Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07048
• Subject: NM_001354703.2
• Aligned Length: 2094
• Identities: 1957
• Gaps: 132

Alignment

Query    1  ATGAGGCTCGCCGTGGGAGCCCTGCTGGTCTGCGCCGTCCTGGGGCTGTGTCTGGCTGTCCCTGATAAAACTGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAGATGGTGTGCAGTGTCGGAGCATGAGGCCACTAAGTGCCAGAGTTTCCGCGACCATATGAAAAGCGTCATTC  148
                                                                      ||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------------ATGAAAAGCGTCATTC  16

Query  149  CATCCGATGGTCCCAGTGTTGCTTGTGTGAAGAAAGCCTCCTACCTTGATTGCATCAGGGCCATTGCGGCAAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   17  CATCCGATGGTCCCAGTGTTGCTTGTGTGAAGAAAGCCTCCTACCTTGATTGCATCAGGGCCATTGCGGCAAAC  90

Query  223  GAAGCGGATGCTGTGACACTGGATGCAGGTTTGGTGTATGATGCTTACCTGGCTCCCAATAACCTGAAGCCTGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   91  GAAGCGGATGCTGTGACACTGGATGCAGGTTTGGTGTATGATGCTTACCTGGCTCCCAATAACCTGAAGCCTGT  164

Query  297  GGTGGCAGAGTTCTATGGGTCAAAAGAGGATCCACAGACTTTCTATTATGCTGTTGCTGTGGTGAAGAAGGATA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  165  GGTGGCAGAGTTCTATGGGTCAAAAGAGGATCCACAGACTTTCTATTATGCTGTTGCTGTGGTGAAGAAGGATA  238

Query  371  GTGGCTTCCAGATGAACCAGCTTCGAGGCAAGAAGTCCTGCCACACGGGTCTAGGCAGGTCCGCTGGGTGGAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  239  GTGGCTTCCAGATGAACCAGCTTCGAGGCAAGAAGTCCTGCCACACGGGTCTAGGCAGGTCCGCTGGGTGGAAC  312

Query  445  ATCCCCATAGGCTTACTTTACTGTGACTTACCTGAGCCACGTAAACCTCTTGAGAAAGCAGTGGCCAATTTCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  313  ATCCCCATAGGCTTACTTTACTGTGACTTACCTGAGCCACGTAAACCTCTTGAGAAAGCAGTGGCCAATTTCTT  386

Query  519  CTCGGGCAGCTGTGCCCCTTGTGCGGATGGGACGGACTTCCCCCAGCTGTGTCAACTGTGTCCAGGGTGTGGCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  387  CTCGGGCAGCTGTGCCCCTTGTGCGGATGGGACGGACTTCCCCCAGCTGTGTCAACTGTGTCCAGGGTGTGGCT  460

Query  593  GCTCCACCCTTAACCAATACTTCGGCTACTCAGGAGCCTTCAAGTGTCTGAAGAATGGTGCTGGGGATGTGGCC  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  461  GCTCCACCCTTAACCAATACTTCGGCTACTCGGGAGCCTTCAAGTGTCTGAAGGATGGTGCTGGGGATGTGGCC  534

Query  667  TTTGTCAAGCACTCGACTATATTTGAGAACTTGGCAAACAAGGCTGACAGGGACCAGTATGAGCTGCTTTGCCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  535  TTTGTCAAGCACTCGACTATATTTGAGAACTTGGCAAACAAGGCTGACAGGGACCAGTATGAGCTGCTTTGCCT  608

Query  741  GGACAACACCCGGAAGCCGGTAGATGAATACAAGGACTGCCACTTGGCCCAGGTCCCTTCTCATACCGTCGTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  609  GGACAACACCCGGAAGCCGGTAGATGAATACAAGGACTGCCACTTGGCCCAGGTCCCTTCTCATACCGTCGTGG  682

Query  815  CCCGAAGTATGGGCGGCAAGGAGGACTTGATCTGGGAGCTTCTCAACCAGGCCCAGGAACATTTTGGCAAAGAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  683  CCCGAAGTATGGGCGGCAAGGAGGACTTGATCTGGGAGCTTCTCAACCAGGCCCAGGAACATTTTGGCAAAGAC  756

Query  889  AAATCAAAAGAATTCCAACTATTCAGCTCTCCTCATGGGAAGGACCTGCTGTTTAAGGACTCTGCCCACGGGTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  757  AAATCAAAAGAATTCCAACTATTCAGCTCTCCTCATGGGAAGGACCTGCTGTTTAAGGACTCTGCCCACGGGTT  830

Query  963  TTTAAAAGTCCCCCCCAGGATGGATGCCAAGATGTACCTGGGCTATGAGTATGTCACTGCCATCCGGAATCTAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  831  TTTAAAAGTCCCCCCCAGGATGGATGCCAAGATGTACCTGGGCTATGAGTATGTCACTGCCATCCGGAATCTAC  904

Query 1037  GGGAAGGCACATGCCAAGAAGCCCCAACAGATGAATGCAAGCCTGTGAAGTGGTGTGCGCTGAGCCACCACGAG  1110
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  905  GGGAAGGCACATGCCCAGAAGCCCCAACAGATGAATGCAAGCCTGTGAAGTGGTGTGCGCTGAGCCACCACGAG  978

Query 1111  AGGCTCAAGTGTGATGAGTGGAGTGTTAACAGTGTAGGGAAAATAGAGTGTGTATCAGCAGAGACCACCGAAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  979  AGGCTCAAGTGTGATGAGTGGAGTGTTAACAGTGTAGGGAAAATAGAGTGTGTATCAGCAGAGACCACCGAAGA  1052

Query 1185  CTGCATCGCCAAGATCATGAATGGAGAAGCTGATGCCATGAGCTTGGATGGAGGGTTTGTCTACATAGCGGGCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1053  CTGCATCGCCAAGATCATGAATGGAGAAGCTGATGCCATGAGCTTGGATGGAGGGTTTGTCTACATAGCGGGCA  1126

Query 1259  AGTGTGGTCTGGTGCCNGTCTTGGCAGAAAACTACAATAAGAGCGATAATTGTGAGGATACACCAGAGGCAGGG  1332
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1127  AGTGTGGTCTGGTGCCTGTCTTGGCAGAAAACTACAATAAGAGCGATAATTGTGAGGATACACCAGAGGCAGGG  1200

Query 1333  TATTTTGCTGTAGCAGTGGTGAAGAAATCAGCTTCTGACCTCACCTGGGACAATCTGAAAGGCAAGAAGTCCTG  1406
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201  TATTTTGCTATAGCAGTGGTGAAGAAATCAGCTTCTGACCTCACCTGGGACAATCTGAAAGGCAAGAAGTCCTG  1274

Query 1407  CCATACGGCAGTTGGCAGAACCGCTGGCTGGAACATCCCCATGGGCCTGCTCTACAATAAGATCAACCACTGCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1275  CCATACGGCAGTTGGCAGAACCGCTGGCTGGAACATCCCCATGGGCCTGCTCTACAATAAGATCAACCACTGCA  1348

Query 1481  GATTTGATGAATTTTTCAGTGAAGGTTGTGCCCCTGGGTCTAAGAAAGACTCCAGTCTCTGTAAGCTGTGTATG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1349  GATTTGATGAATTTTTCAGTGAAGGTTGTGCCCCTGGGTCTAAGAAAGACTCCAGTCTCTGTAAGCTGTGTATG  1422

Query 1555  GGCTCAGGCCTAAACCTGTGTGAACCCAACAACAAAGAGGGATACTACGGCTACACAGGCGCTTTCAGGTGTCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1423  GGCTCAGGCCTAAACCTGTGTGAACCCAACAACAAAGAGGGATACTACGGCTACACAGGCGCTTTCAGGTGTCT  1496

Query 1629  GGTTGAGAAGGGAGATGTGGCCTTTGTGAAACACCAGACTGTCCCACAGAACACTGGGGGAAAAAACCCTGATC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1497  GGTTGAGAAGGGAGATGTGGCCTTTGTGAAACACCAGACTGTCCCACAGAACACTGGGGGAAAAAACCCTGATC  1570

Query 1703  CATGGGCTAAGAATCTGAATGAAAAAGACTATGAGTTGCTGTGCCTTGATGGTACCAGGAAACCTGTGGAGGAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1571  CATGGGCTAAGAATCTGAATGAAAAAGACTATGAGTTGCTGTGCCTTGATGGTACCAGGAAACCTGTGGAGGAG  1644

Query 1777  TATGCGAACTGCCACCTGGCCAGAGCCCCGAATCACGCTGTGGTCACACGGAAAGATAAGGAAGCTTGCGTCCA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1645  TATGCGAACTGCCACCTGGCCAGAGCCCCGAATCACGCTGTGGTCACACGGAAAGATAAGGAAGCTTGCGTCCA  1718

Query 1851  CAAGATATTACGTCAACAGCAGCACCTATTTGGAAGCAACGTAACTGACTGCTCGGGCAACTTTTGTTTGTTCC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1719  CAAGATATTACGTCAACAGCAGCACCTATTTGGAAGCAACGTAACTGACTGCTCGGGCAACTTTTGTTTGTTCC  1792

Query 1925  GGTCGGAAACCAAGGACCTTCTGTTCAGAGATGACACAGTATGTTTGGCCAAACTTCATGACAGAAACACATAT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1793  GGTCGGAAACCAAGGACCTTCTGTTCAGAGATGACACAGTATGTTTGGCCAAACTTCATGACAGAAACACATAT  1866

Query 1999  GAAAAATACTTAGGAGAAGAATATGTCAAGGCTGTTGGTAACCTGAGAAAATGCTCCACCTCATCACTCCTGGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1867  GAAAAATACTTAGGAGAAGAATATGTCAAGGCTGTTGGTAACCTGAGAAAATGCTCCACCTCATCACTCCTGGA  1940

Query 2073  AGCCTGCACTTTCCGTAGACCT  2094
            ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1941  AGCCTGCACTTTCCGTAGACCT  1962