Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06826
• Subject: XM_017019742.2
• Aligned Length: 1689
• Identities: 1667
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  AT--GGAC---------------GACCTC-GACGCCCTGCTGGCGGACTTGGAGTCTACCACCTCCCACATCTC  56
            ||  ||||               |||..| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGACACTGCGTGAAGCCAAGACAGCAGACGCCCTGCTGGCGGACTTGGAGTCTACCACCTCCCACATCTC  74

Query   57  CAAACGGCCTGTGTTCTTGTCGGAGGAGACCCCCTACTCATACCCAACTGGAAACCACACATACCAGGAGATTG  130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAAACGGCCTGTGTTCTTGTCGGAGGAGACCCCCTACTCATACCCAACTGGAAACCACACATACCAGGAGATTG  148

Query  131  CCGTGCCACCCCCCGTCCCCCCACCCCCGTCCAGCGAGGCCCTCAATGGCACAATCCTTGACCCCTTAGACCAG  204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCGTGCCACCCCCCGTCCCCCCACCCCCGTCCAGCGAGGCCCTCAATGGCACAATCCTTGACCCCTTAGACCAG  222

Query  205  TGGCAGCCCAGCGGCTCCCGATTCATCCACCAGCAGCCTCAGTCCTCATCACCTGTGTACGGCTCCAGTGCCAA  278
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGCAGCCCAGCAGCTCCCGATTCATCCACCAGCAGCCTCAGTCCTCATCACCTGTGTACGGCTCCAGTGCCAA  296

Query  279  AACTTCCAGTGTCTCCAACCCTCAGGACAGTGTTGGCTCTCCGTGCTCCCGAGTGGGTGAGGAGGAGCACGTCT  352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AACTTCCAGTGTCTCCAACCCTCAGGACAGTGTTGGCTCTCCGTGCTCCCGAGTGGGTGAGGAGGAGCACGTCT  370

Query  353  ACAGCTTCCCCAACAAGCAGAAATCAGCTGAGCCTTCACCCACCGTAATGAGCACGTCCCTGGGCAGCAACCTT  426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAGCTTCCCCAACAAGCAGAAATCAGCTGAGCCTTCACCCACCGTAATGAGCACGTCCCTGGGCAGCAACCTT  444

Query  427  TCTGAACTCGACCGCCTGCTGCTGGAACTGAACGCTGTACAGCATAACCCGCCAGGCTTCCCTGCAGATGAGGC  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCTGAACTCGACCGCCTGCTGCTGGAACTGAACGCTGTACAGCATAACCCGCCAGGCTTCCCTGCAGATGAGGC  518

Query  501  CAACTCAAGCCCCCCGCTTCCTGGGGCCCTGAGCCCCCTCTATGGTGTCCCAGAGACTAACAGCCCCTTGGGAG  574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAACTCAAGCCCCCCGCTTCCTGGGGCCCTGAGCCCCCTCTATGGTGTCCCAGAGACTAACAGCCCCTTGGGAG  592

Query  575  GCAAAGCTGGGCCCCTGACGAAAGAGAAGCCTAAGCGGAATGGGGGCCGGGGCCTGGAGGACGTGCGGCCCAGT  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCAAAGCTGGGCCCCTGACGAAAGAGAAGCCTAAGCGGAATGGGGGCCGGGGCCTGGAGGACGTGCGGCCCAGT  666

Query  649  GTGGAGAGTCTCTTGGATGAACTGGAGAGCTCCGTGCCCAGCCCCGTCCCTGCCATCACTGTGAACCAGGGCGA  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGGAGAGTCTCTTGGATGAACTGGAGAGCTCCGTGCCCAGCCCCGTCCCTGCCATCACTGTGAACCAGGGCGA  740

Query  723  GATGAGCAGCCCGCAGCGCGTCACCTCCACCCAACAGCAGACACGCATCTCGGCCTCCTCTGCCACCAGGGAGC  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GATGAGCAGCCCGCAGCGCGTCACCTCCACCCAACAGCAGACACGCATCTCGGCCTCCTCTGCCACCAGGGAGC  814

Query  797  TGGACGAGCTGATGGCTTCGCTGTCGGATTTCAAGTTCATGGCCCAGGGGAAGACAGGGAGCAGCTCACCCCCT  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGACGAGCTGATGGCTTCGCTGTCGGATTTCAAGTTCATGGCCCAGGGGAAGACAGGGAGCAGCTCACCCCCT  888

Query  871  GGGGGGCCCCCGAAGCCCGGGAGCCAGCTGGACAGCATGCTGGGGAGCCTGCAGTCTGACCTGAACAAGCTGGG  944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGGGGGCCCCCGAAGCCCGGGAGCCAGCTGGACAGCATGCTGGGGAGCCTGCAGTCTGACCTGAACAAGCTGGG  962

Query  945  GGTCGCCACAGTCGCCAAAGGAGTCTGCGGGGCCTGCAAGAAGCCCATCGCCGGGCAGGTTGTGACCGCCATGG  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGTCGCCACAGTCGCCAAAGGAGTCTGCGGGGCCTGCAAGAAGCCCATCGCCGGGCAGGTTGTGACCGCCATGG  1036

Query 1019  GGAAGACGTGGCACCCCGAGCACTTCGTCTGCACCCACTGCCAGGAGGAGATCGGATCCCGGAACTTCTTCGAG  1092
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGAAGACGTGGCACCCCGAGCACTTCGTCTGCACCCACTGCCAGGAGGAGATCGGATCCCGGAACTTCTTCGAG  1110

Query 1093  CGGGATGGACAGCCCTACTGTGAAAAGGACTACCACAACCTCTTCTCCCCGCGCTGCTACTACTGCAACGGCCC  1166
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGGGATGGACAGCCCTACTGTGAAAAGGACTACCACAACCTCTTCTCCCCGCGCTGCTACTACTGCAACGGCCC  1184

Query 1167  CATCCTGGATAAAGTGGTGACAGCCCTTGACCGGACGTGGCACCCTGAACACTTCTTCTGTGCACAGTGTGGAG  1240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATCCTGGATAAAGTGGTGACAGCCCTTGACCGGACGTGGCACCCTGAACACTTCTTCTGTGCACAGTGTGGAG  1258

Query 1241  CCTTCTTTGGTCCCGAAGGGTTCCACGAGAAGGACGGCAAGGCCTACTGTCGCAAGGACTACTTCGACATGTTC  1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCTTCTTTGGTCCCGAAGGGTTCCACGAGAAGGACGGCAAGGCCTACTGTCGCAAGGACTACTTCGACATGTTC  1332

Query 1315  GCACCCAAGTGTGGCGGCTGCGCCCGGGCCATCCTGGAGAACTATATCTCAGCCCTCAACACGCTGTGGCATCC  1388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCACCCAAGTGTGGCGGCTGCGCCCGGGCCATCCTGGAGAACTATATCTCAGCCCTCAACACGCTGTGGCATCC  1406

Query 1389  TGAGTGCTTTGTGTGCCGGGAATGCTTCACGCCATTCGTGAACGGCAGCTTCTTCGAGCACGACGGGCAGCCCT  1462
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGAGTGCTTTGTGTGCCGGGAATGCTTCACGCCATTCGTGAACGGCAGCTTCTTCGAGCACGACGGGCAGCCCT  1480

Query 1463  ACTGTGAGGTGCACTACCACGAGCGGCGCGGCTCGCTGTGTTCTGGCTGCCAGAAGCCCATCACCGGCCGCTGC  1536
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACTGTGAGGTGCACTACCACGAGCGGCGCGGCTCGCTGTGTTCTGGCTGCCAGAAGCCCATCACCGGCCGCTGC  1554

Query 1537  ATCACCGCCATGGCCAAGAAGTTCCACCCCGAGCACTTCGTCTGTGCCTTCTGCCTCAAGCAGCTCAACAAGGG  1610
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATCACCGCCATGGCCAAGAAGTTCCACCCCGAGCACTTCGTCTGTGCCTTCTGCCTCAAGCAGCTCAACAAGGG  1628

Query 1611  CACCTTCAAGGAGCAGAACGACAAGCCTTACTGTCAGAACTGCTTCCTCAGGCTCTTCTGC  1671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1629  CACCTTCAAGGAGCAGAACGACAAGCCTTACTGTCAGAACTGCTTCCTCAAGCTCTTCTGC  1689