Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06826
• Subject: XM_017019737.2
• Aligned Length: 2100
• Identities: 1667
• Gaps: 429

Alignment

Query    1  AT--GGAC---------------GACCTC-GACGCCCTGCTGGCGGACTTGGAGTCTACCACCTCCCACATCTC  56
            ||  ||||               |||..| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGACACTGCGTGAAGCCAAGACAGCAGACGCCCTGCTGGCGGACTTGGAGTCTACCACCTCCCACATCTC  74

Query   57  CAAACGGCCTGTGTTCTTGTCGGAGGAGACCCCCTACTCATACCCAACTGGAAACCACACATACCAGGAGATTG  130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAAACGGCCTGTGTTCTTGTCGGAGGAGACCCCCTACTCATACCCAACTGGAAACCACACATACCAGGAGATTG  148

Query  131  CCGTGCCACCCCCCGTCCCCCCACCCCCGTCCAGCGAGGCCCTCAATGGCACAATCCTTGACCCCTTAGACCAG  204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCGTGCCACCCCCCGTCCCCCCACCCCCGTCCAGCGAGGCCCTCAATGGCACAATCCTTGACCCCTTAGACCAG  222

Query  205  TGGCAGCCCAGCGGCTCCCGATTCATCCACCAGCAGCCTCAGTCCTCATCACCTGTGTACGGCTCCAGTGCCAA  278
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGCAGCCCAGCAGCTCCCGATTCATCCACCAGCAGCCTCAGTCCTCATCACCTGTGTACGGCTCCAGTGCCAA  296

Query  279  AACTTCCAGTGTCTCCAACCCTCAGGACAGTGTTGGCTCTCCGTGCTCCCGAGTGGGTGAGGAGGAGCACGTCT  352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AACTTCCAGTGTCTCCAACCCTCAGGACAGTGTTGGCTCTCCGTGCTCCCGAGTGGGTGAGGAGGAGCACGTCT  370

Query  353  ACAGCTTCCCCAACAAGCAGAAATCAGCTGAGCCTTCACCCACCGTAATGAGCACGTCCCTGGGCAGCAACCTT  426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAGCTTCCCCAACAAGCAGAAATCAGCTGAGCCTTCACCCACCGTAATGAGCACGTCCCTGGGCAGCAACCTT  444

Query  427  TCTGAACTCGACCGCCTGCTGCTGGAACTGAACGCTGTACAGCATAACCCGCCAGGCTTCCCTGCAGATGAGGC  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCTGAACTCGACCGCCTGCTGCTGGAACTGAACGCTGTACAGCATAACCCGCCAGGCTTCCCTGCAGATGAGGC  518

Query  501  CAACTCAAGCCCCCCGCTTCCTGGGGCCCTGAGCCCCCTCTATGGTGTCCCAGAGACTAACAGCCCCTTGGGAG  574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAACTCAAGCCCCCCGCTTCCTGGGGCCCTGAGCCCCCTCTATGGTGTCCCAGAGACTAACAGCCCCTTGGGAG  592

Query  575  GCAAAGCTGGGCCCCTGACGAAAGAGAAGCCTAAGCGGAATGGGGGCCGGGGCCTGGAGGACGTGCGGCCCAGT  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCAAAGCTGGGCCCCTGACGAAAGAGAAGCCTAAGCGGAATGGGGGCCGGGGCCTGGAGGACGTGCGGCCCAGT  666

Query  649  GTGGAGAGTCTCTTGGATGAACTGGAGAGCTCCGTGCCCAGCCCCGTCCCTGCCATCACTGTGAACCAGGGCGA  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGGAGAGTCTCTTGGATGAACTGGAGAGCTCCGTGCCCAGCCCCGTCCCTGCCATCACTGTGAACCAGGGCGA  740

Query  723  GATGAGCAGCCCGCAGCGCGTCACCTCCACCCAACAGCAGACACGCATCTCGGCCTCCTCTGCCACCAGGGAGC  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GATGAGCAGCCCGCAGCGCGTCACCTCCACCCAACAGCAGACACGCATCTCGGCCTCCTCTGCCACCAGGGAGC  814

Query  797  TGGACGAGCTGATGGCTTCGCTGTCGGATTTCAA----------------------------------------  830
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                        
Sbjct  815  TGGACGAGCTGATGGCTTCGCTGTCGGATTTCAAGGTTGTCTTCCCTCCTGGCTCTCCCATTCCCCTGAGAAGA  888

Query  831  --------------------------------------------------------------------------  830
                                                                                      
Sbjct  889  ACCATCTCTGTCCTGGCTTCTCCTTCTGTCCCTTTGCTCCAGCATCGCACAGACGCCGCGGCCAGCAGCTCTTC  962

Query  831  --------------------------------------------------------------------------  830
                                                                                      
Sbjct  963  TCCCCTGCCCAGCCTGCTCGCCTCCTCCCCCCTGGGGCCCTCAGCTTATACCTGTGGTTCTTCTGGGGTCCAGA  1036

Query  831  --------------------------------------------------------------------------  830
                                                                                      
Sbjct 1037  GTGCAGGGGAAGAGCCCCATGATGAGGGGGTGCAGGGCCCTGCCCTTCCCATTCCTGCACCCCACACCATGAGG  1110

Query  831  --------------------------------------------------------------------------  830
                                                                                      
Sbjct 1111  TCCGTGGGCTGCCAGACTGATGAGGACCCGCTCTTCCCCCCGATGCAGATCCAGGGCCTGGAGCAAAGAGCGGA  1184

Query  831  --------------------------------------------------------------------------  830
                                                                                      
Sbjct 1185  TGGGGAGCGGTGCTGGGCGGCCGGCTGGCCTCGGGACGGCGGGCGGAGCAGCCCCGGAGGGCAGGACGAGGGAG  1258

Query  831  -GTTCATGGCCCAGGGGAAGACAGGGAGCAGCTCACCCCCTGGGGGGCCCCCGAAGCCCGGGAGCCAGCTGGAC  903
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGTTCATGGCCCAGGGGAAGACAGGGAGCAGCTCACCCCCTGGGGGGCCCCCGAAGCCCGGGAGCCAGCTGGAC  1332

Query  904  AGCATGCTGGGGAGCCTGCAGTCTGACCTGAACAAGCTGGGGGTCGCCACAGTCGCCAAAGGAGTCTGCGGGGC  977
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGCATGCTGGGGAGCCTGCAGTCTGACCTGAACAAGCTGGGGGTCGCCACAGTCGCCAAAGGAGTCTGCGGGGC  1406

Query  978  CTGCAAGAAGCCCATCGCCGGGCAGGTTGTGACCGCCATGGGGAAGACGTGGCACCCCGAGCACTTCGTCTGCA  1051
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTGCAAGAAGCCCATCGCCGGGCAGGTTGTGACCGCCATGGGGAAGACGTGGCACCCCGAGCACTTCGTCTGCA  1480

Query 1052  CCCACTGCCAGGAGGAGATCGGATCCCGGAACTTCTTCGAGCGGGATGGACAGCCCTACTGTGAAAAGGACTAC  1125
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCCACTGCCAGGAGGAGATCGGATCCCGGAACTTCTTCGAGCGGGATGGACAGCCCTACTGTGAAAAGGACTAC  1554

Query 1126  CACAACCTCTTCTCCCCGCGCTGCTACTACTGCAACGGCCCCATCCTGGATAAAGTGGTGACAGCCCTTGACCG  1199
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CACAACCTCTTCTCCCCGCGCTGCTACTACTGCAACGGCCCCATCCTGGATAAAGTGGTGACAGCCCTTGACCG  1628

Query 1200  GACGTGGCACCCTGAACACTTCTTCTGTGCACAGTGTGGAGCCTTCTTTGGTCCCGAAGGGTTCCACGAGAAGG  1273
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GACGTGGCACCCTGAACACTTCTTCTGTGCACAGTGTGGAGCCTTCTTTGGTCCCGAAGGGTTCCACGAGAAGG  1702

Query 1274  ACGGCAAGGCCTACTGTCGCAAGGACTACTTCGACATGTTCGCACCCAAGTGTGGCGGCTGCGCCCGGGCCATC  1347
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACGGCAAGGCCTACTGTCGCAAGGACTACTTCGACATGTTCGCACCCAAGTGTGGCGGCTGCGCCCGGGCCATC  1776

Query 1348  CTGGAGAACTATATCTCAGCCCTCAACACGCTGTGGCATCCTGAGTGCTTTGTGTGCCGGGAATGCTTCACGCC  1421
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTGGAGAACTATATCTCAGCCCTCAACACGCTGTGGCATCCTGAGTGCTTTGTGTGCCGGGAATGCTTCACGCC  1850

Query 1422  ATTCGTGAACGGCAGCTTCTTCGAGCACGACGGGCAGCCCTACTGTGAGGTGCACTACCACGAGCGGCGCGGCT  1495
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ATTCGTGAACGGCAGCTTCTTCGAGCACGACGGGCAGCCCTACTGTGAGGTGCACTACCACGAGCGGCGCGGCT  1924

Query 1496  CGCTGTGTTCTGGCTGCCAGAAGCCCATCACCGGCCGCTGCATCACCGCCATGGCCAAGAAGTTCCACCCCGAG  1569
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CGCTGTGTTCTGGCTGCCAGAAGCCCATCACCGGCCGCTGCATCACCGCCATGGCCAAGAAGTTCCACCCCGAG  1998

Query 1570  CACTTCGTCTGTGCCTTCTGCCTCAAGCAGCTCAACAAGGGCACCTTCAAGGAGCAGAACGACAAGCCTTACTG  1643
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CACTTCGTCTGTGCCTTCTGCCTCAAGCAGCTCAACAAGGGCACCTTCAAGGAGCAGAACGACAAGCCTTACTG  2072

Query 1644  TCAGAACTGCTTCCTCAGGCTCTTCTGC  1671
            |||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2073  TCAGAACTGCTTCCTCAAGCTCTTCTGC  2100