Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06892
• Subject: NM_001039567.3
• Aligned Length: 790
• Identities: 653
• Gaps: 2

Alignment

Query   1  ATGGCCCGGGGCCCCAAGAAGCATCTGAAGCGGGTGGCAGCTCCAAAGCATTGGATGCTGGATAAATTGACCGG  74
           |||||||||||||||||||||||..|||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||.|.||.||
Sbjct   1  ATGGCCCGGGGCCCCAAGAAGCACTTGAAGCGTGTTGCAGCGCCGAAGCATTGGATGCTGGATAAACTAACTGG  74

Query  75  TGTGTTTGCTCCTCGTCCATCCACCGGTCCCCACAAGTTGAGAGAGTGTCTCCCCCTCATCATTTTCCTGAGGA  148
           |||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||.||||.||.|||||.|||||.||..|.|||||.||||
Sbjct  75  TGTATTTGCACCTCGTCCATCGACAGGTCCTCACAAGCTGAGGGAATGTCTTCCCCTGATAGTCTTCCTCAGGA  148

Query 149  ACAGACTTAAGTATGCCCTGACAGGAGATGAAGTAAAGAAGATTTGCATGCAGCGGTTCATTAAAATCGATGGC  222
           |.|||||.||||||||..||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.|..|||.|.|||||.||||||
Sbjct 149  ATAGACTCAAGTATGCATTGACTGGAGATGAGGTAAAGAAGATATGTATGCAACACTTCCTCAAAATTGATGGC  222

Query 223  AAGGTCCGAACTGATATAACCTACCCTGCTGGATTCATGGATGTCATCAGCATTGACAAGACGGGAGAGAATTT  296
           |||||.|||...||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||.||||
Sbjct 223  AAGGTTCGAGTGGACATCACATACCCTGCTGGATTCATAGATGTCATCAGCATTGAGAAAACAGGTGAGCATTT  296

Query 297  CCGTCTGATCTATGACACCAAGGGTCGCTTTGCTGTACATCGTATTACACCTGAGGAGGCCAAGTACAAGTTGT  370
           |||.|||.|||||.|.||||||||..|.||||||||.||||||||.|||...||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 297  CCGCCTGGTCTATAATACCAAGGGCTGTTTTGCTGTTCATCGTATCACAGTGGAAGAGGCAAAGTACAAGTTGT  370

Query 371  GCAAAGTGAGAAAGATCTTTGTGGGCACAAAAGGAATCCCTCATCTGGTGACTCATGATGCCCGCACCATCCGC  444
           ||||||||||.|||||...||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 371  GCAAAGTGAGGAAGATTACTGTGGGGACAAAGGGAATTCCACACCTGGTGACTCATGATGCTCGAACCATTCGC  444

Query 445  TACCCCGATCCCCTCATCAAGGTGAATGATACCATTCAGATTGATTTAGAGACTGGCAAGATTA-CTGATTTCA  517
           |||||.|||||.||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||||.||||||.|||||.| |.|.||| |
Sbjct 445  TACCCAGATCCTCTCATCAAGGTGAACGATACTGTGCAGATTGATTTAGGGACTGGGAAGATAACCAGCTTT-A  517

Query 518  TCAAGTTCGACACTGGTAACCTGTGTATGGTGACTGGAGGTGCTAACCTAGGAAGAATTGGTGTGATCACCAAC  591
           ||||.||.|||||.||.||..|.||||||||||.||..||.||||||||.||..|..|||||||||||||.|||
Sbjct 518  TCAAATTTGACACAGGCAATGTATGTATGGTGATTGCTGGAGCTAACCTCGGTCGTGTTGGTGTGATCACAAAC  591

Query 592  AGAGAGAGGCACCCTGGATCTTTTGACGTGGTTCACGTGAAAGATGCCAATGGCAACAGCTTTGCCACTCGACT  665
           ||.||.||.||.|||||.||||..||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||..|..|
Sbjct 592  AGGGAAAGACATCCTGGTTCTTGCGATGTGGTACATGTGAAGGATGCCAACGGCAACAGCTTTGCCACAAGGAT  665

Query 666  TTCCAACATTTTTGTTATTGGCAAGGGCAACAAACCATGGATTTCTCTTCCCCGAGGAAAGGGTATCCGCCTCA  739
           |||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.||.|||.|.||||||||.|||||.||.|
Sbjct 666  TTCCAACATTTTTGTCATTGGCAATGGTAATAAACCTTGGATTTCCCTGCCCAGGGGAAAGGGCATCCGACTTA  739

Query 740  CCATTGCTGAAGAGAGAGACAAAAGACTGGCTGCCAAACAGAGCAGTGGC  789
           |.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740  CTATTGCTGAAGAGAGAGACAAGAGGCTGGCTGCCAAACAGAGCAGTGGC  789