Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06912
- Subject:
- NM_001330669.1
- Aligned Length:
- 1608
- Identities:
- 1541
- Gaps:
- 66
Alignment
Query 1 ATGGTGCTGGATCTGGATTTGTTTCGGGTGGATAAAGGAGGGGACCCAGCCCTCATCCGAGAGACGCAGGAGAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTGCTGGATCTGGATTTGTTTCGGGTGGATAAAGGAGGGGACCCAGCCCTCATCCGAGAGACGCAGGAGAA 74
Query 75 GCGCTTCAAGGACCCGGGACTAGTGGACCAGCTGGTGAAGGCAGACAGCGAGTGGCGACGATGTAGATTTCGGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCGCTTCAAGGACCCGGGACTAGTGGACCAGCTGGTGAAGGCAGACAGCGAGTGGCGACGATGTAGATTTCGGG 148
Query 149 CAGACAACTTGAACAAGCTGAAGAACCTATGCAGCAAGACAATCGGAGAGAAAATGAAGAAAAAAGAGCCAGTG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAGACAACTTGAACAAGCTGAAGAACCTATGCAGCAAGACAATCGGAGAGAAAATGAAGAAAAAAGAGCCAGTG 222
Query 223 GGAGATGATGAGTCTGTCCCAGAGAATGTGCTGAGTTTCGATGACCTTACTGCAGACGCTTTAGCTAACCTGAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGAGATGATGAGTCTGTCCCAGAGAATGTGCTGAGTTTCGATGACCTTACTGCAGACGCTTTAGCTAACCTGAA 296
Query 297 AGTCTCACAAATCAAAAAAGTCCGACTCCTCATTGATGAAGCCATCCTGAAGTGTGACGCGGAGCGGATAAAGT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGTCTCACAAATCAAAAAAGTCCGACTCCTCATTGATGAAGCCATCCTGAAGTGTGACGCGGAGCGGATAAAGT 370
Query 371 TGGAAGCAGAGCGGTTTGAGAACCTCCGAGAGATTGGGAACCTTCTGCACCCTTCTGTACCCATCAGTAACGAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGGAAGCAGAGCGGTTTGAGAACCTCCGAGAGATTGGGAACCTTCTGCACCCTTCTGTACCCATCAGTAACGAT 444
Query 445 GAGGATGTGGACAACAAAGTAGAGAGGATTTGGGGTGATTGTACAGTCAGGAAGAAGTACTCTCATGTGGACCT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAGGATGTGGACAACAAAGTAGAGAGGATTTGGGGTGATTGTACAGTCAGGAAGAAGTACTCTCATGTGGACCT 518
Query 519 GGTGGTGATGGTAGATGGCTTTGAAGGCGAAAAGGGGGCCGTGGTGGCTGGGAGTCGAGGGTACTTCTTGAAGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGTGGTGATGGTAGATGGCTTTGAAGGCGAAAAGGGGGCCGTGGTGGCTGGGAGTCGAGGGTACTTCTTGAAGG 592
Query 593 GGGTCCTGGTGTTCCTGGAACAGGCTCTCATCCAGTATGCCCTTCGCACCTTGGGAAGTCGGGGCTACATTCCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGGTCCTGGTGTTCCTGGAACAGGCTCTCATCCAGTATGCCCTTCGCACCTTGGGAAGTCGGGGCTACATTCCC 666
Query 667 ATTTATACCCCCTTTTTCATGAGGAAGGAGGTCATGCAGGAGGTGGCACAGCTCAGCCAGTTTGATGAAGAACT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATTTATACCCCCTTTTTCATGAGGAAGGAGGTCATGCAGGAGGTGGCACAGCTCAGCCAGTTTGATGAAGAACT 740
Query 741 TTATAAGGTGATTGGCAAAGGCAGTGAAAAGTCTGATGACAACTCCTATGATGAGAAGTACCTGATTGCCACCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTATAAGGTGATTGGCAAAGGCAGTGAAAAGTCTGATGACAACTCCTATGATGAGAAGTACCTGATTGCCACCT 814
Query 815 CAGAGCAGCCCATTGCTGCCCTGCACCGGGATGAGTGGCTCCGGCCGGAGGACCTGCCCATCAAGTATGCTGGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAGAGCAGCCCATTGCTGCCCTGCACCGGGATGAGTGGCTCCGGCCGGAGGACCTGCCCATCAAGTATGCTGGC 888
Query 889 CTGTCTACCTGCTTCCGTCAGGAGGTGGGCTCCCATGGCCGTGACACCCGTGGCATCTTCCGAGTCCATCAGTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGTCTACCTGCTTCCGTCAGGAGGTGGGCTCCCATGGCCGTGACACCCGTGGCATCTTCCGAGTCCATCAGTT 962
Query 963 TGAGAAGATTGAACAGTTTGTGTACTCATCACCCCATGACAACAAGTCATGGGAGATGTTTGAAGAGATGATTA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGAGAAGATTGAACAGTTTGTGTACTCATCACCCCATGACAACAAGTCATGGGAGATGTTTGAAGAGATGATTA 1036
Query 1037 CCACCGCAGAGGAGTTCTACCAGTCCCTGGGGATTCCTTACCACATTGTGAATATTGTCTCAGGTTCTTTGAAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCACCGCAGAGGAGTTCTACCAGTCCCTGGGGATTCCTTACCACATTGTGAATATTGTCTCAGGTTCTTTGAAT 1110
Query 1111 CATGCTGCCAGTAAGAAGCTTGACCTGGAGGCCTGGTTTCCGGGCTCAGGAGCCTTCCGTGAGTTGGTCTCCTG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CATGCTGCCAGTAAGAAGCTTGACCTGGAGGCCTGGTTTCCGGGCTCAGGAGCCTTCCGTGAGTTGGTCTCCTG 1184
Query 1185 TTCTAATTGCACGGATTACCAGGCTCGCCGGCTTCGAATCCGATATGGGCAAACCAAGAAGATGATGGAC---- 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TTCTAATTGCACGGATTACCAGGCTCGCCGGCTTCGAATCCGATATGGGCAAACCAAGAAGATGATGGACAAGA 1258
Query 1255 --------------------------------------------------------------AAGGTGGAGTTT 1266
||||||||||||
Sbjct 1259 GAAAGAATAATCTCCATTTATCTACACAGAACAAGTTGGAGGCTTCCCTCTTCTCACCCAAGAAGGTGGAGTTT 1332
Query 1267 GTCCATATGCTCAATGCTACCATGTGCGCCACTACCTGTACCATCTGCGCCATCCTGGAGAACTACCAGACAGA 1340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTCCATATGCTCAATGCTACCATGTGCGCCACTACCCGTACCATCTGCGCCATCCTGGAGAACTACCAGACAGA 1406
Query 1341 GAAGGGCATCACTGTGCCTGAGAAATTGAAGGAGTTCATGCCGCCAGGACTGCAAGAACTGATCCCCTTTGTGA 1414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAAGGGCATCACTGTGCCTGAGAAATTGAAGGAGTTCATGCCGCCAGGACTGCAAGAACTGATCCCCTTTGTGA 1480
Query 1415 AGCCTGCGCCCATTGAGCAGGAGCCATCAAAGAAGCAGAAGAAGCAACATGAGGGCAGCAAAAAGAAAGCAGCA 1488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGCCTGCGCCCATTGAGCAGGAGCCATCAAAGAAGCAGAAGAAGCAACATGAGGGCAGCAAAAAGAAAGCAGCA 1554
Query 1489 GCAAGAGACGTCACCCTAGAAAACAGGCTGCAGAACATGGAGGTCACCGATGCT 1542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GCAAGAGACGTCACCCTAGAAAACAGGCTGCAGAACATGGAGGTCACCGATGCT 1608