Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06848
- Subject:
- XM_006529358.3
- Aligned Length:
- 1614
- Identities:
- 1385
- Gaps:
- 117
Alignment
Query 1 ATGAACCTCGAGTTGCTGGAGTCCTTTGGGCAGAACTATCCAGAGGAAGCTGATGGAACTTTGGATTGTATCAG 74
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.||.|||||
Sbjct 1 ATGAACCTCGAGTTGCTGGAGTCCTTTGGACAGAACTACCCAGAGGAAGCTGATGGGACTCTGGACTGCATCAG 74
Query 75 CATGGCTTTGACTTGCACCTTTAACAGGTGGGGCACACTGCTTGCAGTTGGCTGTAATGATGGCCGAATTGTCA 148
||||||..||||.|||||||||||||
Sbjct 75 CATGGCCCTGACCTGCACCTTTAACA------------------------------------------------ 100
Query 149 TCTGGGATTTCTTGACAAGAGGCATTGCTAAAATAATTAGTGCACACATCCATCCAGTGTGTTCTTTATGCTGG 222
|.|||
Sbjct 101 ---------------------------------------------------------------------GTTGG 105
Query 223 AGCCGAGATGGTCATAAACTCGTGAGTGCTTCCACTGATAACATAGTGTCACAGTGGGATGTTCTTTCAGGCGA 296
|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 106 AGCCGAGATGGTCATAAGCTTGTGAGTGCTTCTACAGATAACATAGTGTCACAGTGGGATGTTCTTTCAGGAGA 179
Query 297 CTGTGACCAGAGGTTTCGATTCCCTTCACCCATCTTAAAAGTCCAATATCATCCACGAGATCAGAACAAGGTTC 370
.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 180 TTGCGACCAGAGGTTTCGATTCCCTTCACCCATCTTAAAAGTCCAATATCATCCTCGAGATCAGAACAAGGTTC 253
Query 371 TCGTGTGTCCCATGAAATCTGCTCCTGTCATGTTGACCCTTTCAGATTCCAAACATGTTGTTCTGCCAGTGGAC 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 254 TCGTGTGTCCCATGAAATCTGCTCCTGTCATGTTGACCCTTTCAGATTCCAAACATGTTGTTCTGCCGGTAGAC 327
Query 445 GATGACTCCGATTTGAACGTTGTGGCATCTTTTGATAGGCGAGGGGAATATATTTATACGGGAAACGCAAAAGG 518
||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 328 GATGACTCGGATTTGAACGTGGTGGCATCTTTTGATAGGCGAGGGGAATATATTTATACAGGAAATGCAAAAGG 401
Query 519 CAAGATTTTGGTCCTAAAAACAGATTCTCAGGATCTTGTTGCTTCCTTCAGAGTGACAACTGGAACAAGCAATA 592
||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 402 CAAGATCTTGGTCCTAAAAACAGACTCTCAGGATCTTGTTGCTTCCTTCAGAGTAACAACTGGGACAAGCAATA 475
Query 593 CCACAGCCATTAAGTCAATTGAGTTTGCCCGGAAGGGGAGTTGCTTTTTAATTAACACGGCAGATCGAATAATC 666
|.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 476 CTACCGCCATTAAATCAATTGAGTTTGCCCGGAAGGGGAGTTGCTTCCTGATTAACACAGCAGATCGAATAATA 549
Query 667 AGAGTTTATGATGGCAGAGAAATCTTAACATGTGGAAGAGATGGAGAGCCTGAACCTATGCAGAAATTGCAGGA 740
|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||..|||||||
Sbjct 550 AGAGTCTATGACGGCAGAGAGATTTTAACGTGTGGAAGGGATGGAGAGCCAGAGCCTATGCAGAAGCTGCAGGA 623
Query 741 TTTGGTGAATAGGACCCCATGGAAGAAATGTTGTTTCTCTGGGGATGGGGAATACATCGTGGCAGGTTCTGCCC 814
.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||..
Sbjct 624 CTTGGTGAATAGGACTCCATGGAAAAAATGTTGTTTCTCTGGGGATGGGGAGTACATAGTGGCGGGCTCTGCGA 697
Query 815 GGCAGCATGCCCTGTACATCTGGGAGAAGAGCATTGGCAACCTGGTGAAGATTCTCCATGGGACGAGAGGAGAA 888
||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||.|||||.|||
Sbjct 698 GGCAGCATGCGCTGTATATCTGGGAAAAGAGCATTGGCAACCTGGTGAAGATCTTACATGGGACCAGAGGGGAA 771
Query 889 CTCCTCTTGGATGTAGCTTGGCATCCTGTTCGACCCATCATAGCATCCATTTCCAGTGGAGTGGTATCTATCTG 962
|||||..||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 772 CTCCTGCTGGACGTGGCTTGGCATCCAGTCCGACCCATCATAGCTTCTATCTCTAGTGGAGTGGTGTCCATTTG 845
Query 963 GGCACAGAATCAAGTAGAAAACTGGAGTGCATTTGCACCAGACTTCAAAGAATTGGATGAAAATGTAGAATACG 1036
|||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 846 GGCCCAAAATCAAGTAGAAAATTGGAGTGCATTTGCACCAGACTTCAAAGAGTTGGATGAAAATGTAGAATATG 919
Query 1037 AAGAAAGGGAATCAGAGTTTGATATTGAAGATGAAGATAAGAGTGAGCCTGAGCAGACAGGGGCTGATGCTGCA 1110
|.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 920 AGGAAAGAGAATCAGAATTTGATATTGAGGATGAAGATAAGAGTGAGCCTGAGCAAACAGGGGCTGATGCTGCT 993
Query 1111 GAAGATGAGGAAGTGGATGTCACCAGCGTGGACCCTATTGCTGCCTTCTGTAGCAGTGATGAAGAGCTGGAAGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 994 GAAGATGAGGAAGTGGATGTCACCAGCGTGGATCCCATCGCTGCCTTCTGTAGCAGTGATGAAGAGCTGGAAGA 1067
Query 1185 TTCAAAGGCTCTATTGTATTTACCCATTGCCCCTGAGGTAGAAGACCCAGAAGAAAATCCTTACGGCCCCCCAC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||
Sbjct 1068 TTCAAAGGCTCTATTGTATTTACCCATTGCCCCTGAGGTAGAAGACCCTGAAGAAAACCCGTATGGCCCTCCAC 1141
Query 1259 CGGATGCAGTCCAAACCTCCTTGATGGATGAAGGGGCTAGTTCAGAGAAGAAGAGGCAGTCCTCAGCAGATGGG 1332
||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1142 CGGATGCAGTCCCAAGCTCCTTGATGGATGAAGGGGCTAGTTCAGAGAAGAAGAGGCAGTCTTCAGCAGATGGA 1215
Query 1333 TCCCAGCCACCTAAGAAGAAACCCAAAACAACCAATATAGAACTTCAAGGAGTACCAAATGATGAAGTCCATCC 1406
|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1216 TCCCAGCCACCAAAGAAGAAACCTAAAACCACCAATATAGAGCTCCAAGGAGTGCCGAATGATGAAGTCCATCC 1289
Query 1407 ACTACTGGGTGTGAAGGGGGATGGCAAATCCAAGAAGAAGCAAGCAGGCCGGCCTAAAGGATCAAAAGGTAAAG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1290 ACTACTGGGTGTGAAGGGGGATGGCAAATCCAAGAAGAAGCAAGCAGGCCGGCCTAAAGGATCAAAAGGTAAAG 1363
Query 1481 AGAAAGATTCTCCATTTAAACCGAAACTCTACAAAGGGGACAGAGGTTTACCTCTGGAAGGATCAGCGAAGGGT 1554
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1364 AGAAAGATTCTCCATTTAAACCGAAACTCTACAAAGGGGACAGAGGTTTACCTCTGGAAGGATCAACGAAGGGT 1437
Query 1555 AAAGTGCAGGCGGAACTCAGCCAGCCCTTGACAGCAGGAGGAGCAATCTCAGAACTGTTA 1614
||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||.||||||||||||.|.
Sbjct 1438 AAAGTGCAGGCGGAACTCAGCCAGTCCTTGGCAGCAGGAGGAGCCATCTCAGAACTGCTG 1497