Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07000
• Subject: NM_001042370.2
• Aligned Length: 1617
• Identities: 1592
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ATGGAGGAATCTGTGAACCAAATGCAGCCACTGAATGAGAAGCAGATAGCCAATTCTCAGGATGGATATGTATG  74
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGAATCTGTAAACCAAATGCAGCCACTGAATGAGAAGCAGATAGCCAATTCTCAGGATGGATATGTATG  74

Query   75  GCAAGTCACTGACATGAATCGACTACACCGGTTCTTATGTTTCGGTTCTGAAGGTGGGACTTATTATATCAAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAAGTCACTGACATGAATCGACTACACCGGTTCTTATGTTTCGGTTCTGAAGGTGGGACTTATTATATCAAAG  148

Query  149  AACAGAAGTTGGGCCTTGAAAATGCTGAAGCTTTAATTAGATTGATTGAAGATGGCAGAGGATGTGAAGTGATA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AACAGAAGTTGGGCCTTGAAAATGCTGAAGCTTTAATTAGATTGATTGAAGATGGCAGAGGATGTGAAGTGATA  222

Query  223  CAAGAAATAAAGTCATTTAGTCAAGAAGGCAGAACCACAAAGCAAGAGCCTATGCTCTTTGCACTTGCCATTTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAAGAAATAAAGTCATTTAGTCAAGAAGGCAGAACCACAAAGCAAGAGCCTATGCTCTTTGCACTTGCCATTTG  296

Query  297  TTCCCAGTGCTCCGACATAAGCACAAAACAAGCAGCATTTAAAGCTGTTTCTGAAGTTTGTCGCATTCCTACCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTCCCAGTGCTCCGACATAAGCACAAAACAAGCAGCATTTAAAGCTGTTTCTGAAGTTTGTCGCATTCCTACCC  370

Query  371  ATCTCTTTACTTTTATCCAGTTTAAGAAAGATCTGAAGGAAAGCATGAAATGTGGCATGTGGGGTCGTGCCCTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATCTCTTTACTTTTATCCAGTTTAAGAAAGATCTGAAGGAAAGCATGAAATGTGGCATGTGGGGTCGTGCCCTC  444

Query  445  CGGAAGGCTATAGCGGACTGGTACAATGAGAAAGGTGGCATGGCCCTTGCTCTGGCAGTTACAAAATATAAACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGGAAGGCTATAGCGGACTGGTACAATGAGAAAGGTGGCATGGCCCTTGCTCTGGCAGTTACAAAATATAAACA  518

Query  519  GAGAAATGGCTGGTCTCACAAAGATCTATTAAGATTGTCACATCTTAAACCTTCCAGTGAAGGACTTGCAATTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAGAAATGGCTGGTCTCACAAAGATCTATTAAGATTGTCACATCTTAAACCTTCCAGTGAAGGACTTGCAATTG  592

Query  593  TGACCAAATATATTACAAAGGGCTGGAAAGAAGTTCATGAATTGTATAAAGAAAAAGCACTCTCTGTGGAGACT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGACCAAATATATTACAAAGGGCTGGAAAGAAGTTCATGAATTGTATAAAGAAAAAGCACTCTCTGTGGAGACT  666

Query  667  GAAAAATTATTAAAGTATCTGGAGGCTGTAGAGAAAGTGAAGCGCACAAGAGATGAGCTAGAAGTCATTCATCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAAAAATTATTAAAGTATCTGGAGGCTGTAGAGAAAGTGAAGCGCACAAGAGATGAGCTAGAAGTCATTCATCT  740

Query  741  AATAGAAGAACATAGATTAGTTAGAGAACATCTTTTAACAAATCACTTAAAGTCTAAAGAGGTATGGAAGGCTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AATAGAAGAACATAGATTAGTTAGAGAACATCTTTTAACAAATCACTTAAAGTCTAAAGAGGTATGGAAGGCTT  814

Query  815  TGTTACAAGAAATGCCGCTTACTGCATTACTAAGGAATCTAGGAAAGATGACTGCTAATTCAGTACTTGAACCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGTTACAAGAAATGCCGCTTACTGCATTACTAAGGAATCTAGGAAAGATGACTGCTAATTCAGTACTTGAACCA  888

Query  889  GGAAATTCAGAAGTATCTTTAGTATGTGAAAAACTGTGTAATGAAAAACTATTAAAAAAGGCTCGTATACATCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGAAATTCAGAAGTATCTTTAGTATGTGAAAAACTGTGTAATGAAAAACTATTAAAAAAGGCTCGTATACATCC  962

Query  963  ATTTCATATTTTGATCGCATTAGAAACTTACAAGACAGGTCATGGTCTCAGAGGGAAACTGAAGTGGCGCCCTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATTTCATATTTTGATCGCATTAGAAACTTACAAGACAGGTCATGGTCTCAGAGGGAAACTGAAGTGGCGCCCTG  1036

Query 1037  ATGAAGAAATTTTGAAAGCATTGGATGCTGCTTTTTATAAAACATTTAAGACAGTTGAACCAACTGGAAAACGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGAAGAAATTTTGAAAGCATTGGATGCTGCTTTTTATAAAACATTTAAGACAGTTGAACCAACTGGAAAACGT  1110

Query 1111  TTCTTACTAGCTGTTGATGTCAGTGCTTCTATGAACCAAAGAGTTTTGGGTAGTATACTCAACGCTAGTACAGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCTTACTAGCTGTTGATGTCAGTGCTTCTATGAACCAAAGAGTTTTGGGTAGTATACTCAACGCTAGTACAGT  1184

Query 1185  TGCTGCAGCAATGTGCATGGTTGTCACACGAACAGAAAAAGATTCTTATGTAGTTGCTTTTTCCGATGAAATGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCTGCAGCAATGTGCATGGTTGTCACACGAACAGAAAAAGATTCTTATGTAGTTGCTTTTTCCGATGAAATGG  1258

Query 1259  TACCATGTCCAGTGACTACAGATATGACCTTACAACAGGTTTTAATGGCTATGAGTCAGATCCCAGCAGGTGGA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TACCATGTCCAGTGACTACAGATATGACCTTACAACAGGTTTTAATGGCTATGAGTCAGATCCCAGCAGGTGGA  1332

Query 1333  ACTGATTGCTCTCTTCCAATGATCTGGGCTCAGAAGACAAACACACCTGCTGATGTCTTCATTGTATTCACTGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACTGATTGCTCTCTTCCAATGATCTGGGCTCAGAAGACAAACACACCTGCTGATGTCTTCATTGTATTCACTGA  1406

Query 1407  TAATGAGACCTTTGCTGGAGGTGTCCATCCTGCTATTGCTCTGAGGGAGTATCGAAAGAAAATGGATATTCCAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TAATGAGACCTTTGCTGGAGGTGTCCATCCTGCTATTGCTCTGAGGGAGTATCGAAAGAAAATGGATATTCCAG  1480

Query 1481  CTAAATTGATTGTTTGTGGAATGACATCAAATGGTTTCACCATTGCAGACCCAGATGATAGAGGCATGTTGGAT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTAAATTGATTGTTTGTGGAATGACATCAAATGGTTTCACCATTGCAGACCCAGATGATAGAGGCATGTTGGAT  1554

Query 1555  ATGTGCGGCTTTGATACTGGAGCTCTGGATGTAATTCGAAATTTC---ACATTAGATATGATT  1614
            |||||||||||||||||||||||||||||  |..||..|||.|.|   ||             
Sbjct 1555  ATGTGCGGCTTTGATACTGGAGCTCTGGA--TCCTTGCAAAATACCCTAC-------------  1602