Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06848
- Subject:
- XM_006529357.2
- Aligned Length:
- 1614
- Identities:
- 1383
- Gaps:
- 114
Alignment
Query 1 ATGAACCTCGAGTTGCTGGAGTCCTTTGGGCAGAACTATCCAGAGGAAGCTGATGGAACTTTGGATTGTATCAG 74
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.||.|||||
Sbjct 1 ATGAACCTCGAGTTGCTGGAGTCCTTTGGACAGAACTACCCAGAGGAAGCTGATGGGACTCTGGACTGCATCAG 74
Query 75 CATGGCTTTGACTTGCACCTTTAACAGGTGGGGCACACTGCTTGCAGTTGGCTGTAATGATGGCCGAATTGTCA 148
||||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 75 CATGGCCCTGACCTGCACCTTTAACAGGTGGGGCACACTGCTTGCTGTTGGCTGTAACGATGGCCGGATTGTTA 148
Query 149 TCTGGGATTTCTTGACAAGAGGCATTGCTAAAATAATTAGTGCACACATCCATCCAGTGTGTTCTTTATGCTGG 222
|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct 149 TTTGGGATTTCTTGACCAGAGGCATTGCTAAAATAATTAGTGCACACATCCATCCAGTCTGTTCTTTGTGTTGG 222
Query 223 AGCCGAGATGGTCATAAACTCGTGAGTGCTTCCACTGATAACATAGTGTCACAGTGGGATGTTCTTTCAGGCGA 296
|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 AGCCGAGATGGTCATAAGCTTGTGAGTGCTTCTACAGATAACATAGTGTCACAGTGGGATGTTCTTTCAGGAGA 296
Query 297 CTGTGACCAGAGGTTTCGATTCCCTTCACCCATCTTAAAAGTCCAATATCATCCACGAGATCAGAACAAGGTTC 370
.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTGCGACCAGAGGTTTCGATTCCCTTCACCCATCTTAAAAGTCCAATATCATCCTCGAGATCAGAACAAGGTTC 370
Query 371 TCGTGTGTCCCATGAAATCTGCTCCTGTCATGTTGACCCTTTCAGATTCCAAACATGTTGTTCTGCCAGTGGAC 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 371 TCGTGTGTCCCATGAAATCTGCTCCTGTCATGTTGACCCTTTCAGATTCCAAACATGTTGTTCTGCCGGTAGAC 444
Query 445 GATGACTCCGATTTGAACGTTGTGGCATCTTTTGATAGGCGAGGGGAATATATTTATACGGGAAACGCAAAAGG 518
||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 445 GATGACTCGGATTTGAACGTGGTGGCATCTTTTGATAGGCGAGGGGAATATATTTATACAGGAAATGCAAAAGG 518
Query 519 CAAGATTTTGGTCCTAAAAACAGATTCTCAGGATCTTGTTGCTTCCTTCAGAGTGACAACTGGAACAAGCAATA 592
||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 519 CAAGATCTTGGTCCTAAAAACAGACTCTCAGGATCTTGTTGCTTCCTTCAGAGTAACAACTGGGACAAGCAATA 592
Query 593 CCACAGCCATTAAGTCAATTGAGTTTGCCCGGAAGGGGAGTTGCTTTTTAATTAACACGGCAGATCGAATAATC 666
|.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 593 CTACCGCCATTAAATCAATTGAGTTTGCCCGGAAGGGGAGTTGCTTCCTGATTAACACAGCAGATCGAATAATA 666
Query 667 AGAGTTTATGATGGCAGAGAAATCTTAACATGTGGAAGAGATGGAGAGCCTGAACCTATGCAGAAATTGCAGGA 740
|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||..|||||||
Sbjct 667 AGAGTCTATGACGGCAGAGAGATTTTAACGTGTGGAAGGGATGGAGAGCCAGAGCCTATGCAGAAGCTGCAGGA 740
Query 741 TTTGGTGAATAGGACCCCATGGAAGAAATGTTGTTTCTCTGGGGATGGGGAATACATCGTGGCAGGTTCTGCCC 814
.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||..
Sbjct 741 CTTGGTGAATAGGACTCCATGGAAAAAATGTTGTTTCTCTGGGGATGGGGAGTACATAGTGGCGGGCTCTGCGA 814
Query 815 GGCAGCATGCCCTGTACATCTGGGAGAAGAGCATTGGCAACCTGGTGAAGATTCTCCATGGGACGAGAGGAGAA 888
||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||.|||||.|||
Sbjct 815 GGCAGCATGCGCTGTATATCTGGGAAAAGAGCATTGGCAACCTGGTGAAGATCTTACATGGGACCAGAGGGGAA 888
Query 889 CTCCTCTTGGATGTAGCTTGGCATCCTGTTCGACCCATCATAGCATCCATTTCCAGTGGAGTGGTATCTATCTG 962
|||||..||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 889 CTCCTGCTGGACGTGGCTTGGCATCCAGTCCGACCCATCATAGCTTCTATCTCTAGTGGAGTGGTGTCCATTTG 962
Query 963 GGCACAGAATCAAGTAGAAAACTGGAGTGCATTTGCACCAGACTTCAAAGAATTGGATGAAAATGTAGAATACG 1036
|||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 963 GGCCCAAAATCAAGTAGAAAATTGGAGTGCATTTGCACCAGACTTCAAAGAGTTGGATGAAAATGTAGAATATG 1036
Query 1037 AAGAAAGGGAATCAGAGTTTGATATTGAAGATGAAGATAAGAGTGAGCCTGAGCAGACAGGGGCTGATGCTGCA 1110
|.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1037 AGGAAAGAGAATCAGAATTTGATATTGAGGATGAAGATAAGAGTGAGCCTGAGCAAACAGGGGCTGATGCTGCT 1110
Query 1111 GAAGATGAGGAAGTGGATGTCACCAGCGTGGACCCTATTGCTGCCTTCTGTAGCAGTGATGAAGAGCTGGAAGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAAGATGAGGAAGTGGATGTCACCAGCGTGGATCCCATCGCTGCCTTCTGTAGCAGTGATGAAGAGCTGGAAGA 1184
Query 1185 TTCAAAGGCTCTATTGTATTTACCCATTGCCCCTGAGGTAGAAGACCCAGAAGAAAATCCTTACGGCCCCCCAC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||
Sbjct 1185 TTCAAAGGCTCTATTGTATTTACCCATTGCCCCTGAGGTAGAAGACCCTGAAGAAAACCCGTATGGCCCTCCAC 1258
Query 1259 CGGATGCAGTCCAAACCTCCTTGATGGATGAAGGGGCTAGTTCAGAGAAGAAGAGGCAGTCCTCAGCAGATGGG 1332
||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1259 CGGATGCAGTCCCAAGCTCCTTGATGGATGAAGGGGCTAGTTCAGAGAAGAAGAGGCAGTCTTCAGCAGATGGA 1332
Query 1333 TCCCAGCCACCTAAGAAGAAACCCAAAACAACCAATATAGAACTTCAAGGAGTACCAAATGATGAAGTCCATCC 1406
|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCCCAGCCACCAAAGAAGAAACCTAAAACCACCAATATAGAGCTCCAAGGAGTGCCGAATGATGAAGTCCATCC 1406
Query 1407 ACTACTGGGTGTGAAGGGGGATGGCAAATCCAAGAAGAAGCAAGCAGGCCGGCCTAAAGGATCAAAAGGTAAAG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ACTACTGGGTGTGAAGGGGGATGGCAAATCCAAGAAGAAGCAAGCAGGCCGGCCTAAAGGATCAAA-------- 1472
Query 1481 AGAAAGATTCTCCATTTAAACCGAAACTCTACAAAGGGGACAGAGGTTTACCTCTGGAAGGATCAGCGAAGGGT 1554
Sbjct 1473 -------------------------------------------------------------------------- 1472
Query 1555 AAAGTGCAGGCGGAACTCAGCCAGCCCTTGACAGCAGGAGGAGCAATCTCAGAACTGTTA 1614
||||||||||||.||||||||||||.|.
Sbjct 1473 --------------------------------AGCAGGAGGAGCCATCTCAGAACTGCTG 1500