Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07036
Subject:
NM_001243231.2
Aligned Length:
671
Identities:
618
Gaps:
46

Alignment

Query   1  MHHQQRMAALGTDKELSDLLDFSAMFSPPVSSGKNGPTSLASGHFTGSNVEDRSSSGSWGNGGHPSPSRNYGDG  74
                                                     .......|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ------------------------------------------MEEDSRDVEDRSSSGSWGNGGHPSPSRNYGDG  32

Query  75  TPYDHMTSRDLGSHDNLSPPFVNSRIQSKTERGSYSSYGRESNLQGCHQQSLLGGDMDMGNPGTLSPTKPGSQY  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  33  TPYDHMTSRDLGSHDNLSPPFVNSRIQSKTERGSYSSYGRESNLQGCHQQSLLGGDMDMGNPGTLSPTKPGSQY  106

Query 149  YQYSSNNPRRRPLHSSAMEVQTKKVRKVPPGLPSSVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPATSTFPSSFFMQDGHH  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 107  YQYSSNNPRRRPLHSSAMEVQTKKVRKVPPGLPSSVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPATSTFPSSFFMQDGHH  180

Query 223  SSDPWSSSSGMNQPGYAGMLGNSSHIPQSSSYCSLHPHERLSYPSHSSADINSSLPPMSTFHRSGTNHYSTSSC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181  SSDPWSSSSGMNQPGYAGMLGNSSHIPQSSSYCSLHPHERLSYPSHSSADINSSLPPMSTFHRSGTNHYSTSSC  254

Query 297  TPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSSNPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQAS  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 255  TPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSSNPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQAS  328

Query 371  SSPNYEGPLHSLQSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYGTGLLSA  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 329  SSPNYEGPLHSLQSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYGTGLLSA  402

Query 445  NRHSLMVGTHREDGVALRGSHSLLPNQVPVPQLPVQSATSPDLNPPQDPYRGMPPGLQGQSVSSGSSEIKSDDE  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 403  NRHSLMVGTHREDGVALRGSHSLLPNQVPVPQLPVQSATSPDLNPPQDPYRGMPPGLQGQSVSSGSSEIKSDDE  476

Query 519  GDENLQDTKSSEDKKLDDDKKDIKSITRSRSSNNDDEDLTPEQKAEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELG  592
           |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477  GDENLQDTKSSEDKKLDDDKKDIKSIT----SNNDDEDLTPEQKAEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELG  546

Query 593  RMVQLHLKSDKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSSEPPPLSLAGPHPGMGDASN  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 547  RMVQLHLKSDKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSSEPPPLSLAGPHPGMGDASN  620

Query 667  HMGQM  671
           |||||
Sbjct 621  HMGQM  625