Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06889
- Subject:
- XM_006723852.3
- Aligned Length:
- 1941
- Identities:
- 1796
- Gaps:
- 144
Alignment
Query 1 ATGGCGCCGCCGGGTTCAAGCACTGTCTTCCTGTTGGCCCTGACAATCATAGCCAGCACCTGGGCTCTGACGCC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGCCGCCGGGTTCAAGCACTGTCTTCCTGTTGGCCCTGACAATCATAGCCAGCACCTGGGCTCTGACGCC 74
Query 75 CACTCACTACCTCACCAAGCATGACGTGGAGAGACTAAAAGCCTCGCTGGATCGCCCTTTCACAAATTTGGAAT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CACTCACTACCTCACCAAGCATGACGTGGAGAGACTAAAAGCCTCGCTGGATCGCCCTTTCACAAATTTGGAAT 148
Query 149 CTGCCTTCTACTCCATCGTGGGACTCAGCAGCCTTGGTGCTCAGGTGCCAGATGCAAAGAAAGCATGTACCTAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTGCCTTCTACTCCATCGTGGGACTCAGCAGCCTTGGTGCTCAGGTGCCAGATGCAAAGAAAGCATGTACCTAC 222
Query 223 ATCAGATCTAACCTTGATCCCAGCAATGTGGATTCCCTCTTCTACGCTGCCCAGGCCAGCCAGGCCCTCTCAGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATCAGATCTAACCTTGATCCCAGCAATGTGGATTCCCTCTTCTACGCTGCCCAGGCCAGCCAGGCCCTCTCAGG 296
Query 297 ATGTGAGATCTCTATTTCAAATGAGACCAAAGATCTGCTTCTGGCAGCTGTCAGTGAGGACTCATCTGTTACCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATGTGAGATCTCTATTTCAAATGAGACCAAAGATCTGCTTCTGGCAGCTGTCAGTGAGGACTCATCTGTTACCC 370
Query 371 AGATCTACCATGCAGTTGCAGCTCTAAGTGGCTTTGGCCTTCCCTTGGCATCCCAAGAAGCACTCAGTGCCCTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGATCTACCATGCAGTTGCAGCTCTAAGTGGCTTTGGCCTTCCCTTGGCATCCCAAGAAGCACTCAGTGCCCTT 444
Query 445 ACTGCTCGTCTCAGCAAGGAGGAGACTGTGCTGGC--------------------------------------- 479
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACTGCTCGTCTCAGCAAGGAGGAGACTGTGCTGGCGAGGGTGTGGAGCACCGTTCTGGAATCCCGTTCGTTGTT 518
Query 480 ---------AACAGTCCAGGCTCTGCAGACAGCATCCCACCTGTCCCAGCAGGCTGACCTGAGGAGCATCGTGG 544
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TAGCAAGAGAACAGTCCAGGCTCTGCAGACAGCATCCCACCTGTCCCAGCAGGCTGACCTGAGGAGCATCGTGG 592
Query 545 AGGAGATTGAGGACCTTGTTGCTCGCCTGGATGAACTCGGGGGCGTGTATCTCCAGTTTGAAGAAGGACTGGAA 618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGGAGATTGAGGACCTTGTTGCTCGCCTGGATGAACTCGGGGGCGTGTATCTCCAGTTTGAAGAAGGACTGGAA 666
Query 619 ACAACAGCGTTATTTGTGGCTGCCACCTACAAGCTCATGGATCATGTGGGGACTGAGCCATCCATTAAGGAGGA 692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACAACAGCGTTATTTGTGGCTGCCACCTACAAGCTCATGGATCATGTGGGGACTGAGCCATCCATTAAGGAGGA 740
Query 693 TCAGGTCATCCAGCTGATGAACGCGATCTTCAGCAAGAAGAACTTTGAGTCCCTCTCCGAAGCCTTCAGCGTGG 766
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCAGGTCATCCAGCTGATGAACGCGATCTTCAGCAAGAAGAACTTTGAGTCCCTCTCCGAAGCCTTCAGCGTGG 814
Query 767 CCTCTGCAGCTGCTGTGCTCTCGCATAATCGCTACCACGTGCCAGTTGTGGTTGTGCCTGAGGGCTCTGCTTCC 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCTCTGCAGCTGCTGTGCTCTCGCATAATCGCTACCACGTGCCAGTTGTGGTTGTGCCTGAGGGCTCTGCTTCC 888
Query 841 GACACTCATGAACAGGCTATCTTGCGGTTGCAAGTCACCAATGTTCTGTCTCAGCCTCTGACTCAGGCCACTGT 914
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GACACTCATGAACAGGCTATCTTGCGGTTGCAAGTCACCAATGTTCTGTCTCAGCCTCTGACTCAGGCCACTGT 962
Query 915 TAAACTAGAACATGCTAAATCTGTTGCTTCCAGAGCCACTGTCCTCCAGAAGACATCCTTCACCCCTGTAGGGG 988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TAAACTAGAACATGCTAAATCTGTTGCTTCCAGAGCCACTGTCCTCCAGAAGACATCCTTCACCCCTGTAGGGG 1036
Query 989 ATGTTTTTGAACTAAATTTCATGAACGTCAAATTTTCCAGTGGTTATTATGACTTCCTTGTCGAAGTTGAAGGT 1062
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATGTTTTTGAACTAAATTTCATGAACGTCAAATTTTCCAGTGGTTATTATGACTTCCTTGTCGAAGTTGAAGGT 1110
Query 1063 GACAACCGGTATATTGCAAATACCGTAGAGCTCAGAGTCAAGATCTCCACTGAAGTTGGCATCACAAATGTTGA 1136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GACAACCGGTATATTGCAAATACCGTAGAGCTCAGAGTCAAGATCTCCACTGAAGTTGGCATCACAAATGTTGA 1184
Query 1137 TCTTTCCACCGTGGATAAGGATCAGAGCATTGCACCCAAAACTACCCGGGTGACATACCCAGCCAAAGCCAAGG 1210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCTTTCCACCGTGGATAAGGATCAGAGCATTGCACCCAAAACTACCCGGGTGACATACCCAGCCAAAGCCAAGG 1258
Query 1211 GCACATTCATCGCAGACAGCCACCAGAACTTCGCCTTGTTCTTCCAGCTGGTAGATGTGAACACTGGTGCTGAA 1284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GCACATTCATCGCAGACAGCCACCAGAACTTCGCCTTGTTCTTCCAGCTGGTAGATGTGAACACTGGTGCTGAA 1332
Query 1285 CTCACTCCTCACCAGACATTTGTCCGACTCCATAACCAGAAGACTGGCCAGGAAGTGGTGTTTGTTGCCGAGCC 1358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTCACTCCTCACCAGACATTTGTCCGACTCCATAACCAGAAGACTGGCCAGGAAGTGGTGTTTGTTGCCGAGCC 1406
Query 1359 AGACAACAAGAACGTGTACAAGTTTGAACTGGATACCTCTGAAAGAAAGATTGAATTTGACTCTGCCTCTGGCA 1432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGACAACAAGAACGTGTACAAGTTTGAACTGGATACCTCTGAAAGAAAGATTGAATTTGACTCTGCCTCTGGCA 1480
Query 1433 CCTACACTCTCTACTTAATCATTGGAGATGCCACTTTGAAGAACCCAATCCTCTGGAATGTGGCTGATGTGGTC 1506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCTACACTCTCTACTTAATCATTGGAGATGCCACTTTGAAGAACCCAATCCTCTGGAATGTGGCTGATGTGGTC 1554
Query 1507 ATCAAGTTCCCTGAGGAAGAAGCTCCCTCGACTGTCTTGTCCCAGAACCTTTTCACTCCAAAACAGGAAATTCA 1580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATCAAGTTCCCTGAGGAAGAAGCTCCCTCGACTGTCTTGTCCCAGAACCTTTTCACTCCAAAACAGGAAATTCA 1628
Query 1581 GCACCTGTTCCGCGAGCCTGAGAAGAGGCCCCCCACCGTGGTGTCCAATACATTCACTGCCCTGATCCTCTCGC 1654
Sbjct 1629 -------------------------------------------------------------------------- 1628
Query 1655 CGTTGCTTCTGCTCTTCGCTCTGTGGATCCGGATTGGTGCCAATGTCTCCAACTTCACTTTTGCTCCTAGCACG 1728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ----------------------GTGGATCCGGATTGGTGCCAATGTCTCCAACTTCACTTTTGCTCCTAGCACG 1680
Query 1729 ATTATATTTCACCTGGGACATGCTGCTATGCTGGGACTCATGTATGTCTACTGGACTCAGCTCAACATGTTCCA 1802
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 ATTATATTTCACCTGGGACATGCTGCTATGCTGGGACTCATGTATGTCTACTGGACTCAGCTCAACATGTTCCA 1754
Query 1803 GACCTTGAAGTACCTGGCCATCTTGGGCAGTGTGACGTTTCTGGCTGGCAATCGGATGCTGGCCCAGCAGGCAG 1876
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1755 GACCTTGAAGTACCTGGCCATCCTGGGCAGTGTGACGTTTCTGGCTGGCAATCGGATGCTGGCCCAGCAGGCAG 1828
Query 1877 TCAAGAGAACAGCACAT 1893
|||||||||||||||||
Sbjct 1829 TCAAGAGAACAGCACAT 1845