Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07018
• Subject: NM_001130824.2
• Aligned Length: 3261
• Identities: 3259
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCGGACAGCGAGGACAGCAACTTTTCCGAGGAGGAGGACAGCGAGCGCAGCAGTGACGGCGAGGAGGCCGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGGACAGCGAGGACAGCAACTTTTCCGAGGAGGAGGACAGCGAGCGCAGCAGTGACGGCGAGGAGGCCGA  74

Query   75  GGTAGACGAAGAGCGGCGGAGTGCAGCGGGCAGTGAGAAAGAAGAAGAGCCTGAGGACGAAGAGGAGGAGGAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGTAGACGAAGAGCGGCGGAGTGCAGCGGGCAGTGAGAAAGAAGAAGAGCCTGAGGACGAAGAGGAGGAGGAAG  148

Query  149  AGGAGGAGGAATATGATGAGGAAGAGGAAGAAGAAGATGATGACCGACCCCCCAAGAAACCCCGCCATGGAGGC  222
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGAGGAGGAATACGATGAGGAAGAGGAGGAAGAAGATGATGACCGACCCCCCAAGAAACCCCGCCATGGAGGC  222

Query  223  TTCATTCTGGACGAGGCTGATGTTGACGATGAGTATGAGGACGAGGACCAGTGGGAGGATGGAGCAGAGGACAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCATTCTGGACGAGGCTGATGTTGACGATGAGTATGAGGACGAGGACCAGTGGGAGGATGGAGCAGAGGACAT  296

Query  297  TCTAGAGAAAGAAGAGATTGAAGCCTCCAATATCGATAATGTTGTCCTGGATGAAGATCGTTCTGGGGCTCGCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCTAGAGAAAGAAGAGATTGAAGCCTCCAATATCGATAATGTTGTCCTGGATGAAGATCGTTCTGGGGCTCGCC  370

Query  371  GCCTGCAAAACCTCTGGAGGGACCAGCGAGAAGAAGAACTGGGCGAGTATTACATGAAGAAATACGCCAAGTCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCTGCAAAACCTCTGGAGGGACCAGCGAGAAGAAGAACTGGGCGAGTATTACATGAAGAAATACGCCAAGTCA  444

Query  445  TCTGTGGGAGAGACGGTGTATGGAGGATCTGATGAGCTCTCAGACGACATCACCCAGCAGCAGCTGCTCCCAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCTGTGGGAGAGACGGTGTATGGAGGATCTGATGAGCTCTCAGACGACATCACCCAGCAGCAGCTGCTCCCAGG  518

Query  519  AGTCAAGGATCCCAATCTGTGGACTGTCAAATGTAAGATTGGGGAGGAACGGGCCACGGCCATTTCCTTGATGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGTCAAGGATCCCAATCTGTGGACTGTCAAATGTAAGATTGGGGAGGAACGGGCCACGGCCATTTCCTTGATGC  592

Query  593  GCAAGTTCATTGCCTACCAGTTCACAGACACGCCCCTGCAGATCAAGTCAGTAGTGGCACCAGAGCATGTGAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCAAGTTCATTGCCTACCAGTTCACAGACACGCCCCTGCAGATCAAGTCAGTAGTGGCACCAGAGCATGTGAAG  666

Query  667  GGCTACATCTACGTGGAGGCCTACAAGCAGACCCACGTGAAGCAGGCCATTGAGGGGGTGGGCAACCTGCGGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCTACATCTACGTGGAGGCCTACAAGCAGACCCACGTGAAGCAGGCCATTGAGGGGGTGGGCAACCTGCGGCT  740

Query  741  TGGCTACTGGAACCAGCAGATGGTGCCCATCAAGGAGATGACAGACGTGCTCAAAGTGGTGAAGGAGGTGGCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGCTACTGGAACCAGCAGATGGTGCCCATCAAGGAGATGACAGACGTGCTCAAAGTGGTGAAGGAGGTGGCCA  814

Query  815  ACCTGAAACCAAAGTCCTGGGTCCGCCTCAAGCGGGGCATCTACAAGGATGACATTGCTCAGGTGGACTACGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCTGAAACCAAAGTCCTGGGTCCGCCTCAAGCGGGGCATCTACAAGGATGACATTGCTCAGGTGGACTACGTG  888

Query  889  GAGCCCAGCCAGAACACCATCTCCCTGAAGATGATCCCACGCATCGACTACGATCGCATCAAGGCCCGCATGAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGCCCAGCCAGAACACCATCTCCCTGAAGATGATCCCACGCATCGACTACGATCGCATCAAGGCCCGCATGAG  962

Query  963  CTTGAAAGACTGGTTTGCCAAAAGGAAGAAGTTTAAGCGGCCTCCACAGAGGCTGTTTGATGCTGAGAAGATCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTGAAAGACTGGTTTGCCAAAAGGAAGAAGTTTAAGCGGCCTCCACAGAGGCTGTTTGATGCTGAGAAGATCA  1036

Query 1037  GGTCCCTGGGGGGTGATGTTGCCTCTGATGGTGACTTCCTCATCTTTGAGGGGAACCGTTACAGCCGGAAGGGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGTCCCTGGGGGGTGATGTTGCCTCTGATGGTGACTTCCTCATCTTTGAGGGGAACCGTTACAGCCGGAAGGGC  1110

Query 1111  TTTCTGTTCAAGAGCTTCGCCATGTCTGCTGTGATCACGGAGGGTGTGAAGCCAACACTCTCTGAGCTGGAAAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTTCTGTTCAAGAGCTTCGCCATGTCTGCTGTGATCACGGAGGGTGTGAAGCCAACACTCTCTGAGCTGGAAAA  1184

Query 1185  GTTTGAGGACCAGCCAGAGGGCATTGACCTGGAGGTGGTGACTGAGAGCACAGGGAAGGAGCGGGAGCACAACT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTTTGAGGACCAGCCAGAGGGCATTGACCTGGAGGTGGTGACTGAGAGCACAGGGAAGGAGCGGGAGCACAACT  1258

Query 1259  TCCAACCTGGGGACAACGTGGAGGTCTGTGAGGGTGAGCTCATCAACCTGCAGGGCAAGATCCTCAGCGTGGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCCAACCTGGGGACAACGTGGAGGTCTGTGAGGGTGAGCTCATCAACCTGCAGGGCAAGATCCTCAGCGTGGAT  1332

Query 1333  GGCAACAAGATCACCATCATGCCCAAGCATGAGGACCTCAAGGACATGTTGGAGTTCCCAGCCCAGGAACTTAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGCAACAAGATCACCATCATGCCCAAGCATGAGGACCTCAAGGACATGTTGGAGTTCCCAGCCCAGGAACTTAG  1406

Query 1407  AAAATACTTCAAGATGGGGGACCACGTGAAGGTGATTGCTGGCCGATTCGAGGGCGACACAGGCCTCATTGTGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AAAATACTTCAAGATGGGGGACCACGTGAAGGTGATTGCTGGCCGATTCGAGGGCGACACAGGCCTCATTGTGC  1480

Query 1481  GGGTGGAGGAGAATTTCGTTATCCTGTTCTCTGACCTCACCATGCATGAGCTGAAGGTGCTCCCCCGGGACCTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGGTGGAGGAGAATTTCGTTATCCTGTTCTCTGACCTCACCATGCATGAGCTGAAGGTGCTCCCCCGGGACCTG  1554

Query 1555  CAGCTCTGCTCAGAGACAGCATCAGGTGTGGATGTTGGGGGCCAGCATGAATGGGGCGAGCTGGTGCAGCTGGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGCTCTGCTCAGAGACAGCATCAGGTGTGGATGTTGGGGGCCAGCATGAATGGGGCGAGCTGGTGCAGCTGGA  1628

Query 1629  TCCCCAGACTGTGGGTGTCATCGTGCGACTAGAACGGGAGACCTTCCAGGTGCTGAACATGTACGGGAAGGTGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TCCCCAGACTGTGGGTGTCATCGTGCGACTAGAACGGGAGACCTTCCAGGTGCTGAACATGTACGGGAAGGTGG  1702

Query 1703  TGACTGTCAGACATCAGGCTGTGACCCGGAAGAAGGACAACCGCTTTGCTGTGGCCTTGGACTCAGAGCAGAAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGACTGTCAGACATCAGGCTGTGACCCGGAAGAAGGACAACCGCTTTGCTGTGGCCTTGGACTCAGAGCAGAAC  1776

Query 1777  AACATCCATGTGAAAGACATCGTTAAGGTCATTGATGGCCCCCACTCAGGCCGAGAAGGGGAGATTCGCCATCT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AACATCCATGTGAAAGACATCGTTAAGGTCATTGATGGCCCCCACTCAGGCCGAGAAGGGGAGATTCGCCATCT  1850

Query 1851  CTTCCGAAGCTTCGCCTTCCTACATTGCAAGAAACTGGTGGAGAACGGGGGCATGTTTGTCTGCAAGACCCGCC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CTTCCGAAGCTTCGCCTTCCTACATTGCAAGAAACTGGTGGAGAACGGGGGCATGTTTGTCTGCAAGACCCGCC  1924

Query 1925  ACCTGGTGCTGGCTGGGGGCTCAAAGCCCCGTGATGTGACCAACTTCACCGTGGGTGGCTTTGCGCCTATGAGT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACCTGGTGCTGGCTGGGGGCTCAAAGCCCCGTGATGTGACCAACTTCACCGTGGGTGGCTTTGCGCCTATGAGT  1998

Query 1999  CCCCGGATCAGCAGCCCCATGCACCCCAGTGCTGGAGGTCAGCGTGGCGGCTTTGGTAGCCCAGGTGGCGGCAG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CCCCGGATCAGCAGCCCCATGCACCCCAGTGCTGGAGGTCAGCGTGGCGGCTTTGGTAGCCCAGGTGGCGGCAG  2072

Query 2073  TGGTGGCATGAGCAGGGGCCGGGGCCGGAGGGACAACGAACTCATCGGCCAGACCGTGCGCATCTCCCAGGGGC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TGGTGGCATGAGCAGGGGCCGGGGCCGGAGGGACAACGAACTCATCGGCCAGACCGTGCGCATCTCCCAGGGGC  2146

Query 2147  CCTACAAAGGCTACATCGGTGTGGTGAAAGATGCCACAGAGTCCACGGCCCGTGTGGAGCTGCACTCCACCTGC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CCTACAAAGGCTACATCGGTGTGGTGAAAGATGCCACAGAGTCCACGGCCCGTGTGGAGCTGCACTCCACCTGC  2220

Query 2221  CAGACCATCTCTGTGGACCGTCAGCGGCTCACCACGGTGGGCTCACGGCGCCCGGGCGGCATGACCTCGACCTA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CAGACCATCTCTGTGGACCGTCAGCGGCTCACCACGGTGGGCTCACGGCGCCCGGGCGGCATGACCTCGACCTA  2294

Query 2295  TGGGAGGACGCCCATGTATGGCTCCCAGACGCCCATGTATGGCTCTGGCTCCCGAACACCCATGTACGGCTCAC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TGGGAGGACGCCCATGTATGGCTCCCAGACGCCCATGTATGGCTCTGGCTCCCGAACACCCATGTACGGCTCAC  2368

Query 2369  AGACACCCCTCCAGGATGGTAGCCGCACCCCACACTACGGCTCACAGACGCCCCTGCATGATGGCAGCCGCACT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AGACACCCCTCCAGGATGGTAGCCGCACCCCACACTACGGCTCACAGACGCCCCTGCATGATGGCAGCCGCACT  2442

Query 2443  CCTGCCCAGAGTGGGGCCTGGGACCCCAACAACCCCAACACGCCGTCACGGGCTGAGGAAGAATATGAGTATGC  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CCTGCCCAGAGTGGGGCCTGGGACCCCAACAACCCCAACACGCCGTCACGGGCTGAGGAAGAATATGAGTATGC  2516

Query 2517  TTTCGATGATGAGCCCACCCCGTCCCCGCAGGCCTATGGGGGAACCCCCAATCCCCAAACACCTGGCTACCCAG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TTTCGATGATGAGCCCACCCCGTCCCCGCAGGCCTATGGGGGAACCCCCAATCCCCAAACACCTGGCTACCCAG  2590

Query 2591  ACCCCTCGTCCCCACAGGTCAACCCACAATACAACCCGCAGACGCCAGGGACGCCGGCCATGTACAACACAGAC  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  ACCCCTCGTCCCCACAGGTCAACCCACAATACAACCCGCAGACGCCAGGGACGCCGGCCATGTACAACACAGAC  2664

Query 2665  CAGTTCTCTCCCTATGCTGCCCCCTCCCCACAAGGTTCCTACCAGCCCAGCCCCAGCCCCCAGAGCTACCACCA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CAGTTCTCTCCCTATGCTGCCCCCTCCCCACAAGGTTCCTACCAGCCCAGCCCCAGCCCCCAGAGCTACCACCA  2738

Query 2739  GGTGGCGCCAAGCCCAGCAGGCTACCAGAATACCCACTCCCCAGCCAGCTACCACCCTACACCGTCGCCCATGG  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  GGTGGCGCCAAGCCCAGCAGGCTACCAGAATACCCACTCCCCAGCCAGCTACCACCCTACACCGTCGCCCATGG  2812

Query 2813  CCTATCAGGCTAGCCCCAGCCCGAGCCCCGTTGGCTACAGTCCTATGACACCTGGAGCTCCCTCCCCTGGTGGC  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CCTATCAGGCTAGCCCCAGCCCGAGCCCCGTTGGCTACAGTCCTATGACACCTGGAGCTCCCTCCCCTGGTGGC  2886

Query 2887  TACAACCCACACACGCCAGGCTCAGGCATCGAGCAGAACTCCAGCGACTGGGTAACCACTGACATTCAGGTGAA  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  TACAACCCACACACGCCAGGCTCAGGCATCGAGCAGAACTCCAGCGACTGGGTAACCACTGACATTCAGGTGAA  2960

Query 2961  GGTGCGGGACACCTACCTGGATACACAGGTGGTGGGACAGACAGGTGTCATCCGCAGTGTCACGGGGGGCATGT  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  GGTGCGGGACACCTACCTGGATACACAGGTGGTGGGACAGACAGGTGTCATCCGCAGTGTCACGGGGGGCATGT  3034

Query 3035  GCTCTGTGTACCTGAAGGACAGTGAGAAGGTTGTCAGCATTTCCAGTGAGCACCTGGAGCCTATCACCCCCACC  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  GCTCTGTGTACCTGAAGGACAGTGAGAAGGTTGTCAGCATTTCCAGTGAGCACCTGGAGCCTATCACCCCCACC  3108

Query 3109  AAGAACAACAAGGTGAAAGTGATCCTGGGCGAGGATCGGGAAGCCACGGGCGTCCTACTGAGCATTGATGGTGA  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  AAGAACAACAAGGTGAAAGTGATCCTGGGCGAGGATCGGGAAGCCACGGGCGTCCTACTGAGCATTGATGGTGA  3182

Query 3183  GGATGGCATTGTCCGTATGGACCTTGATGAGCAGCTCAAGATCCTCAACCTCCGCTTCCTGGGGAAGCTCCTGG  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  GGATGGCATTGTCCGTATGGACCTTGATGAGCAGCTCAAGATCCTCAACCTCCGCTTCCTGGGGAAGCTCCTGG  3256

Query 3257  AAGCC  3261
            |||||
Sbjct 3257  AAGCC  3261