGCAGCAACCTTTCTGAACTCGACCGCCTG  444
            ||||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct  371  AGAAGTCGGCAGAGCCCTCACCTACCGTCATGAGCTCCTCCCTGGGCAGCAACCTCTCTGAACTTGACCGGCTG  444

Query  445  CTGCTGGAACTGAACGCTGTACAGCATAACCCGCCAGGCTTCCCTGCAGATGAGGCCAACTCAAGCCCCCCGCT  518
            .|.|||||.||||||||.||.|||||.|.||||||.|||||||||||||||||.|||.|.||.|||||||| ||
Sbjct  445  TTACTGGAGCTGAACGCAGTGCAGCACAGCCCGCCTGGCTTCCCTGCAGATGAAGCCGAATCGAGCCCCCC-CT  517

Query  519  T-CCTGGGGCCCTGAGCCCCCTCTATGGTGTCCCAGAGACTAACAGCCCCTTGGGAGGCAAAGCTGGGCCCCTG  591
            | |||||.||||||||||||||.|||||..|||||||.|.|||||..||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  518  TGCCTGGAGCCCTGAGCCCCCTTTATGGCATCCCAGAAAATAACACTCCCTTGGGGGGCAAAGCGGGGCCCCTG  591

Query  592  ACGAAAGAGAAGCCTAAGCGGAATGGGGGCCGGGGCCTGGAGGACGTGCGGCCCAGTGTGGAGAGTCTCTTGGA  665
            ..||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  592  GTGAAAGAGAAGCCAAAGCGAAATGGAGGCCGGGGGCTGGAGGATGTGCGGCCCAGCGTGGAGAGCCTCTTGGA  665

Query  666  TGAACTGGAGAGCTCCGTGCCCAGCCCCGTCCCTGCCATCACTGTGAACCAGGGCGAGATGAGCAGCCCGCAGC  739
            ||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  666  TGAACTGGAGAGTTCCGTGCCCAGCCCTGTCCCGGCCATCACTGTGAACCAGGGAGAGATGAGCAGTCCGCAGC  739

Query  740  GCGTCACCTCCACCCAACAGCAGACACGCATCTCGGCCTCCTCTGCCACCAGGGAGCTGGACGAGCTGATGGCT  813
            |.||||||||||.|||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  740  GAGTCACCTCCAGCCAGCAGCAGACCCGGATCTCGGCCTCCTCTGCCACCAGGGAGCTGGACGAGCTCATGGCG  813

Query  814  TCGCTGTCGGATTTCAA---------------------------------------------------------  830
            ||.|||||.||||||||                                                         
Sbjct  814  TCACTGTCAGATTTCAAGATGCAGGGCCTGGAACAGAGAGTGGATGGAGAGCGGCCGTGGGCAGCCAGCTGGCC  887

Query  831  ---------------------------------------------GTTCATGGCCCAGGGGAAGACAGGGAGCA  859
                                                         ||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  888  CCCCAGCAGCAGGCAGAGCAGCCCCGAAGGGCAGGACGAGGGAGGGTTCATGGCCCAGGGGAAAACTGGGAGCA  961

Query  860  GCTCACCCCCTGGGGGGCCCCCGAAGCCCGGGAGCCAGCTGGACAGCATGCTGGGGAGCCTGCAGTCTGACCTG  933
            ||||||||||||||||.|.|.|.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||
Sbjct  962  GCTCACCCCCTGGGGGACTCTCCAAGCCCGGGAGCCAGCTGGACAGCATGTTGGGGAGTCTGCAGTCCGACCTG  1035

Query  934  AACAAGCTGGGGGTCGCCACAGTCGCCAAAGGAGTCTGCGGGGCCTGCAAGAAGCCCATCGCCGGGCAGGTTGT  1007
            ||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1036  AACAAGCTAGGGGTCGCCACCGTTGCCAAAGGGGTCTGTGGAGCCTGCAAGAAGCCCATCGCCGGGCAGGTCGT  1109

Query 1008  GACCGCCATGGGGAAGACGTGGCACCCCGAGCACTTCGTCTGCACCCACTGCCAGGAGGAGATCGGATCCCGGA  1081
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1110  GACCGCCATGGGGAAGACATGGCACCCCGAGCACTTTGTGTGCACCCACTGCCAGGAGGAGATTGGATCCCGAA  1183

Query 1082  ACTTCTTCGAGCGGGATGGACAGCCCTACTGTGAAAAGGACTACCACAACCTCTTCTCCCCGCGCTGCTACTAC  1155
            ||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1184  ACTTTTTTGAGCGGGACGGACAGCCCTACTGTGAGAAGGACTACCACAGCCTCTTCTCCCCACGCTGCTACTAC  1257

Query 1156  TGCAACGGCCCCATCCTGGATAAAGTGGTGACAGCCCTTGACCGGACGTGGCACCCTGAACACTTCTTCTGTGC  1229
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1258  TGCAACGGACCCATCCTGGATAAAGTGGTGACAGCGCTGGACCGCACATGGCACCCGGAACACTTCTTCTGTGC  1331

Query 1230  ACAGTGTGGAGCCTTCTTTGGTCCCGAAGGGTTCCACGAGAAGGACGGCAAGGCCTACTGTCGCAAGGACTACT  1303
            .|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||||
Sbjct 1332  CCAGTGTGGAGCCTTCTTTGGTCCAGAAGGCTTCCACGAGAAGGACGGCAAAGCGTACTGTCGTAAAGATTACT  1405

Query 1304  TCGACATGTTCGCACCCAAGTGTGGCGGCTGCGCCCGGGCCATCCTGGAGAACTATATCTCAGCCCTCAACACG  1377
            ||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1406  TCGACATGTTTGCTCCCAAGTGCGGCGGCTGCGCCCGTGCCATCCTGGAGAACTACATTTCAGCCCTCAACACC  1479

Query 1378  CTGTGGCATCCTGAGTGCTTTGTGTGCCGGGAATGCTTCACGCCATTCGTGAACGGCAGCTTCTTCGAGCACGA  1451
            ||.|||||.||.||.||||||||||||.||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1480  CTCTGGCACCCCGAATGCTTTGTGTGCAGGGAGTGCTTCACACCCTTCGTCAACGGCAGCTTCTTTGAGCACGA  1553

Query 1452  CGGGCAGCCCTACTGTGAGGTGCACTACCACGAGCGGCGCGGCTCGCTGTGTTCTGGCTGCCAGAAGCCCATCA  1525
            |||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1554  CGGGCAGCCGTACTGTGAGGTCCACTACCACGAGCGGCGCGGCTCGCTGTGCTCCGGCTGCCAGAAGCCCATCA  1627

Query 1526  CCGGCCGCTGCATCACCGCCATGGCCAAGAAGTTCCACCCCGAGCACTTCGTCTGTGCCTTCTGCCTCAAGCAG  1599
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 1628  CGGGCCGCTGCATCACCGCCATGGCCAAGAAGTTCCACCCCGAGCATTTCGTGTGCGCCTTTTGCCTGAAGCAG  1701

Query 1600  CTCAACAAGGGCACCTTCAAGGAGCAGAACGACAAGCCTTACTGTCAGAACTGCTTCCTCAGGCTCTTCTGC  1671
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||.|||||||.|.|.||||||||||
Sbjct 1702  CTCAACAAGGGCACCTTCAAGGAGCAGAACGACAAACCCTACTGCCAGAGCTGCTTCGTGAAGCTCTTCTGC  1773