Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06889
• Subject: XM_006499024.3
• Aligned Length: 2008
• Identities: 1667
• Gaps: 116

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------------ATGGCGCC  8
                                                                              | ||.|.|
Sbjct    1  ATGAAAGCTTTTGAGCATGTCACTAGACTTTCTTCGACTTCTAGGTTCCTTTTCCCTGACAGGGACA-GGAGAC  73

Query    9  GC-CGGGTTCAAGCACTGTCTTCCTGTTGGCCCTGACAATCATAGCCAGCACCTGGGCTCTGACGCCCACTCAC  81
            .| |.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||..||||||..|..|||||||||.|||||.|||
Sbjct   74  TCACAGGTTCAAGCGCTGTCTTCCTGTTGGCCCTGACAATCACTGCCAGCGTCCAGGCTCTGACCCCCACCCAC  147

Query   82  TACCTCACCAAGCATGACGTGGAGAGACTAAAAGCCTCGCTGGATCGCCCTTTCACAAATTTGGAATCTGCCTT  155
            ||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||.|||||||.||||||||
Sbjct  148  TACCTCACCAAGCAGGATGTGGAAAGGCTGAAGGCCTCACTGGACCGCCCCTTCACAGATTTGGAGTCTGCCTT  221

Query  156  CTACTCCATCGTGGGACTCAGCAGCCTTGGTGCTCAGGTGCCAGATGCAAAGAAAGCATGTACCTACATCAGAT  229
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||..||||||||.|||||||.|||||..|
Sbjct  222  CTACTCCATCGTGGGACTCAGCAGCCTTGGGGTACAGGTGCCAGATGTCAAGAAAGCGTGTACCTTCATCAAGT  295

Query  230  CTAACCTTGATCCCAGCAATGTGGATTCCCTCTTCTACGCTGCCCAGGCCAGCCAGGCCCTCTCAGGATGTGAG  303
            |.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||.|||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct  296  CCAACCTTGATCCCAGCAACGTGGATTCTCTCTTCTATGCAGCCCAGTCCAGCCAGGTCCTCTCAGGCTGTGAG  369

Query  304  ATCTCTATTTCAAATGAGACCAAAGATCTGCTTCTGGCAGCTGTCAGTGAGGACTCATCTGTTACCCAGATCTA  377
            ||.|||.|||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||..|..||.||||||||||
Sbjct  370  ATATCTGTTTCAAATGAGACCAAAGAGCTCCTGCTGGCAGCAGTGAGTGAAGACTCCCCCATTGCCCAGATCTA  443

Query  378  CCATGCAGTTGCAGCTCTAAGTGGCTTTGGCCTTCCCTTGGCATCCCAAGAAGCACTCAGTGCCCTTACTGCTC  451
            |||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||.|.|||||.|||.||||||||||.||||
Sbjct  444  CCATGCAGTTGCAGCACTCAGCGGGTTTGGGCTTCCCTTGGCATCCAATGAAGCCCTCGGTGCCCTTACCGCTC  517

Query  452  GTCTCAGCAAGGAGGAGACTGTGCTGGCAACAGTCCAGGCTCTGCAGACAGCATCCCACCTGTCCCAGCAGGCT  525
            |.|||.|||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  518  GCCTCGGCAAGGAAGAGACTGTGCTAGCAACGGTCCAGGCTCTGCAGACAGCGTCCCACCTCTCCCAGCAGGCT  591

Query  526  GACCTGAGGAGCATCGTGGAGGAGATTGAGGACCTTGTTGCTCGCCTGGATGAACTCGGGGGCGTGTATCTCCA  599
            ||||||||||.|||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct  592  GACCTGAGGAACATTGTAGAGGAGATTGAGGACCTTGTTGCTCGGCTGGATGAACTAGGGGGTGTGTATCTGCA  665

Query  600  GTTTGAAGAAGGACTGGAAACAACAGCGTTATTTGTGGCTGCCACCTACAAGCTCATGGATCATGTGGGGACTG  673
            ||||||.|||||||||||....||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct  666  GTTTGAGGAAGGACTGGAGCTCACGGCGCTGTTTGTTGCTGCCACCTACAAGCTCATGGACCACGTGGGGACCG  739

Query  674  AGCCATCCATTAAGGAGGATCAGGTCATCCAGCTGATGAACGCGATCTTCAGCAAGAAGAACTTTGAGTCCCTC  747
            |.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  AACCGTCCATGAAGGAGGATCAGGTTATCCAGCTCATGAACACAATCTTCAGCAAGAAGAACTTTGAGTCCCTC  813

Query  748  TCCGAAGCCTTCAGCGTGGCCTCTGCAGCTGCTGTGCTCTCGCATAATCGCTACCACGTGCCAGTTGTGGTTGT  821
            ||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||...|.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  814  TCAGAAGCCTTCAGTGTGGCCTCTGCTGCTGCTGCATTGTCCCAGAATCGCTACCACGTACCAGTGGTGGTTGT  887

Query  822  GCCTGAGGGCTCTGCTTCCGACACTCATGAACAGGCTATCTTGCGGTTGCAAGTCACCAATGTTCTGTCTCAGC  895
            |||.|||||||||.||||.||||||||.||||||||||||.||.|||||||.||||.|||||||.|||||||||
Sbjct  888  GCCCGAGGGCTCTACTTCTGACACTCAAGAACAGGCTATCCTGAGGTTGCAGGTCAGCAATGTTTTGTCTCAGC  961

Query  896  CTCTGACTCAGGCCACTGTTAAACTAGAACATGCTAAATCTGTTGCTTCCAGAGCCACTGTCCTCCAGAAGACA  969
            |||||.||||.||..|.||.||.||.||.||||||||.||.|..|||.||||.||.||.|||||.||||||||.
Sbjct  962  CTCTGGCTCAAGCTGCAGTGAAGCTGGAGCATGCTAAGTCGGCGGCTACCAGGGCTACCGTCCTGCAGAAGACG  1035

Query  970  TCCTTCACCCCTGTAGGGGATGTTTTTGAACTAAATTTCATGAACGTCAAATTTTCCAGTGGTTATTATGACTT  1043
            .||||..|.|.|||.|||.||||||||||.|||||.||||.|||.||.|||.||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1036  CCCTTTTCGCTTGTGGGGAATGTTTTTGAGCTAAACTTCAAGAATGTTAAACTTTCCAGTGGCTACTATGACTT  1109

Query 1044  CCTTGTCGAAGTTGAAGGTGACAACCGGTATATTGCAAATACCGTAGAGCTCAGAGTCAAGATCTCCACTGAAG  1117
            |..||||..||||||||||||||.|||.||.||||||||.||.||||||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  CTCTGTCCGAGTTGAAGGTGACAGCCGTTACATTGCAAACACTGTAGAGCTTCGAGTCAAGATCTCCACTGAAG  1183

Query 1118  TTGGCATCACAAATGTTGATCTTTCCACCGTGGATAAGGATCAGAGCATTGCACCCAAAACTACCCGGGTGACA  1191
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1184  TTGGCATCACAAATGTTGATCTTTCCACTGTGGATAAGGATCAGAGCATTGCACCCAAAACTACCCGGGTGACC  1257

Query 1192  TACCCAGCCAAAGCCAAGGGCACATTCATCGCAGACAGCCACCAGAACTTCGCCTTGTTCTTCCAGCTGGTAGA  1265
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||.||||||||||||||
Sbjct 1258  TACCCAGCCAAAGCCAAGGGTACATTCATCGCAGACAGCCATCAGAACTTTGCCCTGTTTTTCCAGCTGGTAGA  1331

Query 1266  TGTGAACACTGGTGCTGAACTCACTCCTCACCAGACATTTGTCCGACTCCATAACCAGAAGACTGGCCAGGAAG  1339
            |||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  TGTGAACACCGGTGCGGAGCTCACCCCTCACCAGACGTTTGTTCGACTTCATAACCAGAAGACTGGCCAGGAAG  1405

Query 1340  TGGTGTTTGTTGCCGAGCCAGACAACAAGAACGTGTACAAGTTTGAACTGGATACCTCTGAAAGAAAGATTGAA  1413
            |||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1406  TGGTGTTTGTTGCTGAGCCAGATAACAAGAATGTATATAAGTTTGAACTGGACACCTCTGAAAGGAAGATTGAA  1479

Query 1414  TTTGACTCTGCCTCTGGCACCTACACTCTCTACTTAATCATTGGAGATGCCACTTTGAAGAACCCAATCCTCTG  1487
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1480  TTTGACTCTGCCTCTGGCACCTACACACTCTACTTAATCATCGGGGATGCCACATTGAAGAACCCAATCCTCTG  1553

Query 1488  GAATGTGGCTGATGTGGTCATCAAGTTCCCTGAGGAAGAAGCTCCCTCGACTGTCTTGTCCCAGAACCTTTTCA  1561
            |||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||||.|||.||.|
Sbjct 1554  GAACGTGGCTGACGTGGTTATCAAGTTCCCTGAGGAGGAAGCCCCCTCGACTGTGCTGTCCCAGAGCCTGTTTA  1627

Query 1562  CTCCAAAACAGGAAATTCAGCACCTGTTCCGCGAGCCTGAGAAGAGGCCCCCCACCGTGGTGTCCAATACATTC  1635
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1628  CCCCAAAACAGGAAATTCAGCACCTGTTCCGAGAGCCTGAGAAGAGGCCCCCCACAGTGGTGTCCAATACATTC  1701

Query 1636  ACTGCCCTGATCCTCTCGCCGTTGCTTCTGCTCTTCGCTCTGTGGATCCGGATTGGTGCCAATGTCTCCAACTT  1709
            ||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1702  ACGGCCCTCATCCTCTCGCCCTTGCTCCTGCTCTTTGCACTGTGGATCCGGATTGGAGCCAATGTCTCCAACTT  1775

Query 1710  CACTTTTGCTCCTAGCACGATTATATTTCACCTGGGACATGCTGCTATGCTGGGACTCATGTATGTCTACTGGA  1783
            |||.||||||||||||||..||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||||
Sbjct 1776  CACATTTGCTCCTAGCACAGTTATCTTCCACCTGGGACATGCTGCGATGCTGGGCCTCATGTATATCTACTGGA  1849

Query 1784  CTCAGCTCAACATGTTCCAGACCTTGAAGTACCTGGCCATCTTGGGCAGTGTGACGTTTCTGGCTGGCAATCGG  1857
            |||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||..||.||||||.|||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1850  CTCAGCTCAACATGTTCCAGACCCTCAAGTACCTGGCTGTCCTGGGCACTGTGACGTTTCTGGCTGGCAACCGA  1923

Query 1858  ATGCTGGCCCAGCAGGCAGTCAAGA------------------------------------------------G  1883
            ||||||||||||||.|||||.||||                                                |
Sbjct 1924  ATGCTGGCCCAGCATGCAGTTAAGAGGATCGCTGCAGAGCAGAGCAGTAGATTGGCAAAATATAGGACACTACG  1997

Query 1884  AACAGCACAT  1893
            ||||||||||
Sbjct 1998  AACAGCACAT  2007