Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06992
• Subject: XM_006499063.3
• Aligned Length: 1663
• Identities: 1452
• Gaps: 62

Alignment

Query    1  ATGGGTAGCAACAAGAGCAAGCCCAAGGATGCCAGCCAGCGGCGCCGCAGCCTGGAGCCCGCCGAGAACGTGCA  74
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||
Sbjct    1  ATGGGCAGCAACAAGAGCAAGCCCAAGGACGCCAGCCAGCGGCGCCGCAGCCTGGAGCCCTCGGAAAACGTGCA  74

Query   75  CGGCGCTGGC-GGGGGCGCTTTCCCCGCCTCGCAGACCCCCAGCAAGCCAGCCTCGGCCGACGGCCACCGCGGC  147
            |||    ||| ||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct   75  CGG----GGCAGGGGGCGCCTTCCCGGCCTCACAGACACCGAGCAAGCCCGCCTCCGCCGACGGCCACCGCGGG  144

Query  148  CCCAGCGCGGCCTTCG---CCCCCGCGGCCGCCGAGCCCAAGCTGTTCGGAGGCTTCAACTCCTCGGACACCGT  218
            ||||||||.|||||||   |.||||||   ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  145  CCCAGCGCCGCCTTCGTGCCGCCCGCG---GCCGAGCCCAAGCTCTTCGGAGGCTTCAACTCCTCGGACACCGT  215

Query  219  CACCTCCCCGCAGAGGGCGGGCCCGCTGGCCGGTGGAGTGACCACCTTTGTGGCCCTCTATGACTATGAGTCTA  292
            |||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct  216  CACCTCCCCGCAGAGGGCGGGGCCTCTGGCAGGTGGGGTGACCACCTTTGTGGCCCTCTATGACTATGAGTCAC  289

Query  293  GGACGGAGACAGACCTGTCCTTCAAGAAAGGCGAGCGGCTCCAGATTGTCAACAACAC----------------  350
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||                
Sbjct  290  GGACAGAGACTGACCTGTCCTTCAAGAAAGGGGAGCGGCTGCAGATTGTCAATAACACGAGGAAGGTGGATGTC  363

Query  351  -----------------------------------AGAGGGAGACTGGTGGCTGGCCCACTCGCTCAGCACAGG  389
                                               |||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct  364  AGCCAGACCTGGTTCACATTCAGATGGCTGCAAAGAGAGGGAGACTGGTGGCTGGCACACTCGCTGAGCACGGG  437

Query  390  ACAGACAGGCTACATCCCCAGCAACTACGTGGCGCCCTCCGACTCCATCCAGGCTGAGGAGTGGTATTTTGGCA  463
            ||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  438  ACAGACCGGTTACATCCCCAGCAACTATGTGGCGCCCTCCGACTCCATCCAGGCTGAGGAGTGGTACTTTGGCA  511

Query  464  AGATCACCAGACGGGAGTCAGAGCGGTTACTGCTCAATGCAGAGAACCCGAGAGGGACCTTCCTCGTGCGAGAA  537
            |||||||.||||||||.|||||||||.|.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||.
Sbjct  512  AGATCACTAGACGGGAATCAGAGCGGCTGCTGCTCAACGCCGAGAACCCGAGAGGGACCTTCCTCGTGAGGGAG  585

Query  538  AGTGAGACCACGAAAGGTGCCTACTGCCTCTCAGTGTCTGACTTCGACAACGCCAAGGGCCTCAACGTGAAGCA  611
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||
Sbjct  586  AGTGAGACCACAAAAGGTGCCTACTGCCTCTCTGTATCCGACTTCGACAATGCCAAGGGCCTAAATGTGAAACA  659

Query  612  CTACAAGATCCGCAAGCTGGACAGCGGCGGCTTCTACATCACCTCCCGCACCCAGTTCAACAGCCTGCAGCAGC  685
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660  CTACAAGATCCGCAAGCTGGACAGCGGCGGTTTCTACATCACCTCCCGCACCCAGTTCAACAGCCTGCAGCAGC  733

Query  686  TGGTGGCCTACTACTCCAAACACGCCGATGGCCTGTGCCACCGCCTCACCACCGTGTGCCCCACGTCCAAGCCG  759
            |.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.
Sbjct  734  TCGTGGCTTACTACTCCAAACATGCTGATGGCCTGTGTCACCGCCTCACTACCGTATGTCCCACATCCAAGCCT  807

Query  760  CAGACTCAGGGCCTGGCCAAGGATGCCTGGGAGATCCCTCGGGAGTCGCTGCGGCTGGAGGTCAAGCTGGGCCA  833
            |||||.|||||..|||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  808  CAGACCCAGGGATTGGCCAAGGATGCGTGGGAGATCCCCCGGGAGTCCCTGCGGCTGGAGGTCAAGCTGGGCCA  881

Query  834  GGGCTGCTTTGGCGAGGTGTGGATGGGGACCTGGAACGGTACCACCAGGGTGGCCATCAAAACCCTGAAGCCTG  907
            |||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct  882  GGGTTGCTTCGGAGAGGTGTGGATGGGGACCTGGAACGGCACCACGAGGGTTGCCATCAAAACTCTGAAGCCAG  955

Query  908  GCACGATGTCTCCAGAGGCCTTCCTGCAGGAGGCCCAGGTCATGAAGAAGCTGAGGCATGAGAAGCTGGTGCAG  981
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  956  GCACCATGTCCCCAGAGGCCTTCCTGCAGGAGGCCCAAGTCATGAAGAAACTGAGGCACGAGAAACTGGTGCAG  1029

Query  982  TTGTATGCTGTGGTTTCAGAGGAGCCCATTTACATCGTCACGGAGTACATGAGCAAGGGGAGTTTGCTGGACTT  1055
            .|||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 1030  CTGTATGCTGTGGTGTCGGAAGAACCCATTTACATTGTGACAGAGTACATGAACAAGGGGAGTCTGCTGGACTT  1103

Query 1056  TCTCAAGGGGGAGACAGGCAAGTACCTGCGGCTGCCTCAGCTGGTGGACATGGCTGCTCAGATCGCCTCAGGCA  1129
            ||||||||||||.||.|||||.||..|||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||
Sbjct 1104  TCTCAAGGGGGAAACGGGCAAATATTTGCGGCTACCCCAGCTGGTGGACATGTCTGCTCAGATCGCTTCAGGCA  1177

Query 1130  TGGCGTACGTGGAGCGGATGAACTACGTCCACCGGGACCTTCGTGCAGCCAACATCCTGGTGGGAGAGAACCTG  1203
            ||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||||||
Sbjct 1178  TGGCCTATGTGGAGCGGATGAACTATGTGCACCGGGACCTTCGAGCCGCCAATATCCTAGTAGGGGAGAACCTG  1251

Query 1204  GTGTGCAAAGTGGCCGACTTTGGGCTGGCTCGGCTCATTGAAGACAATGAGTACACGGCGCGGCAAGGTGCCAA  1277
            ||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1252  GTGTGCAAAGTGGCCGACTTTGGGTTGGCCCGGCTCATAGAAGACAACGAATACACAGCCCGGCAAGGTGCCAA  1325

Query 1278  ATTCCCCATCAAGTGGACGGCTCCAGAAGCTGCCCTCTATGGCCGCTTCACCATCAAGTCGGACGTGTGGTCCT  1351
            ||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.|||.|.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1326  ATTCCCCATCAAGTGGACCGCCCCTGAAGCTGCTCTGTACGGCAGGTTCACCATCAAGTCGGATGTGTGGTCCT  1399

Query 1352  TCGGGATCCTGCTGACTGAGCTCACCACAAAGGGACGGGTGCCCTACCCTGGGATGGTGAACCGCGAGGTGCTG  1425
            |.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1400  TTGGGATTCTGCTGACCGAGCTCACCACTAAGGGAAGAGTGCCCTATCCTGGGATGGTGAACCGTGAGGTTCTG  1473

Query 1426  GACCAGGTGGAGCGGGGCTACCGGATGCCCTGCCCGCCGGAGTGTCCCGAGTCCCTGCACGACCTCATGTGCCA  1499
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1474  GACCAGGTGGAGCGGGGCTACCGGATGCCTTGTCCCCCCGAGTGCCCCGAGTCCCTGCATGACCTTATGTGCCA  1547

Query 1500  GTGCTGGCGGAAGGAGCCTGAGGAGCGGCCCACCTTCGAGTACCTGCAGGCCTTCCTGGAGGACTACTTCACGT  1573
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1548  GTGCTGGCGGAAGGAGCCCGAGGAGCGGCCCACCTTCGAGTACCTGCAGGCCTTCCTGGAAGACTACTTTACGT  1621

Query 1574  CCACCGAGCCCCAGTACCAGCCCGGGGAGAACCTC  1608
            ||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1622  CCACTGAGCCACAGTACCAGCCCGGGGAGAACCTA  1656