Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06849
• Subject: XM_005269060.5
• Aligned Length: 1289
• Identities: 1179
• Gaps: 100

Alignment

Query    1  ATGCTGCTATCCGTGACTTCCAGGCCCGGGATTTCGACTTTTGGCTACAATAGAAACAACAAGAAGCCATATGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGCTATCCGTGACTTCCAGGCCCGGGATTTCGACTTTTGGCTACAATAGAAACAACAAGAAGCCATATGT  74

Query   75  GTCACTGGCTCAGCAGATGGCACCACCTAGCCCAAGCAACAGTACACCTAACAGCAGTAGTGGAAGCAATGGAA  148
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTCATTGGCTCAGCAGATGGCACCACCTAGCCCAAGCAACAGTACACCTAACAGCAGTAGTGGAAGCAATGGAA  148

Query  149  ATGACCAGCTGAGCAAAACCAACCTATACATCCGAGGATTGCAACCAGGCACTACTGACCAAGATCTTGTCAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGACCAGCTGAGCAAAACCAACCTATACATCCGAGGATTGCAACCAGGCACTACTGACCAAGATCTTGTCAAG  222

Query  223  CTGTGTCAGCCATATGGCAAGATTGTTTCCACTAAGGCCATACTGGACAAGACCACAAACAAATGTAAAGGCTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGTGTCAGCCATATGGCAAGATTGTTTCCACTAAGGCCATACTGGACAAGACCACAAACAAATGTAAAGGCTA  296

Query  297  TGGCTTTGTAGATTTTGACAGCCCTTCAGCAGCACAGAAAGCTGTAACAGCACTGAAGGCCAGCGGTGTACAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGCTTTGTAGATTTTGACAGCCCTTCAGCAGCACAGAAAGCTGTAACAGCACTGAAGGCCAGCGGTGTACAGG  370

Query  371  CACAGATGGCAAAGCAACAGGAACAGGACCCCACAAATTTATACATCTCAAACCTCCCACTGTCAATGGATGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CACAGATGGCAAAGCAACAGGAACAGGACCCCACAAATTTATACATCTCAAACCTCCCACTGTCAATGGATGAG  444

Query  445  CAGGAACTGGAGGGGATGCTGAAGCCCTTTGGCCAGGTTATCTCCACCCGTATCCTTCGAGATACCAGTGGGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGGAACTGGAGGGGATGCTGAAGCCCTTTGGCCAGGTTATCTCCACCCGTATCCTTCGAGATACCAGTGGGAC  518

Query  519  CAGCAGAGGTGTTGGCTTTGCAAGGATGGAGTCCACAGAGAAGTGTGAAGCCATCATCACCCACTTTAATGGAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAGCAGAGGTGTTGGCTTTGCAAGGATGGAGTCCACAGAGAAGTGTGAAGCCATCATCACCCACTTTAATGGAA  592

Query  593  AATATATTAAGACACCCCCTGGAGTACCAGCCCCATCCGATCCCTTGCTTTGCAAATTTGCTGATGGCGGGCCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AATATATTAAGACACCCCCTGGAGTACCAGCCCCATCCGATCCCTTGCTTTGCAAATTTGCTGATGGCGGGCCA  666

Query  667  AAGAAACGACAGAACCAAGGAAAATTTGTGCAAAATGGACGGGCTTGGCCAAGGAATGCAGACATGGGCGTCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGAAACGACAGAACCAAGGAAAATTTGTGCAAAATGGACGGGCTTGGCCAAGGAATGCAGACATGGGCGTCAT  740

Query  741  GGCCTTGACCTATGACCCCACCACAGCTCTTCAGAATGGGTTTTACCCAGCCCCCTATAACATCACCCCCAACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCCTTGACCTATGACCCCACCACAGCTCTTCAGAATGGGTTTTACCCAGCCCCCTATAACATCACCCCCAACA  814

Query  815  GGATGCTTGCTCAGTCTGCACTCTCCCCATACCTTTCCTCTCCTGTGTCTTCGTATCAGAGAGTGACTCAGACA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGATGCTTGCTCAGTCTGCACTCTCCCCATACCTTTCCTCTCCTGTGTCTTCGTATCAGAGAGTGACTCAGACA  888

Query  889  TCTCCTCTACAAGTACCTAACCCATCCTGGATGCACCACCATTCATACCTCATGCAGCCTTCAGGTTCAGTTCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCTCCTCTACAAGTACCTAACCCATCCTGGATGCACCACCATTCATACCTCATGCAGCCTTCAGGTTCAGTTCT  962

Query  963  GACACCAGGGATGGACCATCCCATTTCTCTCCAGCCTGCCTCCATGATGGGACCCCTTACCCAGCAACTGGGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GACACCAGGGATGGACCATCCCATTTCTCTCCAGCCTGCCTCCATGATGGGACCCCTTACCCAGCAACTGGGCC  1036

Query 1037  ATCTCTCCCTCAGCAGCACAGGCACGTATATGCCGACGGCTGCAGCTATGCAAGGAGCTTACATCTCCCAGTAC  1110
            ||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATCTCTCCCTCAGCAGCACA-----GTATATGCCGACGGCTGCAGCTATGCAAGGAGCTTACATCTCCCAGTAC  1105

Query 1111  ACCCCTGTGCCTTCTTCCAGTGTTTCAGTCGAGGAGAGCAGCGGCC---------------AACAGAACCAAG-  1168
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||...|     ||               ||.||||  |.| 
Sbjct 1106  ACCCCTGTGCCTTCTTCCAGTGTTTCAGTCGAGGATTCC-----CCTCCCCATCTTTACTGAATAGAA--ATGA  1172

Query 1169  -----TGGCAG-TGGACGCA--CCCTCAGAGCATGGGGTCTATTCTTTCCA----GTTCAACAAG---------  1221
                 ||| || |  ||.||  |.|.||||                |||||    ||| |||.||         
Sbjct 1173  ATTCTTGG-AGAT--ACTCATGCTCCCAGA----------------TTCCAGAGGGTT-AACCAGGAATGGAGA  1226

Query 1222  -------------------------------  1221
                                           
Sbjct 1227  CCATCCGTCGGCCCTGCTAAGGACTAACACT  1257