Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06855
• Subject: NM_001260493.1
• Aligned Length: 1812
• Identities: 1747
• Gaps: 63

Alignment

Query    1  ATGCCGAAACCAATCAACGTAAGAGTAACTACAATGGATGCTGAGCTGGAATTTGCCATTCAGCCCAATACAAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCGAAACCAATCAACGTAAGAGTAACTACAATGGATGCTGAGCTGGAATTTGCCATTCAGCCCAATACAAC  74

Query   75  TGGCAAACAACTTTTTGACCAGGTGGTGAAAACAGTTGGTTTGCGTGAGGTCTGGTTTTTTGGGCTGCAGTATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGCAAACAACTTTTTGACCAGGTGGTGAAAACAGTTGGTTTGCGTGAGGTCTGGTTTTTTGGGCTGCAGTATG  148

Query  149  TAGACAGCAAAGGTTATTCTACATGGCTTAAACTAAATAAAAAGGTAACACAGCAGGATGTTAAAAAAGAGAAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAGACAGCAAAGGTTATTCTACATGGCTTAAACTAAATAAAAAGGTAACACAGCAGGATGTTAAAAAAGAGAAT  222

Query  223  CCTTTACAGTTCAAGTTTAGAGCTAAATTCTTTCCTGAAGATGTTTCTGAGGAATTAATTCAAGAAATAACCCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTTTACAGTTCAAGTTTAGAGCTAAATTCTTTCCTGAAGATGTTTCTGAGGAATTAATTCAAGAAATAACCCA  296

Query  297  GAGACTCTTCTTCTTGCAAGTTAAAGAAGCCATCTTAAATGATGAGATATATTGCCCGCCAGAAACTGCAGTTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAGACTCTTCTTCTTGCAAGTTAAAGAAGCCATCTTAAATGATGAGATATATTGCCCGCCAGAAACTGCAGTTC  370

Query  371  TTTTGGCTTCCTATGCTGTCCAAGCCAAGTATGGAGATTACAATAAAGAGATTCATAAGCCAGGCTACCTGGCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTTTGGCTTCCTATGCTGTCCAAGCCAAGTATGGAGATTACAATAAAGAGATTCATAAGCCAGGCTACCTGGCT  444

Query  445  AATGATAGACTCCTACCCCAGCGTGTATTGGAACAACACAAACTAACAAAAGAACAGTGGGAAGAAAGAATACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AATGATAGACTCCTACCCCAGCGTGTATTGGAACAACACAAACTAACAAAAGAACAGTGGGAAGAAAGAATACA  518

Query  519  GAACTGGCATGAAGAACATAGAGGAATGTTAAGGGAGGATTCTATGATGGAATACCTGAAGATTGCACAAGATC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAACTGGCATGAAGAACATAGAGGAATGTTAAGGGAGGATTCTATGATGGAATACCTGAAGATTGCACAAGATC  592

Query  593  TAGAAATGTATGGAGTCAACTATTTTGAAATAAAAAATAAAAAAGGAACTGAATTGTGGCTAGGTGTTGATGCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAGAAATGTATGGAGTCAACTATTTTGAAATAAAAAATAAAAAAGGAACTGAATTGTGGCTAGGTGTTGATGCT  666

Query  667  TTGGGTCTGAATATTTATGAGCATGACGACAAGTTAACACCTAAAATTGGTTTTCCCTGGAGTGAAATCAGAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTGGGTCTGAATATTTATGAGCATGACGACAAGTTAACACCTAAAATTGGTTTTCCCTGGAGTGAAATCAGAAA  740

Query  741  TATTTCATTTAATGACAAAAAATTTGTTATAAAGCCAATCGACAAAAAGGCACCTGATTTTGTGTTTTATGCAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TATTTCATTTAATGACAAAAAATTTGTTATAAAGCCAATCGACAAAAAGGCACCTGATTTTGTGTTTTATGCAC  814

Query  815  CTCGTCTGAGAATCAATAAGAGGATTTTGGCCTTATGTATGGGAAACCATGAACTATACATGCGAAGAAGGAAG  888
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTCGTCTGAGAATCAATAAGCGGATTTTGGCCTTATGTATGGGAAACCATGAACTATACATGCGAAGAAGGAAG  888

Query  889  CCTGATACTATTGAAGTACAACAGATGAAGGCTCAGGCTAGGGAGGAGAAACATCAGAAGCAGTTGGAAAGGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTGATACTATTGAAGTACAACAGATGAAGGCTCAGGCTAGGGAGGAGAAACATCAGAAGCAGTTGGAAAGGGC  962

Query  963  ACAATTAGAGAATGAAAAGGAGAAAAGAGAAATAGCAGAAAAGGAAAAGGAAAGAATAGAACGTGAAAAGGAAG  1036
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACAATTAGAGAATGAAAAGAAGAAAAGAGAAATAGCAGAAAAGGAAAAGGAAAGAATAGAACGTGAAAAGGAAG  1036

Query 1037  AGCTAATGGAACGTCTAAAACAAATTGAAGAGCAGACAATTAAAGCTCAGAAAGAACTAGAAGAACAGACTCGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCTAATGGAACGTCTAAAACAAATTGAAGAGCAGACAATTAAAGCTCAGAAAGAACTAGAAGAACAGACTCGA  1110

Query 1111  AAAGCTCTAGAACTGGATCAAGAACGAAAACGAGCAAAAGAAGAAGCAGAACGACTTGAAAAGGAGCGTCGAGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGCTCTAGAACTGGATCAAGAACGAAAACGAGCAAAAGAAGAAGCAGAACGACTTGAAAAGGAGCGTCGAGC  1184

Query 1185  TGCTGAAGAGGCAAAGTCTGCCATAGCAAAACAAGCTGCCGACCAGATGAAGAATCAGGAGCAGCTAGCAGCAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCTGAAGAGGCAAAGTCTGCCATAGCAAAACAAGCTGCCGACCAGATGAAGAATCAGGAGCAGCTAGCAGCAG  1258

Query 1259  AACTTGCTGAATTCACTGCCAAGATTGCACTTCTAGAGGAAGCCAAGAAGAAAAAGGAAGAGGAAGCTACTGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AACTTGCTGAATTCACTGCCAAGATTGCACTTCTAGAGGAAGCCAAGAAGAAAAAGGAAGAGGAAGCTACTGAG  1332

Query 1333  TGGCAACACAAAGCTTTTGCAGCCCAGGAAGACTTGGAAAAGACCAAAGAAGAGTTAAAAACTGTGATGTCTGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TGGCAACACAAAGCTTTTGCAGCCCAGGAAGACTTGGAAAAGACCAAAGAAGAGTTAAAAACTGTGATGTCTGC  1406

Query 1407  CCCCCCTCCACCTCCACCACCACCAGTCATTCCTCCAACAGAAAACGAACATGATGAACACGATGAGAATAATG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCCCCCTCCACCTCCACCACCACCAGTCATTCCTCCAACAGAAAACGAACATGATGAACACGATGAGAATAATG  1480

Query 1481  CTGAAGCTAGTGCTGAATTATCAAATGAAGGGGTAATGAACCATAGAAGCGAGGAAGAACGTGTAACCGAAACA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGAAGCTAGTGCTGAATTATCAAATGAAGGGGTAATGAACCATAGAAGCGAGGAAGAACGTGTAACCGAAACA  1554

Query 1555  CAGAAAAATGAGCGTGTTAAGAAGCAACTTCAGGCATTAAGTTCAGAATTAGCCCAAGCCAGAGATGAAACCAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGAAAAATGAGCGTGTTAAGAAGCAACTTCAGGCATTAAGTTCAGAATTAGCCCAAGCCAGAGATGAAACCAA  1628

Query 1629  GAAAACACAAAATGATGTTCTTCATGCTGAGAATGTTAAAGCAGGCCGTGATAAGTACAAGACTCTGCGACAGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GAAAACACAAAATGATGTTCTTCATGCTGAGAATGTTAAAGCAGGCCGTGATAAGTACAAGACTCTGCGACAGA  1702

Query 1703  TTCGACAAGGCAATACAAAGCAGCGTATCGATGAGTTTGAAGCAATG---------------------------  1749
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct 1703  TTCGACAAGGCAATACAAAGCAGCGTATCGATGAGTTTGAAGCAATGTGGGGACCCAAACTGTATGCATTGTTC  1776

Query 1750  ------------------------------------  1749
                                                
Sbjct 1777  CAGATGCGCTCTTGCCAAAGCAGCATAAAGCAAATG  1812