Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07000
• Subject: NM_013835.2
• Aligned Length: 1618
• Identities: 1381
• Gaps: 8

Alignment

Query    1  ATGGAGGAATCTGTGAACCAAATGCAGCCACTGAATGAGAAGCAGATAGCCAATTCTCAGGATGGATATGTATG  74
            |||||.|.|||||..|||||..||||||||||||.|||||..||..|||..||.||..|||..||.|.||||||
Sbjct    1  ATGGAAGGATCTGCAAACCAGTTGCAGCCACTGAGTGAGACTCAAGTAGTTAACTCAGAGGGCGGCTGTGTATG  74

Query   75  GCAAGTCACTGACATGAATCGACTACACCGGTTCTTATGTTTCGGTTCTGAAGGTGGGACTTATTATATCAAAG  148
            |||.|||||.||||||||.||.||.|.|||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct   75  GCAGGTCACCGACATGAACCGGCTGCGCCGCTTCTTGTGTTTTGGCTCTGAAGGTGGCACGTACTATATCAAAG  148

Query  149  AACAGAAGTTGGGCCTTGAAAATGCTGAAGCTTTAATTAGATTGATTGAAGATGGCAGAGGATGTGAAGTGATA  222
            ||||||||.||||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  AACAGAAGCTGGGCCTTGAGAATGCTGAAGCCTTAATTAGACTGATTGAAGACGGCAGAGGATGTGAAGTGATC  222

Query  223  CAAGAAATAAAGTCATTTAGTCAAGAAGGCAGAACCACAAAGCAAGAGCCTATGCTCTTTGCACTTGCCATTTG  296
            ||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||..|.||.||||||||..||||.||||||||.|||.||||
Sbjct  223  CAGGAAATCAAGTCCTTTAGTCAGGAAGGCAGGACTGCCAAACAAGAGCCACTGCTGTTTGCACTGGCCGTTTG  296

Query  297  TTCCCAGTGCTCCGACATAAGCACAAAACAAGCAGCATTTAAAGCTGTTTCTGAAGTTTGTCGCATTCCTACCC  370
            |||||||||..|.|||||||.||||||.||||||||.|||||||||||..|||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  297  TTCCCAGTGTGCGGACATAAACACAAAGCAAGCAGCCTTTAAAGCTGTCCCTGAAGTGTGTCGCATTCCGACCC  370

Query  371  ATCTCTTTACTTTTATCCAGTTTAAGAAAGATCTGAAGGAAAGCATGAAATGTGGCATGTGGGGTCGTGCCCTC  444
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  ACCTCTTCACTTTTATCCAGTTTAAGAAAGACCTGAAGGAGAGCATGAAGTGTGGCATGTGGGGTCGCGCCCTC  444

Query  445  CGGAAGGCTATAGCGGACTGGTACAATGAGAAAGGTGGCATGGCCCTTGCTCTGGCAGTTACAAAATATAAACA  518
            ||||||||..|.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||.|.||.||||..||||||||.||||||||
Sbjct  445  CGGAAGGCAGTGGCAGACTGGTACAATGAAAAAGGCGGCATGGCCGTGGCGCTGGTGGTTACAAAGTATAAACA  518

Query  519  GAGAAATGGCTGGTCTCACAAAGATCTATTAAGATTGTCACATCTTAAACCTTCCAGTGAAGGACTTGCAATTG  592
            ..||||.||||||||||||||||||||..|..||.||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  ACGAAACGGCTGGTCTCACAAAGATCTCCTCCGACTGTCCCACCTTAAGCCTTCCAGTGAAGGACTTGCTATTG  592

Query  593  TGACCAAATATATTACAAAGGGCTGGAAAGAAGTTCATGAATTGTATAAAGAAAAAGCACTCTCTGTGGAGACT  666
            |||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||..||||||||||||.||.||.|||||||||.||
Sbjct  593  TGACCAAGTATATCACAAAGGGCTGGAAAGAAGTCCATGAAGAGTATAAAGAAAAGGCGCTTTCTGTGGAGGCT  666

Query  667  GAAAAATTATTAAAGTATCTGGAGGCTGTAGAGAAAGTGAAGCGCACAAGAGATGAGCTAGAAGTCATTCATCT  740
            ||.||..|..|.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|.|||.||.||.||||||||||||||
Sbjct  667  GAGAAGCTGCTCAAGTACCTGGAGGCTGTGGAGAAAGTGAAGCGCACGAAAGACGACCTGGAAGTCATTCATCT  740

Query  741  AATAGAAGAACAT-AGATTAGTTAGAGAACATCTTTTAACAAATCACTTAAAGTCTAAAGAGGTATGGAAGGCT  813
            .||.|||||.||| || ||||||||.|||||.||..|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GATTGAAGAGCATCAG-TTAGTTAGGGAACACCTGCTGACAAATCACTTGAAGTCTAAAGAGGTATGGAAGGCT  813

Query  814  TTGTTACAAGAAATGCCGCTTACTGCATTACTAAGGAATCTAGGAAAGATGACTGCTAATTCAGTACTTGAACC  887
            ||||||||.||||||||.||||||||..|.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  814  TTGTTACAGGAAATGCCCCTTACTGCGCTCCTGAGGAACCTGGGAAAGATGACTGCTAATTCAGTGCTTGAACC  887

Query  888  AGGAAATTCAGAAGTATCTTTAGTATGTGAAAAACTGTGTAATGAAAAACTATTAAAAAAGGCTCGTATACATC  961
            ||||||.||.||||||||||||.||||||||||||||.|.||||||||.||..|.|||||||||||||||||||
Sbjct  888  AGGAAACTCTGAAGTATCTTTAATATGTGAAAAACTGAGCAATGAAAAGCTGCTCAAAAAGGCTCGTATACATC  961

Query  962  CATTTCATATTTTGATCGCATTAGAAACTTACAAGA-CAGGTCATGGTCTCAGAGGGAAACTGAAGTGGCGCCC  1034
            ||||||||.||||.||.||||||||.||.||| ||| ||||.||.||.|||||||||||||||||||||...||
Sbjct  962  CATTTCATGTTTTAATTGCATTAGAGACCTAC-AGAGCAGGCCACGGGCTCAGAGGGAAACTGAAGTGGATTCC  1034

Query 1035  TGATGAAGAAATTTTGAAAGCATTGGATGCTGCTTTTTATAAAACATTTAAGACAGTTGAACCAACTGGAAAAC  1108
            .|||.||||.||.|||.||||.||.||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct 1035  AGATAAAGACATCTTGCAAGCCTTAGATGCTGCTTTTTATACAACATTTAAGACTGTTGAACCAACTGGGAAGC  1108

Query 1109  GTTTCTTACTAGCTGTTGATGTCAGTGCTTCTATGAACCAAAGAGTTTTGGGTAGTATACTCAACGCTAGTACA  1182
            |.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||..|||||||||.|||||||.||||||||.
Sbjct 1109  GCTTCTTGCTCGCTGTTGACGTCAGTGCCTCTATGAACCAGAGAGCCTTGGGTAGTGTACTCAATGCTAGTACT  1182

Query 1183  GTTGCTGCAGCAATGTGCATGGTTGTCACACGAACAGAAAAAGATTCTTATGTAGTTGCTTTTTCCGATGAAAT  1256
            |||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||..||.|||||||||.||..|||.||
Sbjct 1183  GTTGCCGCAGCAATGTGCATGGTGGTTACACGGACAGAAAAAGAGTCTTCGGTGGTTGCTTTTGCCTGTGATAT  1256

Query 1257  GGTACCATGTCCAGTGACTACAGATATGACCTTACAACAGGTTTTAATGGCTATGAGTCAGATCCCAGCAGGTG  1330
            |||.||.|.|||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||.||||||||.|.|..|.||||||||..
Sbjct 1257  GGTTCCGTTTCCAGTGACTACAGACATGACATTACAGCAGGTTTTAACGGCTATGAATAAAGTTCCAGCAGGCA  1330

Query 1331  GAACTGATTGCTCTCTTCCAATGATCTGGGCTCAGAAGACAAACACACCTGCTGATGTCTTCATTGTATTCACT  1404
            ..||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.|||||.|.||.|||||||||.||||.||.|||
Sbjct 1331  ACACGGATTGCTCTCTCCCAATGATCTGGGCCCAGAAAACAGACACAGCCGCAGATGTCTTCGTTGTGTTTACT  1404

Query 1405  GATAATGAGACCTTTGCTGG--AGGTGTCCATCCTGCTATTGCTCTGAGGGAGTATCGAAAGAAAATGGATATT  1476
            |||||||||||||||||.||  |||||  |||||||||.||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1405  GATAATGAGACCTTTGCAGGGCAGGTG--CATCCTGCTGTTGCCCTGAGAGAGTACCGAAAGAAAATGGATATT  1476

Query 1477  CCAGCTAAATTGATTGTTTGTGGAATGACATCAAATGGTTTCACCATTGCAGACCCAGATGATAGAGGCATGTT  1550
            ||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1477  CCTGCTAAATTGATTGTTTGTGGGATGACATCAAATGGCTTTACCATTGCAGACCCAGACGATAGAGGCATGTT  1550

Query 1551  GGATATGTGCGGCTTTGATACTGGAGCTCTGGATGTAATTCGAAATTTCACATTAGATATGATT  1614
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.|||
Sbjct 1551  GGATATGTGCGGCTTTGATACTGCAGCTCTGGATGTAATTCGGAATTTCACATTGGATGTCATT  1614