Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07018
- Subject:
- XM_017027174.2
- Aligned Length:
- 3261
- Identities:
- 1911
- Gaps:
- 1350
Alignment
Query 1 ATGTCGGACAGCGAGGACAGCAACTTTTCCGAGGAGGAGGACAGCGAGCGCAGCAGTGACGGCGAGGAGGCCGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGTAGACGAAGAGCGGCGGAGTGCAGCGGGCAGTGAGAAAGAAGAAGAGCCTGAGGACGAAGAGGAGGAGGAAG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGGAGGAGGAATATGATGAGGAAGAGGAAGAAGAAGATGATGACCGACCCCCCAAGAAACCCCGCCATGGAGGC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TTCATTCTGGACGAGGCTGATGTTGACGATGAGTATGAGGACGAGGACCAGTGGGAGGATGGAGCAGAGGACAT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TCTAGAGAAAGAAGAGATTGAAGCCTCCAATATCGATAATGTTGTCCTGGATGAAGATCGTTCTGGGGCTCGCC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 GCCTGCAAAACCTCTGGAGGGACCAGCGAGAAGAAGAACTGGGCGAGTATTACATGAAGAAATACGCCAAGTCA 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 TCTGTGGGAGAGACGGTGTATGGAGGATCTGATGAGCTCTCAGACGACATCACCCAGCAGCAGCTGCTCCCAGG 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 AGTCAAGGATCCCAATCTGTGGACTGTCAAATGTAAGATTGGGGAGGAACGGGCCACGGCCATTTCCTTGATGC 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 GCAAGTTCATTGCCTACCAGTTCACAGACACGCCCCTGCAGATCAAGTCAGTAGTGGCACCAGAGCATGTGAAG 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 GGCTACATCTACGTGGAGGCCTACAAGCAGACCCACGTGAAGCAGGCCATTGAGGGGGTGGGCAACCTGCGGCT 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 TGGCTACTGGAACCAGCAGATGGTGCCCATCAAGGAGATGACAGACGTGCTCAAAGTGGTGAAGGAGGTGGCCA 814
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 815 ACCTGAAACCAAAGTCCTGGGTCCGCCTCAAGCGGGGCATCTACAAGGATGACATTGCTCAGGTGGACTACGTG 888
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 889 GAGCCCAGCCAGAACACCATCTCCCTGAAGATGATCCCACGCATCGACTACGATCGCATCAAGGCCCGCATGAG 962
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 963 CTTGAAAGACTGGTTTGCCAAAAGGAAGAAGTTTAAGCGGCCTCCACAGAGGCTGTTTGATGCTGAGAAGATCA 1036
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1037 GGTCCCTGGGGGGTGATGTTGCCTCTGATGGTGACTTCCTCATCTTTGAGGGGAACCGTTACAGCCGGAAGGGC 1110
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1111 TTTCTGTTCAAGAGCTTCGCCATGTCTGCTGTGATCACGGAGGGTGTGAAGCCAACACTCTCTGAGCTGGAAAA 1184
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1185 GTTTGAGGACCAGCCAGAGGGCATTGACCTGGAGGTGGTGACTGAGAGCACAGGGAAGGAGCGGGAGCACAACT 1258
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1259 TCCAACCTGGGGACAACGTGGAGGTCTGTGAGGGTGAGCTCATCAACCTGCAGGGCAAGATCCTCAGCGTGGAT 1332
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1333 GGCAACAAGATCACCATCATGCCCAAGCATGAGGACCTCAAGGACATGTTGGAGTTCCCAGCCCAGGAACTTAG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ------------------ATGCCCAAGCATGAGGACCTCAAGGACATGTTGGAGTTCCCAGCCCAGGAACTTAG 56
Query 1407 AAAATACTTCAAGATGGGGGACCACGTGAAGGTGATTGCTGGCCGATTCGAGGGCGACACAGGCCTCATTGTGC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 57 AAAATACTTCAAGATGGGGGACCACGTGAAGGTGATTGCTGGCCGATTCGAGGGCGACACAGGCCTCATTGTGC 130
Query 1481 GGGTGGAGGAGAATTTCGTTATCCTGTTCTCTGACCTCACCATGCATGAGCTGAAGGTGCTCCCCCGGGACCTG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 131 GGGTGGAGGAGAATTTCGTTATCCTGTTCTCTGACCTCACCATGCATGAGCTGAAGGTGCTCCCCCGGGACCTG 204
Query 1555 CAGCTCTGCTCAGAGACAGCATCAGGTGTGGATGTTGGGGGCCAGCATGAATGGGGCGAGCTGGTGCAGCTGGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 205 CAGCTCTGCTCAGAGACAGCATCAGGTGTGGATGTTGGGGGCCAGCATGAATGGGGCGAGCTGGTGCAGCTGGA 278
Query 1629 TCCCCAGACTGTGGGTGTCATCGTGCGACTAGAACGGGAGACCTTCCAGGTGCTGAACATGTACGGGAAGGTGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 279 TCCCCAGACTGTGGGTGTCATCGTGCGACTAGAACGGGAGACCTTCCAGGTGCTGAACATGTACGGGAAGGTGG 352
Query 1703 TGACTGTCAGACATCAGGCTGTGACCCGGAAGAAGGACAACCGCTTTGCTGTGGCCTTGGACTCAGAGCAGAAC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 353 TGACTGTCAGACATCAGGCTGTGACCCGGAAGAAGGACAACCGCTTTGCTGTGGCCTTGGACTCAGAGCAGAAC 426
Query 1777 AACATCCATGTGAAAGACATCGTTAAGGTCATTGATGGCCCCCACTCAGGCCGAGAAGGGGAGATTCGCCATCT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 427 AACATCCATGTGAAAGACATCGTTAAGGTCATTGATGGCCCCCACTCAGGCCGAGAAGGGGAGATTCGCCATCT 500
Query 1851 CTTCCGAAGCTTCGCCTTCCTACATTGCAAGAAACTGGTGGAGAACGGGGGCATGTTTGTCTGCAAGACCCGCC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 501 CTTCCGAAGCTTCGCCTTCCTACATTGCAAGAAACTGGTGGAGAACGGGGGCATGTTTGTCTGCAAGACCCGCC 574
Query 1925 ACCTGGTGCTGGCTGGGGGCTCAAAGCCCCGTGATGTGACCAACTTCACCGTGGGTGGCTTTGCGCCTATGAGT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 575 ACCTGGTGCTGGCTGGGGGCTCAAAGCCCCGTGATGTGACCAACTTCACCGTGGGTGGCTTTGCGCCTATGAGT 648
Query 1999 CCCCGGATCAGCAGCCCCATGCACCCCAGTGCTGGAGGTCAGCGTGGCGGCTTTGGTAGCCCAGGTGGCGGCAG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 649 CCCCGGATCAGCAGCCCCATGCACCCCAGTGCTGGAGGTCAGCGTGGCGGCTTTGGTAGCCCAGGTGGCGGCAG 722
Query 2073 TGGTGGCATGAGCAGGGGCCGGGGCCGGAGGGACAACGAACTCATCGGCCAGACCGTGCGCATCTCCCAGGGGC 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 723 TGGTGGCATGAGCAGGGGCCGGGGCCGGAGGGACAACGAACTCATCGGCCAGACCGTGCGCATCTCCCAGGGGC 796
Query 2147 CCTACAAAGGCTACATCGGTGTGGTGAAAGATGCCACAGAGTCCACGGCCCGTGTGGAGCTGCACTCCACCTGC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 797 CCTACAAAGGCTACATCGGTGTGGTGAAAGATGCCACAGAGTCCACGGCCCGTGTGGAGCTGCACTCCACCTGC 870
Query 2221 CAGACCATCTCTGTGGACCGTCAGCGGCTCACCACGGTGGGCTCACGGCGCCCGGGCGGCATGACCTCGACCTA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 871 CAGACCATCTCTGTGGACCGTCAGCGGCTCACCACGGTGGGCTCACGGCGCCCGGGCGGCATGACCTCGACCTA 944
Query 2295 TGGGAGGACGCCCATGTATGGCTCCCAGACGCCCATGTATGGCTCTGGCTCCCGAACACCCATGTACGGCTCAC 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 945 TGGGAGGACGCCCATGTATGGCTCCCAGACGCCCATGTATGGCTCTGGCTCCCGAACACCCATGTACGGCTCAC 1018
Query 2369 AGACACCCCTCCAGGATGGTAGCCGCACCCCACACTACGGCTCACAGACGCCCCTGCATGATGGCAGCCGCACT 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 AGACACCCCTCCAGGATGGTAGCCGCACCCCACACTACGGCTCACAGACGCCCCTGCATGATGGCAGCCGCACT 1092
Query 2443 CCTGCCCAGAGTGGGGCCTGGGACCCCAACAACCCCAACACGCCGTCACGGGCTGAGGAAGAATATGAGTATGC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1093 CCTGCCCAGAGTGGGGCCTGGGACCCCAACAACCCCAACACGCCGTCACGGGCTGAGGAAGAATATGAGTATGC 1166
Query 2517 TTTCGATGATGAGCCCACCCCGTCCCCGCAGGCCTATGGGGGAACCCCCAATCCCCAAACACCTGGCTACCCAG 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1167 TTTCGATGATGAGCCCACCCCGTCCCCGCAGGCCTATGGGGGAACCCCCAATCCCCAAACACCTGGCTACCCAG 1240
Query 2591 ACCCCTCGTCCCCACAGGTCAACCCACAATACAACCCGCAGACGCCAGGGACGCCGGCCATGTACAACACAGAC 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1241 ACCCCTCGTCCCCACAGGTCAACCCACAATACAACCCGCAGACGCCAGGGACGCCGGCCATGTACAACACAGAC 1314
Query 2665 CAGTTCTCTCCCTATGCTGCCCCCTCCCCACAAGGTTCCTACCAGCCCAGCCCCAGCCCCCAGAGCTACCACCA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1315 CAGTTCTCTCCCTATGCTGCCCCCTCCCCACAAGGTTCCTACCAGCCCAGCCCCAGCCCCCAGAGCTACCACCA 1388
Query 2739 GGTGGCGCCAAGCCCAGCAGGCTACCAGAATACCCACTCCCCAGCCAGCTACCACCCTACACCGTCGCCCATGG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1389 GGTGGCGCCAAGCCCAGCAGGCTACCAGAATACCCACTCCCCAGCCAGCTACCACCCTACACCGTCGCCCATGG 1462
Query 2813 CCTATCAGGCTAGCCCCAGCCCGAGCCCCGTTGGCTACAGTCCTATGACACCTGGAGCTCCCTCCCCTGGTGGC 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1463 CCTATCAGGCTAGCCCCAGCCCGAGCCCCGTTGGCTACAGTCCTATGACACCTGGAGCTCCCTCCCCTGGTGGC 1536
Query 2887 TACAACCCACACACGCCAGGCTCAGGCATCGAGCAGAACTCCAGCGACTGGGTAACCACTGACATTCAGGTGAA 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1537 TACAACCCACACACGCCAGGCTCAGGCATCGAGCAGAACTCCAGCGACTGGGTAACCACTGACATTCAGGTGAA 1610
Query 2961 GGTGCGGGACACCTACCTGGATACACAGGTGGTGGGACAGACAGGTGTCATCCGCAGTGTCACGGGGGGCATGT 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1611 GGTGCGGGACACCTACCTGGATACACAGGTGGTGGGACAGACAGGTGTCATCCGCAGTGTCACGGGGGGCATGT 1684
Query 3035 GCTCTGTGTACCTGAAGGACAGTGAGAAGGTTGTCAGCATTTCCAGTGAGCACCTGGAGCCTATCACCCCCACC 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1685 GCTCTGTGTACCTGAAGGACAGTGAGAAGGTTGTCAGCATTTCCAGTGAGCACCTGGAGCCTATCACCCCCACC 1758
Query 3109 AAGAACAACAAGGTGAAAGTGATCCTGGGCGAGGATCGGGAAGCCACGGGCGTCCTACTGAGCATTGATGGTGA 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1759 AAGAACAACAAGGTGAAAGTGATCCTGGGCGAGGATCGGGAAGCCACGGGCGTCCTACTGAGCATTGATGGTGA 1832
Query 3183 GGATGGCATTGTCCGTATGGACCTTGATGAGCAGCTCAAGATCCTCAACCTCCGCTTCCTGGGGAAGCTCCTGG 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1833 GGATGGCATTGTCCGTATGGACCTTGATGAGCAGCTCAAGATCCTCAACCTCCGCTTCCTGGGGAAGCTCCTGG 1906
Query 3257 AAGCC 3261
|||||
Sbjct 1907 AAGCC 1911
