Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06848
• Subject: NM_001193272.2
• Aligned Length: 1614
• Identities: 1499
• Gaps: 114

Alignment

Query    1  ATGAACCTCGAGTTGCTGGAGTCCTTTGGGCAGAACTATCCAGAGGAAGCTGATGGAACTTTGGATTGTATCAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACCTCGAGTTGCTGGAGTCCTTTGGGCAGAACTATCCAGAGGAAGCTGATGGAACTTTGGATTGTATCAG  74

Query   75  CATGGCTTTGACTTGCACCTTTAACAGGTGGGGCACACTGCTTGCAGTTGGCTGTAATGATGGCCGAATTGTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATGGCTTTGACTTGCACCTTTAACAGGTGGGGCACACTGCTTGCAGTTGGCTGTAATGATGGCCGAATTGTCA  148

Query  149  TCTGGGATTTCTTGACAAGAGGCATTGCTAAAATAATTAGTGCACACATCCATCCAGTGTGTTCTTTATGCTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTGGGATTTCTTGACAAGAGGCATTGCTAAAATAATTAGTGCACACATCCATCCAGTGTGTTCTTTATGCTGG  222

Query  223  AGCCGAGATGGTCATAAACTCGTGAGTGCTTCCACTGATAACATAGTGTCACAGTGGGATGTTCTTTCAGGCGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCCGAGATGGTCATAAACTCGTGAGTGCTTCCACTGATAACATAGTGTCACAGTGGGATGTTCTTTCAGGCGA  296

Query  297  CTGTGACCAGAGGTTTCGATTCCCTTCACCCATCTTAAAAGTCCAATATCATCCACGAGATCAGAACAAGGTTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTGTGACCAGAGGTTTCGATTCCCTTCACCCATCTTAAAAGTCCAATATCATCCACGAGATCAGAACAAGGTTC  370

Query  371  TCGTGTGTCCCATGAAATCTGCTCCTGTCATGTTGACCCTTTCAGATTCCAAACATGTTGTTCTGCCAGTGGAC  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  TCGTGTGTCCCATGAAATCTGCTCCTGTCATGTTGACCCTTTCAGATTCCAAACATGTTGTTCTGCCGGTGGAC  444

Query  445  GATGACTCCGATTTGAACGTTGTGGCATCTTTTGATAGGCGAGGGGAATATATTTATACGGGAAACGCAAAAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATGACTCCGATTTGAACGTTGTGGCATCTTTTGATAGGCGAGGGGAATATATTTATACGGGAAACGCAAAAGG  518

Query  519  CAAGATTTTGGTCCTAAAAACAGATTCTCAGGATCTTGTTGCTTCCTTCAGAGTGACAACTGGAACAAGCAATA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAGATTTTGGTCCTAAAAACAGATTCTCAGGATCTTGTTGCTTCCTTCAGAGTGACAACTGGAACAAGCAATA  592

Query  593  CCACAGCCATTAAGTCAATTGAGTTTGCCCGGAAGGGGAGTTGCTTTTTAATTAACACGGCAGATCGAATAATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCACAGCCATTAAGTCAATTGAGTTTGCCCGGAAGGGGAGTTGCTTTTTAATTAACACGGCAGATCGAATAATC  666

Query  667  AGAGTTTATGATGGCAGAGAAATCTTAACATGTGGAAGAGATGGAGAGCCTGAACCTATGCAGAAATTGCAGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGAGTTTATGATGGCAGAGAAATCTTAACATGTGGAAGAGATGGAGAGCCTGAACCTATGCAGAAATTGCAGGA  740

Query  741  TTTGGTGAATAGGACCCCATGGAAGAAATGTTGTTTCTCTGGGGATGGGGAATACATCGTGGCAGGTTCTGCCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTTGGTGAATAGGACCCCATGGAAGAAATGTTGTTTCTCTGGGGATGGGGAATACATCGTGGCAGGTTCTGCCC  814

Query  815  GGCAGCATGCCCTGTACATCTGGGAGAAGAGCATTGGCAACCTGGTGAAGATTCTCCATGGGACGAGAGGAGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCAGCATGCCCTGTACATCTGGGAGAAGAGCATTGGCAACCTGGTGAAGATTCTCCATGGGACGAGAGGAGAA  888

Query  889  CTCCTCTTGGATGTAGCTTGGCATCCTGTTCGACCCATCATAGCATCCATTTCCAGTGGAGTGGTATCTATCTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTCCTCTTGGATGTAGCTTGGCATCCTGTTCGACCCATCATAGCATCCATTTCCAGTGGAGTGGTATCTATCTG  962

Query  963  GGCACAGAATCAAGTAGAAAACTGGAGTGCATTTGCACCAGACTTCAAAGAATTGGATGAAAATGTAGAATACG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGCACAGAATCAAGTAGAAAACTGGAGTGCATTTGCACCAGACTTCAAAGAATTGGATGAAAATGTAGAATACG  1036

Query 1037  AAGAAAGGGAATCAGAGTTTGATATTGAAGATGAAGATAAGAGTGAGCCTGAGCAGACAGGGGCTGATGCTGCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAGAAAGGGAATCAGAGTTTGATATTGAAGATGAAGATAAGAGTGAGCCTGAGCAGACAGGGGCTGATGCTGCA  1110

Query 1111  GAAGATGAGGAAGTGGATGTCACCAGCGTGGACCCTATTGCTGCCTTCTGTAGCAGTGATGAAGAGCTGGAAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAAGATGAGGAAGTGGATGTCACCAGCGTGGACCCTATTGCTGCCTTCTGTAGCAGTGATGAAGAGCTGGAAGA  1184

Query 1185  TTCAAAGGCTCTATTGTATTTACCCATTGCCCCTGAGGTAGAAGACCCAGAAGAAAATCCTTACGGCCCCCCAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTCAAAGGCTCTATTGTATTTACCCATTGCCCCTGAGGTAGAAGACCCAGAAGAAAATCCTTACGGCCCCCCAC  1258

Query 1259  CGGATGCAGTCCAAACCTCCTTGATGGATGAAGGGGCTAGTTCAGAGAAGAAGAGGCAGTCCTCAGCAGATGGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGGATGCAGTCCAAACCTCCTTGATGGATGAAGGGGCTAGTTCAGAGAAGAAGAGGCAGTCCTCAGCAGATGGG  1332

Query 1333  TCCCAGCCACCTAAGAAGAAACCCAAAACAACCAATATAGAACTTCAAGGAGTACCAAATGATGAAGTCCATCC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCCCAGCCACCTAAGAAGAAACCCAAAACAACCAATATAGAACTTCAAGGAGTACCAAATGATGAAGTCCATCC  1406

Query 1407  ACTACTGGGTGTGAAGGGGGATGGCAAATCCAAGAAGAAGCAAGCAGGCCGGCCTAAAGGATCAAAAGGTAAAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct 1407  ACTACTGGGTGTGAAGGGGGATGGCAAATCCAAGAAGAAGCAAGCAGGCCGGCCTAAAGGATCAAA--------  1472

Query 1481  AGAAAGATTCTCCATTTAAACCGAAACTCTACAAAGGGGACAGAGGTTTACCTCTGGAAGGATCAGCGAAGGGT  1554
                                                                                      
Sbjct 1473  --------------------------------------------------------------------------  1472

Query 1555  AAAGTGCAGGCGGAACTCAGCCAGCCCTTGACAGCAGGAGGAGCAATCTCAGAACTGTTA  1614
                                            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1473  --------------------------------AGCAGGAGGAGCAATCTCAGAACTGTTA  1500