Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06889
• Subject: NM_019642.4
• Aligned Length: 1893
• Identities: 1672
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGCCGCCGGGTTCAAGCACTGTCTTCCTGTTGGCCCTGACAATCATAGCCAGCACCTGGGCTCTGACGCC  74
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||..||||||..|..|||||||||.||
Sbjct    1  ATGGCGCCGCCGGGTTCAAGCGCTGTCTTCCTGTTGGCCCTGACAATCACTGCCAGCGTCCAGGCTCTGACCCC  74

Query   75  CACTCACTACCTCACCAAGCATGACGTGGAGAGACTAAAAGCCTCGCTGGATCGCCCTTTCACAAATTTGGAAT  148
            |||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||.|||||||.|
Sbjct   75  CACCCACTACCTCACCAAGCAGGATGTGGAAAGGCTGAAGGCCTCACTGGACCGCCCCTTCACAGATTTGGAGT  148

Query  149  CTGCCTTCTACTCCATCGTGGGACTCAGCAGCCTTGGTGCTCAGGTGCCAGATGCAAAGAAAGCATGTACCTAC  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||..||||||||.|||||||.|
Sbjct  149  CTGCCTTCTACTCCATCGTGGGACTCAGCAGCCTTGGGGTACAGGTGCCAGATGTCAAGAAAGCGTGTACCTTC  222

Query  223  ATCAGATCTAACCTTGATCCCAGCAATGTGGATTCCCTCTTCTACGCTGCCCAGGCCAGCCAGGCCCTCTCAGG  296
            ||||..||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||.|||||||||.|||||||||
Sbjct  223  ATCAAGTCCAACCTTGATCCCAGCAACGTGGATTCTCTCTTCTATGCAGCCCAGTCCAGCCAGGTCCTCTCAGG  296

Query  297  ATGTGAGATCTCTATTTCAAATGAGACCAAAGATCTGCTTCTGGCAGCTGTCAGTGAGGACTCATCTGTTACCC  370
            .||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||..|..||.|||
Sbjct  297  CTGTGAGATATCTGTTTCAAATGAGACCAAAGAGCTCCTGCTGGCAGCAGTGAGTGAAGACTCCCCCATTGCCC  370

Query  371  AGATCTACCATGCAGTTGCAGCTCTAAGTGGCTTTGGCCTTCCCTTGGCATCCCAAGAAGCACTCAGTGCCCTT  444
            ||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||.|.|||||.|||.||||||||
Sbjct  371  AGATCTACCATGCAGTTGCAGCACTCAGCGGGTTTGGGCTTCCCTTGGCATCCAATGAAGCCCTCGGTGCCCTT  444

Query  445  ACTGCTCGTCTCAGCAAGGAGGAGACTGTGCTGGCAACAGTCCAGGCTCTGCAGACAGCATCCCACCTGTCCCA  518
            ||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  445  ACCGCTCGCCTCGGCAAGGAAGAGACTGTGCTAGCAACGGTCCAGGCTCTGCAGACAGCGTCCCACCTCTCCCA  518

Query  519  GCAGGCTGACCTGAGGAGCATCGTGGAGGAGATTGAGGACCTTGTTGCTCGCCTGGATGAACTCGGGGGCGTGT  592
            |||||||||||||||||.|||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  519  GCAGGCTGACCTGAGGAACATTGTAGAGGAGATTGAGGACCTTGTTGCTCGGCTGGATGAACTAGGGGGTGTGT  592

Query  593  ATCTCCAGTTTGAAGAAGGACTGGAAACAACAGCGTTATTTGTGGCTGCCACCTACAAGCTCATGGATCATGTG  666
            ||||.||||||||.|||||||||||....||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  593  ATCTGCAGTTTGAGGAAGGACTGGAGCTCACGGCGCTGTTTGTTGCTGCCACCTACAAGCTCATGGACCACGTG  666

Query  667  GGGACTGAGCCATCCATTAAGGAGGATCAGGTCATCCAGCTGATGAACGCGATCTTCAGCAAGAAGAACTTTGA  740
            |||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGGACCGAACCGTCCATGAAGGAGGATCAGGTTATCCAGCTCATGAACACAATCTTCAGCAAGAAGAACTTTGA  740

Query  741  GTCCCTCTCCGAAGCCTTCAGCGTGGCCTCTGCAGCTGCTGTGCTCTCGCATAATCGCTACCACGTGCCAGTTG  814
            |||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||...|.||.||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  741  GTCCCTCTCAGAAGCCTTCAGTGTGGCCTCTGCTGCTGCTGCATTGTCCCAGAATCGCTACCACGTACCAGTGG  814

Query  815  TGGTTGTGCCTGAGGGCTCTGCTTCCGACACTCATGAACAGGCTATCTTGCGGTTGCAAGTCACCAATGTTCTG  888
            ||||||||||.|||||||||.||||.||||||||.||||||||||||.||.|||||||.||||.|||||||.||
Sbjct  815  TGGTTGTGCCCGAGGGCTCTACTTCTGACACTCAAGAACAGGCTATCCTGAGGTTGCAGGTCAGCAATGTTTTG  888

Query  889  TCTCAGCCTCTGACTCAGGCCACTGTTAAACTAGAACATGCTAAATCTGTTGCTTCCAGAGCCACTGTCCTCCA  962
            ||||||||||||.||||.||..|.||.||.||.||.||||||||.||.|..|||.||||.||.||.|||||.||
Sbjct  889  TCTCAGCCTCTGGCTCAAGCTGCAGTGAAGCTGGAGCATGCTAAGTCGGCGGCTACCAGGGCTACCGTCCTGCA  962

Query  963  GAAGACATCCTTCACCCCTGTAGGGGATGTTTTTGAACTAAATTTCATGAACGTCAAATTTTCCAGTGGTTATT  1036
            ||||||..||||..|.|.|||.|||.||||||||||.|||||.||||.|||.||.|||.||||||||||.||.|
Sbjct  963  GAAGACGCCCTTTTCGCTTGTGGGGAATGTTTTTGAGCTAAACTTCAAGAATGTTAAACTTTCCAGTGGCTACT  1036

Query 1037  ATGACTTCCTTGTCGAAGTTGAAGGTGACAACCGGTATATTGCAAATACCGTAGAGCTCAGAGTCAAGATCTCC  1110
            ||||||||..||||..||||||||||||||.|||.||.||||||||.||.||||||||..||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGACTTCTCTGTCCGAGTTGAAGGTGACAGCCGTTACATTGCAAACACTGTAGAGCTTCGAGTCAAGATCTCC  1110

Query 1111  ACTGAAGTTGGCATCACAAATGTTGATCTTTCCACCGTGGATAAGGATCAGAGCATTGCACCCAAAACTACCCG  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACTGAAGTTGGCATCACAAATGTTGATCTTTCCACTGTGGATAAGGATCAGAGCATTGCACCCAAAACTACCCG  1184

Query 1185  GGTGACATACCCAGCCAAAGCCAAGGGCACATTCATCGCAGACAGCCACCAGAACTTCGCCTTGTTCTTCCAGC  1258
            ||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||||
Sbjct 1185  GGTGACCTACCCAGCCAAAGCCAAGGGTACATTCATCGCAGACAGCCATCAGAACTTTGCCCTGTTTTTCCAGC  1258

Query 1259  TGGTAGATGTGAACACTGGTGCTGAACTCACTCCTCACCAGACATTTGTCCGACTCCATAACCAGAAGACTGGC  1332
            ||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGTAGATGTGAACACCGGTGCGGAGCTCACCCCTCACCAGACGTTTGTTCGACTTCATAACCAGAAGACTGGC  1332

Query 1333  CAGGAAGTGGTGTTTGTTGCCGAGCCAGACAACAAGAACGTGTACAAGTTTGAACTGGATACCTCTGAAAGAAA  1406
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1333  CAGGAAGTGGTGTTTGTTGCTGAGCCAGATAACAAGAATGTATATAAGTTTGAACTGGACACCTCTGAAAGGAA  1406

Query 1407  GATTGAATTTGACTCTGCCTCTGGCACCTACACTCTCTACTTAATCATTGGAGATGCCACTTTGAAGAACCCAA  1480
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1407  GATTGAATTTGACTCTGCCTCTGGCACCTACACACTCTACTTAATCATCGGGGATGCCACATTGAAGAACCCAA  1480

Query 1481  TCCTCTGGAATGTGGCTGATGTGGTCATCAAGTTCCCTGAGGAAGAAGCTCCCTCGACTGTCTTGTCCCAGAAC  1554
            ||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||||.|
Sbjct 1481  TCCTCTGGAACGTGGCTGACGTGGTTATCAAGTTCCCTGAGGAGGAAGCCCCCTCGACTGTGCTGTCCCAGAGC  1554

Query 1555  CTTTTCACTCCAAAACAGGAAATTCAGCACCTGTTCCGCGAGCCTGAGAAGAGGCCCCCCACCGTGGTGTCCAA  1628
            ||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1555  CTGTTTACCCCAAAACAGGAAATTCAGCACCTGTTCCGAGAGCCTGAGAAGAGGCCCCCCACAGTGGTGTCCAA  1628

Query 1629  TACATTCACTGCCCTGATCCTCTCGCCGTTGCTTCTGCTCTTCGCTCTGTGGATCCGGATTGGTGCCAATGTCT  1702
            |||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1629  TACATTCACGGCCCTCATCCTCTCGCCCTTGCTCCTGCTCTTTGCACTGTGGATCCGGATTGGAGCCAATGTCT  1702

Query 1703  CCAACTTCACTTTTGCTCCTAGCACGATTATATTTCACCTGGGACATGCTGCTATGCTGGGACTCATGTATGTC  1776
            ||||||||||.||||||||||||||..||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||
Sbjct 1703  CCAACTTCACATTTGCTCCTAGCACAGTTATCTTCCACCTGGGACATGCTGCGATGCTGGGCCTCATGTATATC  1776

Query 1777  TACTGGACTCAGCTCAACATGTTCCAGACCTTGAAGTACCTGGCCATCTTGGGCAGTGTGACGTTTCTGGCTGG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||..||.||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TACTGGACTCAGCTCAACATGTTCCAGACCCTCAAGTACCTGGCTGTCCTGGGCACTGTGACGTTTCTGGCTGG  1850

Query 1851  CAATCGGATGCTGGCCCAGCAGGCAGTCAAGAGAACAGCACAT  1893
            |||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1851  CAACCGAATGCTGGCCCAGCATGCAGTTAAGAGAACAGCACAT  1893