Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06902
• Subject: NM_001033.5
• Aligned Length: 2376
• Identities: 2373
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCATGTGATCAAGCGAGATGGCCGCCAAGAACGAGTCATGTTTGACAAAATTACATCTCGAATCCAGAAGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCATGTGATCAAGCGAGATGGCCGCCAAGAACGAGTCATGTTTGACAAAATTACATCTCGAATCCAGAAGCT  74

Query   75  TTGTTATGGACTCAATATGGATTTTGTTGATCCTGCTCAGATCACCATGAAAGTAATCCAAGGCTTGTACAGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTGTTATGGACTCAATATGGATTTTGTTGATCCTGCTCAGATCACCATGAAAGTAATCCAAGGCTTGTACAGTG  148

Query  149  GGGTCACCACAGTGGAACTAGATACTTTGGCTGCTGAAACAGCTGCAACCTTGACTACTAAGCACCCTGACTAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGTCACCACAGTGGAACTAGATACTTTGGCTGCTGAAACAGCTGCAACCTTGACTACTAAGCACCCTGACTAT  222

Query  223  GCTATCCTGGCAGCCAGGATCGCTGTCTCTAACTTGCACAAAGAAACAAAGAAAGTGTTCAGTGATGTGATGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTATCCTGGCAGCCAGGATCGCTGTCTCTAACTTGCACAAAGAAACAAAGAAAGTGTTCAGTGATGTGATGGA  296

Query  297  AGACCTCTATAACTACATAAATCCACATAATGGCAAACACTCTCCCATGGTGGCCAAGTCAACATTGGATATTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGACCTCTATAACTACATAAATCCACATAATGGCAAACACTCTCCCATGGTGGCCAAGTCAACATTGGATATTG  370

Query  371  TTCTGGCCAATAAAGATCGCCTGAATTCTGCTATTATCTATGACCGAGATTTCTCTTACAATTACTTCGGCTTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCTGGCCAATAAAGATCGCCTGAATTCTGCTATTATCTATGACCGAGATTTCTCTTACAATTACTTCGGCTTT  444

Query  445  AAGACGCTAGAGCGGTCTTATTTGTTGAAGATCAATGGAAAAGTGGCTGAAAGACCACAACATATGTTGATGAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGACGCTAGAGCGGTCTTATTTGTTGAAGATCAATGGAAAAGTGGCTGAAAGACCACAACATATGTTGATGAG  518

Query  519  AGTATCTGTTGGGATCCACAAAGAAGACATTGATGCAGCAATTGAAACATATAATCTTCTTTCTGAGAGGTGGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGTATCTGTTGGGATCCACAAAGAAGACATTGATGCAGCAATTGAAACATATAATCTTCTTTCTGAGAGGTGGT  592

Query  593  TTACTCATGCTTCGCCCACTCTCTTCAATGCTGGTACCAACCGCCCACAACTTTCTAGCTGTTTTCTTCTGAGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTACTCATGCTTCGCCCACTCTCTTCAATGCTGGTACCAACCGCCCACAACTTTCTAGCTGTTTTCTTCTGAGT  666

Query  667  ATGAAAGATGACAGCATTGAAGGCATTTATGACACTCTAAAGCAATGTGCATTGATTTCTAAGTCTGCTGGAGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATGAAAGATGACAGCATTGAAGGCATTTATGACACTCTAAAGCAATGTGCATTGATTTCTAAGTCTGCTGGAGG  740

Query  741  AATTGGTGTTGCTGTGAGTTGTATTCGGGCTACTGGCAGCTACATTGCTGGGACTAATGGCAATTCCAATGGCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AATTGGTGTTGCTGTGAGTTGTATTCGGGCTACTGGCAGCTACATTGCTGGGACTAATGGCAATTCCAATGGCC  814

Query  815  TTGTACCGATGCTGAGAGTATATAACAACACAGCTAGATATGTGGATCAAGGTGGGAACAAGCGTCCTGGGGCA  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGTACCGATGCTGAGAGTATATAACAACACAGCTCGATATGTGGATCAAGGTGGGAACAAGCGTCCTGGGGCA  888

Query  889  TTTGCTATTTACCTGGAGCCTTGGCATTTAGACATCTTTGAATTCCTTGATTTAAAGAAGAACACAGGAAAGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTGCTATTTACCTGGAGCCTTGGCATTTAGACATCTTTGAATTCCTTGATTTAAAGAAGAACACAGGAAAGGA  962

Query  963  AGAGCAGCGTGCCAGAGATCTTTTCTTTGCTCTTTGGATTCCGGATCTCTTCATGAAACGAGTGGAGACTAATC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGAGCAGCGTGCCAGAGATCTTTTCTTTGCTCTTTGGATTCCGGATCTCTTCATGAAACGAGTGGAGACTAATC  1036

Query 1037  AGGACTGGTCTTTGATGTGTCCAAATGAGTGTCCTGGTCTGGATGAGGTTTGGGGAGAGGAATTTGAGAAACTA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGACTGGTCTTTGATGTGTCCAAATGAGTGTCCTGGTCTGGATGAGGTTTGGGGAGAGGAATTTGAGAAACTA  1110

Query 1111  TATGCAAGTTATGAGAAACAAGGTCGTGTCCGCAAAGTTGTAAAAGCTCAGCAGCTTTGGTATGCCATCATTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TATGCAAGTTATGAGAAACAAGGTCGTGTCCGCAAAGTTGTAAAAGCTCAGCAGCTTTGGTATGCCATCATTGA  1184

Query 1185  GTCTCAGACGGAAACAGGCACCCCGTATATGCTCTACAAAGATTCCTGTAATCGAAAGAGCAACCAGCAGAACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTCTCAGACGGAAACAGGCACCCCGTATATGCTCTACAAAGATTCCTGTAATCGAAAGAGCAACCAGCAGAACC  1258

Query 1259  TGGGAACCATCAAATGCAGCAACCTGTGCACAGAAATAGTGGAGTACACCAGCAAAGATGAGGTTGCTGTTTGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGGAACCATCAAATGCAGCAACCTGTGCACAGAAATAGTGGAGTACACCAGCAAAGATGAGGTTGCTGTTTGT  1332

Query 1333  AATTTGGCTTCCCTGGCCCTGAATATGTATGTCACATCAGAACACACATACGACTTTAAGAAGTTGGCTGAAGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AATTTGGCTTCCCTGGCCCTGAATATGTATGTCACATCAGAACACACATACGACTTTAAGAAGTTGGCTGAAGT  1406

Query 1407  CACTAAAGTCGTTGTCCGAAACTTGAATAAAATTATTGATATAAACTACTATCCTGTACCAGAGGCATGCCTAT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CACTAAAGTCGTTGTCCGAAACTTGAATAAAATTATTGATATAAACTACTATCCTGTACCAGAGGCATGCCTAT  1480

Query 1481  CAAATAAACGCCATCGCCCCATTGGAATTGGGGTACAAGGTCTGGCAGATGCTTTTATCCTGATGAGATACCCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CAAATAAACGCCATCGCCCCATTGGAATTGGGGTACAAGGTCTGGCAGATGCTTTTATCCTGATGAGATACCCT  1554

Query 1555  TTTGAGAGTGCAGAAGCCCAGTTACTGAATAAGCAGATCTTTGAAACTATTTATTATGGTGCTCTGGAAGCCAG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTTGAGAGTGCAGAAGCCCAGTTACTGAATAAGCAGATCTTTGAAACTATTTATTATGGTGCTCTGGAAGCCAG  1628

Query 1629  CTGTGACCTTGCCAAGGAGCAGGGCCCATACGAAACCTATGAGGGCTCTCCAGTTAGCAAAGGAATTCTTCAGT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTGTGACCTTGCCAAGGAGCAGGGCCCATACGAAACCTATGAGGGCTCTCCAGTTAGCAAAGGAATTCTTCAGT  1702

Query 1703  ATGATATGTGGAATGTTACTCCTACAGACCTATGGGACTGGAAGGTTCTCAAGGAGAAGATTGCAAAGTATGGT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATGATATGTGGAATGTTACTCCTACAGACCTATGGGACTGGAAGGTTCTCAAGGAGAAGATTGCAAAGTATGGT  1776

Query 1777  ATAAGAAACAGTTTACTTATTGCCCCGATGCCTACAGCTTCCACTGCTCAGATCCTGGGGAATAATGAGTCCAT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATAAGAAACAGTTTACTTATTGCCCCGATGCCTACAGCTTCCACTGCTCAGATCCTGGGGAATAATGAGTCCAT  1850

Query 1851  TGAACCTTACACCAGCAACATCTATACTCGCAGAGTCTTGTCAGGAGAATTTCAGATTGTAAATCCTCACTTAT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGAACCTTACACCAGCAACATCTATACTCGCAGAGTCTTGTCAGGAGAATTTCAGATTGTAAATCCTCACTTAT  1924

Query 1925  TGAAAGATCTTACCGAGCGGGGCCTATGGCATGAAGAGATGAAAAACCAGATTATTGCATGCAATGGCTCTATT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGAAAGATCTTACCGAGCGGGGCCTATGGCATGAAGAGATGAAAAACCAGATTATTGCATGCAATGGCTCTATT  1998

Query 1999  CAGAGCATACCAGAAATTCCTGATGACCTGAAGCAACTTTATAAAACTGTGTGGGAAATCTCTCAGAAAACTGT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CAGAGCATACCAGAAATTCCTGATGACCTGAAGCAACTTTATAAAACTGTGTGGGAAATCTCTCAGAAAACTGT  2072

Query 2073  TCTCAAGATGGCAGCTGAGAGAGGTGCTTTCATTGATCAAAGCCAATCTTTGAACATCCACATTGCTGAGCCTA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TCTCAAGATGGCAGCTGAGAGAGGTGCTTTCATTGATCAAAGCCAATCTTTGAACATCCACATTGCTGAGCCTA  2146

Query 2147  ACTATGGCAAACTCACTAGTATGCACTTCTACGGCTGGAAGCAGGGTTTGAAGACTGGGATGTATTATTTAAGG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  ACTATGGCAAACTCACTAGTATGCACTTCTACGGCTGGAAGCAGGGTTTGAAGACTGGGATGTATTATTTAAGG  2220

Query 2221  ACGAGACCAGCAGCTAATCCAATCCAGTTCACTCTAAATAAGGAGAAGCTAAAAGATAAAGAAAAGGTATCAAA  2294
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ACAAGACCAGCGGCTAATCCAATCCAGTTCACTCTAAATAAGGAGAAGCTAAAAGATAAAGAAAAGGTATCAAA  2294

Query 2295  AGAGGAAGAAGAGAAGGAGAGGAACACAGCAGCCATGGTGTGCTCTTTGGAGAATAGAGATGAATGTCTGATGT  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  AGAGGAAGAAGAGAAGGAGAGGAACACAGCAGCCATGGTGTGCTCTTTGGAGAATAGAGATGAATGTCTGATGT  2368

Query 2369  GTGGATCC  2376
            ||||||||
Sbjct 2369  GTGGATCC  2376