Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06826
• Subject: XM_024449109.1
• Aligned Length: 1774
• Identities: 1662
• Gaps: 110

Alignment

Query    1  ATGGACGACCTC-GACGCCCTGCTGGCGGACTTGGAGTCTACCACCTCCCACATCTCCAAACGGCCTGTGTTCT  73
            ||||       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGG-------CAGACGCCCTGCTGGCGGACTTGGAGTCTACCACCTCCCACATCTCCAAACGGCCTGTGTTCT  67

Query   74  TGTCGGAGGAGACCCCCTACTCATACCCAACTGGAAACCACACATACCAGGAGATTGCCGTGCCACCCCCCGTC  147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   68  TGTCGGAGGAGACCCCCTACTCATACCCAACTGGAAACCACACATACCAGGAGATTGCCGTGCCACCCCCCGTC  141

Query  148  CCCCCACCCCCGTCCAGCGAGGCCCTCAATGGCACAATCCTTGACCCCTTAGACCAGTGGCAGCCCAGCGGCTC  221
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  142  CCCCCACCCCCGTCCAGCGAGGCCCTCAATGGCACAATCCTTGACCCCTTAGACCAGTGGCAGCCCAGCAGCTC  215

Query  222  CCGATTCATCCACCAGCAGCCTCAGTCCTCATCACCTGTGTACGGCTCCAGTGCCAAAACTTCCAGTGTCTCCA  295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  216  CCGATTCATCCACCAGCAGCCTCAGTCCTCATCACCTGTGTACGGCTCCAGTGCCAAAACTTCCAGTGTCTCCA  289

Query  296  ACCCTCAGGACAGTGTTGGCTCTCCGTGCTCCCGAGTGGGTGAGGAGGAGCACGTCTACAGCTTCCCCAACAAG  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  290  ACCCTCAGGACAGTGTTGGCTCTCCGTGCTCCCGAGTGGGTGAGGAGGAGCACGTCTACAGCTTCCCCAACAAG  363

Query  370  CAGAAATCAGCTGAGCCTTCACCCACCGTAATGAGCACGTCCCTGGGCAGCAACCTTTCTGAACTCGACCGCCT  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  364  CAGAAATCAGCTGAGCCTTCACCCACCGTAATGAGCACGTCCCTGGGCAGCAACCTTTCTGAACTCGACCGCCT  437

Query  444  GCTGCTGGAACTGAACGCTGTACAGCATAACCCGCCAGGCTTCCCTGCAGATGAGGCCAACTCAAGCCCCCCGC  517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  438  GCTGCTGGAACTGAACGCTGTACAGCATAACCCGCCAGGCTTCCCTGCAGATGAGGCCAACTCAAGCCCCCCGC  511

Query  518  TTCCTGGGGCCCTGAGCCCCCTCTATGGTGTCCCAGAGACTAACAGCCCCTTGGGAGGCAAAGCTGGGCCCCTG  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  512  TTCCTGGGGCCCTGAGCCCCCTCTATGGTGTCCCAGAGACTAACAGCCCCTTGGGAGGCAAAGCTGGGCCCCTG  585

Query  592  ACGAAAGAGAAGCCTAAGCGGAATGGGGGCCGGGGCCTGGAGGACGTGCGGCCCAGTGTGGAGAGTCTCTTGGA  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  586  ACGAAAGAGAAGCCTAAGCGGAATGGGGGCCGGGGCCTGGAGGACGTGCGGCCCAGTGTGGAGAGTCTCTTGGA  659

Query  666  TGAACTGGAGAGCTCCGTGCCCAGCCCCGTCCCTGCCATCACTGTGAACCAGGGCGAGATGAGCAGCCCGCAGC  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660  TGAACTGGAGAGCTCCGTGCCCAGCCCCGTCCCTGCCATCACTGTGAACCAGGGCGAGATGAGCAGCCCGCAGC  733

Query  740  GCGTCACCTCCACCCAACAGCAGACACGCATCTCGGCCTCCTCTGCCACCAGGGAGCTGGACGAGCTGATGGCT  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  734  GCGTCACCTCCACCCAACAGCAGACACGCATCTCGGCCTCCTCTGCCACCAGGGAGCTGGACGAGCTGATGGCT  807

Query  814  TCGCTGTCGGATTTCAA---------------------------------------------------------  830
            |||||||||||||||||                                                         
Sbjct  808  TCGCTGTCGGATTTCAAGATCCAGGGCCTGGAGCAAAGAGCGGATGGGGAGCGGTGCTGGGCGGCCGGCTGGCC  881

Query  831  ---------------------------------------------GTTCATGGCCCAGGGGAAGACAGGGAGCA  859
                                                         |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  882  TCGGGACGGCGGGCGGAGCAGCCCCGGAGGGCAGGACGAGGGAGGGTTCATGGCCCAGGGGAAGACAGGGAGCA  955

Query  860  GCTCACCCCCTGGGGGGCCCCCGAAGCCCGGGAGCCAGCTGGACAGCATGCTGGGGAGCCTGCAGTCTGACCTG  933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  956  GCTCACCCCCTGGGGGGCCCCCGAAGCCCGGGAGCCAGCTGGACAGCATGCTGGGGAGCCTGCAGTCTGACCTG  1029

Query  934  AACAAGCTGGGGGTCGCCACAGTCGCCAAAGGAGTCTGCGGGGCCTGCAAGAAGCCCATCGCCGGGCAGGTTGT  1007
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030  AACAAGCTGGGGGTCGCCACAGTCGCCAAAGGAGTCTGCGGGGCCTGCAAGAAGCCCATCGCCGGGCAGGTTGT  1103

Query 1008  GACCGCCATGGGGAAGACGTGGCACCCCGAGCACTTCGTCTGCACCCACTGCCAGGAGGAGATCGGATCCCGGA  1081
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104  GACCGCCATGGGGAAGACGTGGCACCCCGAGCACTTCGTCTGCACCCACTGCCAGGAGGAGATCGGATCCCGGA  1177

Query 1082  ACTTCTTCGAGCGGGATGGACAGCCCTACTGTGAAAAGGACTACCACAACCTCTTCTCCCCGCGCTGCTACTAC  1155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178  ACTTCTTCGAGCGGGATGGACAGCCCTACTGTGAAAAGGACTACCACAACCTCTTCTCCCCGCGCTGCTACTAC  1251

Query 1156  TGCAACGGCCCCATCCTGGATAAAGTGGTGACAGCCCTTGACCGGACGTGGCACCCTGAACACTTCTTCTGTGC  1229
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252  TGCAACGGCCCCATCCTGGATAAAGTGGTGACAGCCCTTGACCGGACGTGGCACCCTGAACACTTCTTCTGTGC  1325

Query 1230  ACAGTGTGGAGCCTTCTTTGGTCCCGAAGGGTTCCACGAGAAGGACGGCAAGGCCTACTGTCGCAAGGACTACT  1303
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1326  ACAGTGTGGAGCCTTCTTTGGTCCCGAAGGGTTCCACGAGAAGGACGGCAAGGCCTACTGTCGCAAGGACTACT  1399

Query 1304  TCGACATGTTCGCACCCAAGTGTGGCGGCTGCGCCCGGGCCATCCTGGAGAACTATATCTCAGCCCTCAACACG  1377
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1400  TCGACATGTTCGCACCCAAGTGTGGCGGCTGCGCCCGGGCCATCCTGGAGAACTATATCTCAGCCCTCAACACG  1473

Query 1378  CTGTGGCATCCTGAGTGCTTTGTGTGCCGGGAATGCTTCACGCCATTCGTGAACGGCAGCTTCTTCGAGCACGA  1451
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474  CTGTGGCATCCTGAGTGCTTTGTGTGCCGGGAATGCTTCACGCCATTCGTGAACGGCAGCTTCTTCGAGCACGA  1547

Query 1452  CGGGCAGCCCTACTGTGAGGTGCACTACCACGAGCGGCGCGGCTCGCTGTGTTCTGGCTGCCAGAAGCCCATCA  1525
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1548  CGGGCAGCCCTACTGTGAGGTGCACTACCACGAGCGGCGCGGCTCGCTGTGTTCTGGCTGCCAGAAGCCCATCA  1621

Query 1526  CCGGCCGCTGCATCACCGCCATGGCCAAGAAGTTCCACCCCGAGCACTTCGTCTGTGCCTTCTGCCTCAAGCAG  1599
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1622  CCGGCCGCTGCATCACCGCCATGGCCAAGAAGTTCCACCCCGAGCACTTCGTCTGTGCCTTCTGCCTCAAGCAG  1695

Query 1600  CTCAACAAGGGCACCTTCAAGGAGCAGAACGACAAGCCTTACTGTCAGAACTGCTTCCTCAGGCTCTTCTGC  1671
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1696  CTCAACAAGGGCACCTTCAAGGAGCAGAACGACAAGCCTTACTGTCAGAACTGCTTCCTCAAGCTCTTCTGC  1767