Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06826
• Subject: XM_017019740.2
• Aligned Length: 1791
• Identities: 1667
• Gaps: 120

Alignment

Query    1  AT--GGAC---------------GACCTC-GACGCCCTGCTGGCGGACTTGGAGTCTACCACCTCCCACATCTC  56
            ||  ||||               |||..| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGACACTGCGTGAAGCCAAGACAGCAGACGCCCTGCTGGCGGACTTGGAGTCTACCACCTCCCACATCTC  74

Query   57  CAAACGGCCTGTGTTCTTGTCGGAGGAGACCCCCTACTCATACCCAACTGGAAACCACACATACCAGGAGATTG  130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAAACGGCCTGTGTTCTTGTCGGAGGAGACCCCCTACTCATACCCAACTGGAAACCACACATACCAGGAGATTG  148

Query  131  CCGTGCCACCCCCCGTCCCCCCACCCCCGTCCAGCGAGGCCCTCAATGGCACAATCCTTGACCCCTTAGACCAG  204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCGTGCCACCCCCCGTCCCCCCACCCCCGTCCAGCGAGGCCCTCAATGGCACAATCCTTGACCCCTTAGACCAG  222

Query  205  TGGCAGCCCAGCGGCTCCCGATTCATCCACCAGCAGCCTCAGTCCTCATCACCTGTGTACGGCTCCAGTGCCAA  278
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGCAGCCCAGCAGCTCCCGATTCATCCACCAGCAGCCTCAGTCCTCATCACCTGTGTACGGCTCCAGTGCCAA  296

Query  279  AACTTCCAGTGTCTCCAACCCTCAGGACAGTGTTGGCTCTCCGTGCTCCCGAGTGGGTGAGGAGGAGCACGTCT  352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AACTTCCAGTGTCTCCAACCCTCAGGACAGTGTTGGCTCTCCGTGCTCCCGAGTGGGTGAGGAGGAGCACGTCT  370

Query  353  ACAGCTTCCCCAACAAGCAGAAATCAGCTGAGCCTTCACCCACCGTAATGAGCACGTCCCTGGGCAGCAACCTT  426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAGCTTCCCCAACAAGCAGAAATCAGCTGAGCCTTCACCCACCGTAATGAGCACGTCCCTGGGCAGCAACCTT  444

Query  427  TCTGAACTCGACCGCCTGCTGCTGGAACTGAACGCTGTACAGCATAACCCGCCAGGCTTCCCTGCAGATGAGGC  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCTGAACTCGACCGCCTGCTGCTGGAACTGAACGCTGTACAGCATAACCCGCCAGGCTTCCCTGCAGATGAGGC  518

Query  501  CAACTCAAGCCCCCCGCTTCCTGGGGCCCTGAGCCCCCTCTATGGTGTCCCAGAGACTAACAGCCCCTTGGGAG  574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAACTCAAGCCCCCCGCTTCCTGGGGCCCTGAGCCCCCTCTATGGTGTCCCAGAGACTAACAGCCCCTTGGGAG  592

Query  575  GCAAAGCTGGGCCCCTGACGAAAGAGAAGCCTAAGCGGAATGGGGGCCGGGGCCTGGAGGACGTGCGGCCCAGT  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCAAAGCTGGGCCCCTGACGAAAGAGAAGCCTAAGCGGAATGGGGGCCGGGGCCTGGAGGACGTGCGGCCCAGT  666

Query  649  GTGGAGAGTCTCTTGGATGAACTGGAGAGCTCCGTGCCCAGCCCCGTCCCTGCCATCACTGTGAACCAGGGCGA  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGGAGAGTCTCTTGGATGAACTGGAGAGCTCCGTGCCCAGCCCCGTCCCTGCCATCACTGTGAACCAGGGCGA  740

Query  723  GATGAGCAGCCCGCAGCGCGTCACCTCCACCCAACAGCAGACACGCATCTCGGCCTCCTCTGCCACCAGGGAGC  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GATGAGCAGCCCGCAGCGCGTCACCTCCACCCAACAGCAGACACGCATCTCGGCCTCCTCTGCCACCAGGGAGC  814

Query  797  TGGACGAGCTGATGGCTTCGCTGTCGGATTTCAA----------------------------------------  830
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                        
Sbjct  815  TGGACGAGCTGATGGCTTCGCTGTCGGATTTCAAGATCCAGGGCCTGGAGCAAAGAGCGGATGGGGAGCGGTGC  888

Query  831  --------------------------------------------------------------GTTCATGGCCCA  842
                                                                          ||||||||||||
Sbjct  889  TGGGCGGCCGGCTGGCCTCGGGACGGCGGGCGGAGCAGCCCCGGAGGGCAGGACGAGGGAGGGTTCATGGCCCA  962

Query  843  GGGGAAGACAGGGAGCAGCTCACCCCCTGGGGGGCCCCCGAAGCCCGGGAGCCAGCTGGACAGCATGCTGGGGA  916
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGGGAAGACAGGGAGCAGCTCACCCCCTGGGGGGCCCCCGAAGCCCGGGAGCCAGCTGGACAGCATGCTGGGGA  1036

Query  917  GCCTGCAGTCTGACCTGAACAAGCTGGGGGTCGCCACAGTCGCCAAAGGAGTCTGCGGGGCCTGCAAGAAGCCC  990
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCCTGCAGTCTGACCTGAACAAGCTGGGGGTCGCCACAGTCGCCAAAGGAGTCTGCGGGGCCTGCAAGAAGCCC  1110

Query  991  ATCGCCGGGCAGGTTGTGACCGCCATGGGGAAGACGTGGCACCCCGAGCACTTCGTCTGCACCCACTGCCAGGA  1064
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATCGCCGGGCAGGTTGTGACCGCCATGGGGAAGACGTGGCACCCCGAGCACTTCGTCTGCACCCACTGCCAGGA  1184

Query 1065  GGAGATCGGATCCCGGAACTTCTTCGAGCGGGATGGACAGCCCTACTGTGAAAAGGACTACCACAACCTCTTCT  1138
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAGATCGGATCCCGGAACTTCTTCGAGCGGGATGGACAGCCCTACTGTGAAAAGGACTACCACAACCTCTTCT  1258

Query 1139  CCCCGCGCTGCTACTACTGCAACGGCCCCATCCTGGATAAAGTGGTGACAGCCCTTGACCGGACGTGGCACCCT  1212
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCCCGCGCTGCTACTACTGCAACGGCCCCATCCTGGATAAAGTGGTGACAGCCCTTGACCGGACGTGGCACCCT  1332

Query 1213  GAACACTTCTTCTGTGCACAGTGTGGAGCCTTCTTTGGTCCCGAAGGGTTCCACGAGAAGGACGGCAAGGCCTA  1286
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAACACTTCTTCTGTGCACAGTGTGGAGCCTTCTTTGGTCCCGAAGGGTTCCACGAGAAGGACGGCAAGGCCTA  1406

Query 1287  CTGTCGCAAGGACTACTTCGACATGTTCGCACCCAAGTGTGGCGGCTGCGCCCGGGCCATCCTGGAGAACTATA  1360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTGTCGCAAGGACTACTTCGACATGTTCGCACCCAAGTGTGGCGGCTGCGCCCGGGCCATCCTGGAGAACTATA  1480

Query 1361  TCTCAGCCCTCAACACGCTGTGGCATCCTGAGTGCTTTGTGTGCCGGGAATGCTTCACGCCATTCGTGAACGGC  1434
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCTCAGCCCTCAACACGCTGTGGCATCCTGAGTGCTTTGTGTGCCGGGAATGCTTCACGCCATTCGTGAACGGC  1554

Query 1435  AGCTTCTTCGAGCACGACGGGCAGCCCTACTGTGAGGTGCACTACCACGAGCGGCGCGGCTCGCTGTGTTCTGG  1508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGCTTCTTCGAGCACGACGGGCAGCCCTACTGTGAGGTGCACTACCACGAGCGGCGCGGCTCGCTGTGTTCTGG  1628

Query 1509  CTGCCAGAAGCCCATCACCGGCCGCTGCATCACCGCCATGGCCAAGAAGTTCCACCCCGAGCACTTCGTCTGTG  1582
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTGCCAGAAGCCCATCACCGGCCGCTGCATCACCGCCATGGCCAAGAAGTTCCACCCCGAGCACTTCGTCTGTG  1702

Query 1583  CCTTCTGCCTCAAGCAGCTCAACAAGGGCACCTTCAAGGAGCAGAACGACAAGCCTTACTGTCAGAACTGCTTC  1656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCTTCTGCCTCAAGCAGCTCAACAAGGGCACCTTCAAGGAGCAGAACGACAAGCCTTACTGTCAGAACTGCTTC  1776

Query 1657  CTCAGGCTCTTCTGC  1671
            ||||.||||||||||
Sbjct 1777  CTCAAGCTCTTCTGC  1791