Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06967
• Subject: NM_053079.2
• Aligned Length: 2135
• Identities: 1780
• Gaps: 19

Alignment

Query    1  ATGGGAATGTCCAAATCACACAGTTTCTTTGGTTATCCCCTGAGCATCTTCTTCATCGTGGTCAATGAGTTTTG  74
            |||||.||||||||.||.|...|||.|||.|||||.||..||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct    1  ATGGGGATGTCCAAGTCTCGGGGTTGCTTCGGTTACCCGTTGAGCATCTTCTTCATCGTGGTCAATGAATTCTG  74

Query   75  CGAAAGATTTTCCTACTATGGAATGCGAGCAATCCTGATTCTGTACTTCACAAATTTCATCAGCTGGGATGATA  148
            .||||||||.|||||||||||.|||||||||.|||||.||||||||||||..||.|||.||.|||||||.||.|
Sbjct   75  TGAAAGATTCTCCTACTATGGCATGCGAGCACTCCTGGTTCTGTACTTCAGGAACTTCCTCGGCTGGGACGACA  148

Query  149  ACCTGTCCACCGCCATCTACCATACGTTTGTGGCTCTGTGCTACCTGACGCCAATTCTCGGAGCTCTTATCGCC  222
            |.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct  149  ATCTCTCCACGGCCATTTACCATACGTTCGTTGCCCTCTGCTACCTGACTCCAATTCTTGGAGCTCTGATCGCA  222

Query  223  GACTCGTGGCTGGGAAAGTTCAAGACCATTGTGTCGCTCTCCATTGTCTACACAATTGGACAAGCAGTCACCTC  296
            ||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||.|||
Sbjct  223  GACTCGTGGCTGGGGAAGTTCAAGACAATTGTTTCACTATCCATCGTCTACACGATTGGACAAGCAGTCATCTC  296

Query  297  AGTAAGCTCCATTAATGACCTCACAGACCACAACCATGATGGCACCCCCGACAGCCTTCCTGTGCACGTGGTGC  370
            .||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||..||||||..||.|||||||||||.||||||||.|..|
Sbjct  297  GGTGAGCTCAATTAATGACCTCACAGACCACGACCACAATGGCAGTCCTGACAGCCTTCCCGTGCACGTAGCAC  370

Query  371  TGTCCTTGATCGGCCTGGCCCTGATAGCTCTCGGGACTGGAGGAATCAAACCCTGTGTGTCTGCGTTTGGTGGA  444
            |||||.||.|.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  TGTCCATGGTTGGCCTGGCCCTGATAGCCCTTGGTACAGGAGGAATCAAGCCCTGTGTGTCTGCGTTTGGTGGC  444

Query  445  GATCAGTTTGAAGAGGGCCAGGAGAAACAAAGAAACAGATTTTTTTCCATCTTTTACTTGGCTATTAATGCTGG  518
            |||||||||||||||||.|||||.|||||..|||||.|.||.||||||||||||||.||||||||.||.|..||
Sbjct  445  GATCAGTTTGAAGAGGGTCAGGAAAAACAGCGAAACCGGTTCTTTTCCATCTTTTATTTGGCTATCAACGGGGG  518

Query  519  AAGTTTGCTTTCCACAATCATCACACCCATGCTCAGAGTTCAACAATGTGGAATTCACAGTAAACAAGCTTGTT  592
            |||..||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||.||||||||||||
Sbjct  519  AAGCCTGCTCTCCACGATCATCACTCCCATACTCAGAGTTCAACAGTGCGGAATCCACAGTCAACAAGCTTGTT  592

Query  593  ACCCACTGGCCTTTGGGGTTCCTGCTGCTCTCATGGCTGTAGCCCTGATTGTGTTTGTCCTTGGCAGTGGGATG  666
            |||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  593  ACCCACTGGCCTTCGGGGTTCCAGCGGCTCTCATGGCTGTTGCCCTAATTGTGTTTGTCCTTGGCAGTGGAATG  666

Query  667  TACAAGAAGTTCAAGCCACAGGGCAACATCATGGGTAAAGTGGCCAAGTGCATCGGTTTTGCCATCAAAAATAG  740
            ||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  667  TACAAGAAGTTCCAGCCCCAGGGCAACATCATGGGCAAAGTGGCCAAGTGCATTGGTTTTGCCATCAAAAACAG  740

Query  741  ATTTAGGCATCGGAGTAAGGCATTTCCCAAGAGGGAGCACTGGCTGGACTGGGCTAAAGAGAAATACGATGAGC  814
            .|||.||||.||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  GTTTCGGCACCGAAGTAAGGCATATCCCAAGAGGGAGCACTGGCTGGACTGGGCTAAAGAGAAATACGACGAGC  814

Query  815  GGCTCATCTCCCAAATTAAGATGGTTACGAGGGTGATGTTCCTGTATATTCCACTCCCAATGTTCTGGGCCTTG  888
            ||||||||||.||.|||||||||||.||||.|||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  815  GGCTCATCTCACAGATTAAGATGGTCACGAAGGTGATGTTCCTGTACATCCCACTCCCCATGTTCTGGGCCTTG  888

Query  889  TTTGACCAGCAGGGCTCCAGGTGGACACTGCAGGCAACAACTATGTCCGGGAAAATCGGAGCTGTTGAAATTCA  962
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||...||||||||.|||||..||||||||||
Sbjct  889  TTTGACCAGCAGGGTTCCAGATGGACACTGCAAGCAACGACCATGAATGGGAAAATTGGAGCAATTGAAATTCA  962

Query  963  GCCCGATCAGATGCAGACCGTGAACGCCATCCTGATCGTGATCATGGTCCCGATCTTCGATGCTGTGCTGTACC  1036
            |||.||.|||||||||||.|||||.||||||.||||.||.|||||||||||.||..|.||.||||||.||||||
Sbjct  963  GCCGGACCAGATGCAGACGGTGAATGCCATCTTGATTGTCATCATGGTCCCCATTGTGGACGCTGTGGTGTACC  1036

Query 1037  CTCTCATTGCAAAATGTGGCTTCAATTTCACCTCCTTGAAGAAGATGGCAGTTGGCATGGTCCTGGCCTCCATG  1110
            |.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|||||||||||.|.|||||.|||.|||||||.||||||
Sbjct 1037  CGCTCATTGCAAAATGTGGTTTCAACTTCACATCCCTGAAGAAGATGACTGTTGGGATGTTCCTGGCGTCCATG  1110

Query 1111  GCCTTTGTGGTGGCTGCCATCGTGCAGGTGGAAATCGATAAAACTCTTCCAGTCTTCCCCAAAGGAAACGAAGT  1184
            |||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||....|||||..||||
Sbjct 1111  GCCTTTGTGGTGGCTGCAATTGTGCAGGTGGAAATCGATAAAACTCTTCCAGTCTTCCCTGGTGGAAATCAAGT  1184

Query 1185  CCAAATTAAAGTTTTGAATATAGGAAACAATACCATGAATATATCTCTTCCTGGAGAGATGGTGACACTTGGCC  1258
            |||||||||.||.|||||.||.||||||||||.|||||...|...|.||||||||.|.|..|||||.||||.||
Sbjct 1185  CCAAATTAAGGTCTTGAACATCGGAAACAATAACATGACCGTGCATTTTCCTGGAAATAGTGTGACGCTTGCCC  1258

Query 1259  CAATGTCTCAAACAAATGCATTTATGACTTTTGATGTAAACAAACTGACAAGGATAAACATTTCTTCTCCTGGA  1332
            .|||||||||.|||.|..|.||.||||||||.|||.||.||||.||||||||.||||||||.|||||..|||||
Sbjct 1259  AAATGTCTCAGACAGACACGTTCATGACTTTCGATATAGACAAGCTGACAAGCATAAACATATCTTCCTCTGGA  1332

Query 1333  TCACC---AGTCACTGCCGTAACTGACGACTTCAAGCAGGGCCAACGCCACACGCTTCTAGTGTGGGCCCCCAA  1403
            ||.||   ||||||..|.|||.||.|.||.||..|||||||.||.||.|||||.||||||||||||..|||||.
Sbjct 1333  TCCCCAGGAGTCACCACAGTAGCTCATGATTTTGAGCAGGGTCACCGGCACACCCTTCTAGTGTGGAACCCCAG  1406

Query 1404  TCACTACCAGGTGGTAAAGGATGGTCTTAACCAGAAGCCAGAAAAAGGGGAAAATGGAATCAGATTTGTAAATA  1477
            |||.||||..||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|
Sbjct 1407  TCAATACCGTGTGGTAAAAGATGGTCTTAACCAAAAGCCAGAGAAAGGGGAGAACGGAATCAGGTTTGTCAACA  1480

Query 1478  CTTTTAACGAGCTCATCACCATCACAATGAGTGGGAAAGTTTATGCAAACATCAGCAGCTACAATGCCAGCACA  1551
            |..||||||||.|..|||||||||.|||||||||||||||.||||.|||..|||.|||..||||.||||||...
Sbjct 1481  CCCTTAACGAGATGGTCACCATCAAAATGAGTGGGAAAGTATATGAAAATGTCACCAGTCACAACGCCAGCGGC  1554

Query 1552  TACCAGTTTTTTCCTTCTGGCATAAAAGGC--TTCACAATAAGCTCAACAGAGATTCCGCCACAATGTCAACCT  1623
            ||||||||.||.|||||||||  .|||.||  |.||||||||.|.|.||.|.|.|..|.|||...||||.|.||
Sbjct 1555  TACCAGTTCTTCCCTTCTGGC--GAAAAGCAGTACACAATAAACACCACGGCGGTGGCACCAACCTGTCTAACT  1626

Query 1624  AATTTCAATACTTTCTACCTTGAATTTGGTAGTGCTTATACCTATATAGTCCAAAGGAAGAATGACAGCTGCCC  1697
            .||||.||..|||.|.|||||||.|||||.||.||.||||||||..|..|||.||||..||.|||..||||||.
Sbjct 1627  GATTTTAAATCTTCCAACCTTGACTTTGGCAGCGCGTATACCTACGTGATCCGAAGGGCGAGTGATGGCTGCCT  1700

Query 1698  TGAAGTGAAGGTGTTTGAAGATATTTCAGCCAACACAGTTAACATGGCTCTGCAAATCCCGCAGTATTTTCTTC  1771
            .||||||||||..||||||||.||..||.|||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||
Sbjct 1701  GGAAGTGAAGGAATTTGAAGACATCCCACCCAACACTGTGAACATGGCTCTGCAGATCCCACAGTACTTCCTTC  1774

Query 1772  TCACCTGTGGCGAAGTGGTCTTCTCTGTCACGGGATTGGAATTCTCATATTCTCAGGCTCCTTCCAACATGAAG  1845
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1775  TCACCTGCGGCGAGGTGGTCTTCTCTGTCACAGGACTGGAGTTCTCTTATTCCCAGGCTCCGTCTAACATGAAG  1848

Query 1846  TCGGTGCTTCAGGCAGGATGGCTGCTGACCGTGGCTGTTGGCAACATCATTGTGCTCATCGTGGCAGGGGCAGG  1919
            ||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1849  TCCGTGCTTCAGGCAGGCTGGCTTCTAACTGTGGCGGTCGGCAATATCATTGTGCTCATCGTGGCAGGGGCGGG  1922

Query 1920  CCAGTTCAGCAAACAGTGGGCCGAGTACATTCTATTTGCCGCGTTGCTTCTGGTCGTCTGTGTAATTTTTGCCA  1993
            .||.|||..||||||||||||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||.|||||.||.||.||.||||
Sbjct 1923  GCACTTCCCCAAACAGTGGGCTGAGTACATTCTGTTTGCCTCATTGCTTCTGGTTGTCTGCGTGATATTCGCCA  1996

Query 1994  TCATGGCTCGGTTCTATACTTACATCAACCCAGCGGAGATCGAAGCTCAATTTGATGAGGATGAAAAGAAAAA-  2066
            ||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||| 
Sbjct 1997  TCATGGCTCGATTCTACACCTACATCAACCCAGCAGAGATTGAAGCACAGTTTGATGAGGATGAGAAGAAAAAG  2070

Query 2067  --CAGACTGGAAAAGAGTAACCCATAT--TTCATGTCAGGGGCCAAT-TCACAGAAACAGATG  2124
              ||.|  |||||.|| .|||||.|||  |||||   .||..|||.| |||||||.|.|.|||
Sbjct 2071  GGCATA--GGAAAGGA-AAACCCGTATTCTTCAT---TGGAACCAGTCTCACAGACAAATATG  2127