Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06843
• Subject: NM_025936.3
• Aligned Length: 1980
• Identities: 1723
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGACGTACTGGTGTCTGAGTGCTCCGCGCGGCTGCTGCAGCAGGAAGAAGAGATTAAATCTCTGACTGCTGA  74
            |||||||..||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||...||||||||..|||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGGTCTGGTGGCTCAGTGCTCCGCGCGGTTGCTGCAGCAGGAAAGGGAGATTAAGGCTCTGACTGCTGA  74

Query   75  AATTGACCGGTTGAAAAACTGTGGCTGTTTAGGAGCTTCTCCAAATTTGGAGCAGTTACAAGAAGAAAATTTAA  148
            .||.||||||.||||.|||||||||||.||.|.|||||||||||.||||||.|||||||.||||||||||||||
Sbjct   75  GATCGACCGGCTGAAGAACTGTGGCTGCTTGGAAGCTTCTCCAAGTTTGGAACAGTTACGAGAAGAAAATTTAA  148

Query  149  AATTAAAGTATCGACTGAATATTCTTCGAAAGAGTCTTCAGGCAGAAAGGAACAAACCAACTAAAAATATGATT  222
            ||||.||||||.|.||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||..||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  AATTGAAGTATAGGCTGAATATTCTTCGAAGGAGTCTTCAGGAAGAAAGGAGAAAACCAACTAAAAACATGATT  222

Query  223  AACATTATTAGCCGCCTACAAGAGGTCTTTGGTCATGCAATTAAGGCTGCATATCCAGATTTGGAAAATCCTCC  296
            |||||.|..||||||||.||.||.||||||||...|||.||||.|||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct  223  AACATCAACAGCCGCCTGCAGGAAGTCTTTGGCTGTGCCATTAGGGCTGCATATCCAGACTTGGAGAACCCTCC  296

Query  297  TCTGCTAGTGACACCAAGTCAGCAGGCCAAGTTTGGGGACTATCAGTGTAATAGTGCTATGGGTATTTCTCAGA  370
            .|||.|.||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTGATCGTGACACCAAGTCAGCAGCCCAAGTTTGGAGACTATCAGTGTAATAGTGCCATGGGTATTTCTCAGA  370

Query  371  TGCTCAAAACCAAGGAACAGAAAGTTAATCCAAGAGAAATTGCTGAAAACATTACCAAACACCTCCCAGACAAT  444
            |||||||..|.||||||||||||||.|.|||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||..|||||
Sbjct  371  TGCTCAAGGCAAAGGAACAGAAAGTCAGTCCCAGAGAAATCGCAGAAAACATTACCAAACACCTGCCGAACAAT  444

Query  445  GAATGTATTGAAAAAGTTGAAATTGCTGGTCCTGGTTTTATTAATGTCCACTTAAGAAAGGATTTTGTATCAGA  518
            .|||.||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||.|.|||||.||.|||||.|||||
Sbjct  445  AAATATATTGACAAAGTTGAAATTGCGGGTCCTGGTTTCATTAATGTGCACCTGAGAAAAGACTTTGTGTCAGA  518

Query  519  ACAATTGACCAGTCTTCTAGTGAATGGAGTTCAACTACCTGCTCTGGGAGAGAATAAAAAGGTTATAGTTGACT  592
            |||..|.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||..||.|||||.||..|.||||||||||||||||
Sbjct  519  ACAGCTAACCAGTCTCCTAGTGAATGGAGTCCAGCTGCCTGTGCTTGGAGACAAGGAGAAGGTTATAGTTGACT  592

Query  593  TTTCCTCCCCTAATATAGCTAAAGAGATGCATGTAGGCCACCTGAGGTCAACTATCATAGGAGAGAGTATAAGC  666
            |||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct  593  TTTCCTCTCCCAACATAGCTAAGGAGATGCATGTTGGCCACCTCAGGTCAACCATCATAGGAGAGAGCATGAGC  666

Query  667  CGCCTCTTTGAATTTGCAGGGTATGACGTGCTCAGGTTAAATCATGTAGGAGACTGGGGGACCCAGTTTGGCAT  740
            ||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  667  CGCCTCTTTGAATTTGCAGGATACGATGTGCTAAGGTTAAACCATGTAGGAGATTGGGGAACCCAGTTTGGCAT  740

Query  741  GCTCATCGCTCACCTGCAAGACAAATTTCCAGATTATCTAACAGTTTCACCTCCTATTGGGGATCTTCAGGTCT  814
            |||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||.||
Sbjct  741  GCTCATCGCTCACCTGCAAGATAAATTTCCGGATTATCTGACAGTTTCACCTCCTATTGGGGATCTGCAGGCCT  814

Query  815  TTTATAAGGAATCTAAGAAGAGGTTTGATACTGAGGAGGAATTTAAGAAGCGAGCATATCAGTGTGTAGTTCTG  888
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||.||
Sbjct  815  TTTATAAGGAATCTAAGAAGAGGTTTGATGCTGATGAGGAGTTTAAGAAGCGAGCCTATCAGTGTGTCGTTTTG  888

Query  889  CTCCAGGGTAAAAACCCAGATATTACAAAAGCTTGGAAGCTTATCTGTGATGTCTCCCGCCAAGAGTTAAATAA  962
            ||.|||.||||||||||||||||.|..|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||..|||||||.||.||
Sbjct  889  CTGCAGAGTAAAAACCCAGATATCATGAAAGCCTGGAACCTCATCTGTGACGTGTCCCGGGAAGAGTTTAAGAA  962

Query  963  AATCTATGATGCATTGGACGTCTCTTTAATAGAGAGAGGGGAATCCTTCTATCAAGATAGGATGAATGATATTG  1036
            |||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  963  AATCTATGATGCATTGGACATCACTTTAATAGAGAGAGGAGAATCCTTCTATCAAGATAGGATGAAGGACATTG  1036

Query 1037  TAAAGGAATTTGAAGATAGAGGATTTGTGCAGGTGGATGATGGCAGAAAGATTGTATTTGTCCCAGGGTGTTCC  1110
            ||||||||||||||||||.|||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.
Sbjct 1037  TAAAGGAATTTGAAGATAAAGGGTTTGTGCAAGTGGATGATGGCAGAAAAATTGTGTTCGTGCCTGGGTGTTCT  1110

Query 1111  ATACCATTAACCATAGTAAAATCAGATGGAGGTTATACCTATGATACATCTGACCTGGCTGCTATTAAACAAAG  1184
            .|.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 1111  GTGCCATTAACGATAGTGAAATCAGATGGGGGCTATACCTATGACACATCTGACCTGGCTGCCATCAAACAGAG  1184

Query 1185  ACTATTTGAGGAAAAAGCAGATATGATTATCTATGTTGTGGACAATGGACAATCTGTGCACTTCCAGACAATAT  1258
            |||.|||||.|||||||||.|.|.||||||.|||||.|||||||||||||||.||.|.||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACTGTTTGAAGAAAAAGCAAACAAGATTATTTATGTGGTGGACAATGGACAAGCTATACACTTCCAGACAATAT  1258

Query 1259  TTGCTGCTGCTCAAATGATTGGTTGGTATGACCCTAAAGTAACTCGAGTCTTCCATGCTGGATTTGGTGTGGTG  1332
            |||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||.|||...|||.|..|||||||||||.||.
Sbjct 1259  TTGCTGCTGCTCAGATGATTGGCTGGTATGACCCGAAAGTAACTCTAGTGACCCACGTGGGATTTGGTGTCGTC  1332

Query 1333  CTAGGGGAAGACAAGAAAAAGTTTAAAACACGTTCGGGTGAAACAGTGCGCCTCATGGATCTTCTGGGAGAAGG  1406
            |||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||.||||||
Sbjct 1333  CTAGGAGAAGACAAGAAGAAATTTAAAACACGTTCAGGTGAAACTGTGCGCCTTATGGACCTGCTGGAAGAAGG  1406

Query 1407  ACTAAAACGATCCATGGACAAGTTGAAGGAAAAAGAAAGAGACAAGGTCTTAACTGCAGAGGAATTGAATGCTG  1480
            .||.|||||.||||||||||||.|.|||||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||.||.|
Sbjct 1407  GCTGAAACGGTCCATGGACAAGCTAAAGGAGAAAGAGAGAGACAAGGTCTTAACTGAAGAGGAATTGAAAGCAG  1480

Query 1481  CTCAGACATCCGTTGCATATGGCTGCATCAAATATGCTGACCTTTCCCATAACCGGTTGAATGACTACATCTTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||..|.|||||||||||||||
Sbjct 1481  CTCAGACATCCGTTGCATATGGCTGCATCAAATACGCCGACCTTTCTCATAATCGCCTCAATGACTACATCTTC  1554

Query 1555  TCCTTTGACAAAATGCTAGATGACAGAGGAAATACAGCTGCTTACTTGTTGTATGCCTTCACTAGAATCAGGTC  1628
            |||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||.|..|||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1555  TCCTTTGACAAGATGCTGGATGACAGAGGGAACACAGCTGCTTACCTACTGTATGCCTTCACCAGAATCAGGTC  1628

Query 1629  TATTGCACGTCTGGCCAATATTGATGAAGAAATGCTCCAAAAAGCTGCTCGAGAAACCAAGATTCTTTTGGATC  1702
            ||||||.||.||.|||||.||||||||.|..|||||.||.|.|||.|||||.|||||||||||..|||||||.|
Sbjct 1629  TATTGCGCGCCTCGCCAACATTGATGAGGCGATGCTACAGAGAGCCGCTCGGGAAACCAAGATCATTTTGGACC  1702

Query 1703  ATGAGAAGGAATGGAAACTAGGCCGGTGCATTTTACGGTTCCCTGAGATTCTGCAAAAGATTTTAGATGACTTA  1776
            ||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||.|||.|.
Sbjct 1703  ATGAAAAGGAGTGGAAGCTGGGGCGGTGCATCTTACGGTTCCCCGAGATCCTCCAGAAGATCTTAGACGACCTG  1776

Query 1777  TTTCTCCACACTCTCTGTGATTATATATATGAGCTGGCAACTGCTTTCACAGAGTTCTATGATAGCTGCTACTG  1850
            |||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1777  TTTCTCCACACCCTCTGTGACTACATTTACGAGCTGGCAACCACCTTCACAGAGTTCTACGATAGCTGCTACTG  1850

Query 1851  TGTGGAGAAAGATAGACAGACTGGAAAAATATTGAAGGTGAACATGTGGCGTATGCTGCTATGTGAAGCAGTAG  1924
            |||||||||||||.||||||||||.|||.|||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|
Sbjct 1851  TGTGGAGAAAGATCGACAGACTGGGAAAGTATTGAAAGTGAACATGTGGCGGATGCTCCTGTGTGAGGCCGTGG  1924

Query 1925  CTGCTGTCATGGCCAAGGGGTTTGATATCCTGGGAATAAAACCTGTCCAAAGGATG  1980
            ||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1925  CTGCTGTCATGGCCAAGGGGTTCGATATACTGGGGATAAAACCCGTCCAAAGGATG  1980