Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06889
• Subject: XM_006499023.2
• Aligned Length: 1941
• Identities: 1662
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  ATGGCGCCGCCGGGTTCAAGCACTGTCTTCCTGTTGGCCCTGACAATCATAGCCAGCACCTGGGCTCTGACGCC  74
            ||         |.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||..||||||..|..|||||||||.||
Sbjct    1  AT---------GTGTTCAAGCGCTGTCTTCCTGTTGGCCCTGACAATCACTGCCAGCGTCCAGGCTCTGACCCC  65

Query   75  CACTCACTACCTCACCAAGCATGACGTGGAGAGACTAAAAGCCTCGCTGGATCGCCCTTTCACAAATTTGGAAT  148
            |||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||.|||||||.|
Sbjct   66  CACCCACTACCTCACCAAGCAGGATGTGGAAAGGCTGAAGGCCTCACTGGACCGCCCCTTCACAGATTTGGAGT  139

Query  149  CTGCCTTCTACTCCATCGTGGGACTCAGCAGCCTTGGTGCTCAGGTGCCAGATGCAAAGAAAGCATGTACCTAC  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||..||||||||.|||||||.|
Sbjct  140  CTGCCTTCTACTCCATCGTGGGACTCAGCAGCCTTGGGGTACAGGTGCCAGATGTCAAGAAAGCGTGTACCTTC  213

Query  223  ATCAGATCTAACCTTGATCCCAGCAATGTGGATTCCCTCTTCTACGCTGCCCAGGCCAGCCAGGCCCTCTCAGG  296
            ||||..||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||.|||||||||.|||||||||
Sbjct  214  ATCAAGTCCAACCTTGATCCCAGCAACGTGGATTCTCTCTTCTATGCAGCCCAGTCCAGCCAGGTCCTCTCAGG  287

Query  297  ATGTGAGATCTCTATTTCAAATGAGACCAAAGATCTGCTTCTGGCAGCTGTCAGTGAGGACTCATCTGTTACCC  370
            .||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||..|..||.|||
Sbjct  288  CTGTGAGATATCTGTTTCAAATGAGACCAAAGAGCTCCTGCTGGCAGCAGTGAGTGAAGACTCCCCCATTGCCC  361

Query  371  AGATCTACCATGCAGTTGCAGCTCTAAGTGGCTTTGGCCTTCCCTTGGCATCCCAAGAAGCACTCAGTGCCCTT  444
            ||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||.|.|||||.|||.||||||||
Sbjct  362  AGATCTACCATGCAGTTGCAGCACTCAGCGGGTTTGGGCTTCCCTTGGCATCCAATGAAGCCCTCGGTGCCCTT  435

Query  445  ACTGCTCGTCTCAGCAAGGAGGAGACTGTGCTGGCAACAGTCCAGGCTCTGCAGACAGCATCCCACCTGTCCCA  518
            ||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  436  ACCGCTCGCCTCGGCAAGGAAGAGACTGTGCTAGCAACGGTCCAGGCTCTGCAGACAGCGTCCCACCTCTCCCA  509

Query  519  GCAGGCTGACCTGAGGAGCATCGTGGAGGAGATTGAGGACCTTGTTGCTCGCCTGGATGAACTCGGGGGCGTGT  592
            |||||||||||||||||.|||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  510  GCAGGCTGACCTGAGGAACATTGTAGAGGAGATTGAGGACCTTGTTGCTCGGCTGGATGAACTAGGGGGTGTGT  583

Query  593  ATCTCCAGTTTGAAGAAGGACTGGAAACAACAGCGTTATTTGTGGCTGCCACCTACAAGCTCATGGATCATGTG  666
            ||||.||||||||.|||||||||||....||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  584  ATCTGCAGTTTGAGGAAGGACTGGAGCTCACGGCGCTGTTTGTTGCTGCCACCTACAAGCTCATGGACCACGTG  657

Query  667  GGGACTGAGCCATCCATTAAGGAGGATCAGGTCATCCAGCTGATGAACGCGATCTTCAGCAAGAAGAACTTTGA  740
            |||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  658  GGGACCGAACCGTCCATGAAGGAGGATCAGGTTATCCAGCTCATGAACACAATCTTCAGCAAGAAGAACTTTGA  731

Query  741  GTCCCTCTCCGAAGCCTTCAGCGTGGCCTCTGCAGCTGCTGTGCTCTCGCATAATCGCTACCACGTGCCAGTTG  814
            |||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||...|.||.||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  732  GTCCCTCTCAGAAGCCTTCAGTGTGGCCTCTGCTGCTGCTGCATTGTCCCAGAATCGCTACCACGTACCAGTGG  805

Query  815  TGGTTGTGCCTGAGGGCTCTGCTTCCGACACTCATGAACAGGCTATCTTGCGGTTGCAAGTCACCAATGTTCTG  888
            ||||||||||.|||||||||.||||.||||||||.||||||||||||.||.|||||||.||||.|||||||.||
Sbjct  806  TGGTTGTGCCCGAGGGCTCTACTTCTGACACTCAAGAACAGGCTATCCTGAGGTTGCAGGTCAGCAATGTTTTG  879

Query  889  TCTCAGCCTCTGACTCAGGCCACTGTTAAACTAGAACATGCTAAATCTGTTGCTTCCAGAGCCACTGTCCTCCA  962
            ||||||||||||.||||.||..|.||.||.||.||.||||||||.||.|..|||.||||.||.||.|||||.||
Sbjct  880  TCTCAGCCTCTGGCTCAAGCTGCAGTGAAGCTGGAGCATGCTAAGTCGGCGGCTACCAGGGCTACCGTCCTGCA  953

Query  963  GAAGACATCCTTCACCCCTGTAGGGGATGTTTTTGAACTAAATTTCATGAACGTCAAATTTTCCAGTGGTTATT  1036
            ||||||..||||..|.|.|||.|||.||||||||||.|||||.||||.|||.||.|||.||||||||||.||.|
Sbjct  954  GAAGACGCCCTTTTCGCTTGTGGGGAATGTTTTTGAGCTAAACTTCAAGAATGTTAAACTTTCCAGTGGCTACT  1027

Query 1037  ATGACTTCCTTGTCGAAGTTGAAGGTGACAACCGGTATATTGCAAATACCGTAGAGCTCAGAGTCAAGATCTCC  1110
            ||||||||..||||..||||||||||||||.|||.||.||||||||.||.||||||||..||||||||||||||
Sbjct 1028  ATGACTTCTCTGTCCGAGTTGAAGGTGACAGCCGTTACATTGCAAACACTGTAGAGCTTCGAGTCAAGATCTCC  1101

Query 1111  ACTGAAGTTGGCATCACAAATGTTGATCTTTCCACCGTGGATAAGGATCAGAGCATTGCACCCAAAACTACCCG  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102  ACTGAAGTTGGCATCACAAATGTTGATCTTTCCACTGTGGATAAGGATCAGAGCATTGCACCCAAAACTACCCG  1175

Query 1185  GGTGACATACCCAGCCAAAGCCAAGGGCACATTCATCGCAGACAGCCACCAGAACTTCGCCTTGTTCTTCCAGC  1258
            ||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||||
Sbjct 1176  GGTGACCTACCCAGCCAAAGCCAAGGGTACATTCATCGCAGACAGCCATCAGAACTTTGCCCTGTTTTTCCAGC  1249

Query 1259  TGGTAGATGTGAACACTGGTGCTGAACTCACTCCTCACCAGACATTTGTCCGACTCCATAACCAGAAGACTGGC  1332
            ||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1250  TGGTAGATGTGAACACCGGTGCGGAGCTCACCCCTCACCAGACGTTTGTTCGACTTCATAACCAGAAGACTGGC  1323

Query 1333  CAGGAAGTGGTGTTTGTTGCCGAGCCAGACAACAAGAACGTGTACAAGTTTGAACTGGATACCTCTGAAAGAAA  1406
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1324  CAGGAAGTGGTGTTTGTTGCTGAGCCAGATAACAAGAATGTATATAAGTTTGAACTGGACACCTCTGAAAGGAA  1397

Query 1407  GATTGAATTTGACTCTGCCTCTGGCACCTACACTCTCTACTTAATCATTGGAGATGCCACTTTGAAGAACCCAA  1480
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1398  GATTGAATTTGACTCTGCCTCTGGCACCTACACACTCTACTTAATCATCGGGGATGCCACATTGAAGAACCCAA  1471

Query 1481  TCCTCTGGAATGTGGCTGATGTGGTCATCAAGTTCCCTGAGGAAGAAGCTCCCTCGACTGTCTTGTCCCAGAAC  1554
            ||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||||.|
Sbjct 1472  TCCTCTGGAACGTGGCTGACGTGGTTATCAAGTTCCCTGAGGAGGAAGCCCCCTCGACTGTGCTGTCCCAGAGC  1545

Query 1555  CTTTTCACTCCAAAACAGGAAATTCAGCACCTGTTCCGCGAGCCTGAGAAGAGGCCCCCCACCGTGGTGTCCAA  1628
            ||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1546  CTGTTTACCCCAAAACAGGAAATTCAGCACCTGTTCCGAGAGCCTGAGAAGAGGCCCCCCACAGTGGTGTCCAA  1619

Query 1629  TACATTCACTGCCCTGATCCTCTCGCCGTTGCTTCTGCTCTTCGCTCTGTGGATCCGGATTGGTGCCAATGTCT  1702
            |||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1620  TACATTCACGGCCCTCATCCTCTCGCCCTTGCTCCTGCTCTTTGCACTGTGGATCCGGATTGGAGCCAATGTCT  1693

Query 1703  CCAACTTCACTTTTGCTCCTAGCACGATTATATTTCACCTGGGACATGCTGCTATGCTGGGACTCATGTATGTC  1776
            ||||||||||.||||||||||||||..||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||
Sbjct 1694  CCAACTTCACATTTGCTCCTAGCACAGTTATCTTCCACCTGGGACATGCTGCGATGCTGGGCCTCATGTATATC  1767

Query 1777  TACTGGACTCAGCTCAACATGTTCCAGACCTTGAAGTACCTGGCCATCTTGGGCAGTGTGACGTTTCTGGCTGG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||..||.||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1768  TACTGGACTCAGCTCAACATGTTCCAGACCCTCAAGTACCTGGCTGTCCTGGGCACTGTGACGTTTCTGGCTGG  1841

Query 1851  CAATCGGATGCTGGCCCAGCAGGCAGTCAAGA------------------------------------------  1882
            |||.||.||||||||||||||.|||||.||||                                          
Sbjct 1842  CAACCGAATGCTGGCCCAGCATGCAGTTAAGAGGATCGCTGCAGAGCAGAGCAGTAGATTGGCAAAATATAGGA  1915

Query 1883  ------GAACAGCACAT  1893
                  |||||||||||
Sbjct 1916  CACTACGAACAGCACAT  1932